MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UM146 chromosome

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017632	GTTTTT	2	12	49483	49494	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017632	GTATCT	2	12	100602	100613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017632	TCGCTT	2	12	135279	135290	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017632	ATAAAA	2	12	140677	140688	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017632	CGGTTA	2	12	150455	150466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017632	GGGAGA	2	12	176220	176231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017632	ATCATT	2	12	198069	198080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017632	AAAAAG	2	12	198904	198915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017632	TACAAC	2	12	203580	203591	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017632	TTTTTA	2	12	245615	245626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017632	TTAAAT	2	12	297495	297506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017632	ACGAAA	2	12	310697	310708	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017632	CTCAGT	2	12	383810	383821	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017632	CCTCAC	2	12	415669	415680	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017632	TCGCGA	2	12	422591	422602	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017632	GGAGGG	2	12	507976	507987	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017632	AACAAA	2	12	540772	540783	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017632	TCTTGT	2	12	565596	565607	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017632	ATCATT	2	12	585915	585926	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017632	ATATCA	2	12	665719	665730	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017632	GTTTTA	2	12	666797	666808	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017632	TTTGAC	2	12	703392	703403	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017632	AGAATG	2	12	703514	703525	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017632	CTATAT	2	12	703576	703587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017632	TGTCCA	2	12	811112	811123	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017632	CGCTCA	2	12	821121	821132	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017632	AAAAGC	2	12	848377	848388	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017632	TGCACT	2	12	951313	951324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017632	CATAAC	2	12	968277	968288	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017632	CATCAG	2	12	986122	986133	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017632	GCTTCT	2	12	1009401	1009412	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017632	TTTTCT	2	12	1079432	1079443	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017632	TCCGCT	2	12	1086575	1086586	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017632	GTGACA	2	12	1089711	1089722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017632	CATTTA	2	12	1103344	1103355	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017632	CAAATG	2	12	1104964	1104975	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017632	TAGCAT	2	12	1215234	1215245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017632	GGAAGA	2	12	1238498	1238509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017632	CCATAG	2	12	1300900	1300911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017632	ACAAAA	2	12	1381896	1381907	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017632	GTTTTC	2	12	1441915	1441926	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017632	ATATGA	2	12	1490466	1490477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017632	ATTTTT	2	12	1529224	1529235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017632	TGTCTG	2	12	1540395	1540406	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017632	ATACAC	2	12	1604743	1604754	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017632	AAATAT	2	12	1630876	1630887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017632	TGAATT	2	12	1632863	1632874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017632	GCATTG	2	12	1637292	1637303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017632	GTAATA	2	12	1739096	1739107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017632	TCGCTG	2	12	1742130	1742141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017632	CTGTTC	2	12	1804207	1804218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017632	CTTTTT	2	12	1842891	1842902	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017632	AAAACA	2	12	1852070	1852081	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017632	TTATTT	2	12	1852702	1852713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017632	TAAGTA	2	12	1866360	1866371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017632	CCAGCC	2	12	1918779	1918790	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017632	TATTGG	2	12	1986004	1986015	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017632	TAACCA	2	12	2004757	2004768	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017632	TATGAA	2	12	2016872	2016883	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017632	TGCTTT	2	12	2019937	2019948	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017632	ATCAAT	2	12	2020469	2020480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017632	CAAAAA	2	12	2021267	2021278	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017632	ATAGTG	2	12	2024247	2024258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017632	TTTAAA	2	12	2042867	2042878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017632	CATTAA	2	12	2047522	2047533	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017632	GATCGT	2	12	2066763	2066774	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017632	TGAGCG	2	12	2067257	2067268	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017632	CGGCAT	2	12	2077196	2077207	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017632	GTGCCG	2	12	2097269	2097280	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017632	GTGCCG	2	12	2097563	2097574	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017632	GAGGCA	2	12	2110433	2110444	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017632	GCTTCC	2	12	2154285	2154296	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017632	AGTTAT	2	12	2156789	2156800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017632	TTCCAT	2	12	2208012	2208023	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017632	TTTAAC	2	12	2256665	2256676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017632	GGGTAT	2	12	2290183	2290194	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017632	TCCGGA	2	12	2297941	2297952	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017632	TCAGCA	2	12	2303458	2303469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017632	TACGAT	2	12	2341373	2341384	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017632	TTCACT	2	12	2344989	2345000	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017632	TCATTT	2	12	2355372	2355383	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017632	ACGGCG	2	12	2386435	2386446	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017632	CTGCGC	2	12	2444153	2444164	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017632	CGGCTG	2	12	