MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	CT	3	6	233	238	0 %	50 %	0 %	50 %	386611994
2	NC_017639	GC	3	6	401	406	0 %	0 %	50 %	50 %	386611994
3	NC_017639	CA	3	6	1173	1178	50 %	0 %	0 %	50 %	386611995
4	NC_017639	CT	3	6	1451	1456	0 %	50 %	0 %	50 %	386611995
5	NC_017639	TA	3	6	1659	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	386611996
6	NC_017639	GA	3	6	4250	4255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017639	GT	3	6	6062	6067	0 %	50 %	50 %	0 %	386612001
8	NC_017639	AC	3	6	7271	7276	50 %	0 %	0 %	50 %	386612001
9	NC_017639	AG	3	6	8551	8556	50 %	0 %	50 %	0 %	386612003
10	NC_017639	GT	3	6	9405	9410	0 %	50 %	50 %	0 %	386612004
11	NC_017639	AG	3	6	9954	9959	50 %	0 %	50 %	0 %	386612005
12	NC_017639	GT	3	6	11452	11457	0 %	50 %	50 %	0 %	386612006
13	NC_017639	CG	3	6	12168	12173	0 %	0 %	50 %	50 %	386612007
14	NC_017639	TG	3	6	12399	12404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017639	GC	3	6	12623	12628	0 %	0 %	50 %	50 %	386612008
16	NC_017639	CT	4	8	17600	17607	0 %	50 %	0 %	50 %	386612015
17	NC_017639	AC	3	6	18356	18361	50 %	0 %	0 %	50 %	386612016
18	NC_017639	AT	3	6	18405	18410	50 %	50 %	0 %	0 %	386612016
19	NC_017639	TA	3	6	18647	18652	50 %	50 %	0 %	0 %	386612016
20	NC_017639	AC	3	6	18819	18824	50 %	0 %	0 %	50 %	386612016
21	NC_017639	CT	3	6	19529	19534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017639	AT	3	6	19605	19610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017639	GC	3	6	19800	19805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017639	AG	3	6	20347	20352	50 %	0 %	50 %	0 %	386612017
25	NC_017639	CA	3	6	20694	20699	50 %	0 %	0 %	50 %	386612017
26	NC_017639	GA	3	6	21095	21100	50 %	0 %	50 %	0 %	386612017
27	NC_017639	TA	3	6	21323	21328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017639	GA	3	6	21703	21708	50 %	0 %	50 %	0 %	386612018
29	NC_017639	GA	3	6	21940	21945	50 %	0 %	50 %	0 %	386612018
30	NC_017639	AT	3	6	22404	22409	50 %	50 %	0 %	0 %	386612018
31	NC_017639	CT	3	6	22919	22924	0 %	50 %	0 %	50 %	386612018
32	NC_017639	GT	4	8	22994	23001	0 %	50 %	50 %	0 %	386612018
33	NC_017639	AG	3	6	25015	25020	50 %	0 %	50 %	0 %	386612020
34	NC_017639	TG	3	6	25327	25332	0 %	50 %	50 %	0 %	386612020
35	NC_017639	TG	3	6	25546	25551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017639	GT	4	8	25906	25913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017639	TC	3	6	26669	26674	0 %	50 %	0 %	50 %	386612022
38	NC_017639	AT	3	6	26989	26994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017639	TG	3	6	28921	28926	0 %	50 %	50 %	0 %	386612024
40	NC_017639	CT	3	6	29670	29675	0 %	50 %	0 %	50 %	386612025
41	NC_017639	AT	3	6	30477	30482	50 %	50 %	0 %	0 %	386612026
42	NC_017639	TA	3	6	30719	30724	50 %	50 %	0 %	0 %	386612026
43	NC_017639	AC	3	6	30891	30896	50 %	0 %	0 %	50 %	386612026
44	NC_017639	TA	3	6	31269	31274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017639	TG	3	6	31486	31491	0 %	50 %	50 %	0 %	386612027
46	NC_017639	GT	3	6	32015	32020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017639	TA	3	6	33673	33678	50 %	50 %	0 %	0 %	386612029
