MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	CCT	2	6	764	769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017639	AAT	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017639	GCA	2	6	832	837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017639	TCA	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017639	CGG	2	6	1541	1546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017639	GCC	2	6	1579	1584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017639	ACA	2	6	1607	1612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017639	GCT	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017639	CTG	2	6	2398	2403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017639	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017639	GAA	2	6	2923	2928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017639	CGG	2	6	3690	3695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017639	CAC	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017639	AGG	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017639	CAT	2	6	3785	3790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017639	GCA	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017639	GTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017639	TGT	3	9	3924	3932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017639	CGT	2	6	4029	4034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017639	TGT	2	6	4035	4040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017639	TGC	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017639	GAA	2	6	4185	4190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017639	GCT	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017639	GTC	2	6	4307	4312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017639	TTA	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017639	TAA	2	6	8214	8219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017639	TAT	2	6	8916	8921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017639	TGA	2	6	9804	9809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017639	TAT	2	6	9820	9825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017639	AGG	2	6	11561	11566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017639	TGG	2	6	12381	12386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017639	TGG	2	6	12465	12470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017639	ATT	2	6	12765	12770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017639	CTC	2	6	13334	13339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017639	GAA	2	6	14798	14803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017639	TTC	2	6	14842	14847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017639	TGA	2	6	16059	16064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017639	CGC	2	6	16077	16082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017639	GCA	2	6	16115	16120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017639	TTC	2	6	16610	16615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017639	ATC	2	6	16641	16646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017639	TTG	2	6	16755	16760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017639	TTG	2	6	19376	19381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017639	TTC	2	6	19503	19508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017639	ATA	2	6	19730	19735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017639	CCT	2	6	19781	19786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017639	AGG	2	6	21330	21335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017639	TAA	2	6	24302	24307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017639	TTA	2	6	24370	24375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017639	ATT	2	6	24435	24440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017639	CAT	2	6	24459	24464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017639	ATT	2	6	25419	25424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017639	ATG	2	6	25450	25455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017639	TCT	2	6	25472	25477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017639	TTA	2	6	25499	25504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017639	TTC	2	6	25527	25532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017639	GGA	2	6	25540	25545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017639	TCA	2	6	25708	25713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017639	CGG	2	6	25748	25753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017639	CAC	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017639	TTC	2	6	25842	25847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017639	GCC	2	6	25887	25892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017639	AAG	2	6	26976	26981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017639	ATT	2	6	27004	27009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017639	CTA	2	6	27021	27026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017639	CAT	2	6	27149	27154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017639	CTG	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017639	AGG	2	6	27429	27434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017639	GAA	2	6	27534	27539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017639	ATG	2	6	28499	28504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017639	CCT	2	6	28549	28554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017639	GTG	2	6	28572	28577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017639	CCG	2	6	28594	28599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017639	GTG	3	9	30053	30061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017639	AAC	2	6	30092	30097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017639	TTA	2	6	31988	31993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017639	GAA	2	6	32064	32069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017639	ACC	2	6	32075	32080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017639	GGC	2	6	32096	32101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017639	CTG	2	6	32129	32134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017639	TTG	2	6	32196	32201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017639	TGT	2	6	32717	32722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017639	CCA	2	6	32724	32729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017639	AGT	2	6	32763	32768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017639	CGG	2	6	34818	34823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017639	CTG	2	6	34843	34848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017639	ATT	2	6	34892	34897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017639	TGT	2	6	36903	36908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017639	ACA	2	6	36924	36929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017639	TGA	2	6	38129	38134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017639	ATC	2	6	38521	38526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017639	GCT	2	6	38550	38555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017639	TAT	2	6	41688	41693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017639	CAA	2	6	41728	41733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017639	TAA	2	6	41743	41748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017639	CGA	2	6	41810	41815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017639	TGT	2	6	41842	41847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017639	GCT	2	6	41882	41887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017639	TGC	2	6	41929	41934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017639	CAA	2	6	41990	41995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017639	ATC	2	6	42000	42005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017639	ATT	2	6	42042	42047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017639	AGT	2	6	42080	42085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017639	CTG	2	6	48135	48140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017639	ATG	2	6	48201	48206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017639	ATA	2	6	48281	48286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017639	GAA	2	6	48307	48312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017639	GCT	2	6	48619	48624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017639	GGC	2	6	48658	48663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017639	CAT	2	6	48739	48744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017639	GCA	3	9	48781	48789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017639	TAT	2	6	48872	48877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017639	GCG	2	6	49526	49531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017639	ATT	2	6	49536	49541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017639	TCA	2	6	49645	49650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017639	ATG	2	6	50296	50301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017639	TCA	2	6	50387	50392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017639	GGC	2	6	50414	50419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017639	TTA	2	6	50545	50550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017639	CGC	2	6	50577	50582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017639	GGC	2	6	51337	51342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017639	TAA	2	6	51378	51383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017639	GAA	2	6	51487	51492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017639	TCA	2	6	51570	51575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017639	CAA	2	6	51611	51616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017639	ATT	2	6	51648	51653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017639	CGG	2	6	52328	52333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017639	CAC	2	6	52350	52355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017639	AGG	2	6	52373	52378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017639	CAT	2	6	52423	52428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017639	GCA	2	6	52448	52453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017639	CAG	2	6	52474	52479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017639	GCT	2	6	54239	54244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017639	ATA	2	6	55665	55670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017639	ATA	2	6	55723	55728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017639	TGG	2	6	55838	55843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017639	TGT	2	6	55929	55934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017639	TTA	2	6	56093	56098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017639	GAT	2	6	56163	56168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017639	CAA	2	6	56592	56597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017639	AGA	2	6	58128	58133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.