MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	CG	3	6	2211	2216	0 %	0 %	50 %	50 %	386611791
2	NC_017637	TG	4	8	2766	2773	0 %	50 %	50 %	0 %	386611791
3	NC_017637	TG	3	6	3488	3493	0 %	50 %	50 %	0 %	386611791
4	NC_017637	TC	3	6	3854	3859	0 %	50 %	0 %	50 %	386611792
5	NC_017637	AT	3	6	7132	7137	50 %	50 %	0 %	0 %	386611796
6	NC_017637	GC	3	6	8068	8073	0 %	0 %	50 %	50 %	386611797
7	NC_017637	CG	3	6	9250	9255	0 %	0 %	50 %	50 %	386611799
8	NC_017637	CA	3	6	10490	10495	50 %	0 %	0 %	50 %	386611802
9	NC_017637	GA	3	6	11111	11116	50 %	0 %	50 %	0 %	386611803
10	NC_017637	GC	3	6	11463	11468	0 %	0 %	50 %	50 %	386611804
11	NC_017637	TC	3	6	12381	12386	0 %	50 %	0 %	50 %	386611805
12	NC_017637	TC	3	6	12892	12897	0 %	50 %	0 %	50 %	386611806
13	NC_017637	CA	3	6	14676	14681	50 %	0 %	0 %	50 %	386611807
14	NC_017637	CA	3	6	15119	15124	50 %	0 %	0 %	50 %	386611807
15	NC_017637	GA	3	6	17162	17167	50 %	0 %	50 %	0 %	386611808
16	NC_017637	CA	3	6	17380	17385	50 %	0 %	0 %	50 %	386611808
17	NC_017637	CA	3	6	18472	18477	50 %	0 %	0 %	50 %	386611809
18	NC_017637	AG	3	6	18909	18914	50 %	0 %	50 %	0 %	386611809
19	NC_017637	CT	3	6	19696	19701	0 %	50 %	0 %	50 %	386611810
20	NC_017637	TG	3	6	20095	20100	0 %	50 %	50 %	0 %	386611810
21	NC_017637	AT	3	6	20916	20921	50 %	50 %	0 %	0 %	386611811
22	NC_017637	TA	3	6	21173	21178	50 %	50 %	0 %	0 %	386611811
23	NC_017637	AG	3	6	21604	21609	50 %	0 %	50 %	0 %	386611811
24	NC_017637	TG	3	6	23276	23281	0 %	50 %	50 %	0 %	386611813
25	NC_017637	AT	3	6	23373	23378	50 %	50 %	0 %	0 %	386611813
26	NC_017637	AT	4	8	24191	24198	50 %	50 %	0 %	0 %	386611814
27	NC_017637	CT	3	6	25027	25032	0 %	50 %	0 %	50 %	386611814
28	NC_017637	AT	3	6	26929	26934	50 %	50 %	0 %	0 %	386611816
29	NC_017637	GT	3	6	27242	27247	0 %	50 %	50 %	0 %	386611816
30	NC_017637	AG	3	6	28854	28859	50 %	0 %	50 %	0 %	386611818
31	NC_017637	GC	3	6	29298	29303	0 %	0 %	50 %	50 %	386611818
32	NC_017637	AG	3	6	29691	29696	50 %	0 %	50 %	0 %	386611818
33	NC_017637	CA	3	6	29697	29702	50 %	0 %	0 %	50 %	386611818
34	NC_017637	TG	3	6	30596	30601	0 %	50 %	50 %	0 %	386611818
35	NC_017637	AG	3	6	31294	31299	50 %	0 %	50 %	0 %	386611818
36	NC_017637	AG	3	6	31755	31760	50 %	0 %	50 %	0 %	386611819
37	NC_017637	GT	3	6	32177	32182	0 %	50 %	50 %	0 %	386611819
38	NC_017637	TG	3	6	34068	34073	0 %	50 %	50 %	0 %	386611823
39	NC_017637	AT	3	6	34967	34972	50 %	50 %	0 %	0 %	386611824
40	NC_017637	AG	3	6	36235	36240	50 %	0 %	50 %	0 %	386611825
