MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli W chromosome

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017635	GAAAAT	2	12	11891	11902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017635	AAGGGA	2	12	86006	86017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017635	TCTCCC	2	12	165900	165911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017635	TCACCC	2	12	165951	165962	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017635	GTAGTG	2	12	200897	200908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017635	GTTTTT	2	12	329337	329348	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017635	AGGGAG	2	12	332117	332128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017635	AGGGAG	2	12	339320	339331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017635	GGGAGA	2	12	339385	339396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017635	TGGAGA	2	12	353252	353263	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017635	GTGCAG	2	12	365392	365403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017635	TAAGGG	2	12	379738	379749	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017635	TGTGGA	2	12	380885	380896	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017635	TTTTCT	2	12	391271	391282	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017635	CTATTT	2	12	392307	392318	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017635	TTTATT	2	12	423954	423965	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017635	TATTGA	2	12	462277	462288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017635	AACAAT	2	12	483359	483370	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017635	TATTGA	2	12	486205	486216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017635	TTTTCA	2	12	550725	550736	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017635	CAGGCG	2	12	569567	569578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017635	TCACCG	2	12	602484	602495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017635	CGCTAC	2	12	602843	602854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017635	AACCGG	2	12	606149	606160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017635	TGCAAA	2	12	683526	683537	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017635	ATTTTT	2	12	779614	779625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017635	CCGTTA	2	12	800397	800408	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017635	CATCAC	2	12	800484	800495	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017635	ATGACC	2	12	800981	800992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017635	TACAGC	2	12	801955	801966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017635	TTTTCT	2	12	865216	865227	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017635	AATATT	2	12	891025	891036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017635	CAGAAG	2	12	969082	969093	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017635	AACCAG	2	12	987582	987593	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017635	CGCTGG	2	12	994669	994680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017635	TAACCG	2	12	1030831	1030842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017635	AAATAA	2	12	1062634	1062645	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017635	AAAGAT	2	12	1095164	1095175	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017635	TGTCCA	2	12	1115963	1115974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017635	TAAGGA	2	12	1138230	1138241	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017635	ATAATG	2	12	1139644	1139655	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017635	AATGAT	2	12	1171617	1171628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017635	GATGGC	2	12	1172004	1172015	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017635	CAAAAA	2	12	1229168	1229179	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017635	TCTTTA	2	12	1304692	1304703	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017635	TTTTGT	2	12	1312357	1312368	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017635	GACAGT	2	12	1314371	1314382	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017635	CACAGG	2	12	1314708	1314719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017635	CAGGCT	2	12	1333145	1333156	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017635	CTTATT	2	12	1384853	1384864	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017635	GGGGGT	2	12	1398969	1398980	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017635	CTGATC	2	12	1401227	1401238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017635	AAAGTT	2	12	1405481	1405492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017635	CTATAA	2	12	1445460	1445471	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017635	ATTTAA	2	12	1507042	1507053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017635	AAGTGA	2	12	1518056	1518067	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017635	AAAAAC	2	12	1664673	1664684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017635	ATTAAT	2	12	1665362	1665373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017635	ACCGTT	2	12	1679545	1679556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017635	TGGTTA	2	12	1688375	1688386	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017635	TTTCTG	2	12	1728898	1728909	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017635	CAAAAA	2	12	1748063	1748074	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017635	TAAATA	2	12	1749863	1749874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017635	TTTTTC	2	12	1751585	1751596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017635	AAAAAC	2	12	1785019	1785030	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017635	CTGTAA	2	12	1798176	1798187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017635	ATACTT	2	12	1887495	1887506	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017635	AAAATA	2	12	1901152	1901163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017635	TGTTTT	2	12	1901785	1901796	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017635	AAGACT	2	12	1902045	1902056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017635	GAACAG	2	12	1949822	1949833	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017635	TATTAC	2	12	2018073	2018084	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017635	TTTCTT	2	12	2038062	2038073	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017635	ATAACC	2	12	2042006	2042017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017635	TCAACG	2	12	2055679	2055690	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017635	ACTGTC	2	12	2085662	2085673	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017635	TTAATG	2	12	2128158	2128169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017635	AATTCA	2	12	2135283	2135294	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017635	TCTTAT	2	12	2149099	2149110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017635	GTGTAT	2	12	2163917	2163928	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017635	ATATTT	2	12	2185343	2185354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017635	CCTGAC	2	12	2197644	2197655	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017635	ACGCTG	2	12	2198163	2198174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017635	ACAGAC	2	12	2202179	2202190	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017635	ATTTTT	2	12	2209389	2209400	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017635	TCCCCC	2	12	2291719	2291730	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
87	NC_017635	GAAAAA	2	12	2366611	2366622	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017635	ATACCG	2	12	2366988	2366999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017635	CCTTAC	2	12	2373060	2373071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017635	CCTTAC	2	12	2373668	2373679	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017635	ACGCAG	2	12	2403564	2403575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017635	TCTTCC	2	12	2433226	2433237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017635	CGCAGG	2	12	2490656	2490667	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017635	CCATGC	2	12	2491226	2491237	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017635	CAGCGT	2	12	2491718	2491729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017635	GCAGTT	2	12	2493223	2493234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017635	CCACTA	2	12	2509755	2509766	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017635	TTACCC	2	12	2540682	2540693	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017635	TAAATG	2	12	2558548	2558559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017635	TGTCAC	2	12	2572182	2572193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017635	AGAAAA	2	12	2582462	2582473	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017635	GTTAAC	2	12	2660648	2660659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017635	GTTAAC	2	12	2660712	2660723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017635	AAATAT	2	12	2663405	2663416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017635	CTGATG	2	12	2679461	2679472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017635	GTTATG	2	12	2697302	2697313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017635	CAAGTG	2	12	2710421	2710432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017635	TCCTTC	2	12	2811009	2811020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017635	TGGACA	2	12	2860638	2860649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017635	CAGTTT	2	12	2875243	2875254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017635	ATTAAC	2	12	2934148	2934159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017635	TCAGCC	2	12	2955596	2955607	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017635	CGGTTT	2	12	3057122	3057133	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017635	GGTTTT	2	12	3071266	3071277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017635	ACAAGA	2	12	3075597	3075608	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017635	ATATTT	2	12	3126257	3126268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017635	AATCAT	2	12	3177464	3177475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017635	AATTTT	2	12	3185175	3185186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017635	ATCGCG	2	12	3238022	3238033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017635	GTAAGG	2	12	3253595	3253606	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017635	GTAAGG	2	12	3253987	3253998	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017635	ACTGAG	2	12	3282110	3282121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017635	TTTTCG	2	12	3337203	3337214	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017635	ATTTAA	2	12	3350403	3350414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017635	TTATAT	2	12	3399459	3399470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_017635	AGTAAA	2	12	4890041	4890052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.