MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli ETEC H10407

Total Repeats: 3362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017633	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	387610479
2	NC_017633	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	387610480
3	NC_017633	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	387610485
4	NC_017633	CGTAC	2	10	9788	9797	20 %	20 %	20 %	40 %	387610486
5	NC_017633	CGCGC	2	10	10775	10784	0 %	0 %	40 %	60 %	387610488
6	NC_017633	TCTTT	2	10	11868	11877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017633	CCGAT	2	10	17841	17850	20 %	20 %	20 %	40 %	387610494
8	NC_017633	AGCGA	2	10	18229	18238	40 %	0 %	40 %	20 %	387610494
9	NC_017633	GTTTT	2	10	20647	20656	0 %	80 %	20 %	0 %	387610498
10	NC_017633	TTAAT	2	10	23659	23668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017633	GATGC	2	10	29011	29020	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017633	CAGTA	2	10	29970	29979	40 %	20 %	20 %	20 %	387610506
13	NC_017633	ATTTA	2	10	32527	32536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017633	CGATG	2	10	34824	34833	20 %	20 %	40 %	20 %	387610510
15	NC_017633	GCGAA	2	10	35765	35774	40 %	0 %	40 %	20 %	387610510
16	NC_017633	CCGTT	2	10	36659	36668	0 %	40 %	20 %	40 %	387610510
17	NC_017633	CACGG	2	10	37036	37045	20 %	0 %	40 %	40 %	387610510
18	NC_017633	GATGC	2	10	38028	38037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017633	GATGC	2	10	38118	38127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017633	CGAAT	2	10	39869	39878	40 %	20 %	20 %	20 %	387610514
21	NC_017633	CCATG	2	10	41407	41416	20 %	20 %	20 %	40 %	387610515
22	NC_017633	TTCAG	2	10	41589	41598	20 %	40 %	20 %	20 %	387610515
23	NC_017633	CCGTA	2	10	43053	43062	20 %	20 %	20 %	40 %	387610516
24	NC_017633	GTACA	2	10	43543	43552	40 %	20 %	20 %	20 %	387610516
25	NC_017633	TTAAA	2	10	43791	43800	60 %	40 %	0 %	0 %	387610516
26	NC_017633	ACCCA	2	10	44534	44543	40 %	0 %	0 %	60 %	387610517
27	NC_017633	TTTGA	2	10	46150	46159	20 %	60 %	20 %	0 %	387610518
28	NC_017633	CGGCG	2	10	46401	46410	0 %	0 %	60 %	40 %	387610518
29	NC_017633	AATCA	2	10	46683	46692	60 %	20 %	0 %	20 %	387610519
30	NC_017633	CGGTT	2	10	47638	47647	0 %	40 %	40 %	20 %	387610520
31	NC_017633	TGGCG	2	10	49328	49337	0 %	20 %	60 %	20 %	387610522
32	NC_017633	TGCAC	2	10	51090	51099	20 %	20 %	20 %	40 %	387610523
33	NC_017633	AGGGC	2	10	52175	52184	20 %	0 %	60 %	20 %	387610524
34	NC_017633	GGCGC	2	10	52209	52218	0 %	0 %	60 %	40 %	387610524
35	NC_017633	GAAAC	2	10	53022	53031	60 %	0 %	20 %	20 %	387610524
36	NC_017633	AACGT	2	10	54934	54943	40 %	20 %	20 %	20 %	387610527
37	NC_017633	GCGTC	2	10	57918	57927	0 %	20 %	40 %	40 %	387610530
38	NC_017633	ATGTT	2	10	58732	58741	20 %	60 %	20 %	0 %	387610531
39	NC_017633	CTTCG	2	10	59165	59174	0 %	40 %	20 %	40 %	387610531
40	NC_017633	TGCGT	2	10	59451	59460	0 %	40 %	40 %	20 %	387610531
41	NC_017633	AAAGT	2	10	66592	66601	60 %	20 %	20 %	0 %	387610535
42	NC_017633	GGTGA	2	10	68840	68849	20 %	20 %	60 %	0 %	387610536
43	NC_017633	CAGCG	2	10	70293	70302	20 %	0 %	40 %	40 %	387610538
44	NC_017633	TCGCG	2	10	71563	71572	0 %	20 %	40 %	40 %	387610538
45	NC_017633	GCTGA	2	10	71942	71951	20 %	20 %	40 %	20 %	387610539
46	NC_017633	TAGTG	2	10	79041	79050	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017633	GATGG	2	10	79929	79938	20 %	20 %	60 %	0 %	387610545
48	NC_017633	ATTTT	2	10	80757	80766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017633	CTGGA	2	10	81829	81838	20 %	20 %	40 %	20 %	387610546
50	NC_017633	CTGGT	2	10	85122	85131	0 %	40 %	40 %	20 %	387610549
51	NC_017633	GACCG	2	10	85670	85679	20 %	0 %	40 %	40 %	387610550
52	NC_017633	ATGTT	2	10	88219	88228	20 %	60 %	20 %	0 %	387610552
