MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli DH1

Total Repeats: 2480

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017638	CGCTG	2	10	694	703	0 %	20 %	40 %	40 %	387619776
2	NC_017638	ATTGC	2	10	3397	3406	20 %	40 %	20 %	20 %	387619777
3	NC_017638	CGCAG	2	10	8361	8370	20 %	0 %	40 %	40 %	387619782
4	NC_017638	CGTAC	2	10	9789	9798	20 %	20 %	20 %	40 %	387619783
5	NC_017638	CGCGC	2	10	10776	10785	0 %	0 %	40 %	60 %	387619785
6	NC_017638	CCGAT	2	10	17842	17851	20 %	20 %	20 %	40 %	387619791
7	NC_017638	AGCGA	2	10	18230	18239	40 %	0 %	40 %	20 %	387619791
8	NC_017638	CAGTA	2	10	26674	26683	40 %	20 %	20 %	20 %	387619800
9	NC_017638	GCGCT	2	10	28475	28484	0 %	20 %	40 %	40 %	387619802
10	NC_017638	ATTTA	2	10	29231	29240	40 %	60 %	0 %	0 %	387619803
11	NC_017638	CGATG	2	10	31528	31537	20 %	20 %	40 %	20 %	387619805
12	NC_017638	GCGAA	2	10	32469	32478	40 %	0 %	40 %	20 %	387619805
13	NC_017638	CCGTT	2	10	33363	33372	0 %	40 %	20 %	40 %	387619805
14	NC_017638	CACGG	2	10	33740	33749	20 %	0 %	40 %	40 %	387619805
15	NC_017638	CGAAT	2	10	36450	36459	40 %	20 %	20 %	20 %	387619810
16	NC_017638	CCATG	2	10	37988	37997	20 %	20 %	20 %	40 %	387619811
17	NC_017638	TTCAG	2	10	38170	38179	20 %	40 %	20 %	20 %	387619811
18	NC_017638	CCGTA	2	10	39634	39643	20 %	20 %	20 %	40 %	387619812
19	NC_017638	TTAAA	2	10	40372	40381	60 %	40 %	0 %	0 %	387619812
20	NC_017638	ACCCA	2	10	41115	41124	40 %	0 %	0 %	60 %	387619813
21	NC_017638	TGATC	2	10	42742	42751	20 %	40 %	20 %	20 %	387619814
22	NC_017638	CGGCG	2	10	42991	43000	0 %	0 %	60 %	40 %	387619814
23	NC_017638	AATCA	2	10	43273	43282	60 %	20 %	0 %	20 %	387619815
24	NC_017638	CGGTT	2	10	44228	44237	0 %	40 %	40 %	20 %	387619816
25	NC_017638	TGGCG	2	10	45918	45927	0 %	20 %	60 %	20 %	387619818
26	NC_017638	TGCAC	2	10	47680	47689	20 %	20 %	20 %	40 %	387619819
27	NC_017638	AGGGC	2	10	48765	48774	20 %	0 %	60 %	20 %	387619820
28	NC_017638	GGCGC	2	10	48799	48808	0 %	0 %	60 %	40 %	387619820
29	NC_017638	GAAAC	2	10	49612	49621	60 %	0 %	20 %	20 %	387619820
30	NC_017638	AACGT	2	10	51524	51533	40 %	20 %	20 %	20 %	387619823
31	NC_017638	GCGTC	2	10	54508	54517	0 %	20 %	40 %	40 %	387619826
32	NC_017638	ATGTT	2	10	55322	55331	20 %	60 %	20 %	0 %	387619827
33	NC_017638	CTTCG	2	10	55755	55764	0 %	40 %	20 %	40 %	387619827
34	NC_017638	TGCGT	2	10	56041	56050	0 %	40 %	40 %	20 %	387619827
35	NC_017638	AAAGT	2	10	63166	63175	60 %	20 %	20 %	0 %	387619832
36	NC_017638	GGTGA	2	10	65414	65423	20 %	20 %	60 %	0 %	387619833
37	NC_017638	CAGCG	2	10	66867	66876	20 %	0 %	40 %	40 %	387619835
