MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407

Total Repeats: 576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017633	TCTTT	2	10	11868	11877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017633	TTAAT	2	10	23659	23668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017633	GATGC	2	10	29011	29020	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017633	ATTTA	2	10	32527	32536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017633	GATGC	2	10	38028	38037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017633	GATGC	2	10	38118	38127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017633	TAGTG	2	10	79041	79050	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017633	ATTTT	2	10	80757	80766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017633	TTTCG	2	10	140366	140375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017633	GGCAT	2	10	145314	145323	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017633	GTAAG	2	10	146078	146087	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017633	TCCTC	2	10	147798	147807	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017633	AAATT	2	10	160374	160383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017633	TTATC	2	10	170736	170745	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017633	TACGT	2	10	185735	185744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017633	TGGCC	2	10	187459	187468	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017633	AAATA	2	10	196065	196074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017633	GTCTG	2	10	196150	196159	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017633	TGCGC	2	10	219334	219343	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017633	CGGTT	2	10	226793	226802	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017633	GTGAT	2	10	243111	243120	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017633	AGCGG	2	10	244079	244088	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017633	TTCAT	2	10	259919	259928	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017633	TAATT	2	10	259947	259956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017633	CGTTC	2	10	263636	263645	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017633	AAAAG	2	10	273336	273345	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017633	CCTTT	2	10	282886	282895	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017633	AGGGC	2	10	284420	284429	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017633	AGGGA	2	10	284983	284992	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017633	CTTCG	2	10	300903	300912	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017633	TAAAT	2	10	301341	301350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017633	AAATT	2	10	302989	302998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017633	GGCCT	2	10	311552	311561	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017633	GAGGG	2	10	314073	314082	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017633	CCATT	2	10	336863	336872	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017633	GTCTG	2	10	361254	361263	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017633	TGTTA	2	10	373025	373034	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017633	TTGAT	2	10	373914	373923	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017633	CAAAA	2	10	382836	382845	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017633	ATTAG	2	10	382869	382878	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017633	TTCCC	2	10	387339	387348	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017633	TGAAC	2	10	412626	412635	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017633	TTGCG	2	10	428919	428928	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017633	CTTCT	2	10	460351	460360	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017633	GTTTC	2	10	493121	493130	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017633	CTTTT	2	10	496597	496606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017633	GGAGT	2	10	499294	499303	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017633	GTTTT	2	10	515855	515864	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017633	GAAGA	2	10	522435	522444	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017633	TAAAA	2	10	529334	529343	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017633	TGAGT	2	10	536195	536204	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017633	CAGGT	2	10	537482	537491	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017633	TCAGG	2	10	565889	565898	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017633	ATTTT	2	10	584195	584204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017633	GTCTG	2	10	590253	590262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017633	TATTT	2	10	601268	601277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017633	AAGCG	2	10	606868	606877	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017633	GATGC	2	10	615130	615139	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017633	GTTTC	2	10	621519	621528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017633	CTCCC	2	10	639463	639472	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
61	NC_017633	CCGTA	2	10	646257	646266	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017633	GTCAG	2	10	663003	663012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017633	GCAGT	2	10	666228	666237	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017633	GTTAA	2	10	683406	683415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017633	TGCTA	2	10	710141	710150	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017633	ATTTG	2	10	711582	711591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017633	TCAAT	2	10	713887	713896	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017633	GGAAC	2	10	715076	715085	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017633	CGTAA	2	10	716284	716293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017633	GCATA	2	10	728478	728487	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017633	AGCAA	2	10	728585	728594	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017633	ATATT	2	10	731529	731538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017633	CAGGG	2	10	756547	756556	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017633	ATAAA	2	10	761840	761849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017633	TCGCG	2	10	762027	762036	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017633	GGCCG	2	10	770588	770597	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017633	ATTTA	2	10	774639	774648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017633	TATAA	2	10	822796	822805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017633	GTCGT	2	10	832400	832409	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017633	GCCAG	2	10	851561	851570	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017633	ATCAC	2	10	856184	856193	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017633	GATGC	2	10	860635	