MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK2

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017636	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386607295
2	NC_017636	ATC	2	6	103	108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386607295
3	NC_017636	TGA	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386607295
4	NC_017636	TAT	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386607295
5	NC_017636	GAT	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386607295
6	NC_017636	GTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386607295
7	NC_017636	TCT	2	6	287	292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386607295
8	NC_017636	ATC	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386607295
9	NC_017636	ACC	2	6	320	325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386607295
10	NC_017636	GCT	2	6	385	390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386607295
11	NC_017636	TTG	2	6	492	497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386607295
12	NC_017636	TCT	2	6	551	556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386607295
13	NC_017636	TCT	2	6	660	665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386607295
14	NC_017636	TAT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386607295
15	NC_017636	TCT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386607295
16	NC_017636	AAT	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386607295
17	NC_017636	CTT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386607295
18	NC_017636	TAG	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386607295
19	NC_017636	AAT	2	6	877	882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386607295
20	NC_017636	TTC	2	6	911	916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386607295
21	NC_017636	TGA	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017636	GAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017636	GGT	2	6	1120	1125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017636	TGT	2	6	1301	1306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386607296
25	NC_017636	CCA	2	6	1510	1515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017636	CCA	2	6	1556	1561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017636	TTC	2	6	1655	1660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386607297
28	NC_017636	CGC	2	6	1709	1714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386607297
29	NC_017636	CTG	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386607297
30	NC_017636	GCC	2	6	1796	1801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386607297
31	NC_017636	TCA	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386607300
32	NC_017636	TGA	3	9	2275	2283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386607301
33	NC_017636	AAC	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386607301
34	NC_017636	GCG	2	6	2335	2340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386607301
35	NC_017636	CCG	2	6	2393	2398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386607301
36	NC_017636	GGT	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386607301
37	NC_017636	GTC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386607301
38	NC_017636	GAT	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386607301
39	NC_017636	GGT	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386607302
40	NC_017636	GAA	2	6	2679	2684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386607302
41	NC_017636	GAA	2	6	2717	2722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386607302
42	NC_017636	GCC	2	6	2762	2767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386607302
43	NC_017636	GGA	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386607302
44	NC_017636	TAC	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386607302
45	NC_017636	TCC	2	6	3040	3045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386607302
46	NC_017636	CGG	2	6	3221	3226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386607302
47	NC_017636	ACG	2	6	3335	3340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386607302
48	NC_017636	CAG	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386607302
49	NC_017636	GGA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386607302
50	NC_017636	GAT	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386607302
51	NC_017636	GCA	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386607302
52	NC_017636	CGG	2	6	3585	3590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386607302
53	NC_017636	GAA	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386607302
54	NC_017636	GAA	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386607302
55	NC_017636	CAG	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386607302
56	NC_017636	AGC	2	6	3818	3823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386607302
57	NC_017636	AGA	2	6	3881	3886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386607302
58	NC_017636	CAG	2	6	3946	3951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386607302
59	NC_017636	GGT	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386607306
60	NC_017636	TTG	2	6	4245	4250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386607306
61	NC_017636	CTG	2	6	4265	4270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386607306
62	NC_017636	TCA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386607307
63	NC_017636	ATT	2	6	4452	4457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386607307
64	NC_017636	GTT	2	6	4796	4801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386607307
65	NC_017636	AAC	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386607307
66	NC_017636	CAT	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386607307
67	NC_017636	ATG	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386607308
68	NC_017636	GTT	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.