MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli UM146 plasmid pUM146

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017630	CA	3	6	891	896	50 %	0 %	0 %	50 %	386602512
2	NC_017630	AT	3	6	932	937	50 %	50 %	0 %	0 %	386602512
3	NC_017630	CA	3	6	1004	1009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017630	CA	3	6	1684	1689	50 %	0 %	0 %	50 %	386602513
5	NC_017630	GT	3	6	1813	1818	0 %	50 %	50 %	0 %	386602513
6	NC_017630	CT	3	6	2406	2411	0 %	50 %	0 %	50 %	386602514
7	NC_017630	CT	3	6	2608	2613	0 %	50 %	0 %	50 %	386602514
8	NC_017630	TC	3	6	2626	2631	0 %	50 %	0 %	50 %	386602514
9	NC_017630	AG	3	6	3026	3031	50 %	0 %	50 %	0 %	386602514
10	NC_017630	CT	3	6	4389	4394	0 %	50 %	0 %	50 %	386602516
11	NC_017630	AC	3	6	5254	5259	50 %	0 %	0 %	50 %	386602516
12	NC_017630	GA	3	6	5301	5306	50 %	0 %	50 %	0 %	386602516
13	NC_017630	TG	3	6	6125	6130	0 %	50 %	50 %	0 %	386602516
14	NC_017630	CT	3	6	6246	6251	0 %	50 %	0 %	50 %	386602516
15	NC_017630	TG	3	6	6742	6747	0 %	50 %	50 %	0 %	386602516
16	NC_017630	CT	3	6	7328	7333	0 %	50 %	0 %	50 %	386602516
17	NC_017630	AT	3	6	8511	8516	50 %	50 %	0 %	0 %	386602516
18	NC_017630	GT	3	6	8638	8643	0 %	50 %	50 %	0 %	386602516
19	NC_017630	AG	4	8	9576	9583	50 %	0 %	50 %	0 %	386602517
20	NC_017630	CA	3	6	9989	9994	50 %	0 %	0 %	50 %	386602517
21	NC_017630	GT	3	6	10327	10332	0 %	50 %	50 %	0 %	386602517
22	NC_017630	AT	3	6	10943	10948	50 %	50 %	0 %	0 %	386602517
23	NC_017630	CA	4	8	11691	11698	50 %	0 %	0 %	50 %	386602518
24	NC_017630	GA	3	6	11802	11807	50 %	0 %	50 %	0 %	386602518
25	NC_017630	GA	3	6	13248	13253	50 %	0 %	50 %	0 %	386602520
26	NC_017630	TA	3	6	13276	13281	50 %	50 %	0 %	0 %	386602520
27	NC_017630	GA	3	6	13338	13343	50 %	0 %	50 %	0 %	386602520
28	NC_017630	TG	3	6	14831	14836	0 %	50 %	50 %	0 %	386602521
29	NC_017630	AC	3	6	15015	15020	50 %	0 %	0 %	50 %	386602521
30	NC_017630	TG	3	6	15647	15652	0 %	50 %	50 %	0 %	386602521
31	NC_017630	CA	3	6	15829	15834	50 %	0 %	0 %	50 %	386602521
32	NC_017630	AC	3	6	16631	16636	50 %	0 %	0 %	50 %	386602522
33	NC_017630	TG	3	6	17563	17568	0 %	50 %	50 %	0 %	386602522
34	NC_017630	AT	4	8	17986	17993	50 %	50 %	0 %	0 %	386602523
35	NC_017630	AT	3	6	18127	18132	50 %	50 %	0 %	0 %	386602523
36	NC_017630	GT	3	6	18433	18438	0 %	50 %	50 %	0 %	386602524
37	NC_017630	GA	3	6	18866	18871	50 %	0 %	50 %	0 %	386602524
38	NC_017630	TG	3	6	19198	19203	0 %	50 %	50 %	0 %	386602525
39	NC_017630	AG	3	6	19274	19279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017630	AT	3	6	19879	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	386602527
41	NC_017630	TG	3	6	21718	21723	0 %	50 %	50 %	0 %	386602530
42	NC_017630	TC	3	6	23249	23254	0 %	50 %	0 %	50 %	386602531
43	NC_017630	GT	3	6	23306	23311	0 %	50 %	50 %	0 %	386602531
44	NC_017630	AT	3	6	23515	23520	50 %	50 %	0 %	0 %	386602532
45	NC_017630	AT	3	6	23676	23681	50 %	50 %	0 %	0 %	386602532
