MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	TACC	2	8	289	296	25 %	25 %	0 %	50 %	386611994
2	NC_017639	CCGA	2	8	332	339	25 %	0 %	25 %	50 %	386611994
3	NC_017639	ACAG	2	8	429	436	50 %	0 %	25 %	25 %	386611994
4	NC_017639	CAGA	2	8	524	531	50 %	0 %	25 %	25 %	386611994
5	NC_017639	GACA	2	8	1109	1116	50 %	0 %	25 %	25 %	386611995
6	NC_017639	CCCT	2	8	1231	1238	0 %	25 %	0 %	75 %	386611995
7	NC_017639	CCCG	2	8	1262	1269	0 %	0 %	25 %	75 %	386611995
8	NC_017639	TTGC	2	8	2106	2113	0 %	50 %	25 %	25 %	386611997
9	NC_017639	TGCG	2	8	2246	2253	0 %	25 %	50 %	25 %	386611997
10	NC_017639	TGAA	2	8	2283	2290	50 %	25 %	25 %	0 %	386611997
11	NC_017639	TCCG	2	8	2448	2455	0 %	25 %	25 %	50 %	386611998
12	NC_017639	GCCA	2	8	3262	3269	25 %	0 %	25 %	50 %	386611999
13	NC_017639	CAGC	2	8	3395	3402	25 %	0 %	25 %	50 %	386611999
14	NC_017639	GGAC	2	8	6093	6100	25 %	0 %	50 %	25 %	386612001
15	NC_017639	TCAG	2	8	6416	6423	25 %	25 %	25 %	25 %	386612001
16	NC_017639	TCAG	2	8	8270	8277	25 %	25 %	25 %	25 %	386612003
17	NC_017639	ACGG	2	8	10295	10302	25 %	0 %	50 %	25 %	386612005
18	NC_017639	AAGG	2	8	10315	10322	50 %	0 %	50 %	0 %	386612005
19	NC_017639	CTTT	2	8	10399	10406	0 %	75 %	0 %	25 %	386612005
20	NC_017639	TCAG	2	8	10509	10516	25 %	25 %	25 %	25 %	386612005
21	NC_017639	GTCT	2	8	10544	10551	0 %	50 %	25 %	25 %	386612005
22	NC_017639	GGCA	2	8	10727	10734	25 %	0 %	50 %	25 %	386612005
23	NC_017639	TGTT	2	8	10816	10823	0 %	75 %	25 %	0 %	386612006
24	NC_017639	GGAC	2	8	11243	11250	25 %	0 %	50 %	25 %	386612006
25	NC_017639	GTCC	2	8	11368	11375	0 %	25 %	25 %	50 %	386612006
26	NC_017639	CAGT	2	8	11392	11399	25 %	25 %	25 %	25 %	386612006
27	NC_017639	GAGT	2	8	11410	11417	25 %	25 %	50 %	0 %	386612006
28	NC_017639	CTGG	2	8	11679	11686	0 %	25 %	50 %	25 %	386612007
29	NC_017639	CCTC	2	8	12519	12526	0 %	25 %	0 %	75 %	386612008
30	NC_017639	CCAC	2	8	12926	12933	25 %	0 %	0 %	75 %	386612009
31	NC_017639	GATG	2	8	13133	13140	25 %	25 %	50 %	0 %	386612009
32	NC_017639	GCCA	2	8	13644	13651	25 %	0 %	25 %	50 %	386612010
33	NC_017639	AGTT	2	8	14936	14943	25 %	50 %	25 %	0 %	386612011
34	NC_017639	AGCC	2	8	15842	15849	25 %	0 %	25 %	50 %	386612012
35	NC_017639	GCCA	2	8	16301	16308	25 %	0 %	25 %	50 %	386612013
36	NC_017639	CCTG	2	8	16364	16371	0 %	25 %	25 %	50 %	386612013
37	NC_017639	CTTG	2	8	16414	16421	0 %	50 %	25 %	25 %	386612013
38	NC_017639	GCCC	2	8	16826	16833	0 %	0 %	25 %	75 %	386612014
39	NC_017639	CCAC	2	8	16865	16872	25 %	0 %	0 %	75 %	386612014
40	NC_017639	CAGC	2	8	17201	17208	25 %	0 %	25 %	50 %	386612015
41	NC_017639	TGCT	2	8	17904	17911	0 %	50 %	25 %	25 %	386612015
42	NC_017639	GAAA	2	8	17962	17969	75 %	0 %	25 %	0 %	386612015
43	NC_017639	GTCT	2	8	18955	18962	0 %	50 %	25 %	25 %	386612016
44	NC_017639	AATA	2	8	19156	19163	75 %	25 %	0 %	0 %	386612016
45	NC_017639	CCAT	2	8	20053	20060	25 %	25 %	0 %	50 %	386612017
46	NC_017639	CAGT	2	8	20599	20606	25 %	25 %	25 %	25 %	386612017
47	NC_017639	AGAA	2	8	20649	20656	75 %	0 %	25 %	0 %	386612017
