MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli IHE3034 chromosome

Total Repeats: 3246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017628	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	386597753
2	NC_017628	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	386597754
3	NC_017628	CGCAG	2	10	8246	8255	20 %	0 %	40 %	40 %	386597759
4	NC_017628	GTGAA	2	10	8923	8932	40 %	20 %	40 %	0 %	386597759
5	NC_017628	CGTAC	2	10	9674	9683	20 %	20 %	20 %	40 %	386597760
6	NC_017628	CGCGC	2	10	10831	10840	0 %	0 %	40 %	60 %	386597762
7	NC_017628	GTTTC	2	10	11727	11736	0 %	60 %	20 %	20 %	386597763
8	NC_017628	GAATT	2	10	15980	15989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017628	CTGGA	2	10	18097	18106	20 %	20 %	40 %	20 %	386597767
10	NC_017628	AATGT	2	10	18509	18518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017628	ACCAC	2	10	18936	18945	40 %	0 %	0 %	60 %	386597768
12	NC_017628	TCCTT	2	10	19775	19784	0 %	60 %	0 %	40 %	386597768
13	NC_017628	CCGAT	2	10	20467	20476	20 %	20 %	20 %	40 %	386597769
14	NC_017628	GATGC	2	10	27241	27250	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017628	GCGAA	2	10	34360	34369	40 %	0 %	40 %	20 %	386597782
16	NC_017628	CCGTT	2	10	35254	35263	0 %	40 %	20 %	40 %	386597782
17	NC_017628	CACGG	2	10	35631	35640	20 %	0 %	40 %	40 %	386597782
18	NC_017628	GATGC	2	10	37333	37342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017628	CGAAT	2	10	39084	39093	40 %	20 %	20 %	20 %	386597787
20	NC_017628	CCATG	2	10	40621	40630	20 %	20 %	20 %	40 %	386597788
21	NC_017628	CCGTA	2	10	42266	42275	20 %	20 %	20 %	40 %	386597789
22	NC_017628	TTAAA	2	10	43004	43013	60 %	40 %	0 %	0 %	386597789
23	NC_017628	ACCCA	2	10	43747	43756	40 %	0 %	0 %	60 %	386597790
24	NC_017628	TTTGA	2	10	45373	45382	20 %	60 %	20 %	0 %	386597791
25	NC_017628	CGGCG	2	10	45624	45633	0 %	0 %	60 %	40 %	386597791
26	NC_017628	AATCA	2	10	45906	45915	60 %	20 %	0 %	20 %	386597792
27	NC_017628	CGGTT	2	10	46861	46870	0 %	40 %	40 %	20 %	386597793
28	NC_017628	TGGCG	2	10	48553	48562	0 %	20 %	60 %	20 %	386597795
29	NC_017628	TGCAC	2	10	50315	50324	20 %	20 %	20 %	40 %	386597796
30	NC_017628	AACGT	2	10	54721	54730	40 %	20 %	20 %	20 %	386597801
31	NC_017628	GCGTC	2	10	57705	57714	0 %	20 %	40 %	40 %	386597804
32	NC_017628	ATGTT	2	10	58519	58528	20 %	60 %	20 %	0 %	386597805
33	NC_017628	TGCGT	2	10	59238	59247	0 %	40 %	40 %	20 %	386597805
34	NC_017628	AAAGT	2	10	65005	65014	60 %	20 %	20 %	0 %	386597808
35	NC_017628	CAGCG	2	10	68620	68629	20 %	0 %	40 %	40 %	386597811
36	NC_017628	TCGCG	2	10	69890	69899	0 %	20 %	40 %	40 %	386597811
37	NC_017628	TTTTC	2	10	74310	74319	0 %	80 %	0 %	20 %	386597814
38	NC_017628	AAAGC	2	10	74614	74623	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017628	CAGCA	2	10	75251	75260	40 %	0 %	20 %	40 %	386597815
40	NC_017628	TAGTG	2	10	79196	79205	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017628	TTGCT	2	10	79348	79357	0 %	60 %	20 %	20 %	386597819
42	NC_017628	GATGG	2	10	80084	80093	20 %	20 %	60 %	0 %	386597819
43	NC_017628	ATTTT	2	10	80912	80921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017628	GGGAG	2	10	81076	81085	20 %	0 %	80 %	0 %	386597820
45	NC_017628	CGCCA	2	10	81140	81149	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_017628	ACCGG	2	10	82081	82090	20 %	0 %	40 %	40 %	386597822
47	NC_017628	CCTGG	2	10	82337	82346	0 %	20 %	40 %	40 %	386597822
48	NC_017628	ATGCG	2	10	83782	83791	20 %	20 %	40 %	20 %	386597823
