MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	CT	3	6	233	238	0 %	50 %	0 %	50 %	386611994
2	NC_017639	GC	3	6	401	406	0 %	0 %	50 %	50 %	386611994
3	NC_017639	CA	3	6	1173	1178	50 %	0 %	0 %	50 %	386611995
4	NC_017639	CT	3	6	1451	1456	0 %	50 %	0 %	50 %	386611995
5	NC_017639	TA	3	6	1659	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	386611996
6	NC_017639	GT	3	6	6062	6067	0 %	50 %	50 %	0 %	386612001
7	NC_017639	AC	3	6	7271	7276	50 %	0 %	0 %	50 %	386612001
8	NC_017639	AG	3	6	8551	8556	50 %	0 %	50 %	0 %	386612003
9	NC_017639	GT	3	6	9405	9410	0 %	50 %	50 %	0 %	386612004
10	NC_017639	AG	3	6	9954	9959	50 %	0 %	50 %	0 %	386612005
11	NC_017639	GT	3	6	11452	11457	0 %	50 %	50 %	0 %	386612006
12	NC_017639	CG	3	6	12168	12173	0 %	0 %	50 %	50 %	386612007
13	NC_017639	GC	3	6	12623	12628	0 %	0 %	50 %	50 %	386612008
14	NC_017639	CT	4	8	17600	17607	0 %	50 %	0 %	50 %	386612015
15	NC_017639	AC	3	6	18356	18361	50 %	0 %	0 %	50 %	386612016
16	NC_017639	AT	3	6	18405	18410	50 %	50 %	0 %	0 %	386612016
17	NC_017639	TA	3	6	18647	18652	50 %	50 %	0 %	0 %	386612016
18	NC_017639	AC	3	6	18819	18824	50 %	0 %	0 %	50 %	386612016
19	NC_017639	AG	3	6	20347	20352	50 %	0 %	50 %	0 %	386612017
20	NC_017639	CA	3	6	20694	20699	50 %	0 %	0 %	50 %	386612017
21	NC_017639	GA	3	6	21095	21100	50 %	0 %	50 %	0 %	386612017
22	NC_017639	GA	3	6	21703	21708	50 %	0 %	50 %	0 %	386612018
23	NC_017639	GA	3	6	21940	21945	50 %	0 %	50 %	0 %	386612018
24	NC_017639	AT	3	6	22404	22409	50 %	50 %	0 %	0 %	386612018
25	NC_017639	CT	3	6	22919	22924	0 %	50 %	0 %	50 %	386612018
26	NC_017639	GT	4	8	22994	23001	0 %	50 %	50 %	0 %	386612018
27	NC_017639	AG	3	6	25015	25020	50 %	0 %	50 %	0 %	386612020
28	NC_017639	TG	3	6	25327	25332	0 %	50 %	50 %	0 %	386612020
29	NC_017639	TC	3	6	26669	26674	0 %	50 %	0 %	50 %	386612022
30	NC_017639	TG	3	6	28921	28926	0 %	50 %	50 %	0 %	386612024
31	NC_017639	CT	3	6	29670	29675	0 %	50 %	0 %	50 %	386612025
32	NC_017639	AT	3	6	30477	30482	50 %	50 %	0 %	0 %	386612026
33	NC_017639	TA	3	6	30719	30724	50 %	50 %	0 %	0 %	386612026
34	NC_017639	AC	3	6	30891	30896	50 %	0 %	0 %	50 %	386612026
35	NC_017639	TG	3	6	31486	31491	0 %	50 %	50 %	0 %	386612027
36	NC_017639	TA	3	6	33673	33678	50 %	50 %	0 %	0 %	386612029
37	NC_017639	CA	3	6	33881	33886	50 %	0 %	0 %	50 %	386612029
38	NC_017639	TC	3	6	34236	34241	0 %	50 %	0 %	50 %	386612029
39	NC_017639	CA	3	6	35910	35915	50 %	0 %	0 %	50 %	386612031
40	NC_017639	CA	3	6	36355	36360	50 %	0 %	0 %	50 %	386612031
41	NC_017639	CT	3	6	36874	36879	0 %	50 %	0 %	50 %	386612031
42	NC_017639	CG	3	6	38211	38216	0 %	0 %	50 %	50 %	386612035
43	NC_017639	TC	3	6	38274	38279	0 %	50 %	0 %	50 %	386612035
44	NC_017639	CG	3	6	38404	38409	0 %	0 %	50 %	50 %	386612035
45	NC_017639	TA	3	6	39371	39376	50 %	50 %	0 %	0 %	386612036
46	NC_017639	CT	3	6	40131	40136	0 %	50 %	0 %	50 %	386612037
47	NC_017639	AT	3	6	41127	41132	50 %	50 %	0 %	0 %	386612038
48	NC_017639	AG	3	6	41236	41241	50 %	0 %	50 %	0 %	386612039
