MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C chromosome

Total Repeats: 2615

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017634	CGCTG	2	10	699	708	0 %	20 %	40 %	40 %	387615346
2	NC_017634	ATTGC	2	10	3402	3411	20 %	40 %	20 %	20 %	387615347
3	NC_017634	CGCAG	2	10	8263	8272	20 %	0 %	40 %	40 %	387615353
4	NC_017634	GTGAA	2	10	8940	8949	40 %	20 %	40 %	0 %	387615353
5	NC_017634	CGTAC	2	10	9691	9700	20 %	20 %	20 %	40 %	387615354
6	NC_017634	CGCGC	2	10	10848	10857	0 %	0 %	40 %	60 %	387615356
7	NC_017634	GTTTC	2	10	11744	11753	0 %	60 %	20 %	20 %	387615357
8	NC_017634	CTGGA	2	10	18117	18126	20 %	20 %	40 %	20 %	387615362
9	NC_017634	ACCAC	2	10	18956	18965	40 %	0 %	0 %	60 %	387615363
10	NC_017634	TCCTT	2	10	19795	19804	0 %	60 %	0 %	40 %	387615363
11	NC_017634	CCGAT	2	10	20487	20496	20 %	20 %	20 %	40 %	387615364
12	NC_017634	GCGAA	2	10	34380	34389	40 %	0 %	40 %	20 %	387615378
13	NC_017634	CCGTT	2	10	35274	35283	0 %	40 %	20 %	40 %	387615378
14	NC_017634	CACGG	2	10	35651	35660	20 %	0 %	40 %	40 %	387615378
15	NC_017634	CGAAT	2	10	38393	38402	40 %	20 %	20 %	20 %	387615382
16	NC_017634	CCATG	2	10	39930	39939	20 %	20 %	20 %	40 %	387615383
17	NC_017634	CGGTA	2	10	40081	40090	20 %	20 %	40 %	20 %	387615383
18	NC_017634	CCGTA	2	10	41575	41584	20 %	20 %	20 %	40 %	387615384
19	NC_017634	TTAAA	2	10	42313	42322	60 %	40 %	0 %	0 %	387615384
20	NC_017634	ACCCA	2	10	43056	43065	40 %	0 %	0 %	60 %	387615385
21	NC_017634	TTTGA	2	10	44682	44691	20 %	60 %	20 %	0 %	387615386
22	NC_017634	CGGCG	2	10	44933	44942	0 %	0 %	60 %	40 %	387615386
23	NC_017634	AATCA	2	10	45215	45224	60 %	20 %	0 %	20 %	387615387
24	NC_017634	CGGTT	2	10	46170	46179	0 %	40 %	40 %	20 %	387615388
25	NC_017634	TGGCG	2	10	47862	47871	0 %	20 %	60 %	20 %	387615390
26	NC_017634	TGCAC	2	10	49624	49633	20 %	20 %	20 %	40 %	387615391
27	NC_017634	AACGT	2	10	54029	54038	40 %	20 %	20 %	20 %	387615397
28	NC_017634	GCGTC	2	10	57013	57022	0 %	20 %	40 %	40 %	387615400
29	NC_017634	ATGTT	2	10	57827	57836	20 %	60 %	20 %	0 %	387615401
30	NC_017634	AAAGT	2	10	64281	64290	60 %	20 %	20 %	0 %	387615404
31	NC_017634	CAGCG	2	10	67812	67821	20 %	0 %	40 %	40 %	387615407
32	NC_017634	TCGCG	2	10	69082	69091	0 %	20 %	40 %	40 %	387615407
33	NC_017634	TTTTC	2	10	73502	73511	0 %	80 %	0 %	20 %	387615410
34	NC_017634	AAAGC	2	10	73806	73815	60 %	0 %	20 %	20 %	387615411
35	NC_017634	CAGCA	2	10	74443	74452	40 %	0 %	20 %	40 %	387615412
