MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli 042 plasmid pAA

Total Repeats: 313

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017627	TACC	2	8	402	409	25 %	25 %	0 %	50 %	387604869
2	NC_017627	CCGA	2	8	445	452	25 %	0 %	25 %	50 %	387604869
3	NC_017627	ACAG	2	8	542	549	50 %	0 %	25 %	25 %	387604869
4	NC_017627	CAGA	2	8	637	644	50 %	0 %	25 %	25 %	387604869
5	NC_017627	TCGC	2	8	1154	1161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017627	GAAA	2	8	1525	1532	75 %	0 %	25 %	0 %	387604870
7	NC_017627	TCAA	2	8	3197	3204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017627	ATGC	2	8	3360	3367	25 %	25 %	25 %	25 %	387604872
9	NC_017627	ATCA	2	8	3536	3543	50 %	25 %	0 %	25 %	387604873
10	NC_017627	CTGA	2	8	4248	4255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017627	TTCT	3	12	4773	4784	0 %	75 %	0 %	25 %	387604874
12	NC_017627	AAGC	2	8	5040	5047	50 %	0 %	25 %	25 %	387604874
13	NC_017627	TCTT	2	8	5127	5134	0 %	75 %	0 %	25 %	387604874
14	NC_017627	TTTC	2	8	5733	5740	0 %	75 %	0 %	25 %	387604875
15	NC_017627	ACAG	2	8	5884	5891	50 %	0 %	25 %	25 %	387604875
16	NC_017627	TTTA	2	8	5897	5904	25 %	75 %	0 %	0 %	387604875
17	NC_017627	TTTA	2	8	6416	6423	25 %	75 %	0 %	0 %	387604875
18	NC_017627	GAAA	2	8	6594	6601	75 %	0 %	25 %	0 %	387604875
19	NC_017627	AAAG	2	8	7033	7040	75 %	0 %	25 %	0 %	387604876
20	NC_017627	GAAT	2	8	7549	7556	50 %	25 %	25 %	0 %	387604876
21	NC_017627	GAGT	2	8	8298	8305	25 %	25 %	50 %	0 %	387604878
22	NC_017627	ATTG	2	8	8542	8549	25 %	50 %	25 %	0 %	387604878
23	NC_017627	TAAG	2	8	9715	9722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017627	AAGC	2	8	10376	10383	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017627	GGAT	2	8	10397	10404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017627	GTCA	2	8	10564	10571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017627	GCCG	2	8	10668	10675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017627	GCGA	2	8	11801	11808	25 %	0 %	50 %	25 %	387604880
29	NC_017627	ACTG	2	8	12289	12296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017627	CCTG	2	8	12930	12937	0 %	25 %	25 %	50 %	387604882
31	NC_017627	CTGA	2	8	12993	13000	25 %	25 %	25 %	25 %	387604882
32	NC_017627	CACT	2	8	13244	13251	25 %	25 %	0 %	50 %	387604882
33	NC_017627	GCAT	2	8	14006	14013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017627	GGAT	2	8	14464	14471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017627	AATG	2	8	14639	14646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017627	GCTG	2	8	14775	14782	0 %	25 %	50 %	25 %	387604885
37	NC_017627	GGCT	2	8	14908	14915	0 %	25 %	50 %	25 %	387604885
38	NC_017627	GCCG	2	8	14965	14972	0 %	0 %	50 %	50 %	387604885
39	NC_017627	CCGC	2	8	15073	15080	0 %	0 %	25 %	75 %	387604885
40	NC_017627	TAAA	2	8	15313	15320	75 %	25 %	0 %	0 %	387604885
41	NC_017627	TACT	2	8	15533	15540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017627	AGAA	2	8	16233	16240	75 %	0 %	25 %	0 %	387604886
43	NC_017627	GAAT	2	8	16241	16248	50 %	25 %	25 %	0 %	387604886
44	NC_017627	AGGA	2	8	16834	16841	50 %	0 %	50 %	0 %	387604887
45	NC_017627	CTGG	2	8	16934	16941	0 %	25 %	50 %	25 %	387604887
46	NC_017627	GTTG	2	8	17056	17063	0 %	50 %	50 %	0 %	387604887
47	NC_017627	GCAT	2	8	17125	17132	25 %	25 %	25 %	25 %	387604887
48	NC_017627	CAGT	2	8	18161	18168	25 %	25 %	25 %	25 %	387604888
49	NC_017627	GGCA	2	8	19776	19783	25 %	0 %	50 %	25 %	387604889
50	NC_017627	CTGA	2	8	19873	19880	25 %	25 %	25 %	25 %	387604889
51	NC_017627	CCAC	2	8	20384	20391	25 %	0 %	0 %	75 %	387604890
52	NC_017627	ATAC	2	8	20564	20571	50 %	25 %	0 %	25 %	387604890
53	NC_017627	GTAA	2	8	20751	20758	50 %	25 %	25 %	0 %	387604890
54	NC_017627	CCAC	2	8	20765	20772	25 %	0 %	0 %	75 %	387604890
55	NC_017627	TCTT	2	8	21007	21014	0 %	75 %	0 %	25 %	387604890