41	NC_017637	GA	3	6	37656	37661	50 %	0 %	50 %	0 %	386611828
42	NC_017637	CT	3	6	38568	38573	0 %	50 %	0 %	50 %	386611828
43	NC_017637	TG	3	6	38703	38708	0 %	50 %	50 %	0 %	386611828
44	NC_017637	GA	3	6	41616	41621	50 %	0 %	50 %	0 %	386611830
45	NC_017637	AT	3	6	41726	41731	50 %	50 %	0 %	0 %	386611830
46	NC_017637	AT	3	6	42537	42542	50 %	50 %	0 %	0 %	386611832
47	NC_017637	AT	3	6	42897	42902	50 %	50 %	0 %	0 %	386611832
48	NC_017637	GA	3	6	44290	44295	50 %	0 %	50 %	0 %	386611833
49	NC_017637	AC	3	6	44609	44614	50 %	0 %	0 %	50 %	386611834
50	NC_017637	GA	3	6	45893	45898	50 %	0 %	50 %	0 %	386611836
51	NC_017637	AT	3	6	47281	47286	50 %	50 %	0 %	0 %	386611837
52	NC_017637	AC	3	6	48319	48324	50 %	0 %	0 %	50 %	386611838
53	NC_017637	AT	3	6	49156	49161	50 %	50 %	0 %	0 %	386611838
54	NC_017637	TA	3	6	49425	49430	50 %	50 %	0 %	0 %	386611838
55	NC_017637	AC	3	6	49741	49746	50 %	0 %	0 %	50 %	386611839
56	NC_017637	TA	3	6	49759	49764	50 %	50 %	0 %	0 %	386611839
57	NC_017637	GT	4	8	50112	50119	0 %	50 %	50 %	0 %	386611839
58	NC_017637	GA	3	6	50226	50231	50 %	0 %	50 %	0 %	386611839
59	NC_017637	CT	3	6	50329	50334	0 %	50 %	0 %	50 %	386611840
60	NC_017637	TG	3	6	50960	50965	0 %	50 %	50 %	0 %	386611841
61	NC_017637	AG	3	6	52281	52286	50 %	0 %	50 %	0 %	386611842
62	NC_017637	GC	3	6	53606	53611	0 %	0 %	50 %	50 %	386611843
63	NC_017637	GA	3	6	53820	53825	50 %	0 %	50 %	0 %	386611843
64	NC_017637	TC	3	6	57220	57225	0 %	50 %	0 %	50 %	386611846
65	NC_017637	CT	3	6	57272	57277	0 %	50 %	0 %	50 %	386611846
66	NC_017637	AT	3	6	59445	59450	50 %	50 %	0 %	0 %	386611849
67	NC_017637	GT	3	6	59666	59671	0 %	50 %	50 %	0 %	386611849
68	NC_017637	CA	3	6	64235	64240	50 %	0 %	0 %	50 %	386611855
69	NC_017637	GC	3	6	64664	64669	0 %	0 %	50 %	50 %	386611855
70	NC_017637	CA	3	6	66287	66292	50 %	0 %	0 %	50 %	386611857
71	NC_017637	TA	3	6	67083	67088	50 %	50 %	0 %	0 %	386611859
72	NC_017637	TA	3	6	67570	67575	50 %	50 %	0 %	0 %	386611860
73	NC_017637	CA	3	6	67645	67650	50 %	0 %	0 %	50 %	386611860
74	NC_017637	TG	3	6	71903	71908	0 %	50 %	50 %	0 %	386611864
75	NC_017637	TG	3	6	72201	72206	0 %	50 %	50 %	0 %	386611864
76	NC_017637	AT	3	6	73528	73533	50 %	50 %	0 %	0 %	386611866
77	NC_017637	TG	4	8	74322	74329	0 %	50 %	50 %	0 %	386611868
78	NC_017637	GT	3	6	75413	75418	0 %	50 %	50 %	0 %	386611868
79	NC_017637	AC	3	6	76622	76627	50 %	0 %	0 %	50 %	386611868