49	NC_017628	GACCG	2	10	84604	84613	20 %	0 %	40 %	40 %	386597824
50	NC_017628	ATGTT	2	10	87150	87159	20 %	60 %	20 %	0 %	386597826
51	NC_017628	AAAAC	2	10	87565	87574	80 %	0 %	0 %	20 %	386597826
52	NC_017628	TGCAT	2	10	88092	88101	20 %	40 %	20 %	20 %	386597827
53	NC_017628	ATTCC	2	10	88262	88271	20 %	40 %	0 %	40 %	386597827
54	NC_017628	AGTTC	2	10	93355	93364	20 %	40 %	20 %	20 %	386597832
55	NC_017628	TGCCT	2	10	93455	93464	0 %	40 %	20 %	40 %	386597833
56	NC_017628	CGTGG	2	10	94728	94737	0 %	20 %	60 %	20 %	386597834
57	NC_017628	TATCG	2	10	95235	95244	20 %	40 %	20 %	20 %	386597834
58	NC_017628	GGGCT	2	10	99107	99116	0 %	20 %	60 %	20 %	386597837
59	NC_017628	GCCTG	2	10	99567	99576	0 %	20 %	40 %	40 %	386597838
60	NC_017628	TCTGG	2	10	100814	100823	0 %	40 %	40 %	20 %	386597839
61	NC_017628	ACCGT	2	10	101480	101489	20 %	20 %	20 %	40 %	386597839
62	NC_017628	ATCAG	2	10	103253	103262	40 %	20 %	20 %	20 %	386597841
63	NC_017628	AGCCG	2	10	105021	105030	20 %	0 %	40 %	40 %	386597842
64	NC_017628	GCGCA	2	10	107349	107358	20 %	0 %	40 %	40 %	386597844
65	NC_017628	CCGGC	2	10	111313	111322	0 %	0 %	40 %	60 %	386597848
66	NC_017628	TGGTC	2	10	111467	111476	0 %	40 %	40 %	20 %	386597848
67	NC_017628	CGCGG	2	10	114519	114528	0 %	0 %	60 %	40 %	386597851
68	NC_017628	CATCG	2	10	116776	116785	20 %	20 %	20 %	40 %	386597854
69	NC_017628	TAACG	2	10	117470	117479	40 %	20 %	20 %	20 %	386597854
70	NC_017628	ATGCC	2	10	117929	117938	20 %	20 %	20 %	40 %	386597854
71	NC_017628	AATGC	2	10	119212	119221	40 %	20 %	20 %	20 %	386597855
72	NC_017628	TCTGT	2	10	120159	120168	0 %	60 %	20 %	20 %	386597857
73	NC_017628	GCAGG	2	10	122591	122600	20 %	0 %	60 %	20 %	386597860
74	NC_017628	GTGTT	2	10	123800	123809	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017628	TCATT	2	10	127631	127640	20 %	60 %	0 %	20 %	386597863
76	NC_017628	AATTG	2	10	127957	127966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017628	CGAAG	2	10	128410	128419	40 %	0 %	40 %	20 %	386597864
78	NC_017628	ACACG	2	10	128543	128552	40 %	0 %	20 %	40 %	386597864
79	NC_017628	TCGCG	2	10	128804	128813	0 %	20 %	40 %	40 %	386597864
80	NC_017628	GCATC	2	10	128894	128903	20 %	20 %	20 %	40 %	386597864
81	NC_017628	GACTG	2	10	130212	130221	20 %	20 %	40 %	20 %	386597865
82	NC_017628	AGAGC	2	10	130622	130631	40 %	0 %	40 %	20 %	386597865
83	NC_017628	CTTCT	2	10	135884	135893	0 %	60 %	0 %	40 %	386597868
84	NC_017628	TCTGG	2	10	139251	139260	0 %	40 %	40 %	20 %	386597869
85	NC_017628	GGGCA	2	10	140662	140671	20 %	0 %	60 %	20 %	386597870
86	NC_017628	CAGCG	2	10	140941	140950	20 %	0 %	40 %	40 %	386597871
87	NC_017628	ACGAC	2	10	142221	142230	40 %	0 %	20 %	40 %	386597872
88	NC_017628	GCGCG	2	10	146980	146989	0 %	0 %	60 %	40 %	386597875
89	NC_017628	CCGTC	2	10	147771	147780	0 %	20 %	20 %	60 %	386597876
90	NC_017628	GTGAA	2	10	147781	147790	40 %	20 %	40 %	0 %	386597876
91	NC_017628	GTTCA	2	10	148168	148177	20 %	40 %	20 %	20 %	386597877
92	NC_017628	ATCCA	2	10	148494	148503	40 %	20 %	0 %	40 %	386597877
93	NC_017628	GTAAG	2	10	148707	148716	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017628	CTTTA	2	10	149757	149766	20 %	60 %	0 %	20 %	386597879
95	NC_017628	TCCTC	2	10	150427	150436	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_017628	TGGTG	2	10	153598	153607	0 %	40 %	60 %	0 %	386597883
97	NC_017628	GGGAG	2	10	153622	153631	20 %	0 %	80 %	0 %	386597883