48	NC_017639	ATGT	2	8	21509	21516	25 %	50 %	25 %	0 %	386612018
49	NC_017639	TCTG	2	8	21835	21842	0 %	50 %	25 %	25 %	386612018
50	NC_017639	TGTC	2	8	22160	22167	0 %	50 %	25 %	25 %	386612018
51	NC_017639	GGCA	2	8	22177	22184	25 %	0 %	50 %	25 %	386612018
52	NC_017639	TTGT	2	8	22434	22441	0 %	75 %	25 %	0 %	386612018
53	NC_017639	GGCA	2	8	22461	22468	25 %	0 %	50 %	25 %	386612018
54	NC_017639	GCAG	2	8	22490	22497	25 %	0 %	50 %	25 %	386612018
55	NC_017639	GTCA	2	8	22574	22581	25 %	25 %	25 %	25 %	386612018
56	NC_017639	ATAA	2	8	23042	23049	75 %	25 %	0 %	0 %	386612018
57	NC_017639	AATC	2	8	23096	23103	50 %	25 %	0 %	25 %	386612019
58	NC_017639	ATCA	2	8	23184	23191	50 %	25 %	0 %	25 %	386612019
59	NC_017639	ATCA	2	8	23244	23251	50 %	25 %	0 %	25 %	386612019
60	NC_017639	CGAA	2	8	23474	23481	50 %	0 %	25 %	25 %	386612019
61	NC_017639	CAGA	2	8	23987	23994	50 %	0 %	25 %	25 %	386612019
62	NC_017639	TGTA	2	8	24076	24083	25 %	50 %	25 %	0 %	386612019
63	NC_017639	ACTG	2	8	26178	26185	25 %	25 %	25 %	25 %	386612021
64	NC_017639	ACCG	2	8	26543	26550	25 %	0 %	25 %	50 %	386612021
65	NC_017639	GCCG	2	8	26576	26583	0 %	0 %	50 %	50 %	386612021
66	NC_017639	CTGG	2	8	26692	26699	0 %	25 %	50 %	25 %	386612022
67	NC_017639	TCCA	2	8	28339	28346	25 %	25 %	0 %	50 %	386612023
68	NC_017639	GAAT	2	8	28872	28879	50 %	25 %	25 %	0 %	386612024
69	NC_017639	GCAG	2	8	30609	30616	25 %	0 %	50 %	25 %	386612026
70	NC_017639	GTCT	2	8	31027	31034	0 %	50 %	25 %	25 %	386612026
71	NC_017639	AATA	2	8	31228	31235	75 %	25 %	0 %	0 %	386612026
72	NC_017639	GCTG	2	8	31367	31374	0 %	25 %	50 %	25 %	386612027
73	NC_017639	TGGC	2	8	31563	31570	0 %	25 %	50 %	25 %	386612027
74	NC_017639	CTGC	2	8	31626	31633	0 %	25 %	25 %	50 %	386612027
75	NC_017639	GCCT	2	8	32440	32447	0 %	25 %	25 %	50 %	386612028
76	NC_017639	ATTA	2	8	33015	33022	50 %	50 %	0 %	0 %	386612029
77	NC_017639	TTGT	2	8	33118	33125	0 %	75 %	25 %	0 %	386612029
78	NC_017639	AATA	2	8	33573	33580	75 %	25 %	0 %	0 %	386612029
79	NC_017639	AGTT	2	8	33650	33657	25 %	50 %	25 %	0 %	386612029
80	NC_017639	ATCA	2	8	34144	34151	50 %	25 %	0 %	25 %	386612029
81	NC_017639	ATAA	2	8	34300	34307	75 %	25 %	0 %	0 %	386612029
82	NC_017639	CAGA	2	8	34367	34374	50 %	0 %	25 %	25 %	386612029
83	NC_017639	TCAA	2	8	34452	34459	50 %	25 %	0 %	25 %	386612029
84	NC_017639	CCAG	2	8	35448	35455	25 %	0 %	25 %	50 %	386612030
85	NC_017639	TGCC	2	8	35568	35575	0 %	25 %	25 %	50 %	386612030
86	NC_017639	CTGA	2	8	35758	35765	25 %	25 %	25 %	25 %	386612031
87	NC_017639	GCCA	2	8	35805	35812	25 %	0 %	25 %	50 %	386612031
88	NC_017639	GACG	2	8	36575	36582	25 %	0 %	50 %	25 %	386612031
89	NC_017639	CTGG	2	8	36752	36759	0 %	25 %	50 %	25 %	386612031
90	NC_017639	CGTT	2	8	36790	36797	0 %	50 %	25 %	25 %	386612031
91	NC_017639	CTTT	2	8	37074	37081	0 %	75 %	0 %	25 %	386612032
92	NC_017639	CCAT	2	8	37326	37333	25 %	25 %	0 %	50 %	386612032
93	NC_017639	TTGC	2	8	37617	37624	0 %	50 %	25 %	25 %	386612033