38	NC_017638	TCGCG	2	10	68137	68146	0 %	20 %	40 %	40 %	387619835
39	NC_017638	GCTGA	2	10	68516	68525	20 %	20 %	40 %	20 %	387619836
40	NC_017638	CTGGA	2	10	78403	78412	20 %	20 %	40 %	20 %	387619842
41	NC_017638	CTGGT	2	10	81696	81705	0 %	40 %	40 %	20 %	387619845
42	NC_017638	GACCG	2	10	82244	82253	20 %	0 %	40 %	40 %	387619846
43	NC_017638	ATGTT	2	10	84793	84802	20 %	60 %	20 %	0 %	387619848
44	NC_017638	AAAAC	2	10	85208	85217	80 %	0 %	0 %	20 %	387619848
45	NC_017638	ATTCC	2	10	85905	85914	20 %	40 %	0 %	40 %	387619849
46	NC_017638	AGTTC	2	10	90998	91007	20 %	40 %	20 %	20 %	387619853
47	NC_017638	CGTGG	2	10	92371	92380	0 %	20 %	60 %	20 %	387619855
48	NC_017638	TATCG	2	10	92878	92887	20 %	40 %	20 %	20 %	387619855
49	NC_017638	GCCTG	2	10	97210	97219	0 %	20 %	40 %	40 %	387619859
50	NC_017638	ACCGT	2	10	99123	99132	20 %	20 %	20 %	40 %	387619860
51	NC_017638	ATCAG	2	10	100896	100905	40 %	20 %	20 %	20 %	387619862
52	NC_017638	AGCCG	2	10	102664	102673	20 %	0 %	40 %	40 %	387619863
53	NC_017638	GCGCA	2	10	104992	105001	20 %	0 %	40 %	40 %	387619865
54	NC_017638	TGGCG	2	10	105986	105995	0 %	20 %	60 %	20 %	387619866
55	NC_017638	CCGGC	2	10	108956	108965	0 %	0 %	40 %	60 %	387619869
56	NC_017638	CGCGG	2	10	112281	112290	0 %	0 %	60 %	40 %	387619872
57	NC_017638	ATCCC	2	10	114525	114534	20 %	20 %	0 %	60 %	387619874
58	NC_017638	CATCG	2	10	114538	114547	20 %	20 %	20 %	40 %	387619874
59	NC_017638	TAACG	2	10	115232	115241	40 %	20 %	20 %	20 %	387619874
60	NC_017638	ATGCC	2	10	115691	115700	20 %	20 %	20 %	40 %	387619874
61	NC_017638	AATGC	2	10	116974	116983	40 %	20 %	20 %	20 %	387619875
62	NC_017638	TCTGT	2	10	117920	117929	0 %	60 %	20 %	20 %	387619877
63	NC_017638	GCATG	2	10	119013	119022	20 %	20 %	40 %	20 %	387619878
64	NC_017638	AGCAG	2	10	120351	120360	40 %	0 %	40 %	20 %	387619880
65	NC_017638	TCAGC	2	10	121219	121228	20 %	20 %	20 %	40 %	387619880
66	NC_017638	CGAAG	2	10	122266	122275	40 %	0 %	40 %	20 %	387619881
67	NC_017638	ACACG	2	10	122399	122408	40 %	0 %	20 %	40 %	387619881
68	NC_017638	TCGCG	2	10	122660	122669	0 %	20 %	40 %	40 %	387619881
69	NC_017638	GCATC	2	10	122750	122759	20 %	20 %	20 %	40 %	387619881
70	NC_017638	GACTG	2	10	124068	124077	20 %	20 %	40 %	20 %	387619882
71	NC_017638	AGAGC	2	10	124478	124487	40 %	0 %	40 %	20 %	387619882
72	NC_017638	AGGCG	2	10	129750	129759	20 %	0 %	60 %	20 %	387619885
73	NC_017638	AGGCG	2	10	129846	129855	20 %	0 %	60 %	20 %	387619885
74	NC_017638	GGTTG	2	10	130503	130512	0 %	40 %	60 %	0 %	387619885
75	NC_017638	TCTGG	2	10	133149	133158	0 %	40 %	40 %	20 %	387619886
