MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C chromosome

Total Repeats: 3071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017634	CGCTG	2	10	699	708	0 %	20 %	40 %	40 %	387615346
2	NC_017634	ATTGC	2	10	3402	3411	20 %	40 %	20 %	20 %	387615347
3	NC_017634	CGCAG	2	10	8263	8272	20 %	0 %	40 %	40 %	387615353
4	NC_017634	GTGAA	2	10	8940	8949	40 %	20 %	40 %	0 %	387615353
5	NC_017634	CGTAC	2	10	9691	9700	20 %	20 %	20 %	40 %	387615354
6	NC_017634	CGCGC	2	10	10848	10857	0 %	0 %	40 %	60 %	387615356
7	NC_017634	GTTTC	2	10	11744	11753	0 %	60 %	20 %	20 %	387615357
8	NC_017634	CTGGA	2	10	18117	18126	20 %	20 %	40 %	20 %	387615362
9	NC_017634	AATGT	2	10	18529	18538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017634	ACCAC	2	10	18956	18965	40 %	0 %	0 %	60 %	387615363
11	NC_017634	TCCTT	2	10	19795	19804	0 %	60 %	0 %	40 %	387615363
12	NC_017634	CCGAT	2	10	20487	20496	20 %	20 %	20 %	40 %	387615364
13	NC_017634	GATGC	2	10	27261	27270	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017634	GCGAA	2	10	34380	34389	40 %	0 %	40 %	20 %	387615378
15	NC_017634	CCGTT	2	10	35274	35283	0 %	40 %	20 %	40 %	387615378
16	NC_017634	CACGG	2	10	35651	35660	20 %	0 %	40 %	40 %	387615378
17	NC_017634	GATGC	2	10	36642	36651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017634	CGAAT	2	10	38393	38402	40 %	20 %	20 %	20 %	387615382
19	NC_017634	CCATG	2	10	39930	39939	20 %	20 %	20 %	40 %	387615383
20	NC_017634	CGGTA	2	10	40081	40090	20 %	20 %	40 %	20 %	387615383
21	NC_017634	CCGTA	2	10	41575	41584	20 %	20 %	20 %	40 %	387615384
22	NC_017634	TTAAA	2	10	42313	42322	60 %	40 %	0 %	0 %	387615384
23	NC_017634	ACCCA	2	10	43056	43065	40 %	0 %	0 %	60 %	387615385
24	NC_017634	TTTGA	2	10	44682	44691	20 %	60 %	20 %	0 %	387615386
25	NC_017634	CGGCG	2	10	44933	44942	0 %	0 %	60 %	40 %	387615386
26	NC_017634	AATCA	2	10	45215	45224	60 %	20 %	0 %	20 %	387615387
27	NC_017634	CGGTT	2	10	46170	46179	0 %	40 %	40 %	20 %	387615388
28	NC_017634	TGGCG	2	10	47862	47871	0 %	20 %	60 %	20 %	387615390
29	NC_017634	TGCAC	2	10	49624	49633	20 %	20 %	20 %	40 %	387615391
30	NC_017634	AACGT	2	10	54029	54038	40 %	20 %	20 %	20 %	387615397
31	NC_017634	GCGTC	2	10	57013	57022	0 %	20 %	40 %	40 %	387615400
32	NC_017634	ATGTT	2	10	57827	57836	20 %	60 %	20 %	0 %	387615401
33	NC_017634	AAAGT	2	10	64281	64290	60 %	20 %	20 %	0 %	387615404
34	NC_017634	CAGCG	2	10	67812	67821	20 %	0 %	40 %	40 %	387615407
35	NC_017634	TCGCG	2	10	69082	69091	0 %	20 %	40 %	40 %	387615407
36	NC_017634	TTTTC	2	10	73502	73511	0 %	80 %	0 %	20 %	387615410
37	NC_017634	AAAGC	2	10	73806	73815	60 %	0 %	20 %	20 %	387615411
38	NC_017634	CAGCA	2	10	74443	74452	40 %	0 %	20 %	40 %	387615412
39	NC_017634	TAGTG	2	10	78388	78397	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017634	TTGCT	2	10	78540	78549	0 %	60 %	20 %	20 %	387615416
41	NC_017634	GATGG	2	10	79276	79285	20 %	20 %	60 %	0 %	387615416
42	NC_017634	ATTTT	2	10	80104	80113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017634	GGGAG	2	10	80268	80277	20 %	0 %	80 %	0 %	387615417
44	NC_017634	CGCCA	2	10	80332	80341	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_017634	ACCGG	2	10	81273	81282	20 %	0 %	40 %	40 %	387615419
46	NC_017634	CCTGG	2	10	81529	81538	0 %	20 %	40 %	40 %	387615419
47	NC_017634	ATGCG	2	10	82974	82983	20 %	20 %	40 %	20 %	387615420
48	NC_017634	GACCG	2	10	83796	83805	20 %	0 %	40 %	40 %	387615421
49	NC_017634	ATGTT	2	10	86342	86351	20 %	60 %	20 %	0 %	387615422
50	NC_017634	AAAAC	2	10	86757	86766	80 %	0 %	0 %	20 %	387615422
51	NC_017634	TGCAT	2	10	87284	87293	20 %	40 %	20 %	20 %	387615423
52	NC_017634	ATTCC	2	10	87454	87463	20 %	40 %	0 %	40 %	387615423