46	NC_017630	TG	3	6	26142	26147	0 %	50 %	50 %	0 %	386602537
47	NC_017630	CA	3	6	26767	26772	50 %	0 %	0 %	50 %	386602537
48	NC_017630	CT	3	6	27030	27035	0 %	50 %	0 %	50 %	386602537
49	NC_017630	GC	3	6	27036	27041	0 %	0 %	50 %	50 %	386602537
50	NC_017630	AC	3	6	27621	27626	50 %	0 %	0 %	50 %	386602537
51	NC_017630	TG	3	6	27741	27746	0 %	50 %	50 %	0 %	386602537
52	NC_017630	CG	3	6	28057	28062	0 %	0 %	50 %	50 %	386602537
53	NC_017630	AT	3	6	28390	28395	50 %	50 %	0 %	0 %	386602537
54	NC_017630	AT	3	6	28662	28667	50 %	50 %	0 %	0 %	386602538
55	NC_017630	AT	3	6	29320	29325	50 %	50 %	0 %	0 %	386602540
56	NC_017630	AT	3	6	29416	29421	50 %	50 %	0 %	0 %	386602540
57	NC_017630	CG	3	6	31175	31180	0 %	0 %	50 %	50 %	386602545
58	NC_017630	GC	3	6	31870	31875	0 %	0 %	50 %	50 %	386602546
59	NC_017630	GC	3	6	32932	32937	0 %	0 %	50 %	50 %	386602546
60	NC_017630	AT	3	6	33868	33873	50 %	50 %	0 %	0 %	386602548
61	NC_017630	AG	3	6	34076	34081	50 %	0 %	50 %	0 %	386602548
62	NC_017630	AG	3	6	34549	34554	50 %	0 %	50 %	0 %	386602549
63	NC_017630	CT	3	6	35386	35391	0 %	50 %	0 %	50 %	386602552
64	NC_017630	TA	3	6	35710	35715	50 %	50 %	0 %	0 %	386602552
65	NC_017630	CT	3	6	35717	35722	0 %	50 %	0 %	50 %	386602552
66	NC_017630	CA	3	6	35904	35909	50 %	0 %	0 %	50 %	386602552
67	NC_017630	GT	3	6	36814	36819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017630	CA	4	8	37473	37480	50 %	0 %	0 %	50 %	386602554
69	NC_017630	TA	4	8	37541	37548	50 %	50 %	0 %	0 %	386602554
70	NC_017630	CT	4	8	38944	38951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017630	AC	3	6	39959	39964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017630	AC	4	8	39970	39977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017630	AG	3	6	39984	39989	50 %	0 %	50 %	0 %	386602557
74	NC_017630	CA	3	6	40119	40124	50 %	0 %	0 %	50 %	386602557
75	NC_017630	GT	3	6	41322	41327	0 %	50 %	50 %	0 %	386602560
76	NC_017630	CA	3	6	41537	41542	50 %	0 %	0 %	50 %	386602560
77	NC_017630	CG	3	6	42814	42819	0 %	0 %	50 %	50 %	386602561
78	NC_017630	CT	3	6	43490	43495	0 %	50 %	0 %	50 %	386602561
79	NC_017630	TC	3	6	43734	43739	0 %	50 %	0 %	50 %	386602562
80	NC_017630	GC	3	6	44084	44089	0 %	0 %	50 %	50 %	386602563
81	NC_017630	CG	3	6	45097	45102	0 %	0 %	50 %	50 %	386602564
82	NC_017630	CG	3	6	45111	45116	0 %	0 %	50 %	50 %	386602564
83	NC_017630	CG	3	6	45206	45211	0 %	0 %	50 %	50 %	386602564
84	NC_017630	CA	3	6	45481	45486	50 %	0 %	0 %	50 %	386602565
85	NC_017630	GC	3	6	45672	45677	0 %	0 %	50 %	50 %	386602565
86	NC_017630	TC	3	6	46880	46885	0 %	50 %	0 %	50 %	386602566
87	NC_017630	CG	3	6	47053	47058	0 %	0 %	50 %	50 %	386602566
88	NC_017630	GT	3	6	47891	47896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017630	CG	3	6	48322	48327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017630	GC	3	6	48734	48739	0 %	0 %	50 %	50 %	386602569
91	NC_017630	GT	3	6	49103	49108	0 %	50 %	50 %	0 %	386602569