76	NC_017638	GGGCA	2	10	134561	134570	20 %	0 %	60 %	20 %	387619887
77	NC_017638	CAGCG	2	10	134840	134849	20 %	0 %	40 %	40 %	387619888
78	NC_017638	GCGCG	2	10	141034	141043	0 %	0 %	60 %	40 %	387619892
79	NC_017638	CCGTC	2	10	141825	141834	0 %	20 %	20 %	60 %	387619893
80	NC_017638	GTGAA	2	10	141835	141844	40 %	20 %	40 %	0 %	387619893
81	NC_017638	GTTCA	2	10	142222	142231	20 %	40 %	20 %	20 %	387619894
82	NC_017638	ATCCA	2	10	142548	142557	40 %	20 %	0 %	40 %	387619894
83	NC_017638	CTTTA	2	10	143811	143820	20 %	60 %	0 %	20 %	387619896
84	NC_017638	TGGCG	2	10	144038	144047	0 %	20 %	60 %	20 %	387619896
85	NC_017638	TTTCA	2	10	146351	146360	20 %	60 %	0 %	20 %	387619899
86	NC_017638	GGGAG	2	10	147676	147685	20 %	0 %	80 %	0 %	387619900
87	NC_017638	GAAAA	2	10	150470	150479	80 %	0 %	20 %	0 %	387619903
88	NC_017638	CAGAC	2	10	150546	150555	40 %	0 %	20 %	40 %	387619903
89	NC_017638	TTTGC	2	10	156616	156625	0 %	60 %	20 %	20 %	387619909
90	NC_017638	GCGAG	2	10	158424	158433	20 %	0 %	60 %	20 %	387619911
91	NC_017638	GGCGT	2	10	158862	158871	0 %	20 %	60 %	20 %	387619911
92	NC_017638	ATCAG	2	10	159500	159509	40 %	20 %	20 %	20 %	387619912
93	NC_017638	ACCAC	2	10	161765	161774	40 %	0 %	0 %	60 %	387619915
94	NC_017638	GGCGT	2	10	163468	163477	0 %	20 %	60 %	20 %	387619916
95	NC_017638	CGACG	2	10	164507	164516	20 %	0 %	40 %	40 %	387619916
96	NC_017638	CTGCG	2	10	166643	166652	0 %	20 %	40 %	40 %	387619917
97	NC_017638	AAAAC	2	10	168494	168503	80 %	0 %	0 %	20 %	387619918
98	NC_017638	TGGTT	2	10	168751	168760	0 %	60 %	40 %	0 %	387619918
99	NC_017638	AACCT	2	10	170832	170841	40 %	20 %	0 %	40 %	387619920
100	NC_017638	TGGTC	2	10	170874	170883	0 %	40 %	40 %	20 %	387619920
101	NC_017638	TGGCG	2	10	172119	172128	0 %	20 %	60 %	20 %	387619921
102	NC_017638	CGGCG	2	10	172749	172758	0 %	0 %	60 %	40 %	387619921
103	NC_017638	CGGCG	2	10	172830	172839	0 %	0 %	60 %	40 %	387619921
104	NC_017638	TTCCA	2	10	173360	173369	20 %	40 %	0 %	40 %	387619921
105	NC_017638	GGTCC	2	10	177806	177815	0 %	20 %	40 %	40 %	387619926
106	NC_017638	ACGGG	2	10	179723	179732	20 %	0 %	60 %	20 %	387619928
107	NC_017638	GTGAT	2	10	181882	181891	20 %	40 %	40 %	0 %	387619929
108	NC_017638	GTGAT	2	10	182173	182182	20 %	40 %	40 %	0 %	387619929
109	NC_017638	CCACG	2	10	184320	184329	20 %	0 %	20 %	60 %	387619932
110	NC_017638	GCCAG	2	10	186605	186614	20 %	0 %	40 %	40 %	387619934
111	NC_017638	GTTCT	2	10	188046	188055	0 %	60 %	20 %	20 %	387619934
112	NC_017638	CTGAA	2	10	190038	190047	40 %	20 %	20 %	20 %	387619936