53	NC_017634	AGTTC	2	10	92547	92556	20 %	40 %	20 %	20 %	387615427
54	NC_017634	CGTGG	2	10	93920	93929	0 %	20 %	60 %	20 %	387615429
55	NC_017634	TATCG	2	10	94427	94436	20 %	40 %	20 %	20 %	387615429
56	NC_017634	GGGCT	2	10	98299	98308	0 %	20 %	60 %	20 %	387615432
57	NC_017634	GCCTG	2	10	98759	98768	0 %	20 %	40 %	40 %	387615433
58	NC_017634	TCTGG	2	10	100006	100015	0 %	40 %	40 %	20 %	387615434
59	NC_017634	ACCGT	2	10	100672	100681	20 %	20 %	20 %	40 %	387615434
60	NC_017634	ATCAG	2	10	102445	102454	40 %	20 %	20 %	20 %	387615436
61	NC_017634	AGCCG	2	10	104213	104222	20 %	0 %	40 %	40 %	387615437
62	NC_017634	GCGCA	2	10	106541	106550	20 %	0 %	40 %	40 %	387615439
63	NC_017634	CCGGC	2	10	110504	110513	0 %	0 %	40 %	60 %	387615443
64	NC_017634	CGCGG	2	10	113710	113719	0 %	0 %	60 %	40 %	387615446
65	NC_017634	CATCG	2	10	115967	115976	20 %	20 %	20 %	40 %	387615449
66	NC_017634	TAACG	2	10	116661	116670	40 %	20 %	20 %	20 %	387615449
67	NC_017634	AATGC	2	10	118403	118412	40 %	20 %	20 %	20 %	387615450
68	NC_017634	TCTGT	2	10	119350	119359	0 %	60 %	20 %	20 %	387615452
69	NC_017634	GCAGG	2	10	121782	121791	20 %	0 %	60 %	20 %	387615455
70	NC_017634	GTGTT	2	10	122991	123000	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017634	TCATT	2	10	125434	125443	20 %	60 %	0 %	20 %	387615457
72	NC_017634	AATTG	2	10	127139	127148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017634	CGAAG	2	10	127592	127601	40 %	0 %	40 %	20 %	387615462
74	NC_017634	ACACG	2	10	127725	127734	40 %	0 %	20 %	40 %	387615462
75	NC_017634	TCGCG	2	10	127986	127995	0 %	20 %	40 %	40 %	387615462
76	NC_017634	GCATC	2	10	128076	128085	20 %	20 %	20 %	40 %	387615462
77	NC_017634	GACTG	2	10	129394	129403	20 %	20 %	40 %	20 %	387615463
78	NC_017634	AGAGC	2	10	129804	129813	40 %	0 %	40 %	20 %	387615463
79	NC_017634	TCTGG	2	10	138421	138430	0 %	40 %	40 %	20 %	387615467
80	NC_017634	GGGCA	2	10	139832	139841	20 %	0 %	60 %	20 %	387615468
81	NC_017634	ACGAC	2	10	141391	141400	40 %	0 %	20 %	40 %	387615470
82	NC_017634	GCGCG	2	10	146368	146377	0 %	0 %	60 %	40 %	387615473
83	NC_017634	CCGTC	2	10	147159	147168	0 %	20 %	20 %	60 %	387615474
84	NC_017634	GTGAA	2	10	147169	147178	40 %	20 %	40 %	0 %	387615474
85	NC_017634	GTTCA	2	10	147556	147565	20 %	40 %	20 %	20 %	387615475
86	NC_017634	ATCCA	2	10	147882	147891	40 %	20 %	0 %	40 %	387615475
87	NC_017634	GTAAG	2	10	148095	148104	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017634	CTTTA	2	10	149145	149154	20 %	60 %	0 %	20 %	387615477
89	NC_017634	TCCTC	2	10	149815	149824	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_017634	TGGTG	2	10	152986	152995	0 %	40 %	60 %	0 %	387615481
91	NC_017634	GGGAG	2	10	153010	153019	20 %	0 %	80 %	0 %	387615481
92	NC_017634	GTCAA	2	10	155546	155555	40 %	20 %	20 %	20 %	387615484
93	NC_017634	CGCCA	2	10	155784	155793	20 %	0 %	20 %	60 %	387615484
94	NC_017634	GTTGG	2	10	156078	156087	0 %	40 %	60 %	0 %	387615484
95	NC_017634	CTGTA	2	10	156695	156704	20 %	40 %	20 %	20 %	387615485
96	NC_017634	TCCTG	2	10	156855	156864	0 %	40 %	20 %	40 %	387615485
97	NC_017634	ATTTT	2	10	157287	157296	20 %	80 %	0 %	0 %	387615486
98	NC_017634	CATAA	2	10	157554	157563	60 %	20 %	0 %	20 %	387615486
99	NC_017634	TTGTT	2	10	158366	158375	0 %	80 %	20 %	0 %	387615488
100	NC_017634	TTCAA	2	10	158516	158525	40 %	40 %	0 %	20 %	387615488
101	NC_017634	AATTT	2	10	162415	162424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017634	TATAT	2	10	162501	162510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017634	GCGAG	2	10	163772	163781	20 %	0 %	60 %	20 %	387615492
104	NC_017634	TGGCG	2	10	164209	164218	0 %	20 %	60 %	20 %	387615492
