MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UM146 plasmid pUM146

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017630	TAAT	2	8	215	222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017630	ATGA	2	8	461	468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017630	TTTA	2	8	484	491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017630	TTCC	2	8	1402	1409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017630	ATTT	2	8	12103	12110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017630	ATTT	2	8	12134	12141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017630	GATT	2	8	12235	12242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017630	TTTC	2	8	28565	28572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017630	TTAA	2	8	29824	29831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017630	AAAT	2	8	36737	36744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017630	TCAG	2	8	38820	38827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017630	CAGT	2	8	39173	39180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017630	TGGC	2	8	43917	43924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017630	CAGT	2	8	44554	44561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017630	ACAA	2	8	44624	44631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017630	AGAC	2	8	45269	45276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017630	TGAC	2	8	47565	47572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017630	AAAT	2	8	47604	47611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017630	CAGT	2	8	47835	47842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017630	GGCA	2	8	47904	47911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017630	GCCC	2	8	48123	48130	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_017630	CCCG	2	8	49674	49681	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_017630	GCCC	2	8	52373	52380	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_017630	GCTG	2	8	59465	59472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017630	CCTG	2	8	62670	62677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017630	CTGA	2	8	62733	62740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017630	GCGA	2	8	62869	62876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017630	CACT	2	8	62983	62990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017630	AATC	2	8	64668	64675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017630	ACCT	2	8	64807	64814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017630	GACA	2	8	65328	65335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017630	ATCA	2	8	65428	65435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017630	TATT	2	8	65436	65443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017630	AATT	2	8	65546	65553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017630	GCCA	2	8	66435	66442	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017630	TTAT	2	8	66545	66552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017630	ACTG	2	8	66608	66615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017630	GGCA	2	8	66663	66670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017630	CGAC	2	8	66854	66861	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017630	AGAC	2	8	67291	67298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017630	ATGA	2	8	67484	67491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017630	AAGT	2	8	67635	67642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017630	TCAG	2	8	67707	67714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017630	CAGG	2	8	67763	67770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017630	TACC	2	8	67911	67918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017630	CCAG	2	8	69176	69183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017630	CATG	2	8	70184	70191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017630	AAAT	2	8	70289	70296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017630	TTAC	2	8	70309	70316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017630	CTGG	2	8	70837	70844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017630	ATCT	2	8	70965	70972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017630	ATTT	2	8	71953	71960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017630	CATC	2	8	72125	72132	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017630	ATGA	2	8	72197	72204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017630	AATG	2	8	72284	72291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017630	AGTA	2	8	72805	72812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017630	AAAT	2	8	73061	73068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017630	TCTG	2	8	77533	77540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017630	ACCA	2	8	81747	81754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017630	CTTG	2	8	83367	83374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017630	CAGA	2	8	83747	83754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017630	GCCC	2	8	83779	83786	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_017630	GTAA	2	8	83804	83811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017630	CCAC	2	8	83818	83825	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_017630	ACAA	2	8	87567	87574	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017630	CGGC	2	8	93441	93448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017630	ACGT	2	8	93509	93516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017630	GTAC	2	8	94273	94280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017630	ATTT	2	8	94614	94621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017630	AGAA	2	8	95258	95265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017630	TAAA	2	8	95592	95599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017630	ACAG	2	8	95623	95630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017630	AGAA	2	8	95646	95653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017630	AGCA	2	8	95706	95713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017630	GCAA	2	8	98483	98490	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017630	CAGG	2	8	98534	98541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017630	GCTG	2	8	98595	98602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017630	TGGC	2	8	98811	98818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017630	CCAG	2	8	106553	106560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017630	CCAG	2	8	106754	106761	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017630	AGCG	2	8	107892	107899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017630	TCAA	2	8	108103	108110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017630	ATTT	2	8	108302	108309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017630	AGGC	2	8	108391	108398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017630	GGCA	2	8	108450	108457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017630	TGAT	2	8	111239	111246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017630	CCAG	2	8	111414	111421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017630	TCTG	2	8	111640	111647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017630	AATG	2	8	111683	111690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017630	GCCA	2	8	113082	113089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017630	TTTC	2	8	113186	113193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017630	GCCT	2	8	113763	113770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017630	TGGC	2	8	113820	113827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.