36	NC_017634	TTGCT	2	10	78540	78549	0 %	60 %	20 %	20 %	387615416
37	NC_017634	GATGG	2	10	79276	79285	20 %	20 %	60 %	0 %	387615416
38	NC_017634	GGGAG	2	10	80268	80277	20 %	0 %	80 %	0 %	387615417
39	NC_017634	ACCGG	2	10	81273	81282	20 %	0 %	40 %	40 %	387615419
40	NC_017634	CCTGG	2	10	81529	81538	0 %	20 %	40 %	40 %	387615419
41	NC_017634	ATGCG	2	10	82974	82983	20 %	20 %	40 %	20 %	387615420
42	NC_017634	GACCG	2	10	83796	83805	20 %	0 %	40 %	40 %	387615421
43	NC_017634	ATGTT	2	10	86342	86351	20 %	60 %	20 %	0 %	387615422
44	NC_017634	AAAAC	2	10	86757	86766	80 %	0 %	0 %	20 %	387615422
45	NC_017634	TGCAT	2	10	87284	87293	20 %	40 %	20 %	20 %	387615423
46	NC_017634	ATTCC	2	10	87454	87463	20 %	40 %	0 %	40 %	387615423
47	NC_017634	AGTTC	2	10	92547	92556	20 %	40 %	20 %	20 %	387615427
48	NC_017634	CGTGG	2	10	93920	93929	0 %	20 %	60 %	20 %	387615429
49	NC_017634	TATCG	2	10	94427	94436	20 %	40 %	20 %	20 %	387615429
50	NC_017634	GGGCT	2	10	98299	98308	0 %	20 %	60 %	20 %	387615432
51	NC_017634	GCCTG	2	10	98759	98768	0 %	20 %	40 %	40 %	387615433
52	NC_017634	TCTGG	2	10	100006	100015	0 %	40 %	40 %	20 %	387615434
53	NC_017634	ACCGT	2	10	100672	100681	20 %	20 %	20 %	40 %	387615434
54	NC_017634	ATCAG	2	10	102445	102454	40 %	20 %	20 %	20 %	387615436
55	NC_017634	AGCCG	2	10	104213	104222	20 %	0 %	40 %	40 %	387615437
56	NC_017634	GCGCA	2	10	106541	106550	20 %	0 %	40 %	40 %	387615439
57	NC_017634	CCGGC	2	10	110504	110513	0 %	0 %	40 %	60 %	387615443
58	NC_017634	CGCGG	2	10	113710	113719	0 %	0 %	60 %	40 %	387615446
59	NC_017634	CATCG	2	10	115967	115976	20 %	20 %	20 %	40 %	387615449
60	NC_017634	TAACG	2	10	116661	116670	40 %	20 %	20 %	20 %	387615449
61	NC_017634	AATGC	2	10	118403	118412	40 %	20 %	20 %	20 %	387615450
62	NC_017634	TCTGT	2	10	119350	119359	0 %	60 %	20 %	20 %	387615452
63	NC_017634	GCAGG	2	10	121782	121791	20 %	0 %	60 %	20 %	387615455
64	NC_017634	TCATT	2	10	125434	125443	20 %	60 %	0 %	20 %	387615457
65	NC_017634	CGAAG	2	10	127592	127601	40 %	0 %	40 %	20 %	387615462
66	NC_017634	ACACG	2	10	127725	127734	40 %	0 %	20 %	40 %	387615462
67	NC_017634	TCGCG	2	10	127986	127995	0 %	20 %	40 %	40 %	387615462
68	NC_017634	GCATC	2	10	128076	128085	20 %	20 %	20 %	40 %	387615462
69	NC_017634	GACTG	2	10	129394	129403	20 %	20 %	40 %	20 %	387615463
70	NC_017634	AGAGC	2	10	129804	129813	40 %	0 %	40 %	20 %	387615463
71	NC_017634	TCTGG	2	10	138421	138430	0 %	40 %	40 %	20 %	387615467
72	NC_017634	GGGCA	2	10	139832	139841	20 %	0 %	60 %	20 %	387615468
