MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli IHE3034 chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017628	GAAAAT	2	12	10669	10680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017628	AAGGGA	2	12	86689	86700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017628	GTAGTG	2	12	205097	205108	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017628	TGTTGA	2	12	263425	263436	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017628	CTTTTC	2	12	279416	279427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017628	TTTTCT	2	12	329355	329366	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017628	CTATTT	2	12	330392	330403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017628	GTCACT	2	12	333894	333905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017628	AATTTC	2	12	337120	337131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017628	TGTCTG	2	12	347050	347061	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017628	TGAGGT	2	12	347243	347254	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017628	TTTATT	2	12	364227	364238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017628	AACAAT	2	12	410789	410800	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017628	TATTGA	2	12	413635	413646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017628	TTTTCA	2	12	475892	475903	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017628	CAGGCG	2	12	494736	494747	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017628	TTTCTG	2	12	521098	521109	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017628	CAGGCA	2	12	548511	548522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017628	AATATG	2	12	602625	602636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017628	TGCAAA	2	12	633436	633447	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017628	CATGAG	2	12	675370	675381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017628	ATTTTT	2	12	728543	728554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017628	CGCTGG	2	12	728634	728645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017628	TTTTCT	2	12	794816	794827	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017628	AATGAT	2	12	930659	930670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017628	TAACCG	2	12	930889	930900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017628	AACGCT	2	12	940330	940341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017628	TTTGCC	2	12	941044	941055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017628	AAATAA	2	12	1002224	1002235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017628	CTGGAA	2	12	1011788	1011799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017628	TGGCAA	2	12	1013716	1013727	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017628	GCATCG	2	12	1013983	1013994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017628	AAAGAT	2	12	1034581	1034592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017628	TAAGGA	2	12	1070471	1070482	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017628	ATAATG	2	12	1071886	1071897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017628	TGGTAA	2	12	1095667	1095678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017628	TGTTAA	2	12	1104111	1104122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017628	ATGAAG	2	12	1137670	1137681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017628	CAAATG	2	12	1172198	1172209	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017628	GAATAA	2	12	1173560	1173571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017628	CAAACC	2	12	1174740	1174751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017628	CAAAAA	2	12	1209284	1209295	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017628	GACAGA	2	12	1318729	1318740	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017628	AAAATG	2	12	1329895	1329906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017628	AGGGGG	2	12	1341816	1341827	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017628	ATCGTA	2	12	1345011	1345022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017628	CTTATT	2	12	1411578	1411589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017628	CAAAAG	2	12	1418629	1418640	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017628	CTGATC	2	12	1429107	1429118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017628	GGAAAA	2	12	1447405	1447416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017628	AAAGTT	2	12	1480435	1480446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017628	TATAAC	2	12	1529663	1529674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017628	TAAATT	2	12	1575581	1575592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017628	GTTAAT	2	12	1640543	1640554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017628	ACCGTT	2	12	1674483	1674494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017628	TGGTTA	2	12	1683312	1683323	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017628	CAAAAA	2	12	1727656	1727667	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017628	ATACTT	2	12	1813438	1813449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017628	AAAATA	2	12	1827101	1827112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017628	TGTTTT	2	12	1827734	1827745	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017628	AAGACT	2	12	1827994	1828005	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017628	ACAGCG	2	12	1937371	1937382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017628	TATTAC	2	12	1940406	1940417	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017628	TTTCTT	2	12	1952859	1952870	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017628	TCAACG	2	12	1970475	1970486	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017628	AATTCA	2	12	2046645	2046656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017628	TCTTAT	2	12	2060453	2060464	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017628	GTGTAT	2	12	2074770	2074781	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017628	TGCACC	2	12	2141796	2141807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017628	CCCGCC	2	12	2149690	2149701	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
71	NC_017628	ACAGAC	2	12	2180978	2180989	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017628	CACCGC	2	12	2200864	2200875	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017628	CCCCCT	2	12	2235122	2235133	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
