MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	GTAA	2	8	1525	1532	50 %	25 %	25 %	0 %	386611790
2	NC_017637	AAGC	2	8	1631	1638	50 %	0 %	25 %	25 %	386611791
3	NC_017637	CCTG	2	8	1833	1840	0 %	25 %	25 %	50 %	386611791
4	NC_017637	GAAC	2	8	2604	2611	50 %	0 %	25 %	25 %	386611791
5	NC_017637	ACGC	2	8	2901	2908	25 %	0 %	25 %	50 %	386611791
6	NC_017637	GAAG	2	8	3069	3076	50 %	0 %	50 %	0 %	386611791
7	NC_017637	TCAG	2	8	3170	3177	25 %	25 %	25 %	25 %	386611791
8	NC_017637	CAGA	2	8	3505	3512	50 %	0 %	25 %	25 %	386611791
9	NC_017637	TCAC	2	8	3701	3708	25 %	25 %	0 %	50 %	386611792
10	NC_017637	CTTT	2	8	4165	4172	0 %	75 %	0 %	25 %	386611793
11	NC_017637	TGGC	2	8	4269	4276	0 %	25 %	50 %	25 %	386611793
12	NC_017637	CCGT	2	8	4356	4363	0 %	25 %	25 %	50 %	386611793
13	NC_017637	AGCA	2	8	8135	8142	50 %	0 %	25 %	25 %	386611797
14	NC_017637	TCGC	2	8	8887	8894	0 %	25 %	25 %	50 %	386611798
15	NC_017637	CTGG	2	8	9760	9767	0 %	25 %	50 %	25 %	386611800
16	NC_017637	GCTG	2	8	10039	10046	0 %	25 %	50 %	25 %	386611800
17	NC_017637	AGGA	2	8	10113	10120	50 %	0 %	50 %	0 %	386611800
18	NC_017637	TCAC	2	8	10227	10234	25 %	25 %	0 %	50 %	386611800
19	NC_017637	CAGC	2	8	11669	11676	25 %	0 %	25 %	50 %	386611804
20	NC_017637	TGAT	2	8	11773	11780	25 %	50 %	25 %	0 %	386611804
21	NC_017637	CCTG	2	8	12286	12293	0 %	25 %	25 %	50 %	386611805
22	NC_017637	AGTG	2	8	12824	12831	25 %	25 %	50 %	0 %	386611806
23	NC_017637	AAGA	2	8	12842	12849	75 %	0 %	25 %	0 %	386611806
24	NC_017637	TGTT	2	8	13054	13061	0 %	75 %	25 %	0 %	386611806
25	NC_017637	TTCG	2	8	13209	13216	0 %	50 %	25 %	25 %	386611807
26	NC_017637	GGCA	2	8	13481	13488	25 %	0 %	50 %	25 %	386611807
27	NC_017637	TGCC	2	8	13743	13750	0 %	25 %	25 %	50 %	386611807
28	NC_017637	GATG	2	8	14016	14023	25 %	25 %	50 %	0 %	386611807
29	NC_017637	AAAG	2	8	14617	14624	75 %	0 %	25 %	0 %	386611807
30	NC_017637	TTTG	2	8	14880	14887	0 %	75 %	25 %	0 %	386611807
31	NC_017637	GCTG	2	8	14922	14929	0 %	25 %	50 %	25 %	386611807
32	NC_017637	ACAA	2	8	15647	15654	75 %	0 %	0 %	25 %	386611807
33	NC_017637	GAAG	2	8	15757	15764	50 %	0 %	50 %	0 %	386611807
34	NC_017637	GGTT	2	8	15930	15937	0 %	50 %	50 %	0 %	386611808
35	NC_017637	TCAA	2	8	16523	16530	50 %	25 %	0 %	25 %	386611808
36	NC_017637	CGGT	2	8	18492	18499	0 %	25 %	50 %	25 %	386611809
37	NC_017637	GGCT	2	8	18569	18576	0 %	25 %	50 %	25 %	386611809
38	NC_017637	CAGG	2	8	18597	18604	25 %	0 %	50 %	25 %	386611809
39	NC_017637	GTTC	2	8	18624	18631	0 %	50 %	25 %	25 %	386611809
40	NC_017637	GCAG	2	8	19012	19019	25 %	0 %	50 %	25 %	386611809
41	NC_017637	ATCA	2	8	19064	19071	50 %	25 %	0 %	25 %	386611809
42	NC_017637	TTTG	2	8	20966	20973	0 %	75 %	25 %	0 %	386611811
43	NC_017637	AAAT	2	8	21239	21246	75 %	25 %	0 %	0 %	386611811
44	NC_017637	AAAT	2	8	21261	21268	75 %	25 %	0 %	0 %	386611811
45	NC_017637	TCTT	2	8	23515	23522	0 %	75 %	0 %	25 %	386611813
46	NC_017637	ATTA	2	8	23945	23952	50 %	50 %	0 %	0 %	386611814
