MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	CCGGC	2	10	44	53	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017637	CCGCC	2	10	3565	3574	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_017637	GGCAC	2	10	5762	5771	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017637	GAGCA	2	10	10284	10293	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017637	TTTAT	2	10	10773	10782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017637	ATCAC	2	10	54092	54101	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017637	GAAAA	2	10	60389	60398	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017637	TTGAA	2	10	61356	61365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017637	GCCCG	2	10	61370	61379	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_017637	TATGG	2	10	62829	62838	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017637	ATTTT	2	10	63394	63403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017637	GAAGA	2	10	63455	63464	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017637	GCCGC	2	10	65190	65199	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017637	TCTTT	2	10	73095	73104	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017637	GTAAA	2	10	73745	73754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017637	AATGC	2	10	83205	83214	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017637	TTTCC	2	10	83253	83262	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017637	GCCAG	2	10	85889	85898	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017637	TGGAG	2	10	88142	88151	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017637	CTTTC	2	10	93471	93480	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017637	GGCAC	2	10	101349	101358	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.