105	NC_017634	ACCAC	2	10	167113	167122	40 %	0 %	0 %	60 %	387615496
106	NC_017634	GGCGT	2	10	168816	168825	0 %	20 %	60 %	20 %	387615497
107	NC_017634	CGACG	2	10	169855	169864	20 %	0 %	40 %	40 %	387615497
108	NC_017634	AAAAC	2	10	173740	173749	80 %	0 %	0 %	20 %	387615499
109	NC_017634	TGGTT	2	10	173997	174006	0 %	60 %	40 %	0 %	387615499
110	NC_017634	TGGTC	2	10	176120	176129	0 %	40 %	40 %	20 %	387615501
111	NC_017634	TGGCG	2	10	177365	177374	0 %	20 %	60 %	20 %	387615502
112	NC_017634	CGGCG	2	10	177995	178004	0 %	0 %	60 %	40 %	387615502
113	NC_017634	TTCCA	2	10	178606	178615	20 %	40 %	0 %	40 %	387615502
114	NC_017634	GACCG	2	10	179131	179140	20 %	0 %	40 %	40 %	387615503
115	NC_017634	GGTCC	2	10	182929	182938	0 %	20 %	40 %	40 %	387615507
116	NC_017634	ACGGG	2	10	184846	184855	20 %	0 %	60 %	20 %	387615509
117	NC_017634	TGCGC	2	10	186553	186562	0 %	20 %	40 %	40 %	387615510
118	NC_017634	GTGAT	2	10	187005	187014	20 %	40 %	40 %	0 %	387615510
119	NC_017634	GTGAT	2	10	187296	187305	20 %	40 %	40 %	0 %	387615510
120	NC_017634	TACGT	2	10	187541	187550	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017634	TGGCC	2	10	189230	189239	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017634	ATGGA	2	10	189338	189347	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017634	GCCAG	2	10	190983	190992	20 %	0 %	40 %	40 %	387615514
124	NC_017634	GGCGT	2	10	191821	191830	0 %	20 %	60 %	20 %	387615514
125	NC_017634	GTTCT	2	10	192424	192433	0 %	60 %	20 %	20 %	387615514
126	NC_017634	CTGAA	2	10	194416	194425	40 %	20 %	20 %	20 %	387615516
127	NC_017634	AAGCG	2	10	194480	194489	40 %	0 %	40 %	20 %	387615516
128	NC_017634	TGGTG	2	10	196263	196272	0 %	40 %	60 %	0 %	387615518
129	NC_017634	TGCAC	2	10	196389	196398	20 %	20 %	20 %	40 %	387615518
130	NC_017634	TGCGC	2	10	196782	196791	0 %	20 %	40 %	40 %	387615518
131	NC_017634	GTCTG	2	10	196947	196956	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017634	CATGG	2	10	198483	198492	20 %	20 %	40 %	20 %	387615520
133	NC_017634	CAGAT	2	10	199522	199531	40 %	20 %	20 %	20 %	387615521
134	NC_017634	ACTTT	2	10	199655	199664	20 %	60 %	0 %	20 %	387615521
135	NC_017634	GACGT	2	10	203575	203584	20 %	20 %	40 %	20 %	387615524
136	NC_017634	ATGCC	2	10	207970	207979	20 %	20 %	20 %	40 %	387615529
137	NC_017634	TGGCC	2	10	209296	209305	0 %	20 %	40 %	40 %	387615531
138	NC_017634	ACCGC	2	10	209309	209318	20 %	0 %	20 %	60 %	387615531
139	NC_017634	GGTGG	2	10	210776	210785	0 %	20 %	80 %	0 %	387615531
140	NC_017634	TGGCG	2	10	219514	219523	0 %	20 %	60 %	20 %	387615540
141	NC_017634	TGCGC	2	10	220130	220139	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017634	ACGGT	2	10	221786	221795	20 %	20 %	40 %	20 %	387615542
143	NC_017634	AGCTC	2	10	222474	222483	20 %	20 %	20 %	40 %	387615542
144	NC_017634	TGATT	2	10	224627	224636	20 %	60 %	20 %	0 %	387615545
145	NC_017634	CGGTT	2	10	227590	227599	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017634	GGTGA	2	10	229896	229905	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017634	GTGAA	2	10	236446	236455	40 %	20 %	40 %	0 %	387615552
148	NC_017634	TAATT	2	10	236630	236639	40 %	60 %	0 %	0 %	387615552
149	NC_017634	CGGAG	2	10	240616	240625	20 %	0 %	60 %	20 %	387615557
150	NC_017634	TGATC	2	10	243101	243110	20 %	40 %	20 %	20 %	387615559
151	NC_017634	GGTTC	2	10	243255	243264	0 %	40 %	40 %	20 %	387615560
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153	NC_017634	TCAAC	2	10	245924	245933	40 %	20 %	0 %	40 %	387615561
154	NC_017634	GCGCC	2	10	246312	246321	0 %	0 %	40 %	60 %	387615561
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156	NC_017634	CCAGA	2	10	247896	247905	40 %	0 %	20 %	40 %	387615561