47	NC_017637	TAAA	2	8	24341	24348	75 %	25 %	0 %	0 %	386611814
48	NC_017637	TAAA	2	8	24796	24803	75 %	25 %	0 %	0 %	386611814
49	NC_017637	CAGC	2	8	24859	24866	25 %	0 %	25 %	50 %	386611814
50	NC_017637	CCAT	2	8	24923	24930	25 %	25 %	0 %	50 %	386611814
51	NC_017637	GGCT	2	8	25252	25259	0 %	25 %	50 %	25 %	386611814
52	NC_017637	GCCA	2	8	26086	26093	25 %	0 %	25 %	50 %	386611815
53	NC_017637	TGGC	2	8	26388	26395	0 %	25 %	50 %	25 %	386611815
54	NC_017637	ATGG	2	8	26571	26578	25 %	25 %	50 %	0 %	386611815
55	NC_017637	TGAT	2	8	26674	26681	25 %	50 %	25 %	0 %	386611816
56	NC_017637	TGAT	2	8	27667	27674	25 %	50 %	25 %	0 %	386611816
57	NC_017637	GCCC	2	8	28513	28520	0 %	0 %	25 %	75 %	386611818
58	NC_017637	GCCT	2	8	29172	29179	0 %	25 %	25 %	50 %	386611818
59	NC_017637	CAGA	2	8	30083	30090	50 %	0 %	25 %	25 %	386611818
60	NC_017637	CCGC	2	8	30572	30579	0 %	0 %	25 %	75 %	386611818
61	NC_017637	GCTG	2	8	30680	30687	0 %	25 %	50 %	25 %	386611818
62	NC_017637	CAGG	2	8	30696	30703	25 %	0 %	50 %	25 %	386611818
63	NC_017637	TCTG	2	8	30737	30744	0 %	50 %	25 %	25 %	386611818
64	NC_017637	GCCA	2	8	30992	30999	25 %	0 %	25 %	50 %	386611818
65	NC_017637	CTGT	2	8	31363	31370	0 %	50 %	25 %	25 %	386611818
66	NC_017637	ATCA	2	8	31574	31581	50 %	25 %	0 %	25 %	386611819
67	NC_017637	ATGA	2	8	31597	31604	50 %	25 %	25 %	0 %	386611819
68	NC_017637	TGGA	2	8	31841	31848	25 %	25 %	50 %	0 %	386611819
69	NC_017637	CAGA	2	8	32039	32046	50 %	0 %	25 %	25 %	386611819
70	NC_017637	GATA	2	8	32698	32705	50 %	25 %	25 %	0 %	386611821
71	NC_017637	CGAT	2	8	33109	33116	25 %	25 %	25 %	25 %	386611822
72	NC_017637	TGGT	2	8	35118	35125	0 %	50 %	50 %	0 %	386611824
73	NC_017637	TTTC	2	8	35548	35555	0 %	75 %	0 %	25 %	386611824
74	NC_017637	GAAC	2	8	35728	35735	50 %	0 %	25 %	25 %	386611825
75	NC_017637	TGGT	2	8	35897	35904	0 %	50 %	50 %	0 %	386611825
76	NC_017637	GCAG	2	8	36388	36395	25 %	0 %	50 %	25 %	386611825
77	NC_017637	GTGC	2	8	36484	36491	0 %	25 %	50 %	25 %	386611825
78	NC_017637	GCTG	2	8	37007	37014	0 %	25 %	50 %	25 %	386611826
79	NC_017637	TTCA	2	8	37317	37324	25 %	50 %	0 %	25 %	386611827
80	NC_017637	GACA	2	8	37426	37433	50 %	0 %	25 %	25 %	386611827
81	NC_017637	GCTC	2	8	37495	37502	0 %	25 %	25 %	50 %	386611827
82	NC_017637	CCTG	2	8	37681	37688	0 %	25 %	25 %	50 %	386611828
83	NC_017637	TCTG	2	8	39077	39084	0 %	50 %	25 %	25 %	386611828
84	NC_017637	AGGA	2	8	39527	39534	50 %	0 %	50 %	0 %	386611828
85	NC_017637	TTTG	2	8	39616	39623	0 %	75 %	25 %	0 %	386611828
86	NC_017637	ATTC	2	8	39691	39698	25 %	50 %	0 %	25 %	386611828
87	NC_017637	TCCA	2	8	40535	40542	25 %	25 %	0 %	50 %	386611828
88	NC_017637	TCTG	2	8	40965	40972	0 %	50 %	25 %	25 %	386611828
89	NC_017637	CAGC	2	8	41231	41238	25 %	0 %	25 %	50 %	386611828
90	NC_017637	CGGG	2	8	41264	41271	0 %	0 %	75 %	25 %	386611828
91	NC_017637	GATG	2	8	41676	41683	25 %	25 %	50 %	0 %	386611830
92	NC_017637	GCAT	2	8	41822	41829	25 %	25 %	25 %	25 %	386611830
93	NC_017637	CTTC	2	8	41915	41922	0 %	50 %	0 %	50 %	386611830
