MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	CCGGC	2	10	44	53	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017637	CCGCC	2	10	3565	3574	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_017637	ACTGA	2	10	3613	3622	40 %	20 %	20 %	20 %	386611792
4	NC_017637	CTGGT	2	10	4541	4550	0 %	40 %	40 %	20 %	386611793
5	NC_017637	GGCAC	2	10	5762	5771	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017637	TGACC	2	10	5890	5899	20 %	20 %	20 %	40 %	386611795
7	NC_017637	CCTCT	2	10	7583	7592	0 %	40 %	0 %	60 %	386611796
8	NC_017637	GTTAC	2	10	9643	9652	20 %	40 %	20 %	20 %	386611800
9	NC_017637	GAGCA	2	10	10284	10293	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017637	TTTAT	2	10	10773	10782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017637	ATGAC	2	10	13247	13256	40 %	20 %	20 %	20 %	386611807
12	NC_017637	ATCGT	2	10	13814	13823	20 %	40 %	20 %	20 %	386611807
13	NC_017637	CAGGG	2	10	19447	19456	20 %	0 %	60 %	20 %	386611810
14	NC_017637	ATAGA	2	10	21420	21429	60 %	20 %	20 %	0 %	386611811
15	NC_017637	CATAA	2	10	25545	25554	60 %	20 %	0 %	20 %	386611814
16	NC_017637	TGAGC	2	10	25555	25564	20 %	20 %	40 %	20 %	386611814
17	NC_017637	GTCTG	2	10	26598	26607	0 %	40 %	40 %	20 %	386611815
18	NC_017637	TCTTT	2	10	29819	29828	0 %	80 %	0 %	20 %	386611818
19	NC_017637	ACCGG	2	10	33448	33457	20 %	0 %	40 %	40 %	386611822
20	NC_017637	CCAGT	2	10	42070	42079	20 %	20 %	20 %	40 %	386611831
21	NC_017637	GACAG	2	10	42612	42621	40 %	0 %	40 %	20 %	386611832
22	NC_017637	AAAGG	2	10	44541	44550	60 %	0 %	40 %	0 %	386611834
23	NC_017637	GAAAA	2	10	45586	45595	80 %	0 %	20 %	0 %	386611835
24	NC_017637	CTATA	2	10	50077	50086	40 %	40 %	0 %	20 %	386611839
25	NC_017637	TGACA	2	10	51509	51518	40 %	20 %	20 %	20 %	386611842
26	NC_017637	ATCAC	2	10	54092	54101	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017637	GTTGT	2	10	54482	54491	0 %	60 %	40 %	0 %	386611844
28	NC_017637	ACTGA	2	10	54679	54688	40 %	20 %	20 %	20 %	386611845
29	NC_017637	TCCAG	2	10	56509	56518	20 %	20 %	20 %	40 %	386611846
30	NC_017637	GCTGT	2	10	58801	58810	0 %	40 %	40 %	20 %	386611848
31	NC_017637	TGGTG	2	10	59363	59372	0 %	40 %	60 %	0 %	386611849
32	NC_017637	GAAAA	2	10	60389	60398	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017637	TTGAA	2	10	61356	61365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017637	GCCCG	2	10	61370	61379	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_017637	CAGCA	2	10	62430	62439	40 %	0 %	20 %	40 %	386611853
36	NC_017637	GCTTC	2	10	62481	62490	0 %	40 %	20 %	40 %	386611853
37	NC_017637	TATGG	2	10	62829	62838	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017637	ATTTT	2	10	63394	63403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017637	GAAGA	2	10	63455	63464	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017637	GCAGC	2	10	64610	64619	20 %	0 %	40 %	40 %	386611855
41	NC_017637	GCCGC	2	10	65190	65199	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017637	TCTTT	2	10	68100	68109	0 %	80 %	0 %	20 %	386611861
43	NC_017637	ATTCC	2	10	71687	71696	20 %	40 %	0 %	40 %	386611864
44	NC_017637	TCTTT	2	10	73095	73104	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017637	GTAAA	2	10	73745	73754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017637	GAATG	2	10	75751	75760	40 %	20 %	40 %	0 %	386611868
47	NC_017637	GCAGA	2	10	77522	77531	40 %	0 %	40 %	20 %	386611869
48	NC_017637	TTTAT	2	10	78291	78300	20 %	80 %	0 %	0 %	386611871
49	NC_017637	TGACC	2	10	78484	78493	20 %	20 %	20 %	40 %	386611871
50	NC_017637	CGTTA	2	10	80357	80366	20 %	40 %	20 %	20 %	386611873
51	NC_017637	TAACT	2	10	81332	81341	40 %	40 %	0 %	20 %	386611873
52	NC_017637	TATAA	2	10	81351	81360	60 %	40 %	0 %	0 %	386611873
53	NC_017637	CATAA	2	10	82381	82390	60 %	20 %	0 %	20 %	386611874
54	NC_017637	AATGC	2	10	83205	83214	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017637	TTTCC	2	10	83253	83262	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017637	GCATG	2	10	83903	83912	20 %	20 %	40 %	20 %	386611877
57	NC_017637	GCCAG	2	10	85889	85898	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017637	TGGAG	2	10	88142	88151	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017637	TGTCA	2	10	89561	89570	20 %	40 %	20 %	20 %	386611882
60	NC_017637	CAGCA	2	10	91184	91193	40 %	0 %	20 %	40 %	386611884
61	NC_017637	TGGGA	2	10	92846	92855	20 %	20 %	60 %	0 %	386611886
62	NC_017637	CTTTC	2	10	93471	93480	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017637	CAGAG	2	10	95076	95085	40 %	0 %	40 %	20 %	386611889
64	NC_017637	AGACC	2	10	95107	95116	40 %	0 %	20 %	40 %	386611889
65	NC_017637	GTTCA	2	10	95283	95292	20 %	40 %	20 %	20 %	386611890
66	NC_017637	CGTAC	2	10	95746	95755	20 %	20 %	20 %	40 %	386611890
67	NC_017637	CGCGG	2	10	98516	98525	0 %	0 %	60 %	40 %	386611895
68	NC_017637	ACGGG	2	10	98567	98576	20 %	0 %	60 %	20 %	386611895
69	NC_017637	GCTGG	2	10	99212	99221	0 %	20 %	60 %	20 %	386611896
70	NC_017637	CCGCC	2	10	100885	100894	0 %	0 %	20 %	80 %	386611899
71	NC_017637	GGCAC	2	10	101349	101358	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017637	ACCGT	2	10	101638	101647	20 %	20 %	20 %	40 %	386611900
73	NC_017637	TGTAC	2	10	101873	101882	20 %	40 %	20 %	20 %	386611901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.