MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UM146 plasmid pUM146

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017630	ATGCA	2	10	92	101	40 %	20 %	20 %	20 %	386602510
2	NC_017630	TGTTT	2	10	424	433	0 %	80 %	20 %	0 %	386602511
3	NC_017630	CCCGG	2	10	620	629	0 %	0 %	40 %	60 %	386602512
4	NC_017630	GACCA	2	10	3758	3767	40 %	0 %	20 %	40 %	386602515
5	NC_017630	CGTGT	2	10	3815	3824	0 %	40 %	40 %	20 %	386602515
6	NC_017630	CAGGT	2	10	4097	4106	20 %	20 %	40 %	20 %	386602516
7	NC_017630	ACGGC	2	10	4635	4644	20 %	0 %	40 %	40 %	386602516
8	NC_017630	CCGGT	2	10	4706	4715	0 %	20 %	40 %	40 %	386602516
9	NC_017630	CGCTG	2	10	5958	5967	0 %	20 %	40 %	40 %	386602516
10	NC_017630	TCCGG	2	10	7389	7398	0 %	20 %	40 %	40 %	386602516
11	NC_017630	AGGTC	2	10	8861	8870	20 %	20 %	40 %	20 %	386602516
12	NC_017630	CCAGC	2	10	9007	9016	20 %	0 %	20 %	60 %	386602516
13	NC_017630	CAGCA	2	10	10218	10227	40 %	0 %	20 %	40 %	386602517
14	NC_017630	CCGTG	2	10	10665	10674	0 %	20 %	40 %	40 %	386602517
15	NC_017630	ACCAG	2	10	12500	12509	40 %	0 %	20 %	40 %	386602519
16	NC_017630	CACTG	2	10	14542	14551	20 %	20 %	20 %	40 %	386602521
17	NC_017630	CCCAG	2	10	16143	16152	20 %	0 %	20 %	60 %	386602521
18	NC_017630	TTCTG	2	10	18722	18731	0 %	60 %	20 %	20 %	386602524
19	NC_017630	GCACT	2	10	22354	22363	20 %	20 %	20 %	40 %	386602530
20	NC_017630	AAAAT	2	10	23570	23579	80 %	20 %	0 %	0 %	386602532
21	NC_017630	GGACT	2	10	24020	24029	20 %	20 %	40 %	20 %	386602533
22	NC_017630	CAGAA	2	10	24083	24092	60 %	0 %	20 %	20 %	386602533
23	NC_017630	GCTTC	2	10	24711	24720	0 %	40 %	20 %	40 %	386602534
24	NC_017630	TCAGA	2	10	27634	27643	40 %	20 %	20 %	20 %	386602537
25	NC_017630	TTCAT	2	10	28672	28681	20 %	60 %	0 %	20 %	386602538
26	NC_017630	AGAAT	2	10	29438	29447	60 %	20 %	20 %	0 %	386602540
27	NC_017630	AACTG	2	10	29980	29989	40 %	20 %	20 %	20 %	386602542
28	NC_017630	CATTT	2	10	31032	31041	20 %	60 %	0 %	20 %	386602545
29	NC_017630	TGTCC	2	10	32557	32566	0 %	40 %	20 %	40 %	386602546
30	NC_017630	CACGG	2	10	32974	32983	20 %	0 %	40 %	40 %	386602546
31	NC_017630	CGCTT	2	10	33814	33823	0 %	40 %	20 %	40 %	386602548
32	NC_017630	GAATC	2	10	36557	36566	40 %	20 %	20 %	20 %	386602553
33	NC_017630	ATCAC	2	10	36604	36613	40 %	20 %	0 %	40 %	386602553
34	NC_017630	TTCCC	2	10	38255	38264	0 %	40 %	0 %	60 %	386602555
35	NC_017630	GTGAT	2	10	39603	39612	20 %	40 %	40 %	0 %	386602556
36	NC_017630	TCTGC	2	10	40587	40596	0 %	40 %	20 %	40 %	386602559
37	NC_017630	GGAAG	2	10	40704	40713	40 %	0 %	60 %	0 %	386602559
38	NC_017630	TCAGT	2	10	41408	41417	20 %	40 %	20 %	20 %	386602560