113	NC_017638	AAGCG	2	10	190102	190111	40 %	0 %	40 %	20 %	387619936
114	NC_017638	TGGTG	2	10	192008	192017	0 %	40 %	60 %	0 %	387619938
115	NC_017638	TGCAC	2	10	192134	192143	20 %	20 %	20 %	40 %	387619938
116	NC_017638	TGCGC	2	10	192527	192536	0 %	20 %	40 %	40 %	387619938
117	NC_017638	CATGG	2	10	194370	194379	20 %	20 %	40 %	20 %	387619940
118	NC_017638	CAGAT	2	10	195409	195418	40 %	20 %	20 %	20 %	387619941
119	NC_017638	ACTTT	2	10	195542	195551	20 %	60 %	0 %	20 %	387619941
120	NC_017638	GACGT	2	10	199462	199471	20 %	20 %	40 %	20 %	387619944
121	NC_017638	CGACG	2	10	201289	201298	20 %	0 %	40 %	40 %	387619946
122	NC_017638	ATGCC	2	10	203857	203866	20 %	20 %	20 %	40 %	387619949
123	NC_017638	GGATG	2	10	204119	204128	20 %	20 %	60 %	0 %	387619949
124	NC_017638	TGGCC	2	10	205183	205192	0 %	20 %	40 %	40 %	387619951
125	NC_017638	GTAAC	2	10	205926	205935	40 %	20 %	20 %	20 %	387619951
126	NC_017638	AGCCG	2	10	206554	206563	20 %	0 %	40 %	40 %	387619951
127	NC_017638	GGTGG	2	10	206663	206672	0 %	20 %	80 %	0 %	387619951
128	NC_017638	ACGGT	2	10	217719	217728	20 %	20 %	40 %	20 %	387619962
129	NC_017638	TGATT	2	10	220561	220570	20 %	60 %	20 %	0 %	387619965
130	NC_017638	TAATT	2	10	232355	232364	40 %	60 %	0 %	0 %	387619972
131	NC_017638	CGCGG	2	10	236338	236347	0 %	0 %	60 %	40 %	387619977
132	NC_017638	AGGGC	2	10	249132	249141	20 %	0 %	60 %	20 %	387619991
133	NC_017638	AGGGA	2	10	249695	249704	40 %	0 %	60 %	0 %	387619991
134	NC_017638	CGATG	2	10	250510	250519	20 %	20 %	40 %	20 %	387619992
135	NC_017638	CAAAA	2	10	252313	252322	80 %	0 %	0 %	20 %	387619995
136	NC_017638	AATGG	2	10	253467	253476	40 %	20 %	40 %	0 %	387619997
137	NC_017638	GATGC	2	10	257137	257146	20 %	20 %	40 %	20 %	387620001
138	NC_017638	TCGCG	2	10	257322	257331	0 %	20 %	40 %	40 %	387620001
139	NC_017638	GTGAT	2	10	260340	260349	20 %	40 %	40 %	0 %	387620004
140	NC_017638	AGCGA	2	10	260902	260911	40 %	0 %	40 %	20 %	387620005
141	NC_017638	TCGCT	2	10	261113	261122	0 %	40 %	20 %	40 %	387620005
142	NC_017638	CGAGG	2	10	267840	267849	20 %	0 %	60 %	20 %	387620015
143	NC_017638	ATGTA	2	10	268617	268626	40 %	40 %	20 %	0 %	387620016
144	NC_017638	ATGGC	2	10	269283	269292	20 %	20 %	40 %	20 %	387620016
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147	NC_017638	GTTGC	2	10	276576	276585	0 %	40 %	40 %	20 %	387620023
148	NC_017638	TCCGG	2	10	280599	280608	0 %	20 %	40 %	40 %	387620029
149	NC_017638	AACAA	2	10	281144	281153	80 %	0 %	0 %	20 %	387620029
150	NC_017638	TTTAC	2	10	285420	285429	20 %	60 %	0 %	20 %	387620032