53	NC_017633	AAAAC	2	10	88634	88643	80 %	0 %	0 %	20 %	387610552
54	NC_017633	ATTCC	2	10	89331	89340	20 %	40 %	0 %	40 %	387610553
55	NC_017633	AGTTC	2	10	94424	94433	20 %	40 %	20 %	20 %	387610557
56	NC_017633	CGTGG	2	10	95797	95806	0 %	20 %	60 %	20 %	387610559
57	NC_017633	TATCG	2	10	96304	96313	20 %	40 %	20 %	20 %	387610559
58	NC_017633	GCCTG	2	10	100636	100645	0 %	20 %	40 %	40 %	387610563
59	NC_017633	ACCGT	2	10	102549	102558	20 %	20 %	20 %	40 %	387610564
60	NC_017633	ATCAG	2	10	104322	104331	40 %	20 %	20 %	20 %	387610566
61	NC_017633	AGCCG	2	10	106090	106099	20 %	0 %	40 %	40 %	387610567
62	NC_017633	GCGCA	2	10	108418	108427	20 %	0 %	40 %	40 %	387610569
63	NC_017633	TGGCG	2	10	109412	109421	0 %	20 %	60 %	20 %	387610570
64	NC_017633	CCGGC	2	10	112382	112391	0 %	0 %	40 %	60 %	387610573
65	NC_017633	CGCGG	2	10	115707	115716	0 %	0 %	60 %	40 %	387610576
66	NC_017633	ATCCC	2	10	117951	117960	20 %	20 %	0 %	60 %	387610579
67	NC_017633	CATCG	2	10	117964	117973	20 %	20 %	20 %	40 %	387610579
68	NC_017633	TAACG	2	10	118658	118667	40 %	20 %	20 %	20 %	387610579
69	NC_017633	ATGCC	2	10	119117	119126	20 %	20 %	20 %	40 %	387610579
70	NC_017633	AATGC	2	10	120400	120409	40 %	20 %	20 %	20 %	387610580
71	NC_017633	TCTGT	2	10	121346	121355	0 %	60 %	20 %	20 %	387610582
72	NC_017633	GCATG	2	10	122439	122448	20 %	20 %	40 %	20 %	387610583
73	NC_017633	AGCAG	2	10	123777	123786	40 %	0 %	40 %	20 %	387610585
74	NC_017633	TCAGC	2	10	124645	124654	20 %	20 %	20 %	40 %	387610585
75	NC_017633	CGAAG	2	10	125692	125701	40 %	0 %	40 %	20 %	387610586
76	NC_017633	ACACG	2	10	125825	125834	40 %	0 %	20 %	40 %	387610586
77	NC_017633	TCGCG	2	10	126086	126095	0 %	20 %	40 %	40 %	387610586
78	NC_017633	GCATC	2	10	126176	126185	20 %	20 %	20 %	40 %	387610586
79	NC_017633	GACTG	2	10	127494	127503	20 %	20 %	40 %	20 %	387610587
80	NC_017633	AGAGC	2	10	127904	127913	40 %	0 %	40 %	20 %	387610587
81	NC_017633	AGGCG	2	10	133068	133077	20 %	0 %	60 %	20 %	387610590
82	NC_017633	GGTTG	2	10	133821	133830	0 %	40 %	60 %	0 %	387610590
83	NC_017633	TCTGG	2	10	136467	136476	0 %	40 %	40 %	20 %	387610591
84	NC_017633	GGGCA	2	10	137878	137887	20 %	0 %	60 %	20 %	387610592
85	NC_017633	CAGCG	2	10	138157	138166	20 %	0 %	40 %	40 %	387610593
86	NC_017633	TTTCG	2	10	140366	140375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017633	GGCTG	2	10	140868	140877	0 %	20 %	60 %	20 %	387610596
88	NC_017633	GCGCG	2	10	144351	144360	0 %	0 %	60 %	40 %	387610597
89	NC_017633	CCGTC	2	10	145142	145151	0 %	20 %	20 %	60 %	387610598
90	NC_017633	GTGAA	2	10	145152	145161	40 %	20 %	40 %	0 %	387610598
91	NC_017633	GGCAT	2	10	145314	145323	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017633	GTTCA	2	10	145539	145548	20 %	40 %	20 %	20 %	387610599
93	NC_017633	ATCCA	2	10	145865	145874	40 %	20 %	0 %	40 %	387610599
94	NC_017633	GTAAG	2	10	146078	146087	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017633	CTTTA	2	10	147128	147137	20 %	60 %	0 %	20 %	387610601
96	NC_017633	TGGCG	2	10	147355	147364	0 %	20 %	60 %	20 %	387610601
97	NC_017633	TCCTC	2	10	147798	147807	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_017633	TTTCA	2	10	149668	149677	20 %	60 %	0 %	20 %	387610604
99	NC_017633	GGGAG	2	10	150993	151002	20 %	0 %	80 %	0 %	387610605
100	NC_017633	GAAAA	2	10	153787	153796	80 %	0 %	20 %	0 %	387610608
101	NC_017633	CAGAC	2	10	153863	153872	40 %	0 %	20 %	40 %	387610608
102	NC_017633	TTTGC	2	10	159933	159942	0 %	60 %	20 %	20 %	387610614
103	NC_017633	AAATT	2	10	160374	160383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017633	GCGAG	2	10	161741	161750	20 %	0 %	60 %	20 %	387610616
105	NC_017633	GGCGT	2	10	162179	162188	0 %	20 %	60 %	20 %	387610616
106	NC_017633	ATCAG	2	10	162817	162826	40 %	20 %	20 %	20 %	387610617