98	NC_017628	CGCCA	2	10	156399	156408	20 %	0 %	20 %	60 %	386597886
99	NC_017628	ATTTT	2	10	156572	156581	20 %	80 %	0 %	0 %	386597886
100	NC_017628	GTTGG	2	10	156693	156702	0 %	40 %	60 %	0 %	386597886
101	NC_017628	CTGTA	2	10	157310	157319	20 %	40 %	20 %	20 %	386597887
102	NC_017628	TCCTG	2	10	157470	157479	0 %	40 %	20 %	40 %	386597887
103	NC_017628	ATTTT	2	10	157902	157911	20 %	80 %	0 %	0 %	386597888
104	NC_017628	CATAA	2	10	158169	158178	60 %	20 %	0 %	20 %	386597888
105	NC_017628	TTGTT	2	10	158981	158990	0 %	80 %	20 %	0 %	386597890
106	NC_017628	TTCAA	2	10	159131	159140	40 %	40 %	0 %	20 %	386597890
107	NC_017628	AATTT	2	10	163030	163039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017628	TATAT	2	10	163116	163125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017628	GCGAG	2	10	164385	164394	20 %	0 %	60 %	20 %	386597894
110	NC_017628	TGGCG	2	10	164822	164831	0 %	20 %	60 %	20 %	386597894
111	NC_017628	ACCAC	2	10	167726	167735	40 %	0 %	0 %	60 %	386597898
112	NC_017628	GGCGT	2	10	169429	169438	0 %	20 %	60 %	20 %	386597899
113	NC_017628	CGACG	2	10	170468	170477	20 %	0 %	40 %	40 %	386597899
114	NC_017628	AAAAC	2	10	174353	174362	80 %	0 %	0 %	20 %	386597902
115	NC_017628	TGGTT	2	10	174610	174619	0 %	60 %	40 %	0 %	386597902
116	NC_017628	TGGTC	2	10	176733	176742	0 %	40 %	40 %	20 %	386597904
117	NC_017628	TGGCG	2	10	177978	177987	0 %	20 %	60 %	20 %	386597905
118	NC_017628	CGGCG	2	10	178608	178617	0 %	0 %	60 %	40 %	386597905
119	NC_017628	TTCCA	2	10	179219	179228	20 %	40 %	0 %	40 %	386597905
120	NC_017628	GACCG	2	10	179744	179753	20 %	0 %	40 %	40 %	386597906
121	NC_017628	GGTCC	2	10	183542	183551	0 %	20 %	40 %	40 %	386597910
122	NC_017628	ACGGG	2	10	185459	185468	20 %	0 %	60 %	20 %	386597912
123	NC_017628	TGCGC	2	10	187166	187175	0 %	20 %	40 %	40 %	386597913
124	NC_017628	GTGAT	2	10	187618	187627	20 %	40 %	40 %	0 %	386597913
125	NC_017628	GTGAT	2	10	187909	187918	20 %	40 %	40 %	0 %	386597913
126	NC_017628	TACGT	2	10	188154	188163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017628	TGGCC	2	10	189840	189849	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017628	GCCAG	2	10	191586	191595	20 %	0 %	40 %	40 %	386597917
129	NC_017628	GGCGT	2	10	192424	192433	0 %	20 %	60 %	20 %	386597917
130	NC_017628	GTTCT	2	10	193027	193036	0 %	60 %	20 %	20 %	386597917
131	NC_017628	CTGAA	2	10	195019	195028	40 %	20 %	20 %	20 %	386597919
132	NC_017628	AAGCG	2	10	195083	195092	40 %	0 %	40 %	20 %	386597919
133	NC_017628	TGGTG	2	10	196866	196875	0 %	40 %	60 %	0 %	386597921
134	NC_017628	TGCAC	2	10	196992	197001	20 %	20 %	20 %	40 %	386597921
135	NC_017628	TGCGC	2	10	197385	197394	0 %	20 %	40 %	40 %	386597921
136	NC_017628	GTCTG	2	10	197550	197559	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017628	CATGG	2	10	199086	199095	20 %	20 %	40 %	20 %	386597923
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146	NC_017628	GGTGG	2	10	211379	211388	0 %	20 %	80 %	0 %	386597934
147	NC_017628	TGCGC	2	10	220732	220741	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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234	NC_017628	AGCGA	2	10	340396	340405	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_017628	TTTTC	2	10	381701	381710	0 %	80 %	0 %	20 %	386598072
263	NC_017628	CTTAC	2	10	382892	382901	20 %	40 %	0 %	40 %	386598073
264	NC_017628	TGTGT	2	10	385141	385150	0 %	60 %	40 %	0 %	386598075
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