MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	TCAG	2	8	698	705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017637	GCCT	2	8	6378	6385	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017637	CTAT	2	8	8996	9003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017637	ATAA	2	8	10807	10814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017637	TACA	2	8	11074	11081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017637	AACT	2	8	12639	12646	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017637	ATTT	2	8	20532	20539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017637	AGTT	2	8	21717	21724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017637	GCGG	2	8	21805	21812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017637	TGGT	2	8	21866	21873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017637	TAAT	2	8	22650	22657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017637	AATG	2	8	22677	22684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017637	CAGA	2	8	22849	22856	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017637	CAAA	2	8	23041	23048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017637	TTAA	2	8	25995	26002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017637	ACAG	2	8	44815	44822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017637	GTTT	2	8	44829	44836	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017637	AAAT	2	8	44859	44866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017637	CTGG	2	8	44923	44930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017637	GTTA	2	8	59062	59069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017637	TAAG	2	8	59080	59087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017637	GTTG	2	8	60021	60028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017637	GGCC	2	8	61212	61219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017637	TTTC	2	8	61260	61267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017637	GGAT	2	8	61319	61326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017637	TGCC	2	8	62773	62780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017637	CAAA	2	8	65028	65035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017637	ACCC	2	8	65311	65318	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017637	CCCG	2	8	65344	65351	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_017637	ATCA	2	8	65592	65599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017637	CTGA	2	8	66807	66814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017637	ATAA	2	8	68525	68532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017637	ATTC	2	8	68538	68545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017637	TACT	2	8	68623	68630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017637	GCAG	2	8	70697	70704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017637	TGCT	2	8	70894	70901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017637	TGAT	2	8	71086	71093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017637	ATGG	2	8	71101	71108	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017637	TAGA	2	8	72883	72890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017637	CTTT	2	8	73370	73377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017637	GAAT	2	8	83010	83017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017637	TCAG	2	8	83283	83290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017637	GCAA	2	8	86071	86078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017637	TCGT	2	8	86106	86113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017637	TGTC	2	8	88031	88038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017637	ATCC	2	8	88272	88279	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017637	ATAC	2	8	90471	90478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017637	AACA	2	8	93019	93026	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017637	TGTT	2	8	93721	93728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017637	ACGG	2	8	101829	101836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.