MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli W chromosome

Total Repeats: 536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017635	TTAAT	2	10	23589	23598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017635	ATTTA	2	10	32421	32430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017635	TAGTG	2	10	77289	77298	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017635	ATTTT	2	10	79005	79014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017635	ATCCC	2	10	116083	116092	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017635	CATCG	2	10	116096	116105	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017635	TAACG	2	10	116790	116799	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017635	ATGCC	2	10	117249	117258	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017635	GGCAT	2	10	143304	143313	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017635	GTAAG	2	10	144068	144077	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017635	TCCTC	2	10	145788	145797	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_017635	ACCGC	2	10	150986	150995	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017635	GCGGT	2	10	151005	151014	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017635	AAATT	2	10	158412	158421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017635	TTATC	2	10	168774	168783	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017635	TACGT	2	10	183650	183659	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017635	TGGCC	2	10	185375	185384	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017635	AAATA	2	10	193265	193274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017635	GTCTG	2	10	193350	193359	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017635	TGCGC	2	10	216534	216543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017635	CGGTT	2	10	223994	224003	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017635	AAAAT	2	10	260407	260416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017635	CTAAT	2	10	260623	260632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017635	TTTGT	2	10	260650	260659	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017635	ACTGT	2	10	261678	261687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017635	GATGC	2	10	275215	275224	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017635	AATTA	2	10	285637	285646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017635	CATGC	2	10	294454	294463	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017635	AAGCG	2	10	329571	329580	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017635	GACAG	2	10	346180	346189	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017635	CGAAA	2	10	346468	346477	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017635	ACTTT	2	10	352934	352943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017635	CGATG	2	10	353424	353433	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017635	TGCTT	2	10	362632	362641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017635	TGTTA	2	10	380812	380821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017635	TACCG	2	10	387010	387019	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017635	CGGCA	2	10	387426	387435	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017635	CAAAA	2	10	391295	391304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017635	TTCCC	2	10	395788	395797	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_017635	AAAAT	2	10	396530	396539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017635	TGTCA	2	10	402739	402748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017635	ATTTT	2	10	402803	402812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017635	CGCTT	2	10	424933	424942	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017635	AAGCG	2	10	440242	440251	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017635	TTGCG	2	10	445440	445449	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017635	CTTCT	2	10	475448	475457	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017635	ACGCA	2	10	484802	484811	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017635	GTTTC	2	10	508114	508123	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017635	CTTTT	2	10	511590	511599	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017635	GGAGT	2	10	514287	514296	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017635	TAGTG	2	10	522680	522689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017635	GTTTT	2	10	533109	533118	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017635	GAAGA	2	10	539688	539697	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017635	TCAGG	2	10	547099	547108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017635	TGAGT	2	10	553447	553456	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017635	CAGGT	2	10	554734	554743	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017635	TCAGG	2	10	583141	583150	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017635	ATTTT	2	10	601245	601254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017635	TGGCG	2	10	601399	601408	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017635	GCCCG	2	10	601501	601510	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_017635	TGACC	2	10	603356	603365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017635	AGCGC	2	10	604544	604553	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017635	GAAAA	2	10	605330	605339	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017635	TAAAT	2	10	606430	606439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017635	AAAGT	2	10	606530	606539	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017635	TATTT	2	10	615614	615623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017635	GTTTC	2	10	635708	635717	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017635	CTTGC	2	10	651607	651616	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017635	CCGTA	2	10	664482	664491	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017635	GTCAG	2	10	679743	679752	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017635	GTCAG	2	10	680246	680255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017635	GCAGT	2	10	683471	683480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017635	GTTAA	2	10	700649	700658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017635	AAACG	2	10	714230	714239	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017635	TGCTA	2	10	727310	727319	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017635	ATTTG	2	10	728751	728760	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017635	TCAAT	2	10	731056	731065	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017635	GGAAC	2	10	732245	732254	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017635	CGTAA	2	10	733453	733462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017635	GCATA	2	10	745649	745658	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017635	AGCAA	2	10	745756	745765	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017635	ATATT	2	10	747378	747387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017635	GTTGG	2	10	759589	759598	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017635	CAGGG	2	10	774267	774276	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017635	ATAAA	2	10	779364	779373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017635	TCGCG	2	10	779551	779560	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017635	GCCCG	2	10	799524	799533	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_017635	GCCGC	2	10	800248	800257	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017635	TGACC	2	10	801126	801135	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017635	CGCAC	2	10	801443	801452	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_017635	AGAAA	2	10	823480	823489	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017635	ATTTT	2	10	823760	823769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017635	ATACA	2	10	836330	836339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017635	TATAA	2	10	841242	841251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017635	GTCGT	2	10	850813	850822	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017635	