48	NC_017639	CA	3	6	33881	33886	50 %	0 %	0 %	50 %	386612029
49	NC_017639	TC	3	6	34236	34241	0 %	50 %	0 %	50 %	386612029
50	NC_017639	AT	3	6	34832	34837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017639	CA	3	6	35910	35915	50 %	0 %	0 %	50 %	386612031
52	NC_017639	CA	3	6	36355	36360	50 %	0 %	0 %	50 %	386612031
53	NC_017639	CT	3	6	36874	36879	0 %	50 %	0 %	50 %	386612031
54	NC_017639	CG	3	6	38211	38216	0 %	0 %	50 %	50 %	386612035
55	NC_017639	TC	3	6	38274	38279	0 %	50 %	0 %	50 %	386612035
56	NC_017639	CG	3	6	38404	38409	0 %	0 %	50 %	50 %	386612035
57	NC_017639	TA	3	6	39371	39376	50 %	50 %	0 %	0 %	386612036
58	NC_017639	CT	3	6	40131	40136	0 %	50 %	0 %	50 %	386612037
59	NC_017639	AT	3	6	41127	41132	50 %	50 %	0 %	0 %	386612038
60	NC_017639	AG	3	6	41236	41241	50 %	0 %	50 %	0 %	386612039
61	NC_017639	TC	3	6	41374	41379	0 %	50 %	0 %	50 %	386612039
62	NC_017639	TG	3	6	41478	41483	0 %	50 %	50 %	0 %	386612039
63	NC_017639	CA	3	6	41579	41584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017639	CA	3	6	41644	41649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017639	CA	3	6	42050	42055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017639	TA	3	6	42067	42072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017639	CT	3	6	42606	42611	0 %	50 %	0 %	50 %	386612040
68	NC_017639	CA	3	6	43113	43118	50 %	0 %	0 %	50 %	386612040
69	NC_017639	AG	3	6	43727	43732	50 %	0 %	50 %	0 %	386612041
70	NC_017639	AT	3	6	43815	43820	50 %	50 %	0 %	0 %	386612041
71	NC_017639	TA	3	6	44140	44145	50 %	50 %	0 %	0 %	386612041
72	NC_017639	GC	3	6	44261	44266	0 %	0 %	50 %	50 %	386612041
73	NC_017639	TA	3	6	44438	44443	50 %	50 %	0 %	0 %	386612041
74	NC_017639	TC	3	6	44889	44894	0 %	50 %	0 %	50 %	386612041
75	NC_017639	CA	3	6	44897	44902	50 %	0 %	0 %	50 %	386612041
76	NC_017639	GT	3	6	45526	45531	0 %	50 %	50 %	0 %	386612042
77	NC_017639	GA	3	6	45922	45927	50 %	0 %	50 %	0 %	386612042
78	NC_017639	CG	3	6	46000	46005	0 %	0 %	50 %	50 %	386612042
79	NC_017639	CT	3	6	46618	46623	0 %	50 %	0 %	50 %	386612042
80	NC_017639	TG	3	6	47096	47101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017639	TG	3	6	47723	47728	0 %	50 %	50 %	0 %	386612043
82	NC_017639	GA	3	6	48226	48231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017639	AC	3	6	50846	50851	50 %	0 %	0 %	50 %	386612046
84	NC_017639	AT	3	6	52962	52967	50 %	50 %	0 %	0 %	386612048
85	NC_017639	AT	3	6	54168	54173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017639	TC	3	6	54560	54565	0 %	50 %	0 %	50 %	386612051
87	NC_017639	TA	3	6	54670	54675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017639	AT	3	6	54700	54705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017639	GC	3	6	55185	55190	0 %	0 %	50 %	50 %	386612052
90	NC_017639	GC	3	6	55233	55238	0 %	0 %	50 %	50 %	386612052
91	NC_017639	TG	3	6	55780	55785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017639	CG	3	6	55868	55873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017639	GC	3	6	55959	55964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017639	GA	3	6	56235	56240	50 %	0 %	50 %	0 %	386612054
95	NC_017639	CT	3	6	56989	56994	0 %	50 %	0 %	50 %	386612055