92	NC_017630	GA	3	6	49392	49397	50 %	0 %	50 %	0 %	386602570
93	NC_017630	CA	3	6	50016	50021	50 %	0 %	0 %	50 %	386602572
94	NC_017630	GT	4	8	50682	50689	0 %	50 %	50 %	0 %	386602572
95	NC_017630	GC	3	6	50937	50942	0 %	0 %	50 %	50 %	386602573
96	NC_017630	CA	3	6	51264	51269	50 %	0 %	0 %	50 %	386602573
97	NC_017630	TG	3	6	51527	51532	0 %	50 %	50 %	0 %	386602575
98	NC_017630	AG	3	6	52648	52653	50 %	0 %	50 %	0 %	386602576
99	NC_017630	TG	3	6	53167	53172	0 %	50 %	50 %	0 %	386602577
100	NC_017630	TG	3	6	53612	53617	0 %	50 %	50 %	0 %	386602577
101	NC_017630	AG	3	6	54330	54335	50 %	0 %	50 %	0 %	386602578
102	NC_017630	GA	3	6	54505	54510	50 %	0 %	50 %	0 %	386602578
103	NC_017630	CA	3	6	54991	54996	50 %	0 %	0 %	50 %	386602579
104	NC_017630	TG	4	8	55785	55792	0 %	50 %	50 %	0 %	386602580
105	NC_017630	TA	3	6	55814	55819	50 %	50 %	0 %	0 %	386602580
106	NC_017630	TA	3	6	56412	56417	50 %	50 %	0 %	0 %	386602581
107	NC_017630	CT	3	6	56497	56502	0 %	50 %	0 %	50 %	386602581
108	NC_017630	TA	3	6	56559	56564	50 %	50 %	0 %	0 %	386602581
109	NC_017630	CG	3	6	56652	56657	0 %	0 %	50 %	50 %	386602581
110	NC_017630	TG	3	6	57650	57655	0 %	50 %	50 %	0 %	386602582
111	NC_017630	TG	3	6	58530	58535	0 %	50 %	50 %	0 %	386602584
112	NC_017630	CG	3	6	58538	58543	0 %	0 %	50 %	50 %	386602584
113	NC_017630	TC	3	6	58765	58770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017630	CA	3	6	59372	59377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017630	AT	3	6	59696	59701	50 %	50 %	0 %	0 %	386602585
116	NC_017630	GT	3	6	60060	60065	0 %	50 %	50 %	0 %	386602586
117	NC_017630	AC	3	6	60466	60471	50 %	0 %	0 %	50 %	386602587
118	NC_017630	CA	3	6	61273	61278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017630	GA	3	6	61757	61762	50 %	0 %	50 %	0 %	386602588
120	NC_017630	GC	3	6	62033	62038	0 %	0 %	50 %	50 %	386602588
121	NC_017630	TC	3	6	62078	62083	0 %	50 %	0 %	50 %	386602588
122	NC_017630	GC	3	6	62912	62917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017630	CT	4	8	63429	63436	0 %	50 %	0 %	50 %	386602590
124	NC_017630	TA	3	6	63724	63729	50 %	50 %	0 %	0 %	386602591
125	NC_017630	GC	3	6	63750	63755	0 %	0 %	50 %	50 %	386602591
126	NC_017630	AC	3	6	65025	65030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017630	AT	3	6	65760	65765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017630	TC	4	8	65808	65815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017630	TC	3	6	66074	66079	0 %	50 %	0 %	50 %	386602593
130	NC_017630	AT	3	6	67366	67371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017630	AC	3	6	67729	67734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017630	TG	3	6	68151	68156	0 %	50 %	50 %	0 %	386602594
133	NC_017630	AG	3	6	68449	68454	50 %	0 %	50 %	0 %	386602594
134	NC_017630	AG	3	6	68818	68823	50 %	0 %	50 %	0 %	386602594
135	NC_017630	TA	3	6	69017	69022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017630	GC	3	6	69869	69874	0 %	0 %	50 %	50 %	386602595