151	NC_017638	GGCGG	2	10	285745	285754	0 %	0 %	80 %	20 %	387620032
152	NC_017638	TTCTG	2	10	285836	285845	0 %	60 %	20 %	20 %	387620032
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173	NC_017638	ATGGC	2	10	337154	337163	20 %	20 %	40 %	20 %	387620082
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230	NC_017638	GGGCA	2	10	446383	446392	20 %	0 %	60 %	20 %	387620186
231	NC_017638	GTGAT	2	10	447501	447510	20 %	40 %	40 %	0 %	387620187
232	NC_017638	CCAGC	2	10	453451	453460	20 %	0 %	20 %	60 %	387620192
233	NC_017638	TCGAT	2	10	457696	457705	20 %	40 %	20 %	20 %	387620196
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236	NC_017638	GTCGT	2	10	466388	466397	0 %	40 %	40 %	20 %	387620204
237	NC_017638	CGACC	2	10	470026	470035	20 %	0 %	20 %	60 %	387620207
238	NC_017638	CAACA	2	10	475918	475927	60 %	0 %	0 %	40 %	387620212
239	NC_017638	TGCTG	2	10	475997	476006	0 %	40 %	40 %	20 %	387620212
240	NC_017638	TCCGG	2	10	476500	476509	0 %	20 %	40 %	40 %	387620213
241	NC_017638	CCGCA	2	10	481921	481930	20 %	0 %	20 %	60 %	387620220
242	NC_017638	TGACA	2	10	482503	482512	40 %	20 %	20 %	20 %	387620220
243	NC_017638	TTAAG	2	10	484845	484854	40 %	40 %	20 %	0 %	387620221
244	NC_017638	TCAAC	2	10	488231	488240	40 %	20 %	0 %	40 %	387620223
245	NC_017638	CGCTG	2	10	493847	493856	0 %	20 %	40 %	40 %	387620228
246	NC_017638	TTGAT	2	10	499934	499943	20 %	60 %	20 %	0 %	387620234
247	NC_017638	AAATA	2	10	500129	500138	80 %	20 %	0 %	0 %	387620234
248	NC_017638	CTTCT	2	10	502433	502442	0 %	60 %	0 %	40 %	387620236
249	NC_017638	CCAGC	2	10	503327	503336	20 %	0 %	20 %	60 %	387620236
250	NC_017638	GGCGT	2	10	505356	505365	0 %	20 %	60 %	20 %	387620238
251	NC_017638	GAAGC	2	10	505920	505929	40 %	0 %	40 %	20 %	387620238
252	NC_017638	AGGTG	2	10	506969	506978	20 %	20 %	60 %	0 %	387620238
253	NC_017638	ATCGG	2	10	507238	507247	20 %	20 %	40 %	20 %	387620239
254	NC_017638	GCCAC	2	10	511011	511020	20 %	0 %	20 %	60 %	387620242
255	NC_017638	AGACG	2	10	514828	514837	40 %	0 %	40 %	20 %	387620246
256	NC_017638	CAGCG	2	10	517909	517918	20 %	0 %	40 %	40 %	387620250
257	NC_017638	CAGGC	2	10	520039	520048	20 %	0 %	40 %	40 %	387620252
258	NC_017638	GCTGG	2	10	522099	522108	0 %	20 %	60 %	20 %	387620254
259	NC_017638	TATTT	2	10	522697	522706	20 %	80 %	0 %	0 %	387620254
260	NC_017638	GGCGT	2	10	523781	523790	0 %	20 %	60 %	20 %	387620255
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262	NC_017638	TGACC	2	10	525733	525742	20 %	20 %	20 %	40 %	387620255
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