MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	A	6	6	826	831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017639	A	6	6	846	851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017639	A	6	6	2259	2264	100 %	0 %	0 %	0 %	386611997
4	NC_017639	G	6	6	2291	2296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017639	T	6	6	3509	3514	0 %	100 %	0 %	0 %	386611999
6	NC_017639	T	7	7	3887	3893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017639	T	6	6	3935	3940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017639	T	7	7	4135	4141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017639	T	7	7	4403	4409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017639	A	6	6	4427	4432	100 %	0 %	0 %	0 %	386612000
11	NC_017639	T	8	8	4452	4459	0 %	100 %	0 %	0 %	386612000
12	NC_017639	A	6	6	4984	4989	100 %	0 %	0 %	0 %	386612001
13	NC_017639	G	11	11	5115	5125	0 %	0 %	100 %	0 %	386612001
14	NC_017639	G	6	6	6608	6613	0 %	0 %	100 %	0 %	386612001
15	NC_017639	G	6	6	7242	7247	0 %	0 %	100 %	0 %	386612001
16	NC_017639	T	8	8	8783	8790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017639	T	6	6	10022	10027	0 %	100 %	0 %	0 %	386612005
18	NC_017639	T	6	6	11623	11628	0 %	100 %	0 %	0 %	386612007
19	NC_017639	G	7	7	14968	14974	0 %	0 %	100 %	0 %	386612011
20	NC_017639	T	6	6	15340	15345	0 %	100 %	0 %	0 %	386612011
21	NC_017639	C	6	6	15827	15832	0 %	0 %	0 %	100 %	386612012
22	NC_017639	T	6	6	17267	17272	0 %	100 %	0 %	0 %	386612015
23	NC_017639	A	7	7	19421	19427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017639	T	8	8	19721	19728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017639	A	7	7	20121	20127	100 %	0 %	0 %	0 %	386612017
26	NC_017639	A	6	6	20137	20142	100 %	0 %	0 %	0 %	386612017
27	NC_017639	A	6	6	20679	20684	100 %	0 %	0 %	0 %	386612017
28	NC_017639	T	6	6	20948	20953	0 %	100 %	0 %	0 %	386612017
29	NC_017639	T	6	6	21282	21287	0 %	100 %	0 %	0 %	386612017
30	NC_017639	A	6	6	21317	21322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017639	G	7	7	21444	21450	0 %	0 %	100 %	0 %	386612018
32	NC_017639	T	6	6	22259	22264	0 %	100 %	0 %	0 %	386612018
33	NC_017639	C	6	6	22484	22489	0 %	0 %	0 %	100 %	386612018
34	NC_017639	A	6	6	23062	23067	100 %	0 %	0 %	0 %	386612018
35	NC_017639	T	6	6	23629	23634	0 %	100 %	0 %	0 %	386612019
36	NC_017639	C	6	6	23653	23658	0 %	0 %	0 %	100 %	386612019
37	NC_017639	T	7	7	23695	23701	0 %	100 %	0 %	0 %	386612019
38	NC_017639	A	7	7	24163	24169	100 %	0 %	0 %	0 %	386612019
39	NC_017639	A	6	6	24488	24493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017639	T	9	9	24499	24507	0 %	100 %	0 %	0 %	386612020
41	NC_017639	A	7	7	24624	24630	100 %	0 %	0 %	0 %	386612020
42	NC_017639	A	6	6	25278	25283	100 %	0 %	0 %	0 %	386612020
43	NC_017639	T	6	6	25812	25817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017639	T	6	6	26143	26148	0 %	100 %	0 %	0 %	386612021
45	NC_017639	A	6	6	28091	28096	100 %	0 %	0 %	0 %	386612023
46	NC_017639	A	7	7	30144	30150	100 %	0 %	0 %	0 %	386612026
47	NC_017639	A	6	6	31439	31444	100 %	0 %	0 %	0 %	386612027
48	NC_017639	T	7	7	32020	32026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017639	A	6	6	34458	34463	100 %	0 %	0 %	0 %	386612029
50	NC_017639	A	6	6	34493	34498	100 %	0 %	0 %	0 %	386612029
51	NC_017639	T	6	6	34760	34765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017639	T	6	6	35627	35632	0 %	100 %	0 %	0 %	386612030
53	NC_017639	T	7	7	37500	37506	0 %	100 %	0 %	0 %	386612033
54	NC_017639	T	6	6	39619	39624	0 %	100 %	0 %	0 %	386612036
55	NC_017639	A	6	6	39627	39632	100 %	0 %	0 %	0 %	386612036
56	NC_017639	T	6	6	41044	41049	0 %	100 %	0 %	0 %	386612038
57	NC_017639	T	6	6	41262	41267	0 %	100 %	0 %	0 %	386612039
58	NC_017639	T	6	6	41305	41310	0 %	100 %	0 %	0 %	386612039
59	NC_017639	T	7	7	41458	41464	0 %	100 %	0 %	0 %	386612039
60	NC_017639	A	7	7	41492	41498	100 %	0 %	0 %	0 %	386612039