73	NC_017634	ACGAC	2	10	141391	141400	40 %	0 %	20 %	40 %	387615470
74	NC_017634	GCGCG	2	10	146368	146377	0 %	0 %	60 %	40 %	387615473
75	NC_017634	CCGTC	2	10	147159	147168	0 %	20 %	20 %	60 %	387615474
76	NC_017634	GTGAA	2	10	147169	147178	40 %	20 %	40 %	0 %	387615474
77	NC_017634	GTTCA	2	10	147556	147565	20 %	40 %	20 %	20 %	387615475
78	NC_017634	ATCCA	2	10	147882	147891	40 %	20 %	0 %	40 %	387615475
79	NC_017634	CTTTA	2	10	149145	149154	20 %	60 %	0 %	20 %	387615477
80	NC_017634	TGGTG	2	10	152986	152995	0 %	40 %	60 %	0 %	387615481
81	NC_017634	GGGAG	2	10	153010	153019	20 %	0 %	80 %	0 %	387615481
82	NC_017634	GTCAA	2	10	155546	155555	40 %	20 %	20 %	20 %	387615484
83	NC_017634	CGCCA	2	10	155784	155793	20 %	0 %	20 %	60 %	387615484
84	NC_017634	GTTGG	2	10	156078	156087	0 %	40 %	60 %	0 %	387615484
85	NC_017634	CTGTA	2	10	156695	156704	20 %	40 %	20 %	20 %	387615485
86	NC_017634	TCCTG	2	10	156855	156864	0 %	40 %	20 %	40 %	387615485
87	NC_017634	ATTTT	2	10	157287	157296	20 %	80 %	0 %	0 %	387615486
88	NC_017634	CATAA	2	10	157554	157563	60 %	20 %	0 %	20 %	387615486
89	NC_017634	TTGTT	2	10	158366	158375	0 %	80 %	20 %	0 %	387615488
90	NC_017634	TTCAA	2	10	158516	158525	40 %	40 %	0 %	20 %	387615488
91	NC_017634	GCGAG	2	10	163772	163781	20 %	0 %	60 %	20 %	387615492
92	NC_017634	TGGCG	2	10	164209	164218	0 %	20 %	60 %	20 %	387615492
93	NC_017634	ACCAC	2	10	167113	167122	40 %	0 %	0 %	60 %	387615496
94	NC_017634	GGCGT	2	10	168816	168825	0 %	20 %	60 %	20 %	387615497
95	NC_017634	CGACG	2	10	169855	169864	20 %	0 %	40 %	40 %	387615497
96	NC_017634	AAAAC	2	10	173740	173749	80 %	0 %	0 %	20 %	387615499
97	NC_017634	TGGTT	2	10	173997	174006	0 %	60 %	40 %	0 %	387615499
98	NC_017634	TGGTC	2	10	176120	176129	0 %	40 %	40 %	20 %	387615501
99	NC_017634	TGGCG	2	10	177365	177374	0 %	20 %	60 %	20 %	387615502
100	NC_017634	CGGCG	2	10	177995	178004	0 %	0 %	60 %	40 %	387615502
101	NC_017634	TTCCA	2	10	178606	178615	20 %	40 %	0 %	40 %	387615502
102	NC_017634	GACCG	2	10	179131	179140	20 %	0 %	40 %	40 %	387615503
103	NC_017634	GGTCC	2	10	182929	182938	0 %	20 %	40 %	40 %	387615507
104	NC_017634	ACGGG	2	10	184846	184855	20 %	0 %	60 %	20 %	387615509
105	NC_017634	TGCGC	2	10	186553	186562	0 %	20 %	40 %	40 %	387615510
106	NC_017634	GTGAT	2	10	187005	187014	20 %	40 %	40 %	0 %	387615510
107	NC_017634	GTGAT	2	10	187296	187305	20 %	40 %	40 %	0 %	387615510
108	NC_017634	GCCAG	2	10	190983	190992	20 %	0 %	40 %	40 %	387615514
