MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017633	GAAAAT	2	12	10613	10624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017633	TAAAAA	2	12	61788	61799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017633	ACGCGT	2	12	79007	79018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017633	AAGGGA	2	12	87758	87769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017633	TCTCCC	2	12	167862	167873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017633	TCACCC	2	12	167913	167924	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017633	GTAGTG	2	12	203697	203708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017633	TCCATC	2	12	242820	242831	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017633	ACCCGC	2	12	270923	270934	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017633	TCCGCC	2	12	284746	284757	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017633	TGCGCC	2	12	285211	285222	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017633	TGTAAC	2	12	335742	335753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017633	GTGCAG	2	12	354896	354907	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017633	TCTGGT	2	12	361041	361052	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017633	TAAGGG	2	12	371951	371962	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017633	TGTGGA	2	12	373098	373109	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017633	TTTTCT	2	12	382812	382823	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017633	CTATTT	2	12	383848	383859	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017633	TAAATT	2	12	406743	406754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017633	TTTATT	2	12	406852	406863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017633	AACAAT	2	12	468262	468273	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017633	TATTGA	2	12	471107	471118	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017633	TTTTCA	2	12	533472	533483	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017633	CAGGCG	2	12	552315	552326	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017633	GATTAC	2	12	625646	625657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017633	TTGGAA	2	12	638547	638558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017633	TGCAAA	2	12	666283	666294	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017633	ATTTTT	2	12	762090	762101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017633	CAAATA	2	12	817876	817887	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017633	TTTTCT	2	12	846672	846683	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017633	ATGGAA	2	12	852610	852621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017633	ATGGAA	2	12	856474	856485	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017633	AAGTTT	2	12	870530	870541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017633	AATAAA	2	12	877933	877944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017633	AAAAAT	2	12	908954	908965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017633	ATTTTT	2	12	909099	909110	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017633	AATATT	2	12	923205	923216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017633	CAGAAA	2	12	936213	936224	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017633	GGCTGG	2	12	1023961	1023972	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017633	CCTGCG	2	12	1024634	1024645	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017633	ATGTTG	2	12	1024654	1024665	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017633	TAACCG	2	12	1026108	1026119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017633	AAATAA	2	12	1058147	1058158	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017633	CTGGAA	2	12	1067711	1067722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017633	AAAGAT	2	12	1090677	1090688	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017633	TGTCCA	2	12	1114017	1114028	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017633	TAAGGA	2	12	1136285	1136296	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017633	ATAATG	2	12	1137699	1137710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017633	TTCACT	2	12	1197011	1197022	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017633	TTTAGC	2	12	1352635	1352646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017633	TCAGAT	2	12	1355265	1355276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017633	ATGGAA	2	12	1355839	1355850	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017633	TTTTGT	2	12	1358612	1358623	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017633	AGCGAT	2	12	1359013	1359024	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017633	CACAGG	2	12	1360963	1360974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017633	ACGCTT	2	12	1379231	1379242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017633	ACTCGA	2	12	1379251	1379262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017633	CAGGCT	2	12	1379383	1379394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017633	CTTATT	2	12	1433146	1433157	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017633	CAAAAG	2	12	1439041	1439052	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017633	GGGGGT	2	12	1447261	1447272	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017633	CTGATC	2	12	1449519	1449530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017633	CTATAA	2	12	1495785	1495796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017633	TTACAC	2	12	1662163	1662174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017633	CGATAA	2	12	1662295	1662306	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017633	AAAAAC	2	12	1674574	1674585	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017633	TATTGA	2	12	1679758	1679769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017633	GGCTTT	2	12	1680257	1680268	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017633	CAGATA	2	12	1680449	1680460	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017633	CAATGT	2	12	1680547	1680558	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017633	TTCATA	2	12	1686159	1686170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017633	ACCGTT	2	12	1689445	1689456	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017633	TGGTTA	2	12	1698275	1698286	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017633	ACCGCT	2	12	1713297	1713308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017633	TGCTTT	2	12	1738509	1738520	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017633	CAAAAA	2	12	1748874	1748885	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017633	TAAATA	2	12	1750673	1750684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017633	CTCGCC	2	12	1756878	1756889	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017633	ATACTT	2	12	1840486	1840497	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017633	AAAATA	2	12	1854142	1854153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017633	TGTTTT	2	12	1854775	1854786	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017633	AAGACT	2	12	1855035	1855046	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017633	GAACAG	2	12	1902806	1902817	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017633	TATTAC	2	12	1971255	1971266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017633	TTTCTT	2	12	1989270	1989281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017633	ATAAAC	2	12	1993990	1994001	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017633	ACTGTC	2	12	2037646	2037657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017633	AATTCA	2	12	2085986	2085997	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017633	GTTACC	2	12	2127009	2127020	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017633	ATACAA	2	12	2169575	2169586	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017633	TCTTAT	2	12	2178297	2178308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017633	CTGATA	2	12	2271402	2271413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017633	TCCGCC	2	12	2290513	2290524	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017633	TTTTGT	2	12	2357682	2357693	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017633	TCCCCC	2	12	2388071	2388082	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
96	NC_017633	GCCAGC	2	12	2405233	2405244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017633	ATGGCA	2	12	2405701	2405712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017633	GAAAAA	2	12	2436114	2436125	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017633	TCTTCC	2	12	2490633	2490644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017633	CCACTA	2	12	2575223	2575234	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017633	TAAATG	2	12	2633287	2633298	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017633	TGTCAC	2	12	2646921	2646932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017633	ATAAGG	2	12	2650307	2650318	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017633	AGAAAA	2	12	2657978	2657989	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017633	CTGATG	2	12	2711953	2711964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017633	GTTATG	2	12	2729794	2729805	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017633	CAAGTG	2	12	2748256	2748267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017633	GGCGCG	2	12	2813046	2813057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017633	TTTGTG	2	12	2817521	2817532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017633	GCGCTG	2	12	2818028	2818039	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017633	CCATTA	2	12	2844459	2844470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017633	TTGATG	2	12	2867957	2867968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017633	AAAAAC	2	12	2883952	2883963	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017633	TCCTTC	2	12	2892361	2892372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017633	CCCGCC	2	12	2917134	2917145	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
116	NC_017633	TGGACA	2	12	2942420	2942431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017633	CAGTTT	2	12	2999738	2999749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017633	ATTAAC	2	12	3082113	3082124	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017633	ATCTTA	2	12	3150616	3150627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017633	AATCAA	2	12	3178440	3178451	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017633	GCTCGC	2	12	3179296	3179307	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017633	GGTTTT	2	12	3213959	3213970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017633	ACAAGA	2	12	3218290	3218301	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017633	TTTGTT	2	12	3243226	3243237	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017633	AATTTT	2	12	3291001	3291012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017633	ATCGCG	2	12	3343952	3343963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.