74	NC_017628	CGCCAG	2	12	2235876	2235887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017628	CCGCCT	2	12	2236445	2236456	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017628	ATCGAT	2	12	2236779	2236790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017628	ACGCAG	2	12	2242182	2242193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017628	CTGATA	2	12	2251287	2251298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017628	GAAAAC	2	12	2278625	2278636	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017628	TTTTGT	2	12	2338651	2338662	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017628	CCTGTT	2	12	2435078	2435089	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017628	TCTTCC	2	12	2482056	2482067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017628	ATGCTA	2	12	2505320	2505331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017628	TAAATG	2	12	2617213	2617224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017628	TGTCAC	2	12	2630847	2630858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017628	AGCGGA	2	12	2633983	2633994	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017628	AGAAAA	2	12	2641126	2641137	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017628	TGCCAT	2	12	2676146	2676157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017628	TATTTG	2	12	2744560	2744571	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017628	CTGATG	2	12	2771506	2771517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017628	GTTATG	2	12	2789351	2789362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017628	TCGATA	2	12	2799977	2799988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017628	CAAGTG	2	12	2806320	2806331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017628	TATGGG	2	12	2919737	2919748	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017628	AAAAAC	2	12	2921655	2921666	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017628	TCCTTC	2	12	2941752	2941763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017628	TGAGCG	2	12	2976228	2976239	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017628	TGGACA	2	12	2986238	2986249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017628	ATATAG	2	12	3092338	3092349	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017628	TGATAT	2	12	3130190	3130201	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017628	TGATAT	2	12	3130330	3130341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017628	TGACGC	2	12	3181637	3181648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017628	AATGAT	2	12	3209553	3209564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017628	ACAAGA	2	12	3229866	3229877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017628	TTTGTT	2	12	3254690	3254701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017628	TCGATA	2	12	3367314	3367325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017628	ATCGCG	2	12	3372884	3372895	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017628	GTAAGG	2	12	3387559	3387570	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017628	ACTGAG	2	12	3411668	3411679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017628	TTTTCG	2	12	3484782	3484793	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017628	ATTTAA	2	12	3497986	3497997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017628	ATTTAA	2	12	3560607	3560618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017628	AGTTGT	2	12	3591904	3591915	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017628	CTTTTT	2	12	3596581	3596592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017628	AATGAT	2	12	3597416	3597427	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017628	TCTCCC	2	12	3619267	3619278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017628	GTAACC	2	12	3645033	3645044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017628	TTTTAT	2	12	3654813	3654824	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017628	AAGCGA	2	12	3660211	3660222	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017628	CTTTCT	2	12	3684078	3684089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017628	ACAGAA	2	12	3707608	3707619	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017628	AGCGTT	2	12	3789395	3789406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017628	TTTATA	2	12	3806067	3806078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017628	CCTTTC	2	12	3809418	3809429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017628	ATTACG	2	12	3862465	3862476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017628	CCCTAT	2	12	3909112	3909123	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017628	AATTTA	2	12	3912111	3912122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017628	CATAAT	2	12	3931745	3931756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017628	TGATAA	2	12	3938921	3938932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017628	AAGATA	2	12	4009731	4009742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017628	AGATGC	2	12	4025200	4025211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017628	GCCAGC	2	12	4088467	4088478	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017628	CTGAAG	2	12	4090920	4090931	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017628	CCGGAA	2	12	4274224	4274235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017628	CTTTTT	2	12	4315100	4315111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017628	TCCAGT	2	12	4392659	4392670	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017628	AAATGG	2	12	4449422	4449433	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017628	ATTTTT	2	12	4554766	4554777	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017628	GGCTAT	2	12	4566187	4566198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017628	CTTATC	2	12	4567126	4567137	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017628	TAACCA	2	12	4641043	4641054	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017628	ATTTAT	2	12	4690215	4690226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017628	GTCTTT	2	12	4699024	4699035	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_017628	GCTGTT	2	12	4714202	4714213	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017628	CTTTCG	2	12	4765913	4765924	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017628	CTGATA	2	12	4766728	4766739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017628	TTTTTA	2	12	4816982	4816993	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017628	ATCGGT	2	12	4818056	4818067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_017628	TTTAAT	2	12	4848841	4848852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017628	CAGCCT	2	12	4888476	4888487	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017628	TTTTTA	2	12	4936115	4936126	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017628	AACAAT	2	12	4966506	4966517	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_017628	CGGTTG	2	12	4988483	4988494	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_017628	TTTTAT	2	12	5050137	5050148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.