80	NC_017637	AG	3	6	77902	77907	50 %	0 %	50 %	0 %	386611870
81	NC_017637	CG	3	6	80045	80050	0 %	0 %	50 %	50 %	386611873
82	NC_017637	GC	4	8	80420	80427	0 %	0 %	50 %	50 %	386611873
83	NC_017637	AT	3	6	81008	81013	50 %	50 %	0 %	0 %	386611873
84	NC_017637	AG	3	6	81303	81308	50 %	0 %	50 %	0 %	386611873
85	NC_017637	CA	4	8	81889	81896	50 %	0 %	0 %	50 %	386611874
86	NC_017637	GC	3	6	83541	83546	0 %	0 %	50 %	50 %	386611876
87	NC_017637	CA	3	6	84058	84063	50 %	0 %	0 %	50 %	386611877
88	NC_017637	AT	3	6	84691	84696	50 %	50 %	0 %	0 %	386611878
89	NC_017637	CG	3	6	85655	85660	0 %	0 %	50 %	50 %	386611878
90	NC_017637	GC	3	6	86470	86475	0 %	0 %	50 %	50 %	386611879
91	NC_017637	GC	3	6	86680	86685	0 %	0 %	50 %	50 %	386611879
92	NC_017637	TC	3	6	87273	87278	0 %	50 %	0 %	50 %	386611879
93	NC_017637	GA	3	6	87284	87289	50 %	0 %	50 %	0 %	386611879
94	NC_017637	CG	3	6	89170	89175	0 %	0 %	50 %	50 %	386611882
95	NC_017637	GA	3	6	89375	89380	50 %	0 %	50 %	0 %	386611882
96	NC_017637	CT	3	6	89544	89549	0 %	50 %	0 %	50 %	386611882
97	NC_017637	GA	3	6	90138	90143	50 %	0 %	50 %	0 %	386611883
98	NC_017637	AT	3	6	90546	90551	50 %	50 %	0 %	0 %	386611884
99	NC_017637	AT	3	6	91322	91327	50 %	50 %	0 %	0 %	386611884
100	NC_017637	GC	3	6	91561	91566	0 %	0 %	50 %	50 %	386611885
101	NC_017637	AT	3	6	93292	93297	50 %	50 %	0 %	0 %	386611887
102	NC_017637	AG	3	6	93311	93316	50 %	0 %	50 %	0 %	386611887
103	NC_017637	TG	3	6	94595	94600	0 %	50 %	50 %	0 %	386611888
104	NC_017637	GC	3	6	94858	94863	0 %	0 %	50 %	50 %	386611889
105	NC_017637	TG	3	6	95476	95481	0 %	50 %	50 %	0 %	386611890
106	NC_017637	GA	3	6	96083	96088	50 %	0 %	50 %	0 %	386611890
107	NC_017637	GC	3	6	96309	96314	0 %	0 %	50 %	50 %	386611890
108	NC_017637	CA	3	6	96318	96323	50 %	0 %	0 %	50 %	386611890
109	NC_017637	GC	3	6	96687	96692	0 %	0 %	50 %	50 %	386611891
110	NC_017637	GT	3	6	97350	97355	0 %	50 %	50 %	0 %	386611893
111	NC_017637	AC	3	6	97759	97764	50 %	0 %	0 %	50 %	386611894
112	NC_017637	TG	3	6	97964	97969	0 %	50 %	50 %	0 %	386611894
113	NC_017637	CA	3	6	99293	99298	50 %	0 %	0 %	50 %	386611896
114	NC_017637	GC	3	6	99524	99529	0 %	0 %	50 %	50 %	386611897
115	NC_017637	GC	3	6	99889	99894	0 %	0 %	50 %	50 %	386611898
116	NC_017637	TG	3	6	100825	100830	0 %	50 %	50 %	0 %	386611899
117	NC_017637	CT	3	6	101678	101683	0 %	50 %	0 %	50 %	386611900
118	NC_017637	GC	3	6	102105	102110	0 %	0 %	50 %	50 %	386611901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.