MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli DH1

Total Repeats: 498

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017638	TCTTT	2	10	11869	11878	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017638	GATGC	2	10	25715	25724	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017638	TAGTG	2	10	75615	75624	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017638	GATGG	2	10	76503	76512	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017638	ATTTT	2	10	77331	77340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017638	GGCAT	2	10	141997	142006	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017638	GTAAG	2	10	142761	142770	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017638	TCCTC	2	10	144481	144490	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017638	AAATT	2	10	157057	157066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017638	TTATC	2	10	167419	167428	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017638	TACGT	2	10	182418	182427	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017638	TGGCC	2	10	184143	184152	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017638	AAATA	2	10	192749	192758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017638	GTCTG	2	10	192834	192843	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017638	CGGTT	2	10	223524	223533	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017638	TTTAA	2	10	238715	238724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017638	CCTTT	2	10	247598	247607	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017638	TCATT	2	10	273223	273232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017638	AGCGC	2	10	276912	276921	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017638	CTTCC	2	10	281398	281407	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_017638	CTGAT	2	10	292295	292304	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017638	TCATT	2	10	294354	294363	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017638	TATAA	2	10	297571	297580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017638	TGTTA	2	10	313212	313221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017638	TTGAT	2	10	314101	314110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017638	CAAAA	2	10	320555	320564	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017638	ATTAG	2	10	320588	320597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017638	TTCCC	2	10	325058	325067	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017638	TGAAC	2	10	350348	350357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017638	TTGCG	2	10	366841	366850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017638	CTTCT	2	10	399780	399789	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017638	GTTTC	2	10	432551	432560	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017638	CTTTT	2	10	436027	436036	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017638	GGAGT	2	10	438724	438733	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017638	GTTTT	2	10	455285	455294	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017638	GAAGA	2	10	461865	461874	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017638	TAAAA	2	10	468764	468773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017638	TCAGG	2	10	469276	469285	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017638	TGAGT	2	10	475625	475634	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017638	CAGGT	2	10	476912	476921	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017638	TCAGG	2	10	505319	505328	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017638	ATTTT	2	10	523625	523634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017638	AAGCG	2	10	543590	543599	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017638	GATGC	2	10	551852	551861	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017638	GTTTC	2	10	558241	558250	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017638	TCATT	2	10	566296	566305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017638	TGTAT	2	10	569387	569396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017638	GTTCT	2	10	570686	570695	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017638	TTTTA	2	10	573646	573655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017638	GTCAG	2	10	599633	599642	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017638	GCAGT	2	10	602858	602867	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017638	GTTAA	2	10	620036	620045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017638	AAACG	2	10	633692	633701	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017638	ACCAA	2	10	644907	644916	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017638	CCAGA	2	10	645331	645340	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017638	TGCTA	2	10	646772	646781	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017638	ATTTG	2	10	648213	648222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017638	TCAAT	2	10	650517	650526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017638	GGAAC	2	10	651706	651715	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017638	CGTAA	2	10	652914	652923	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017638	GCATA	2	10	665108	665117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017638	AGCAA	2	10	665215	665224	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017638	ATATT	2	10	666837	666846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017638	TCATT	2	10	678154	678163	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017638	CAGGG	2	10	693054	693063	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017638	ATAAA	2	10	698282	698291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017638	TCGCG	2	10	698469	698478	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017638	GGCCG	2	10	707030	707039	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017638	ATTTT	2	10	742084	742093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017638	AGCGC	2	10	747503	747512	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017638	ATACA	2	10	754935	754944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017638	GTCGT	2	10	769418	769427	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017638	TTGAG	2	10	770716	770725	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017638	GATGC	2	10	794801	794810	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017638	GATGC	2	10	794894	794903	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017638	ACATA	2	10	825320	825329	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017638	GATGC	2	10	830586	830595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017638	CAAAA	2	10	837329	837338	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017638	TATAT	2	10	842062	842071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017638	TGATG	2	10	848144	848153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017638	ATTTT	2	10	862010	862019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017638	CAGGG	2	10	867059	867068	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017638	AGTAA	2	10	878920	878929	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017638	GCAAC	2	10	946622	946631	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017638	TTCAC	2	10	960592	960601	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017638	AGCGA	2	10	994889	994898	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017638	TAGGG	2	10	994925	994934	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017638	ATGAC	2	10	996629	996638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017638	TATTT	2	10	996692	996701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017638	TTTTC	2	10	1004667	1004676	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017638	TTCTT	2	10	1007410	1007419	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017638	GTACA	2	10	1009946	1009955	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017638	TTATG	2	10	1010103	1010112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017638	GGCGC	2	10	1016420	1016429	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017638	CTTAT	2	10	1021942	