MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli 042 plasmid pAA

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017627	TCGC	2	8	1154	1161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017627	TCAA	2	8	3197	3204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017627	CTGA	2	8	4248	4255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017627	TAAG	2	8	9715	9722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017627	AAGC	2	8	10376	10383	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017627	GGAT	2	8	10397	10404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017627	GTCA	2	8	10564	10571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017627	GCCG	2	8	10668	10675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017627	ACTG	2	8	12289	12296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017627	GCAT	2	8	14006	14013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017627	GGAT	2	8	14464	14471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017627	AATG	2	8	14639	14646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017627	TACT	2	8	15533	15540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017627	TACG	2	8	21667	21674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017627	GGCT	2	8	22131	22138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017627	GTTT	2	8	22540	22547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017627	GGCG	2	8	25840	25847	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017627	CTGC	2	8	26240	26247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017627	ATCA	2	8	27910	27917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017627	TTCA	2	8	28044	28051	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017627	GTCA	2	8	32171	32178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017627	CTTC	2	8	32195	32202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017627	GCCA	2	8	32357	32364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017627	TGCC	2	8	32584	32591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017627	GCCT	2	8	32593	32600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017627	GCCA	2	8	32852	32859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017627	TTCT	2	8	32872	32879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017627	ATCC	2	8	33147	33154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017627	ACTG	2	8	34607	34614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017627	TGTT	2	8	35089	35096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017627	CTTC	2	8	37820	37827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017627	CGCT	2	8	37828	37835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017627	CAAC	2	8	38355	38362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017627	TTTA	2	8	38414	38421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017627	CTTT	2	8	39570	39577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017627	AATA	2	8	39587	39594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017627	ATCA	2	8	42603	42610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017627	AATA	2	8	43082	43089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017627	ATAA	2	8	43149	43156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017627	CCAT	2	8	43259	43266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017627	TTAT	2	8	43576	43583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017627	AGCC	2	8	43714	43721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017627	CAGA	2	8	44298	44305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017627	CTTC	2	8	44910	44917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017627	TGGA	2	8	45056	45063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017627	ACTG	2	8	49571	49578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017627	AATA	2	8	49761	49768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017627	TCGT	2	8	49935	49942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017627	TCCA	2	8	50298	50305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017627	ATTT	2	8	60406	60413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017627	ATTT	2	8	60437	60444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017627	GATA	2	8	81759	81766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017627	TAAT	2	8	82881	82888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017627	ATTT	2	8	83388	83395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017627	AAAT	2	8	83605	83612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017627	CAGT	2	8	86053	86060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017627	CAGT	2	8	94996	95003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017627	CAGA	2	8	95366	95373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017627	CCGT	2	8	96240	96247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017627	CCCG	2	8	96906	96913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_017627	CCGG	2	8	99511	99518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017627	CAAA	2	8	99611	99618	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017627	ACAA	2	8	99664	99671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017627	ATTG	2	8	99674	99681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017627	GAAC	2	8	101389	101396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017627	ACCA	2	8	103473	103480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017627	CATT	2	8	103721	103728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017627	TAAC	2	8	105494	105501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017627	CGAG	2	8	105536	105543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017627	TTCA	2	8	106262	106269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017627	CGCA	2	8	106299	106306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017627	CGGG	2	8	106805	106812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017627	GAGG	2	8	106834	106841	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017627	TCTG	2	8	106956	106963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017627	AATG	2	8	106999	107006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017627	AGAA	2	8	108213	108220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017627	GCCA	2	8	108403	108410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017627	TCAC	2	8	108439	108446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017627	TCAG	2	8	108992	108999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017627	GGAT	2	8	109229	109236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017627	ATCC	2	8	112297	112304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017627	ACTG	2	8	112533	112540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017627	GTGA	2	8	113087	113094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017627	TGGC	2	8	113123	113130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.