94	NC_017639	CTGG	2	8	37638	37645	0 %	25 %	50 %	25 %	386612033
95	NC_017639	ATCA	2	8	37764	37771	50 %	25 %	0 %	25 %	386612033
96	NC_017639	GACT	2	8	37944	37951	25 %	25 %	25 %	25 %	386612034
97	NC_017639	GTTG	2	8	37974	37981	0 %	50 %	50 %	0 %	386612034
98	NC_017639	CAGC	2	8	38081	38088	25 %	0 %	25 %	50 %	386612034
99	NC_017639	CAGA	2	8	38300	38307	50 %	0 %	25 %	25 %	386612035
100	NC_017639	AGTT	2	8	38474	38481	25 %	50 %	25 %	0 %	386612035
101	NC_017639	AATA	2	8	38782	38789	75 %	25 %	0 %	0 %	386612036
102	NC_017639	CGAC	2	8	39592	39599	25 %	0 %	25 %	50 %	386612036
103	NC_017639	TTCA	2	8	39768	39775	25 %	50 %	0 %	25 %	386612036
104	NC_017639	CTTC	2	8	40929	40936	0 %	50 %	0 %	50 %	386612038
105	NC_017639	GCCA	2	8	41093	41100	25 %	0 %	25 %	50 %	386612038
106	NC_017639	AACA	2	8	42249	42256	75 %	0 %	0 %	25 %	386612040
107	NC_017639	TGGC	2	8	42531	42538	0 %	25 %	50 %	25 %	386612040
108	NC_017639	CAGC	2	8	42707	42714	25 %	0 %	25 %	50 %	386612040
109	NC_017639	AAAT	2	8	43423	43430	75 %	25 %	0 %	0 %	386612040
110	NC_017639	TCAT	2	8	43444	43451	25 %	50 %	0 %	25 %	386612040
111	NC_017639	AAAG	2	8	43537	43544	75 %	0 %	25 %	0 %	386612040
112	NC_017639	TAAA	2	8	43772	43779	75 %	25 %	0 %	0 %	386612041
113	NC_017639	ATTA	2	8	43973	43980	50 %	50 %	0 %	0 %	386612041
114	NC_017639	CCTG	2	8	44055	44062	0 %	25 %	25 %	50 %	386612041
115	NC_017639	AACA	2	8	44147	44154	75 %	0 %	0 %	25 %	386612041
116	NC_017639	CTGG	2	8	44246	44253	0 %	25 %	50 %	25 %	386612041
117	NC_017639	AGAC	2	8	44666	44673	50 %	0 %	25 %	25 %	386612041
118	NC_017639	TCCC	2	8	44958	44965	0 %	25 %	0 %	75 %	386612042
119	NC_017639	GCCA	2	8	44969	44976	25 %	0 %	25 %	50 %	386612042
120	NC_017639	ACCA	2	8	45043	45050	50 %	0 %	0 %	50 %	386612042
121	NC_017639	GCTG	2	8	45153	45160	0 %	25 %	50 %	25 %	386612042
122	NC_017639	CCTG	2	8	45674	45681	0 %	25 %	25 %	50 %	386612042
123	NC_017639	AAAT	2	8	46112	46119	75 %	25 %	0 %	0 %	386612042
124	NC_017639	GGCA	2	8	46236	46243	25 %	0 %	50 %	25 %	386612042
125	NC_017639	GAAG	2	8	47119	47126	50 %	0 %	50 %	0 %	386612043
126	NC_017639	TGCC	2	8	47620	47627	0 %	25 %	25 %	50 %	386612043
127	NC_017639	TTGT	2	8	49285	49292	0 %	75 %	25 %	0 %	386612044
128	NC_017639	ACAG	2	8	49363	49370	50 %	0 %	25 %	25 %	386612044
129	NC_017639	GGCG	2	8	50773	50780	0 %	0 %	75 %	25 %	386612046
130	NC_017639	GCCA	2	8	51900	51907	25 %	0 %	25 %	50 %	386612047
131	NC_017639	CAGC	2	8	52033	52040	25 %	0 %	25 %	50 %	386612047
132	NC_017639	GCGG	2	8	52191	52198	0 %	0 %	75 %	25 %	386612047
133	NC_017639	ATTC	2	8	53439	53446	25 %	50 %	0 %	25 %	386612049
134	NC_017639	AGTA	2	8	53533	53540	50 %	25 %	25 %	0 %	386612049
135	NC_017639	CGTC	2	8	55150	55157	0 %	25 %	25 %	50 %	386612052
136	NC_017639	CAGC	2	8	55199	55206	25 %	0 %	25 %	50 %	386612052
137	NC_017639	CAGC	2	8	55333	55340	25 %	0 %	25 %	50 %	386612052
138	NC_017639	CATT	2	8	55467	55474	25 %	50 %	0 %	25 %	386612053
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.