56	NC_017627	TACG	2	8	21667	21674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017627	GGCT	2	8	22131	22138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017627	GTTT	2	8	22540	22547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017627	GCCT	2	8	22781	22788	0 %	25 %	25 %	50 %	387604892
60	NC_017627	CATA	2	8	23014	23021	50 %	25 %	0 %	25 %	387604893
61	NC_017627	TTCC	2	8	23199	23206	0 %	50 %	0 %	50 %	387604893
62	NC_017627	CAGC	2	8	23824	23831	25 %	0 %	25 %	50 %	387604893
63	NC_017627	TGAC	2	8	23925	23932	25 %	25 %	25 %	25 %	387604893
64	NC_017627	GAAT	2	8	24278	24285	50 %	25 %	25 %	0 %	387604893
65	NC_017627	CCCT	2	8	25417	25424	0 %	25 %	0 %	75 %	387604893
66	NC_017627	GGCG	2	8	25840	25847	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017627	CTGC	2	8	26240	26247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017627	GCTG	2	8	27443	27450	0 %	25 %	50 %	25 %	387604895
69	NC_017627	TGGC	2	8	27576	27583	0 %	25 %	50 %	25 %	387604895
70	NC_017627	ATCA	2	8	27910	27917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017627	TTCA	2	8	28044	28051	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017627	AAAC	2	8	28158	28165	75 %	0 %	0 %	25 %	387604896
73	NC_017627	GTAT	2	8	28864	28871	25 %	50 %	25 %	0 %	387604896
74	NC_017627	TATT	2	8	28995	29002	25 %	75 %	0 %	0 %	387604896
75	NC_017627	TATC	2	8	29641	29648	25 %	50 %	0 %	25 %	387604896
76	NC_017627	ACTG	2	8	30739	30746	25 %	25 %	25 %	25 %	387604896
77	NC_017627	AAAC	2	8	30823	30830	75 %	0 %	0 %	25 %	387604896
78	NC_017627	TCTG	2	8	31019	31026	0 %	50 %	25 %	25 %	387604896
79	NC_017627	CCTT	2	8	31107	31114	0 %	50 %	0 %	50 %	387604896
80	NC_017627	AACA	2	8	31262	31269	75 %	0 %	0 %	25 %	387604896
81	NC_017627	GCAG	2	8	31328	31335	25 %	0 %	50 %	25 %	387604896
82	NC_017627	GTCA	2	8	32171	32178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017627	CTTC	2	8	32195	32202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017627	GCCA	2	8	32357	32364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017627	TGCC	2	8	32584	32591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017627	GCCT	2	8	32593	32600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017627	GCCA	2	8	32852	32859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017627	TTCT	2	8	32872	32879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017627	ATCC	2	8	33147	33154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017627	TTAC	2	8	34028	34035	25 %	50 %	0 %	25 %	387604898
91	NC_017627	GTAT	2	8	34215	34222	25 %	50 %	25 %	0 %	387604898
92	NC_017627	GTGG	2	8	34395	34402	0 %	25 %	75 %	0 %	387604898
93	NC_017627	ACTG	2	8	34607	34614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017627	TGTT	2	8	35089	35096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017627	TGTT	2	8	35165	35172	0 %	75 %	25 %	0 %	387604900
96	NC_017627	TCAG	2	8	35480	35487	25 %	25 %	25 %	25 %	387604900
97	NC_017627	CTTC	2	8	37820	37827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017627	CGCT	2	8	37828	37835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017627	CAAC	2	8	38355	38362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017627	TTTA	2	8	38414	38421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017627	ACAT	2	8	39434	39441	50 %	25 %	0 %	25 %	387604902
102	NC_017627	TAAA	2	8	39557	39564	75 %	25 %	0 %	0 %	387604902
103	NC_017627	CTTT	2	8	39570	39577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017627	AATA	2	8	39587	39594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017627	TGTT	2	8	39668	39675	0 %	75 %	25 %	0 %	387604903
106	NC_017627	AAAT	2	8	39936	39943	75 %	25 %	0 %	0 %	387604903
107	NC_017627	GCCA	2	8	40463	40470	25 %	0 %	25 %	50 %	387604904
108	NC_017627	CAGC	2	8	40596	40603	25 %	0 %	25 %	50 %	387604904
