MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	AGCCTC	2	12	1181	1192	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386611789
2	NC_017637	GGCGCT	2	12	2187	2198	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386611791
3	NC_017637	CAGGTG	2	12	2218	2229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386611791
4	NC_017637	GTGGCG	2	12	2308	2319	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386611791
5	NC_017637	GCCGGA	2	12	2559	2570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386611791
6	NC_017637	GGCTGT	2	12	4097	4108	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386611793
7	NC_017637	GATATC	2	12	17080	17091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386611808
8	NC_017637	TATCAA	2	12	23323	23334	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386611813
9	NC_017637	ACCGGT	2	12	29671	29682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386611818
10	NC_017637	CTTTTC	2	12	32094	32105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611819
11	NC_017637	TTCCGG	2	12	32286	32297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611819
12	NC_017637	AGTGTC	2	12	38400	38411	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386611828
13	NC_017637	CGGCAA	2	12	40513	40524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611828
14	NC_017637	TTCGTC	2	12	52562	52573	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386611843
15	NC_017637	CGTAGT	2	12	56228	56239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386611846
16	NC_017637	GTTTAT	2	12	62290	62301	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017637	GTGAAA	2	12	64516	64527	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386611855
18	NC_017637	GGATGG	2	12	65566	65577	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017637	ATAGAT	3	18	66563	66580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386611858
20	NC_017637	AGTACA	2	12	66708	66719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017637	ATGCTC	2	12	69597	69608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386611863
22	NC_017637	TGCTGA	2	12	70784	70795	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017637	AGCCGC	2	12	72776	72787	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017637	TGTTTT	2	12	73215	73226	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017637	TGACAC	2	12	75173	75184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386611868
26	NC_017637	TACGGT	2	12	75430	75441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386611868
27	NC_017637	CGGTGG	2	12	76316	76327	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386611868
28	NC_017637	ACGGAA	2	12	77322	77333	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386611869
29	NC_017637	ATGGGA	2	12	78433	78444	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386611871
30	NC_017637	TTACTG	2	12	78516	78527	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386611871
31	NC_017637	AGTGAA	2	12	78730	78741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386611871
32	NC_017637	ATTTTG	2	12	80572	80583	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386611873
33	NC_017637	GTTGTG	2	12	88631	88642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017637	CCGTAG	2	12	88938	88949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386611882
35	NC_017637	AACAGC	2	12	93127	93138	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386611887

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.