96	NC_017639	GT	4	8	57016	57023	0 %	50 %	50 %	0 %	386612055
97	NC_017639	GC	3	6	57776	57781	0 %	0 %	50 %	50 %	386612056
98	NC_017639	AG	3	6	58352	58357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017639	GC	3	6	58398	58403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017639	TC	3	6	58674	58679	0 %	50 %	0 %	50 %	386612057
101	NC_017639	GT	3	6	59965	59970	0 %	50 %	50 %	0 %	386612058
102	NC_017639	AT	3	6	60735	60740	50 %	50 %	0 %	0 %	386612059
103	NC_017639	TG	3	6	61059	61064	0 %	50 %	50 %	0 %	386612060
104	NC_017639	GA	3	6	61666	61671	50 %	0 %	50 %	0 %	386612060
105	NC_017639	GC	3	6	61892	61897	0 %	0 %	50 %	50 %	386612060
106	NC_017639	CA	3	6	61901	61906	50 %	0 %	0 %	50 %	386612060
107	NC_017639	GC	3	6	62270	62275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017639	TA	3	6	62723	62728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017639	CA	4	8	62750	62757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017639	GT	3	6	62932	62937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017639	AC	3	6	63341	63346	50 %	0 %	0 %	50 %	386612061
112	NC_017639	TG	3	6	63814	63819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017639	TC	3	6	64180	64185	0 %	50 %	0 %	50 %	386612062
114	NC_017639	GA	3	6	65041	65046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017639	CA	3	6	65095	65100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017639	TG	3	6	65239	65244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017639	AG	4	8	66427	66434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017639	TA	4	8	67842	67849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017639	TG	4	8	67910	67917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017639	AC	3	6	68571	68576	50 %	0 %	0 %	50 %	386612067
121	NC_017639	TG	3	6	69481	69486	0 %	50 %	50 %	0 %	386612069
122	NC_017639	GA	3	6	69667	69672	50 %	0 %	50 %	0 %	386612069
123	NC_017639	TA	3	6	69675	69680	50 %	50 %	0 %	0 %	386612069
124	NC_017639	AG	3	6	69999	70004	50 %	0 %	50 %	0 %	386612069
125	NC_017639	AT	3	6	70119	70124	50 %	50 %	0 %	0 %	386612069
126	NC_017639	CT	3	6	70836	70841	0 %	50 %	0 %	50 %	386612070
127	NC_017639	CT	3	6	71309	71314	0 %	50 %	0 %	50 %	386612072
128	NC_017639	AT	3	6	71521	71526	50 %	50 %	0 %	0 %	386612072
129	NC_017639	GC	3	6	72467	72472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017639	GC	3	6	73530	73535	0 %	0 %	50 %	50 %	386612074
131	NC_017639	CG	3	6	76134	76139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017639	TG	3	6	76565	76570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017639	GC	3	6	76772	76777	0 %	0 %	50 %	50 %	386612078
134	NC_017639	CA	3	6	77191	77196	50 %	0 %	0 %	50 %	386612078
135	NC_017639	CG	3	6	77240	77245	0 %	0 %	50 %	50 %	386612078
136	NC_017639	GC	3	6	78957	78962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017639	AT	3	6	79546	79551	50 %	50 %	0 %	0 %	386612080
138	NC_017639	AT	3	6	79899	79904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017639	AG	3	6	80015	80020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017639	AC	3	6	81037	81042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.