39	NC_017630	CGGCG	2	10	45650	45659	0 %	0 %	60 %	40 %	386602565
40	NC_017630	CCCGG	2	10	46910	46919	0 %	0 %	40 %	60 %	386602566
41	NC_017630	ACAGT	2	10	48959	48968	40 %	20 %	20 %	20 %	386602569
42	NC_017630	ACGGT	2	10	49197	49206	20 %	20 %	40 %	20 %	386602570
43	NC_017630	GTGCC	2	10	49487	49496	0 %	20 %	40 %	40 %	386602570
44	NC_017630	TGGCG	2	10	50587	50596	0 %	20 %	60 %	20 %	386602572
45	NC_017630	CCAGC	2	10	51604	51613	20 %	0 %	20 %	60 %	386602575
46	NC_017630	GCCGG	2	10	51636	51645	0 %	0 %	60 %	40 %	386602575
47	NC_017630	AAGGT	2	10	53315	53324	40 %	20 %	40 %	0 %	386602577
48	NC_017630	CACAT	2	10	56058	56067	40 %	20 %	0 %	40 %	386602581
49	NC_017630	GAACA	2	10	56909	56918	60 %	0 %	20 %	20 %	386602581
50	NC_017630	TAACT	2	10	57298	57307	40 %	40 %	0 %	20 %	386602582
51	NC_017630	AAAAG	2	10	57721	57730	80 %	0 %	20 %	0 %	386602582
52	NC_017630	CATCA	2	10	60632	60641	40 %	20 %	0 %	40 %	386602587
53	NC_017630	CACAG	2	10	74522	74531	40 %	0 %	20 %	40 %	386602598
54	NC_017630	AGTTA	2	10	74997	75006	40 %	40 %	20 %	0 %	386602598
55	NC_017630	GGGAT	2	10	75559	75568	20 %	20 %	60 %	0 %	386602598
56	NC_017630	CCCTG	2	10	76764	76773	0 %	20 %	20 %	60 %	386602599
57	NC_017630	CCGAA	2	10	76986	76995	40 %	0 %	20 %	40 %	386602600
58	NC_017630	CAGCC	2	10	77064	77073	20 %	0 %	20 %	60 %	386602600
59	NC_017630	GCGCT	2	10	78196	78205	0 %	20 %	40 %	40 %	386602601
60	NC_017630	ACCTT	2	10	78596	78605	20 %	40 %	0 %	40 %	386602602
61	NC_017630	CGAAC	2	10	78945	78954	40 %	0 %	20 %	40 %	386602602
62	NC_017630	GAGTA	2	10	81531	81540	40 %	20 %	40 %	0 %	386602607
63	NC_017630	ACACG	2	10	81910	81919	40 %	0 %	20 %	40 %	386602608
64	NC_017630	TTGTT	2	10	82969	82978	0 %	80 %	20 %	0 %	386602608
65	NC_017630	ACTGA	2	10	84642	84651	40 %	20 %	20 %	20 %	386602610
66	NC_017630	CTGAA	2	10	89939	89948	40 %	20 %	20 %	20 %	386602615
67	NC_017630	CGTTA	2	10	90386	90395	20 %	40 %	20 %	20 %	386602615
68	NC_017630	GTCTG	2	10	90518	90527	0 %	40 %	40 %	20 %	386602615
69	NC_017630	AAATT	2	10	91443	91452	60 %	40 %	0 %	0 %	386602615
70	NC_017630	TACAC	2	10	94203	94212	40 %	20 %	0 %	40 %	386602618
71	NC_017630	CGGCC	2	10	96704	96713	0 %	0 %	40 %	60 %	386602622
72	NC_017630	AACAA	2	10	98880	98889	80 %	0 %	0 %	20 %	386602626
73	NC_017630	GCAGC	2	10	104006	104015	20 %	0 %	40 %	40 %	386602633
74	NC_017630	GGCCT	2	10	110307	110316	0 %	20 %	40 %	40 %	386602638
75	NC_017630	GAGCA	2	10	110496	110505	40 %	0 %	40 %	20 %	386602639
76	NC_017630	ATGCA	2	10	114137	114146	40 %	20 %	20 %	20 %	386602642

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.