94	NC_017637	CCTG	2	8	42732	42739	0 %	25 %	25 %	50 %	386611832
95	NC_017637	TGCC	2	8	43246	43253	0 %	25 %	25 %	50 %	386611832
96	NC_017637	CCGA	2	8	43274	43281	25 %	0 %	25 %	50 %	386611832
97	NC_017637	TGGT	2	8	43312	43319	0 %	50 %	50 %	0 %	386611832
98	NC_017637	CTTC	2	8	43751	43758	0 %	50 %	0 %	50 %	386611833
99	NC_017637	AGCC	2	8	44000	44007	25 %	0 %	25 %	50 %	386611833
100	NC_017637	GTTC	2	8	44504	44511	0 %	50 %	25 %	25 %	386611834
101	NC_017637	CAGC	2	8	44713	44720	25 %	0 %	25 %	50 %	386611834
102	NC_017637	GATT	2	8	45334	45341	25 %	50 %	25 %	0 %	386611835
103	NC_017637	GAAT	2	8	45702	45709	50 %	25 %	25 %	0 %	386611835
104	NC_017637	ACCT	2	8	46614	46621	25 %	25 %	0 %	50 %	386611836
105	NC_017637	CAAA	2	8	46715	46722	75 %	0 %	0 %	25 %	386611836
106	NC_017637	TCTG	2	8	47205	47212	0 %	50 %	25 %	25 %	386611837
107	NC_017637	ATTT	2	8	47296	47303	25 %	75 %	0 %	0 %	386611837
108	NC_017637	AGCC	2	8	48754	48761	25 %	0 %	25 %	50 %	386611838
109	NC_017637	AACC	2	8	48781	48788	50 %	0 %	0 %	50 %	386611838
110	NC_017637	CAAT	2	8	49541	49548	50 %	25 %	0 %	25 %	386611838
111	NC_017637	CAGA	2	8	49847	49854	50 %	0 %	25 %	25 %	386611839
112	NC_017637	TAAT	2	8	50062	50069	50 %	50 %	0 %	0 %	386611839
113	NC_017637	TGTC	2	8	50342	50349	0 %	50 %	25 %	25 %	386611840
114	NC_017637	TTAT	2	8	50576	50583	25 %	75 %	0 %	0 %	386611840
115	NC_017637	TTTG	2	8	50703	50710	0 %	75 %	25 %	0 %	386611840
116	NC_017637	CGGG	2	8	50729	50736	0 %	0 %	75 %	25 %	386611840
117	NC_017637	ATAA	2	8	50737	50744	75 %	25 %	0 %	0 %	386611840
118	NC_017637	GTTT	2	8	50832	50839	0 %	75 %	25 %	0 %	386611841
119	NC_017637	GTTA	2	8	50935	50942	25 %	50 %	25 %	0 %	386611841
120	NC_017637	TTTC	2	8	51372	51379	0 %	75 %	0 %	25 %	386611841
121	NC_017637	TTTA	2	8	51435	51442	25 %	75 %	0 %	0 %	386611842
122	NC_017637	AGCC	2	8	51695	51702	25 %	0 %	25 %	50 %	386611842
123	NC_017637	CATG	2	8	52657	52664	25 %	25 %	25 %	25 %	386611843
124	NC_017637	GCTG	2	8	52987	52994	0 %	25 %	50 %	25 %	386611843
125	NC_017637	TGTA	2	8	53084	53091	25 %	50 %	25 %	0 %	386611843
126	NC_017637	GGCA	2	8	53353	53360	25 %	0 %	50 %	25 %	386611843
127	NC_017637	CAGA	2	8	53398	53405	50 %	0 %	25 %	25 %	386611843
128	NC_017637	ATGG	2	8	54520	54527	25 %	25 %	50 %	0 %	386611844
129	NC_017637	TCGT	2	8	54976	54983	0 %	50 %	25 %	25 %	386611845
130	NC_017637	GGCA	2	8	55261	55268	25 %	0 %	50 %	25 %	386611845
131	NC_017637	CAGA	2	8	56107	56114	50 %	0 %	25 %	25 %	386611846
132	NC_017637	TCAG	2	8	56904	56911	25 %	25 %	25 %	25 %	386611846
133	NC_017637	TGTT	2	8	57260	57267	0 %	75 %	25 %	0 %	386611846
134	NC_017637	TGCC	2	8	57557	57564	0 %	25 %	25 %	50 %	386611847
135	NC_017637	TGCC	2	8	58219	58226	0 %	25 %	25 %	50 %	386611848
136	NC_017637	ACTG	2	8	58669	58676	25 %	25 %	25 %	25 %	386611848
137	NC_017637	TCCG	2	8	59403	59410	0 %	25 %	25 %	50 %	386611849
138	NC_017637	TTTA	2	8	59544	59551	25 %	75 %	0 %	0 %	386611849
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.