MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ABU 83972 chromosome

Total Repeats: 495

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017631	AATGT	2	10	18542	18551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017631	GATGC	2	10	27274	27283	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017631	GATGC	2	10	36655	36664	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017631	TAGTG	2	10	78543	78552	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017631	ATTTT	2	10	80259	80268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017631	GGGAG	2	10	80423	80432	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017631	CGCCA	2	10	80487	80496	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017631	GTTCA	2	10	114615	114624	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017631	GTGTT	2	10	124577	124586	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017631	AATTG	2	10	128723	128732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017631	GTAAG	2	10	149528	149537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017631	TCCTC	2	10	151248	151257	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017631	AATTT	2	10	164177	164186	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017631	TATAT	2	10	164263	164272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017631	ACCAC	2	10	168875	168884	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017631	TACGT	2	10	189318	189327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017631	TGGCC	2	10	191007	191016	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017631	GTCTG	2	10	198717	198726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017631	TGCGC	2	10	221900	221909	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017631	TGAAC	2	10	221978	221987	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017631	CAGTT	2	10	223398	223407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017631	CGGTT	2	10	230790	230799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017631	GGTGA	2	10	233109	233118	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017631	AGATT	2	10	235984	235993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017631	CAAAG	2	10	245496	245505	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017631	AATCT	2	10	262907	262916	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017631	TCAGC	2	10	272935	272944	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017631	CGAAT	2	10	274040	274049	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017631	CGAAG	2	10	274905	274914	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017631	TCCAG	2	10	279696	279705	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017631	AAAAT	2	10	282328	282337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017631	AACGA	2	10	283368	283377	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017631	AAAAG	2	10	285553	285562	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017631	ATATT	2	10	291188	291197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017631	CATTT	2	10	291284	291293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017631	ATGCA	2	10	291496	291505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017631	TGGAG	2	10	293683	293692	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017631	TGAAA	2	10	294973	294982	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017631	TAAAA	2	10	301638	301647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017631	GAAAT	2	10	316874	316883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017631	ACTAA	2	10	316973	316982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017631	TGCAG	2	10	325812	325821	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017631	CTTAC	2	10	327307	327316	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017631	TTTTA	2	10	327623	327632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017631	GTATC	2	10	332973	332982	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017631	CTATT	2	10	337382	337391	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017631	CAAAA	2	10	377561	377570	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017631	GGAGC	2	10	379629	379638	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017631	ACCAA	2	10	387512	387521	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017631	ACATT	2	10	387759	387768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017631	GCAAT	2	10	388775	388784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017631	TGTGT	2	10	396617	396626	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017631	TGTTA	2	10	397725	397734	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017631	TTGAT	2	10	398614	398623	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017631	GTTAA	2	10	401026	401035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017631	AGGGT	2	10	409867	409876	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017631	CAAAA	2	10	414441	414450	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017631	GGTTT	2	10	423961	423970	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017631	AGCGA	2	10	425453	425462	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017631	TGAAC	2	10	449015	449024	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017631	CTTCT	2	10	483119	483128	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017631	TGCAG	2	10	491075	491084	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017631	GTTTC	2	10	515898	515907	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017631	CTTTT	2	10	519374	519383	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017631	GAGTA	2	10	521947	521956	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017631	ATAAA	2	10	535484	535493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017631	GAAGA	2	10	545086	545095	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017631	TGAGT	2	10	558858	558867	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017631	CAGGT	2	10	560145	560154	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017631	TTTTC	2	10	580686	580695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017631	TCAGG	2	10	588445	588454	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017631	TATTT	2	10	615373	615382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017631	GATGC	2	10	629073	629082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017631	AACCC	2	10	634559	634568	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017631	AAAGG	2	10	639679	639688	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017631	GTCAG	2	10	660605	660614	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017631	GTTAA	2	10	680853	680862	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017631	ATAGC	2	10	688737	688746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017631	ATTTG	2	10	707548	707557	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017631	TCAAT	2	10	709852	709861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017631	CGTAA	2	10	711648	711657	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017631	GCATA	2	10	723843	723852	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017631	AGCAA	2	10	723950	723959	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017631	GTGTT	2	10	728898	728907	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017631	