109	NC_017634	GGCGT	2	10	191821	191830	0 %	20 %	60 %	20 %	387615514
110	NC_017634	GTTCT	2	10	192424	192433	0 %	60 %	20 %	20 %	387615514
111	NC_017634	CTGAA	2	10	194416	194425	40 %	20 %	20 %	20 %	387615516
112	NC_017634	AAGCG	2	10	194480	194489	40 %	0 %	40 %	20 %	387615516
113	NC_017634	TGGTG	2	10	196263	196272	0 %	40 %	60 %	0 %	387615518
114	NC_017634	TGCAC	2	10	196389	196398	20 %	20 %	20 %	40 %	387615518
115	NC_017634	TGCGC	2	10	196782	196791	0 %	20 %	40 %	40 %	387615518
116	NC_017634	CATGG	2	10	198483	198492	20 %	20 %	40 %	20 %	387615520
117	NC_017634	CAGAT	2	10	199522	199531	40 %	20 %	20 %	20 %	387615521
118	NC_017634	ACTTT	2	10	199655	199664	20 %	60 %	0 %	20 %	387615521
119	NC_017634	GACGT	2	10	203575	203584	20 %	20 %	40 %	20 %	387615524
120	NC_017634	ATGCC	2	10	207970	207979	20 %	20 %	20 %	40 %	387615529
121	NC_017634	TGGCC	2	10	209296	209305	0 %	20 %	40 %	40 %	387615531
122	NC_017634	ACCGC	2	10	209309	209318	20 %	0 %	20 %	60 %	387615531
123	NC_017634	GGTGG	2	10	210776	210785	0 %	20 %	80 %	0 %	387615531
124	NC_017634	TGGCG	2	10	219514	219523	0 %	20 %	60 %	20 %	387615540
125	NC_017634	ACGGT	2	10	221786	221795	20 %	20 %	40 %	20 %	387615542
126	NC_017634	AGCTC	2	10	222474	222483	20 %	20 %	20 %	40 %	387615542
127	NC_017634	TGATT	2	10	224627	224636	20 %	60 %	20 %	0 %	387615545
128	NC_017634	GTGAA	2	10	236446	236455	40 %	20 %	40 %	0 %	387615552
129	NC_017634	TAATT	2	10	236630	236639	40 %	60 %	0 %	0 %	387615552
130	NC_017634	CGGAG	2	10	240616	240625	20 %	0 %	60 %	20 %	387615557
131	NC_017634	TGATC	2	10	243101	243110	20 %	40 %	20 %	20 %	387615559
132	NC_017634	GGTTC	2	10	243255	243264	0 %	40 %	40 %	20 %	387615560
133	NC_017634	CCAGA	2	10	244875	244884	40 %	0 %	20 %	40 %	387615561
134	NC_017634	TCAAC	2	10	245924	245933	40 %	20 %	0 %	40 %	387615561
135	NC_017634	GCGCC	2	10	246312	246321	0 %	0 %	40 %	60 %	387615561
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254	NC_017634	GGGCA	2	10	445060	445069	20 %	0 %	60 %	20 %	387615743
255	NC_017634	GTGAT	2	10	446178	446187	20 %	40 %	40 %	0 %	387615744
256	NC_017634	ACCGC	2	10	448235	448244	20 %	0 %	20 %	60 %	387615747
257	NC_017634	CCAGC	2	10	452128	452137	20 %	0 %	20 %	60 %	387615749
258	NC_017634	GTTTT	2	10	453962	453971	0 %	80 %	20 %	0 %	387615752
259	NC_017634	TCGAT	2	10	456373	456382	20 %	40 %	20 %	20 %	387615754
260	NC_017634	CGTTC	2	10	456937	456946	0 %	40 %	20 %	40 %	387615755
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