137	NC_017630	CT	3	6	70426	70431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017630	TA	3	6	70784	70789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017630	AT	3	6	71784	71789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017630	AT	3	6	71836	71841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017630	AT	3	6	72059	72064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017630	AC	3	6	72115	72120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017630	TG	3	6	72509	72514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017630	AT	3	6	72741	72746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017630	TA	3	6	72838	72843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017630	TA	3	6	73010	73015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017630	AT	3	6	73074	73079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017630	AT	3	6	73973	73978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017630	GA	3	6	74475	74480	50 %	0 %	50 %	0 %	386602598
150	NC_017630	GC	3	6	74629	74634	0 %	0 %	50 %	50 %	386602598
151	NC_017630	CG	3	6	75498	75503	0 %	0 %	50 %	50 %	386602598
152	NC_017630	AC	3	6	75675	75680	50 %	0 %	0 %	50 %	386602598
153	NC_017630	AT	3	6	76249	76254	50 %	50 %	0 %	0 %	386602599
154	NC_017630	TG	3	6	76704	76709	0 %	50 %	50 %	0 %	386602599
155	NC_017630	GA	3	6	78639	78644	50 %	0 %	50 %	0 %	386602602
156	NC_017630	CG	3	6	78753	78758	0 %	0 %	50 %	50 %	386602602
157	NC_017630	GA	4	8	78980	78987	50 %	0 %	50 %	0 %	386602602
158	NC_017630	CT	3	6	80085	80090	0 %	50 %	0 %	50 %	386602603
159	NC_017630	CT	3	6	80095	80100	0 %	50 %	0 %	50 %	386602603
160	NC_017630	TC	3	6	81154	81159	0 %	50 %	0 %	50 %	386602606
161	NC_017630	TG	3	6	81331	81336	0 %	50 %	50 %	0 %	386602607
162	NC_017630	GC	3	6	83954	83959	0 %	0 %	50 %	50 %	386602609
163	NC_017630	TG	3	6	84419	84424	0 %	50 %	50 %	0 %	386602610
164	NC_017630	AG	3	6	84452	84457	50 %	0 %	50 %	0 %	386602610
165	NC_017630	AT	3	6	86422	86427	50 %	50 %	0 %	0 %	386602611
166	NC_017630	GT	3	6	87057	87062	0 %	50 %	50 %	0 %	386602612
167	NC_017630	GA	3	6	87064	87069	50 %	0 %	50 %	0 %	386602612
168	NC_017630	CG	3	6	87251	87256	0 %	0 %	50 %	50 %	386602613
169	NC_017630	TG	3	6	88089	88094	0 %	50 %	50 %	0 %	386602614
170	NC_017630	GT	3	6	88642	88647	0 %	50 %	50 %	0 %	386602614
171	NC_017630	AG	3	6	89017	89022	50 %	0 %	50 %	0 %	386602614
172	NC_017630	CG	3	6	89097	89102	0 %	0 %	50 %	50 %	386602614
173	NC_017630	AG	3	6	89495	89500	50 %	0 %	50 %	0 %	386602615
174	NC_017630	GC	3	6	89877	89882	0 %	0 %	50 %	50 %	386602615
175	NC_017630	GT	3	6	90049	90054	0 %	50 %	50 %	0 %	386602615
176	NC_017630	CG	3	6	90085	90090	0 %	0 %	50 %	50 %	386602615
177	NC_017630	AT	3	6	90567	90572	50 %	50 %	0 %	0 %	386602615
178	NC_017630	AG	3	6	92508	92513	50 %	0 %	50 %	0 %	386602617