GTGTT	2	10	741087	741096	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017631	CAGGG	2	10	744532	744541	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017631	ATAAA	2	10	758709	758718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017631	TCGCG	2	10	758896	758905	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017631	GTCGT	2	10	811450	811459	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017631	GATGC	2	10	835695	835704	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017631	ACATA	2	10	866959	866968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017631	AGCGC	2	10	869987	869996	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017631	GATGC	2	10	872398	872407	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017631	ACAAA	2	10	878996	879005	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017631	TATAT	2	10	883733	883742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017631	CAGGG	2	10	907271	907280	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017631	AGTAA	2	10	919132	919141	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017631	GCAAC	2	10	983417	983426	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017631	TTCAC	2	10	997386	997395	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017631	TTGTT	2	10	1023304	1023313	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017631	AGCGA	2	10	1024644	1024653	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017631	ATGAC	2	10	1026384	1026393	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017631	TTTTC	2	10	1034275	1034284	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017631	TTCTT	2	10	1037018	1037027	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017631	GTACA	2	10	1039567	1039576	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017631	TTATG	2	10	1039724	1039733	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017631	CTTAT	2	10	1050228	1050237	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017631	TAAAA	2	10	1060825	1060834	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017631	GGAGG	2	10	1073665	1073674	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017631	AAGGA	2	10	1073751	1073760	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017631	TACGC	2	10	1095782	1095791	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017631	CAATA	2	10	1107397	1107406	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017631	TGAGG	2	10	1109398	1109407	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017631	GTTAT	2	10	1109470	1109479	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017631	AAAAC	2	10	1115464	1115473	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017631	TCTGA	2	10	1115489	1115498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017631	GAAAT	2	10	1140747	1140756	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017631	ACTAA	2	10	1140846	1140855	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017631	GCCTG	2	10	1143211	1143220	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017631	TTTTA	2	10	1159177	1159186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017631	AGAAT	2	10	1182361	1182370	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017631	CAGTA	2	10	1185333	1185342	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017631	AAAGA	2	10	1190889	1190898	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017631	CCGGG	2	10	1199091	1199100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017631	AACAA	2	10	1219104	1219113	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017631	AAGGG	2	10	1219295	1219304	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017631	CAAAA	2	10	1219316	1219325	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017631	TGACT	2	10	1238180	1238189	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017631	TGTAA	2	10	1238205	1238214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017631	TGGTA	2	10	1245824	1245833	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017631	AAAAT	2	10	1246325	1246334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017631	GATCG	2	10	1276240	1276249	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017631	GTCAT	2	10	1287655	1287664	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017631	TAAAA	2	10	1288161	1288170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017631	TGCAG	2	10	1296358	1296367	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017631	GTCGC	2	10	1311420	1311429	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017631	GGGGA	2	10	1357506	1357515	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017631	TTGTG	2	10	1365221	1365230	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017631	CAGTG	2	10	1371679	1371688	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017631	CGATG	2	10	1384596	1384605	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017631	GATTC	2	10	1385720	1385729	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017631	ATTAA	2	10	1415039	1415048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017631	AAGGA	2	10	1419450	1419459	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017631	ATTTT	2	10	1422355	1422364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017631	CTGGT	2	10	1422559	1422568	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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147	NC_017631	CCTTA	2	10	1433098	1433107	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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149	NC_017631	GAAAA	2	10	1455195	1455204	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_017631	ATTTT	2	10	1615231	1615240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_017631	GCGTC	2	10	2785193	2785202	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_017631	AGCAA	2	10	2892713	2892722	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_017631	TAATC	2	10	2959550	2959559	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_017631	TCGGT	2	10	2961778	2961787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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473	NC_017631	TGAAT	2	10	4953623	4953632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017631	ATAAA	2	10	4963187	4963196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_017631	CTGTC	2	10	4990877	4990886	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
480	NC_017631	CCAGT	2	10	4993186	4993195	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
481	NC_017631	TGGTT	2	10	4993208	4993217	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017631	GCCTT	2	10	5005282	5005291	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
483	NC_017631	CATTA	2	10	5011497	5011506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
484	NC_017631	TTCAT	2	10	5015972	5015981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
485	NC_017631	TACCT	2	10	5046716	5046725	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_017631	TGCGT	2	10	5077290	5077299	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
488	NC_017631	TTTCC	2	10	5077565	5077574	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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492	NC_017631	AAGAA	2	10	5095728	5095737	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.