MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	TGGT	2	8	12388	12395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017639	CAGC	2	8	16085	16092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017639	CAGA	2	8	16794	16801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017639	AATA	2	8	19350	19357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017639	AATG	2	8	19704	19711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017639	CGTT	2	8	23081	23088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017639	AAAC	2	8	24212	24219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017639	AAAG	2	8	24387	24394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017639	TCAG	2	8	24403	24410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017639	AAAG	2	8	25594	25601	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017639	AAGG	2	8	25786	25793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017639	GTGA	2	8	27259	27266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017639	GGCA	2	8	27388	27395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017639	ACCG	2	8	28753	28760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017639	ACTG	2	8	38576	38583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017639	TAAA	2	8	41539	41546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017639	GTAT	2	8	41614	41621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017639	TAAT	2	8	41656	41663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017639	CATT	2	8	42030	42037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017639	TTTG	2	8	48406	48413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017639	AACA	2	8	50626	50633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017639	AAAT	2	8	51543	51550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017639	ACTC	2	8	51551	51558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017639	AACA	2	8	54739	54746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017639	CTCA	2	8	55903	55910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017639	ATAC	2	8	56568	56575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017639	TGCT	2	8	58474	58481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017639	GTGA	2	8	62041	62048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017639	AGAA	2	8	62276	62283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017639	CAGC	2	8	62456	62463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017639	TGTA	2	8	62717	62724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017639	CTGG	2	8	63805	63812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017639	CCGT	2	8	65027	65034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017639	AGTG	2	8	65145	65152	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017639	GGCG	2	8	65528	65535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017639	ATTT	2	8	68646	68653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017639	AAAT	2	8	68863	68870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017639	ATTA	2	8	69370	69377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017639	TGAG	2	8	70257	70264	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017639	TCAG	2	8	72435	72442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017639	ATGT	2	8	74319	74326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017639	GTGA	2	8	75480	75487	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017639	AAAT	2	8	75556	75563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017639	AGTC	2	8	75701	75708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017639	ATGA	2	8	76031	76038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017639	TGGT	2	8	76176	76183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017639	CACC	2	8	76373	76380	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_017639	CTGC	2	8	78742	78749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017639	CCAG	2	8	79173	79180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017639	CTGG	2	8	80141	80148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017639	AATG	2	8	80998	81005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017639	CCCG	2	8	81021	81028	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017639	GAAA	2	8	81439	81446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017639	GATG	2	8	81454	81461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017639	TGGC	2	8	81543	81550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.