179	NC_017630	AC	3	6	92855	92860	50 %	0 %	0 %	50 %	386602617
180	NC_017630	AT	3	6	93173	93178	50 %	50 %	0 %	0 %	386602617
181	NC_017630	GC	3	6	93461	93466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_017630	TG	3	6	93520	93525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017630	GC	3	6	93790	93795	0 %	0 %	50 %	50 %	386602618
184	NC_017630	CA	3	6	93933	93938	50 %	0 %	0 %	50 %	386602618
185	NC_017630	TG	3	6	94420	94425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017630	TC	3	6	94460	94465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
187	NC_017630	AT	3	6	94934	94939	50 %	50 %	0 %	0 %	386602620
188	NC_017630	TA	3	6	95654	95659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017630	AG	3	6	95831	95836	50 %	0 %	50 %	0 %	386602621
190	NC_017630	AT	3	6	95893	95898	50 %	50 %	0 %	0 %	386602621
191	NC_017630	GC	3	6	96751	96756	0 %	0 %	50 %	50 %	386602622
192	NC_017630	GC	3	6	97899	97904	0 %	0 %	50 %	50 %	386602625
193	NC_017630	GA	3	6	99201	99206	50 %	0 %	50 %	0 %	386602626
194	NC_017630	TA	3	6	99674	99679	50 %	50 %	0 %	0 %	386602627
195	NC_017630	GC	4	8	99866	99873	0 %	0 %	50 %	50 %	386602628
196	NC_017630	AT	3	6	100343	100348	50 %	50 %	0 %	0 %	386602629
197	NC_017630	TC	3	6	100612	100617	0 %	50 %	0 %	50 %	386602629
198	NC_017630	GC	3	6	100645	100650	0 %	0 %	50 %	50 %	386602629
199	NC_017630	AC	4	8	101339	101346	50 %	0 %	0 %	50 %	386602631
200	NC_017630	CG	3	6	101840	101845	0 %	0 %	50 %	50 %	386602631
201	NC_017630	CG	3	6	102088	102093	0 %	0 %	50 %	50 %	386602632
202	NC_017630	AG	3	6	102140	102145	50 %	0 %	50 %	0 %	386602632
203	NC_017630	CG	4	8	103465	103472	0 %	0 %	50 %	50 %	386602633
204	NC_017630	CT	3	6	104061	104066	0 %	50 %	0 %	50 %	386602633
205	NC_017630	AG	3	6	104756	104761	50 %	0 %	50 %	0 %	386602634
206	NC_017630	CG	3	6	106055	106060	0 %	0 %	50 %	50 %	386602635
207	NC_017630	GC	3	6	106773	106778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
208	NC_017630	GC	3	6	107126	107131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
209	NC_017630	GC	3	6	107328	107333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
210	NC_017630	GC	3	6	107877	107882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
211	NC_017630	GC	3	6	107961	107966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
212	NC_017630	AG	3	6	108161	108166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
213	NC_017630	AC	4	8	108326	108333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
214	NC_017630	CG	3	6	108977	108982	0 %	0 %	50 %	50 %	386602636
215	NC_017630	GC	3	6	110507	110512	0 %	0 %	50 %	50 %	386602639
216	NC_017630	GA	3	6	110626	110631	50 %	0 %	50 %	0 %	386602639
217	NC_017630	AG	4	8	111047	111054	50 %	0 %	50 %	0 %	386602639
218	NC_017630	GA	3	6	111300	111305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
219	NC_017630	AG	3	6	111867	111872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.