61	NC_017639	T	6	6	41755	41760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017639	C	6	6	41914	41919	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_017639	C	7	7	41938	41944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_017639	A	6	6	42102	42107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017639	C	6	6	43935	43940	0 %	0 %	0 %	100 %	386612041
66	NC_017639	A	6	6	44072	44077	100 %	0 %	0 %	0 %	386612041
67	NC_017639	A	6	6	44084	44089	100 %	0 %	0 %	0 %	386612041
68	NC_017639	A	6	6	44470	44475	100 %	0 %	0 %	0 %	386612041
69	NC_017639	A	8	8	44550	44557	100 %	0 %	0 %	0 %	386612041
70	NC_017639	T	8	8	44601	44608	0 %	100 %	0 %	0 %	386612041
71	NC_017639	A	6	6	44774	44779	100 %	0 %	0 %	0 %	386612041
72	NC_017639	C	6	6	45559	45564	0 %	0 %	0 %	100 %	386612042
73	NC_017639	A	6	6	46187	46192	100 %	0 %	0 %	0 %	386612042
74	NC_017639	A	6	6	46761	46766	100 %	0 %	0 %	0 %	386612042
75	NC_017639	A	6	6	47110	47115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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77	NC_017639	T	6	6	48513	48518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017639	T	6	6	48982	48987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017639	A	6	6	49386	49391	100 %	0 %	0 %	0 %	386612044
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81	NC_017639	T	6	6	51105	51110	0 %	100 %	0 %	0 %	386612046
82	NC_017639	T	6	6	51594	51599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017639	T	6	6	52147	52152	0 %	100 %	0 %	0 %	386612047
84	NC_017639	A	7	7	53135	53141	100 %	0 %	0 %	0 %	386612049
85	NC_017639	A	6	6	53642	53647	100 %	0 %	0 %	0 %	386612050
86	NC_017639	A	6	6	54188	54193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017639	A	6	6	56032	56037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017639	T	6	6	56118	56123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017639	A	6	6	56263	56268	100 %	0 %	0 %	0 %	386612054
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91	NC_017639	T	6	6	58280	58285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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93	NC_017639	A	7	7	59704	59710	100 %	0 %	0 %	0 %	386612058
94	NC_017639	A	6	6	60364	60369	100 %	0 %	0 %	0 %	386612059
95	NC_017639	A	6	6	60656	60661	100 %	0 %	0 %	0 %	386612059
96	NC_017639	T	6	6	62649	62654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017639	A	6	6	62780	62785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017639	A	7	7	66507	66513	100 %	0 %	0 %	0 %	386612065
99	NC_017639	A	6	6	66563	66568	100 %	0 %	0 %	0 %	386612065
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102	NC_017639	T	6	6	68162	68167	0 %	100 %	0 %	0 %	386612067
103	NC_017639	T	6	6	68471	68476	0 %	100 %	0 %	0 %	386612067
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105	NC_017639	T	6	6	70068	70073	0 %	100 %	0 %	0 %	386612069
106	NC_017639	T	8	8	70198	70205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017639	T	7	7	70575	70581	0 %	100 %	0 %	0 %	386612070
108	NC_017639	A	6	6	71078	71083	100 %	0 %	0 %	0 %	386612071
109	NC_017639	A	6	6	71087	71092	100 %	0 %	0 %	0 %	386612071
110	NC_017639	A	6	6	71786	71791	100 %	0 %	0 %	0 %	386612072
111	NC_017639	T	7	7	71820	71826	0 %	100 %	0 %	0 %	386612073
112	NC_017639	G	6	6	73322	73327	0 %	0 %	100 %	0 %	386612074
113	NC_017639	A	6	6	74448	74453	100 %	0 %	0 %	0 %	386612076
114	NC_017639	A	6	6	74813	74818	100 %	0 %	0 %	0 %	386612076
115	NC_017639	A	6	6	74968	74973	100 %	0 %	0 %	0 %	386612077
116	NC_017639	T	6	6	75298	75303	0 %	100 %	0 %	0 %	386612077
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118	NC_017639	A	6	6	77839	77844	100 %	0 %	0 %	0 %	386612079
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121	NC_017639	A	6	6	79739	79744	100 %	0 %	0 %	0 %	386612080
122	NC_017639	A	6	6	80867	80872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017639	T	7	7	81059	81065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017639	A	6	6	81162	81167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.