107	NC_017633	ACCAC	2	10	165082	165091	40 %	0 %	0 %	60 %	387610620
108	NC_017633	GGCGT	2	10	166785	166794	0 %	20 %	60 %	20 %	387610621
109	NC_017633	CGACG	2	10	167824	167833	20 %	0 %	40 %	40 %	387610621
110	NC_017633	CTGCG	2	10	169960	169969	0 %	20 %	40 %	40 %	387610622
111	NC_017633	TTATC	2	10	170736	170745	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017633	AAAAC	2	10	171811	171820	80 %	0 %	0 %	20 %	387610623
113	NC_017633	TGGTT	2	10	172068	172077	0 %	60 %	40 %	0 %	387610623
114	NC_017633	AACCT	2	10	174149	174158	40 %	20 %	0 %	40 %	387610625
115	NC_017633	TGGTC	2	10	174191	174200	0 %	40 %	40 %	20 %	387610625
116	NC_017633	TGGCG	2	10	175436	175445	0 %	20 %	60 %	20 %	387610626
117	NC_017633	CGGCG	2	10	176066	176075	0 %	0 %	60 %	40 %	387610626
118	NC_017633	CGGCG	2	10	176147	176156	0 %	0 %	60 %	40 %	387610626
119	NC_017633	TTCCA	2	10	176677	176686	20 %	40 %	0 %	40 %	387610626
120	NC_017633	GGTCC	2	10	181123	181132	0 %	20 %	40 %	40 %	387610631
121	NC_017633	ACGGG	2	10	183040	183049	20 %	0 %	60 %	20 %	387610633
122	NC_017633	GTGAT	2	10	185199	185208	20 %	40 %	40 %	0 %	387610634
123	NC_017633	GTGAT	2	10	185490	185499	20 %	40 %	40 %	0 %	387610634
124	NC_017633	TACGT	2	10	185735	185744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017633	TGGCC	2	10	187459	187468	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017633	CCACG	2	10	187636	187645	20 %	0 %	20 %	60 %	387610637
127	NC_017633	GCCAG	2	10	189921	189930	20 %	0 %	40 %	40 %	387610639
128	NC_017633	GTTCT	2	10	191362	191371	0 %	60 %	20 %	20 %	387610639
129	NC_017633	CTGAA	2	10	193354	193363	40 %	20 %	20 %	20 %	387610641
130	NC_017633	AAGCG	2	10	193418	193427	40 %	0 %	40 %	20 %	387610641
131	NC_017633	TGGTG	2	10	195324	195333	0 %	40 %	60 %	0 %	387610643
132	NC_017633	TGCAC	2	10	195450	195459	20 %	20 %	20 %	40 %	387610643
133	NC_017633	TGCGC	2	10	195843	195852	0 %	20 %	40 %	40 %	387610643
134	NC_017633	AAATA	2	10	196065	196074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017633	GTCTG	2	10	196150	196159	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017633	CATGG	2	10	197686	197695	20 %	20 %	40 %	20 %	387610645
137	NC_017633	CAGAT	2	10	198725	198734	40 %	20 %	20 %	20 %	387610646
138	NC_017633	ACTTT	2	10	198858	198867	20 %	60 %	0 %	20 %	387610646
139	NC_017633	CGACG	2	10	204605	204614	20 %	0 %	40 %	40 %	387610651
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145	NC_017633	AGCCG	2	10	209870	209879	20 %	0 %	40 %	40 %	387610656
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149	NC_017633	ACGGT	2	10	220989	220998	20 %	20 %	40 %	20 %	387610666
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151	NC_017633	CGGTT	2	10	226793	226802	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_017633	CGCGG	2	10	239826	239835	0 %	0 %	60 %	40 %	387610681
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156	NC_017633	AGCGG	2	10	244079	244088	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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257	NC_017633	ATTAG	2	10	382869	382878	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_017633	ATAAA	2	10	388019	388028	80 %	20 %	0 %	0 %	387610839
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268	NC_017633	GGGCA	2	10	401144	401153	20 %	0 %	60 %	20 %	387610850
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276	NC_017633	TGAAC	2	10	412626	412635	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_017633	TTGCG	2	10	428919	428928	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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395	NC_017633	GTTTC	2	10	621519	621528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
396	NC_017633	TATTT	2	10	622710	622719	20 %	80 %	0 %	0 %	387611057
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