1021951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017638	GCATC	2	10	1030893	1030902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017638	AATGT	2	10	1036151	1036160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017638	TAAAA	2	10	1041587	1041596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017638	AGCGT	2	10	1080268	1080277	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017638	TCATT	2	10	1081548	1081557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017638	GATCG	2	10	1086665	1086674	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017638	GTCAT	2	10	1098083	1098092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017638	TGCAG	2	10	1106783	1106792	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017638	GTCGC	2	10	1121848	1121857	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017638	GGGGA	2	10	1167920	1167929	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017638	GAAAT	2	10	1175827	1175836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017638	AATGA	2	10	1175845	1175854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017638	CATGA	2	10	1190998	1191007	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017638	ACGTA	2	10	1192857	1192866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017638	ATTTT	2	10	1201956	1201965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017638	TTTTG	2	10	1202762	1202771	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017638	TATAA	2	10	1206163	1206172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017638	TTCTA	2	10	1209217	1209226	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017638	CTTAC	2	10	1213381	1213390	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017638	GATTA	2	10	1216177	1216186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017638	TTCAA	2	10	1218883	1218892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017638	GAAAA	2	10	1229585	1229594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017638	TGAAA	2	10	1235284	1235293	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017638	CTTCA	2	10	1248138	1248147	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017638	CTTCA	2	10	1248673	1248682	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017638	CTTCA	2	10	1249207	1249216	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017638	TTATC	2	10	1256525	1256534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017638	CTGGT	2	10	1261552	1261561	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017638	TCCAC	2	10	1261809	1261818	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_017638	TCGCT	2	10	1266040	1266049	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017638	TCGAA	2	10	1266097	1266106	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017638	ACCGT	2	10	1267311	1267320	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017638	GCGAT	2	10	1269836	1269845	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017638	CAAAT	2	10	1277004	1277013	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017638	ATTGA	2	10	1279437	1279446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017638	ATTGA	2	10	1281767	1281776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017638	GCGCA	2	10	1283620	1283629	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017638	TTTGC	2	10	1316680	1316689	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017638	GGCGC	2	10	1338736	1338745	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017638	TGCGC	2	10	1347822	1347831	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017638	CAGGA	2	10	1354188	1354197	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017638	GCATC	2	10	1363910	1363919	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017638	TGGCC	2	10	1365029	1365038	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_017638	TTAAT	2	10	1373891	1373900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017638	GATAA	2	10	1384661	1384670	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017638	CGATC	2	10	1391558	1391567	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017638	CTGCA	2	10	1401678	1401687	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017638	CATTA	2	10	1402445	1402454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017638	TCATA	2	10	1415883	1415892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017638	TTATT	2	10	1419092	1419101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017638	ATTTT	2	10	1419326	1419335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017638	CATTG	2	10	1419345	1419354	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017638	TATAT	2	10	1447383	1447392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017638	TGCAT	2	10	1491358	1491367	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_017638	AATTT	2	10	1538687	1538696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017638	CATGC	2	10	1545312	1545321	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_017638	ACAAT	2	10	1554375	1554384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_017638	ATCGA	2	10	1569963	1569972	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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178	NC_017638	ATGCT	2	10	1639705	1639714	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
179	NC_017638	TCCCG	2	10	1654074	1654083	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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181	NC_017638	ATTAA	2	10	1660389	1660398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017638	TGGTT	2	10	1670579	1670588	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_017638	ATTTT	2	10	1788405	1788414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_017638	CATGC	2	10	2502959	2502968	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
263	NC_017638	CATGC	2	10	2503074	2503083	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
264	NC_017638	TTGAG	2	10	2506280	2506289	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017638	AGAGC	2	10	2507589	2507598	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_017638	GCGTC	2	10	2518541	2518550	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
267	NC_017638	AAATA	2	10	2528640	2528649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_017638	CGATA	2	10	2537187	2537196	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_017638	ACTTT	2	10	2556731	2556740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_017638	TATCA	2	10	2575878	2575887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_017638	ATTTT	2	10	2599246	2599255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017638	GTTAA	2	10	2621009	2621018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017638	AAAAT	2	10	2623063	2623072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017638	ATCTT	2	10	2646916	2646925	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_017638	GATAG	2	10	2667560	2667569	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017638	CTACA	2	10	2685128	2685137	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
279	NC_017638	CCAAA	2	10	2687938	2687947	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
280	NC_017638	TCGGT	2	10	2706355	2706364	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
281	NC_017638	TAAGG	2	10	2707520	2707529	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_017638	TTATC	2	10	4333804	4333813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
465	NC_017638	GCAGA	2	10	4338438	4338447	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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467	NC_017638	GACCA	2	10	4339087	4339096	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
468	NC_017638	AGAAA	2	10	4353350	4353359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017638	TAATT	2	10	4361502	4361511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_017638	GCAAA	2	10	4403468	4403477	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
473	NC_017638	GCATC	2	10	4413553	4413562	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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479	NC_017638	CCAGT	2	10	4490411	4490420	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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