AAGCG	2	10	851373	851382	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017635	AAGCG	2	10	851677	851686	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017635	TTGAG	2	10	852012	852021	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017635	GATGC	2	10	876074	876083	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017635	GATGC	2	10	876167	876176	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017635	ACATA	2	10	906593	906602	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017635	GATGC	2	10	911859	911868	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017635	CAAAA	2	10	918458	918467	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017635	TATAT	2	10	923191	923200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017635	TGATG	2	10	930547	930556	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017635	CAGGG	2	10	949463	949472	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017635	GTTGG	2	10	959434	959443	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017635	TCATG	2	10	969837	969846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017635	AGTAA	2	10	997897	997906	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017635	AGCGC	2	10	1007746	1007755	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017635	GCAAC	2	10	1065652	1065661	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017635	TTCAC	2	10	1079621	1079630	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017635	GATGC	2	10	1101385	1101394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017635	AGCGA	2	10	1114084	1114093	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017635	TAGGG	2	10	1114120	1114129	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017635	ATGAC	2	10	1115824	1115833	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017635	TATTT	2	10	1115887	1115896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017635	TTTTC	2	10	1123861	1123870	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017635	TTATT	2	10	1124671	1124680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017635	TTCTT	2	10	1126604	1126613	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017635	GTACA	2	10	1129140	1129149	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017635	TTATG	2	10	1129297	1129306	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017635	CTTAT	2	10	1139800	1139809	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017635	GCATC	2	10	1148751	1148760	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017635	AATGT	2	10	1154009	1154018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017635	TAAAA	2	10	1158669	1158678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017635	GTAAA	2	10	1171546	1171555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017635	AAGGG	2	10	1189038	1189047	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017635	TCGCT	2	10	1204447	1204456	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017635	TCGCT	2	10	1204628	1204637	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017635	TCGCT	2	10	1204809	1204818	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017635	TCGCT	2	10	1204990	1204999	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017635	TCGCT	2	10	1205171	1205180	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017635	TCGCT	2	10	1205352	1205361	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017635	GATCG	2	10	1217217	1217226	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017635	GTCAT	2	10	1228635	1228644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017635	TGCAG	2	10	1237338	1237347	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017635	GTCGC	2	10	1252405	1252414	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_017635	GATGC	2	10	1273741	1273750	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017635	GGGGA	2	10	1298588	1298597	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017635	CATGA	2	10	1305196	1305205	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017635	ACGTA	2	10	1307055	1307064	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017635	CGGTT	2	10	1312885	1312894	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017635	CAACT	2	10	1314421	1314430	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017635	ATTTT	2	10	1316154	1316163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017635	CTGGT	2	10	1316358	1316367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017635	GGGGT	2	10	1316685	1316694	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017635	TATAA	2	10	1320379	1320388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017635	ACACC	2	10	1322997	1323006	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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151	NC_017635	CTTAC	2	10	1327595	1327604	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_017635	TTCAA	2	10	1333097	1333106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_017635	TGAAA	2	10	1349588	1349597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017635	CTTCA	2	10	1362442	1362451	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
156	NC_017635	CTTCA	2	10	1362978	1362987	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_017635	CTTCA	2	10	1363513	1363522	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
158	NC_017635	TATCT	2	10	1363664	1363673	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_017635	TTATC	2	10	1370830	1370839	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017635	ACCGT	2	10	1381086	1381095	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_017635	CAAAT	2	10	1389779	1389788	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017635	CGTTG	2	10	1406276	1406285	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_017635	TGCGC	2	10	1455034	1455043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
166	NC_017635	GCATC	2	10	1471122	1471131	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
167	NC_017635	TGGCC	2	10	1472241	1472250	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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178	NC_017635	ATTTT	2	10	1551894	1551903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017635	CATTG	2	10	1551913	1551922	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_017635	ACGTA	2	10	1596627	1596636	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_017635	ATTTA	2	10	1665418	1665427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017635	CATGC	2	10	1672043	1672052	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_017635	TTTAA	2	10	1693034	1693043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017635	ATCGA	2	10	1696702	1696711	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_017635	CCCAA	2	10	1728838	1728847	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
193	NC_017635	ATATC	2	10	1738272	1738281	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_017635	AATGA	2	10	2345832	2345841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_017635	GTTGG	2	10	2367749	2367758	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017635	AAAAT	2	10	2384234	2384243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017635	GCAAT	2	10	2394492	2394501	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_017635	GTCAG	2	10	2398561	2398570	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_017635	AAAAT	2	10	2416238	2416247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017635	ATTTT	2	10	2419104	2419113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017635	CCGGC	2	10	2423613	2423622	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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281	NC_017635	ATTTC	2	10	2433109	2433118	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_017635	ATAAA	2	10	2447869	2447878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_017635	AGTTT	2	10	3671988	3671997	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_017635	AGAAA	2	10	3691853	3691862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_017635	ATTTT	2	10	4342009	4342018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_017635	ATTTT	2	10	4365693	4365702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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