2505574	2505585	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017632	CTGTGC	2	12	2508959	2508970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017632	GGTTTG	2	12	2510239	2510250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017632	TTATTC	2	12	2511419	2511430	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017632	CATTTG	2	12	2512781	2512792	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017632	TTGTTT	2	12	2522070	2522081	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017632	CATTAT	2	12	2613100	2613111	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017632	ATCGCT	2	12	2647600	2647611	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017632	ACGTTC	2	12	2674101	2674112	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017632	CATATC	2	12	2677644	2677655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017632	ATCGTT	2	12	2679022	2679033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017632	AGCGTT	2	12	2711473	2711484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017632	CTGGCG	2	12	2804705	2804716	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017632	AAAGTG	2	12	2839366	2839377	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017632	TGCCGC	2	12	2873699	2873710	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017632	TTTGCC	2	12	2940999	2941010	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017632	CATATT	2	12	2943991	2944002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017632	CCTGGC	2	12	2952964	2952975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017632	GGCGCT	2	12	3006367	3006378	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017632	TTCCAT	2	12	3044091	3044102	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017632	CAGAAA	2	12	3082695	3082706	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017632	ACGTGG	2	12	3139513	3139524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017632	CGCACG	2	12	3139569	3139580	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017632	TTCGTC	2	12	3189639	3189650	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017632	GCGCCA	2	12	3206917	3206928	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017632	CCGTAG	2	12	3207070	3207081	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017632	ATATTG	2	12	3208162	3208173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017632	CGCCAC	2	12	3230633	3230644	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017632	CAGACA	2	12	3256742	3256753	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017632	GATGGA	2	12	3257097	3257108	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017632	CGCCCG	2	12	3270331	3270342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017632	GGAAAT	2	12	3293029	3293040	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017632	CCTTTC	2	12	3397855	3397866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017632	CTACAG	2	12	3466239	3466250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017632	CAAAGG	2	12	3527263	3527274	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017632	CCCTAT	2	12	3537733	3537744	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017632	TACTCG	2	12	3556848	3556859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017632	AAAGAT	2	12	3568184	3568195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017632	CCGTTC	2	12	3639043	3639054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017632	AGCGGC	2	12	3643677	3643688	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017632	AACATG	2	12	3653238	3653249	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017632	CGCAGA	2	12	3674671	3674682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017632	TACCGC	2	12	3684948	3684959	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017632	CATACT	2	12	3721429	3721440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017632	ATGTCG	2	12	3750531	3750542	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017632	CCCGAT	2	12	3754862	3754873	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017632	CTTCGG	2	12	3772217	3772228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017632	ACAGGC	2	12	3775808	3775819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017632	TAACAA	2	12	3801194	3801205	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017632	CTCCGT	2	12	3808742	3808753	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017632	CGCGGT	2	12	3821875	3821886	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017632	TGCGGG	2	12	3844010	3844021	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017632	TGATTT	2	12	3846632	3846643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017632	CGGCTC	2	12	3940167	3940178	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017632	CTTTGG	2	12	3982900	3982911	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017632	CCTGAC	2	12	4005761	4005772	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017632	GCGTGA	2	12	4006694	4006705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017632	GGCGCT	2	12	4019104	4019115	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017632	CTTCCG	2	12	4023533	4023544	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017632	GGAGTT	2	12	4078524	4078535	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017632	ATGACG	2	12	4078673	4078684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017632	CTCTGG	2	12	4126764	4126775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017632	GCCAGC	2	12	4142463	4142474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017632	CGTCCA	2	12	4142850	4142861	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017632	ACTGGT	2	12	4146683	4146694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_017632	GTACTT	2	12	4174120	4174131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_017632	CCTGAT	2	12	4210700	4210711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017632	TAACCA	2	12	4229475	4229486	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017632	CAGCGT	2	12	4238607	4238618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017632	ACTGAC	2	12	4241318	4241329	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017632	CGGTGA	2	12	4250199	4250210	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_017632	GTCTTT	2	12	4287456	4287467	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_017632	GGCATC	2	12	4306538	4306549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017632	AATCGC	2	12	4341881	4341892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017632	ACGGTA	2	12	4362185	4362196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_017632	GAACAG	2	12	4369833	4369844	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_017632	GACCGC	2	12	4381926	4381937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
161	NC_017632	TTGAGT	2	12	4390856	4390867	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017632	TTTTTA	2	12	4405424	4405435	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017632	GCGCTG	2	12	4432746	4432757	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_017632	TTTGAG	2	12	4439985	4439996	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017632	AATATT	2	12	4450181	4450192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017632	TCGTCT	2	12	4478333	4478344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_017632	TTAACA	2	12	4575756	4575767	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.