109	NC_017627	CTTC	2	8	41759	41766	0 %	50 %	0 %	50 %	387604906
110	NC_017627	ATCA	2	8	42603	42610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017627	AGAC	2	8	42833	42840	50 %	0 %	25 %	25 %	387604907
112	NC_017627	CATA	2	8	42873	42880	50 %	25 %	0 %	25 %	387604907
113	NC_017627	AATA	2	8	43082	43089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017627	ATAA	2	8	43149	43156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017627	CCAT	2	8	43259	43266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017627	TTAT	2	8	43576	43583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017627	AGCC	2	8	43714	43721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017627	CAGA	2	8	44298	44305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017627	CTTC	2	8	44910	44917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017627	TGGA	2	8	45056	45063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017627	CTTC	2	8	45773	45780	0 %	50 %	0 %	50 %	387604909
122	NC_017627	GCCA	2	8	45937	45944	25 %	0 %	25 %	50 %	387604909
123	NC_017627	AATC	2	8	46588	46595	50 %	25 %	0 %	25 %	387604911
124	NC_017627	TGCA	2	8	47349	47356	25 %	25 %	25 %	25 %	387604912
125	NC_017627	TGGA	2	8	47487	47494	25 %	25 %	50 %	0 %	387604912
126	NC_017627	CCGG	2	8	48032	48039	0 %	0 %	50 %	50 %	387604912
127	NC_017627	GGCG	2	8	48377	48384	0 %	0 %	75 %	25 %	387604912
128	NC_017627	CCAG	2	8	48741	48748	25 %	0 %	25 %	50 %	387604913
129	NC_017627	CCGG	2	8	48856	48863	0 %	0 %	50 %	50 %	387604914
130	NC_017627	AGGC	2	8	49234	49241	25 %	0 %	50 %	25 %	387604914
131	NC_017627	ACTG	2	8	49571	49578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017627	AATA	2	8	49761	49768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017627	TCGT	2	8	49935	49942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017627	TCCA	2	8	50298	50305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017627	GGCA	2	8	50664	50671	25 %	0 %	50 %	25 %	387604915
136	NC_017627	CAGC	2	8	51327	51334	25 %	0 %	25 %	50 %	387604916
137	NC_017627	AGGC	2	8	51335	51342	25 %	0 %	50 %	25 %	387604916
138	NC_017627	CCAC	2	8	51484	51491	25 %	0 %	0 %	75 %	387604916
139	NC_017627	CAGC	2	8	52426	52433	25 %	0 %	25 %	50 %	387604917
140	NC_017627	CCTG	2	8	52668	52675	0 %	25 %	25 %	50 %	387604917
141	NC_017627	TCCG	2	8	53051	53058	0 %	25 %	25 %	50 %	387604917
142	NC_017627	ACCG	2	8	54089	54096	25 %	0 %	25 %	50 %	387604917
143	NC_017627	CAGG	2	8	54904	54911	25 %	0 %	50 %	25 %	387604917
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284	NC_017627	CAGG	2	8	106357	106364	25 %	0 %	50 %	25 %	387604982
285	NC_017627	TGAT	2	8	106553	106560	25 %	50 %	25 %	0 %	387604982
286	NC_017627	CGGG	2	8	106805	106812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
287	NC_017627	GAGG	2	8	106834	106841	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017627	TCTG	2	8	106956	106963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
289	NC_017627	AATG	2	8	106999	107006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017627	TCGG	2	8	107735	107742	0 %	25 %	50 %	25 %	387604983
292	NC_017627	GGTA	2	8	107778	107785	25 %	25 %	50 %	0 %	387604983
293	NC_017627	AGAA	2	8	108213	108220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017627	GCCA	2	8	108403	108410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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297	NC_017627	TCAG	2	8	108992	108999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
298	NC_017627	GGAT	2	8	109229	109236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_017627	CAGA	2	8	112808	112815	50 %	0 %	25 %	25 %	387604988
312	NC_017627	GTGA	2	8	113087	113094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
313	NC_017627	TGGC	2	8	113123	113130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.