49	NC_017639	TC	3	6	41374	41379	0 %	50 %	0 %	50 %	386612039
50	NC_017639	TG	3	6	41478	41483	0 %	50 %	50 %	0 %	386612039
51	NC_017639	CT	3	6	42606	42611	0 %	50 %	0 %	50 %	386612040
52	NC_017639	CA	3	6	43113	43118	50 %	0 %	0 %	50 %	386612040
53	NC_017639	AG	3	6	43727	43732	50 %	0 %	50 %	0 %	386612041
54	NC_017639	AT	3	6	43815	43820	50 %	50 %	0 %	0 %	386612041
55	NC_017639	TA	3	6	44140	44145	50 %	50 %	0 %	0 %	386612041
56	NC_017639	GC	3	6	44261	44266	0 %	0 %	50 %	50 %	386612041
57	NC_017639	TA	3	6	44438	44443	50 %	50 %	0 %	0 %	386612041
58	NC_017639	TC	3	6	44889	44894	0 %	50 %	0 %	50 %	386612041
59	NC_017639	CA	3	6	44897	44902	50 %	0 %	0 %	50 %	386612041
60	NC_017639	GT	3	6	45526	45531	0 %	50 %	50 %	0 %	386612042
61	NC_017639	GA	3	6	45922	45927	50 %	0 %	50 %	0 %	386612042
62	NC_017639	CG	3	6	46000	46005	0 %	0 %	50 %	50 %	386612042
63	NC_017639	CT	3	6	46618	46623	0 %	50 %	0 %	50 %	386612042
64	NC_017639	TG	3	6	47723	47728	0 %	50 %	50 %	0 %	386612043
65	NC_017639	AC	3	6	50846	50851	50 %	0 %	0 %	50 %	386612046
66	NC_017639	AT	3	6	52962	52967	50 %	50 %	0 %	0 %	386612048
67	NC_017639	TC	3	6	54560	54565	0 %	50 %	0 %	50 %	386612051
68	NC_017639	GC	3	6	55185	55190	0 %	0 %	50 %	50 %	386612052
69	NC_017639	GC	3	6	55233	55238	0 %	0 %	50 %	50 %	386612052
70	NC_017639	GA	3	6	56235	56240	50 %	0 %	50 %	0 %	386612054
71	NC_017639	CT	3	6	56989	56994	0 %	50 %	0 %	50 %	386612055
72	NC_017639	GT	4	8	57016	57023	0 %	50 %	50 %	0 %	386612055
73	NC_017639	GC	3	6	57776	57781	0 %	0 %	50 %	50 %	386612056
74	NC_017639	TC	3	6	58674	58679	0 %	50 %	0 %	50 %	386612057
75	NC_017639	GT	3	6	59965	59970	0 %	50 %	50 %	0 %	386612058
76	NC_017639	AT	3	6	60735	60740	50 %	50 %	0 %	0 %	386612059
77	NC_017639	TG	3	6	61059	61064	0 %	50 %	50 %	0 %	386612060
78	NC_017639	GA	3	6	61666	61671	50 %	0 %	50 %	0 %	386612060
79	NC_017639	GC	3	6	61892	61897	0 %	0 %	50 %	50 %	386612060
80	NC_017639	CA	3	6	61901	61906	50 %	0 %	0 %	50 %	386612060
81	NC_017639	AC	3	6	63341	63346	50 %	0 %	0 %	50 %	386612061
82	NC_017639	TC	3	6	64180	64185	0 %	50 %	0 %	50 %	386612062
83	NC_017639	AC	3	6	68571	68576	50 %	0 %	0 %	50 %	386612067
84	NC_017639	TG	3	6	69481	69486	0 %	50 %	50 %	0 %	386612069
85	NC_017639	GA	3	6	69667	69672	50 %	0 %	50 %	0 %	386612069
86	NC_017639	TA	3	6	69675	69680	50 %	50 %	0 %	0 %	386612069
87	NC_017639	AG	3	6	69999	70004	50 %	0 %	50 %	0 %	386612069
88	NC_017639	AT	3	6	70119	70124	50 %	50 %	0 %	0 %	386612069
89	NC_017639	CT	3	6	70836	70841	0 %	50 %	0 %	50 %	386612070
90	NC_017639	CT	3	6	71309	71314	0 %	50 %	0 %	50 %	386612072
91	NC_017639	AT	3	6	71521	71526	50 %	50 %	0 %	0 %	386612072
92	NC_017639	GC	3	6	73530	73535	0 %	0 %	50 %	50 %	386612074
93	NC_017639	GC	3	6	76772	76777	0 %	0 %	50 %	50 %	386612078
94	NC_017639	CA	3	6	77191	77196	50 %	0 %	0 %	50 %	386612078
95	NC_017639	CG	3	6	77240	77245	0 %	0 %	50 %	50 %	386612078
96	NC_017639	AT	3	6	79546	79551	50 %	50 %	0 %	0 %	386612080

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.