860644	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017633	GATGC	2	10	860728	860737	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017633	AAAAT	2	10	862231	862240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017633	GTTGG	2	10	863842	863851	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017633	ATACT	2	10	908440	908449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017633	ACATA	2	10	939550	939559	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017633	GATGC	2	10	944816	944825	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017633	CAAAA	2	10	951559	951568	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017633	TATAT	2	10	956292	956301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017633	TGATG	2	10	962374	962383	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017633	CAGGG	2	10	981290	981299	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017633	AGTAA	2	10	993151	993160	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017633	ATGGC	2	10	1024347	1024356	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017633	TCGCT	2	10	1029130	1029139	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017633	TCGCT	2	10	1029307	1029316	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017633	GCAAC	2	10	1061165	1061174	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017633	TTCAC	2	10	1075135	1075144	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017633	GTCTG	2	10	1105555	1105564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017633	CGAAT	2	10	1108260	1108269	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017633	AGCGA	2	10	1112138	1112147	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017633	TAGGG	2	10	1112174	1112183	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017633	ATGAC	2	10	1113878	1113887	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017633	TATTT	2	10	1113941	1113950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017633	TTTTC	2	10	1121916	1121925	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017633	TTATT	2	10	1122726	1122735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017633	TTCTT	2	10	1124659	1124668	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017633	GTACA	2	10	1127195	1127204	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017633	TTATG	2	10	1127352	1127361	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017633	CTTAT	2	10	1137855	1137864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017633	GCATC	2	10	1146806	1146815	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017633	TAAAA	2	10	1156723	1156732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017633	AGCGT	2	10	1195405	1195414	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017633	TCGCT	2	10	1202509	1202518	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017633	TCGCT	2	10	1202689	1202698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017633	GATCG	2	10	1214554	1214563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017633	GTCAT	2	10	1226749	1226758	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017633	TGCAG	2	10	1235450	1235459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017633	ATTTC	2	10	1294877	1294886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017633	AGGAG	2	10	1298832	1298841	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017633	GTTTT	2	10	1300805	1300814	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017633	AAAAC	2	10	1306591	1306600	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017633	AATAA	2	10	1307105	1307114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017633	GTCTG	2	10	1314195	1314204	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017633	GCATG	2	10	1335500	1335509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017633	GGGGA	2	10	1344059	1344068	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017633	CATGA	2	10	1350674	1350683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017633	ACGTA	2	10	1352533	1352542	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017633	CAAAT	2	10	1353514	1353523	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017633	ATTCC	2	10	1353525	1353534	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017633	AGTCG	2	10	1359129	1359138	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017633	ATTTT	2	10	1362408	1362417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017633	TTTTG	2	10	1363214	1363223	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017633	TATAA	2	10	1366615	1366624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017633	TTCTA	2	10	1369669	1369678	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017633	CTTAC	2	10	1373833	1373842	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017633	GATTA	2	10	1376629	1376638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017633	TTCAA	2	10	1379335	1379344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017633	GAAAA	2	10	1390037	1390046	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017633	TGAAA	2	10	1395736	1395745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017633	CTTCA	2	10	1408588	1408597	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017633	CTTCA	2	10	1409123	1409132	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017633	CTTCA	2	10	1409658	1409667	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017633	TATCT	2	10	1409809	1409818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017633	TTATC	2	10	1418299	1418308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017633	TCGCT	2	10	1427814	1427823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017633	TCGAA	2	10	1427871	1427880	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017633	TCGCT	2	10	1428108	1428117	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017633	TCGAA	2	10	1428165	1428174	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017633	ACCGT	2	10	1429379	1429388	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_017633	CAAAT	2	10	1438071	1438080	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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160	NC_017633	CGATC	2	10	1546702	1546711	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_017633	TTATT	2	10	1551176	1551185	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017633	ATTTT	2	10	1551410	1551419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017633	CATTG	2	10	1551429	1551438	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017633	TATAT	2	10	1579467	1579476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_017633	ACGTA	2	10	1605014	1605023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_017633	ATCGA	2	10	1706601	1706610	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_017633	TTGTG	2	10	2654995	2655004	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_017633	CTTCA	2	10	2671615	2671624	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_017633	GTGAT	2	10	4520106	4520115	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

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