MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli 042 plasmid pAA

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017627	ACCAT	2	10	3159	3168	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017627	TAAAA	2	10	9693	9702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017627	AAGCG	2	10	14198	14207	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017627	CACTG	2	10	15321	15330	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017627	TCGCA	2	10	18825	18834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017627	CTGAA	2	10	20229	20238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017627	GCCCA	2	10	26467	26476	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017627	TAAAA	2	10	26712	26721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017627	TCAGT	2	10	32805	32814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017627	GCCCA	2	10	36378	36387	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017627	TGGTG	2	10	42526	42535	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017627	CAGAC	2	10	49478	49487	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017627	AAATC	2	10	67915	67924	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017627	GAATC	2	10	83425	83434	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017627	ATCAC	2	10	83472	83481	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017627	GTGAT	2	10	86417	86426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017627	GTGCC	2	10	96719	96728	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017627	ACCTT	2	10	96892	96901	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017627	GGCAC	2	10	96935	96944	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017627	CCCGT	2	10	99499	99508	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_017627	GCCGC	2	10	99550	99559	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017627	ACCCA	2	10	99636	99645	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017627	ATAAA	2	10	101177	101186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017627	CAGTT	2	10	105274	105283	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017627	ATTTC	2	10	105632	105641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.