157	NC_017634	TGCGG	2	10	249263	249272	0 %	20 %	60 %	20 %	387615562
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160	NC_017634	GGTTT	2	10	258289	258298	0 %	60 %	40 %	0 %	387615570
161	NC_017634	GCCTT	2	10	260680	260689	0 %	40 %	20 %	40 %	387615572
162	NC_017634	AAATA	2	10	262470	262479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017634	ATATC	2	10	265602	265611	40 %	40 %	0 %	20 %	387615576
164	NC_017634	GATAT	2	10	266629	266638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017634	TACCT	2	10	266824	266833	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_017634	ACAGT	2	10	267043	267052	40 %	20 %	20 %	20 %	387615578
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168	NC_017634	TCAGA	2	10	267526	267535	40 %	20 %	20 %	20 %	387615578
169	NC_017634	GGGAA	2	10	268128	268137	40 %	0 %	60 %	0 %	387615578
170	NC_017634	AAGTA	2	10	268210	268219	60 %	20 %	20 %	0 %	387615578
171	NC_017634	AGATA	2	10	269605	269614	60 %	20 %	20 %	0 %	387615581
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174	NC_017634	TTGGT	2	10	270798	270807	0 %	60 %	40 %	0 %	387615583
175	NC_017634	TGAAC	2	10	275376	275385	40 %	20 %	20 %	20 %	387615587
176	NC_017634	AAACG	2	10	277561	277570	60 %	0 %	20 %	20 %	387615589
177	NC_017634	TGCAT	2	10	279029	279038	20 %	40 %	20 %	20 %	387615591
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179	NC_017634	AGGGA	2	10	281102	281111	40 %	0 %	60 %	0 %	387615592
180	NC_017634	CGATG	2	10	281917	281926	20 %	20 %	40 %	20 %	387615593
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182	NC_017634	AATGG	2	10	284873	284882	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017634	GGGGC	2	10	285768	285777	0 %	0 %	80 %	20 %	387615598
184	NC_017634	GATGC	2	10	289570	289579	20 %	20 %	40 %	20 %	387615602
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195	NC_017634	ACCAA	2	10	301999	302008	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
196	NC_017634	CTGGT	2	10	302119	302128	0 %	40 %	40 %	20 %	387615612
197	NC_017634	ACATT	2	10	302246	302255	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_017634	GCAAT	2	10	303262	303271	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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201	NC_017634	TGTGT	2	10	311104	311113	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
202	NC_017634	TGTTA	2	10	312212	312221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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219	NC_017634	TACCG	2	10	324644	324653	20 %	20 %	20 %	40 %	387615631
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222	NC_017634	ATGTT	2	10	332722	332731	20 %	60 %	20 %	0 %	387615639
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226	NC_017634	AAAAT	2	10	334172	334181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
227	NC_017634	GTTGA	2	10	334666	334675	20 %	40 %	40 %	0 %	387615641
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229	NC_017634	GGTTT	2	10	339387	339396	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_017634	TGAAC	2	10	364545	364554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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258	NC_017634	TGTGT	2	10	381007	381016	0 %	60 %	40 %	0 %	387615679
259	NC_017634	ACACC	2	10	383658	383667	40 %	0 %	0 %	60 %	387615683
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264	NC_017634	CTTCT	2	10	398703	398712	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
265	NC_017634	GATGG	2	10	401310	401319	20 %	20 %	60 %	0 %	387615699
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