MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli 042 plasmid pAA

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017627	TACC	2	8	402	409	25 %	25 %	0 %	50 %	387604869
2	NC_017627	CCGA	2	8	445	452	25 %	0 %	25 %	50 %	387604869
3	NC_017627	ACAG	2	8	542	549	50 %	0 %	25 %	25 %	387604869
4	NC_017627	CAGA	2	8	637	644	50 %	0 %	25 %	25 %	387604869
5	NC_017627	GAAA	2	8	1525	1532	75 %	0 %	25 %	0 %	387604870
6	NC_017627	ATGC	2	8	3360	3367	25 %	25 %	25 %	25 %	387604872
7	NC_017627	ATCA	2	8	3536	3543	50 %	25 %	0 %	25 %	387604873
8	NC_017627	TTCT	3	12	4773	4784	0 %	75 %	0 %	25 %	387604874
9	NC_017627	AAGC	2	8	5040	5047	50 %	0 %	25 %	25 %	387604874
10	NC_017627	TCTT	2	8	5127	5134	0 %	75 %	0 %	25 %	387604874
11	NC_017627	TTTC	2	8	5733	5740	0 %	75 %	0 %	25 %	387604875
12	NC_017627	ACAG	2	8	5884	5891	50 %	0 %	25 %	25 %	387604875
13	NC_017627	TTTA	2	8	5897	5904	25 %	75 %	0 %	0 %	387604875
14	NC_017627	TTTA	2	8	6416	6423	25 %	75 %	0 %	0 %	387604875
15	NC_017627	GAAA	2	8	6594	6601	75 %	0 %	25 %	0 %	387604875
16	NC_017627	AAAG	2	8	7033	7040	75 %	0 %	25 %	0 %	387604876
17	NC_017627	GAAT	2	8	7549	7556	50 %	25 %	25 %	0 %	387604876
18	NC_017627	GAGT	2	8	8298	8305	25 %	25 %	50 %	0 %	387604878
19	NC_017627	ATTG	2	8	8542	8549	25 %	50 %	25 %	0 %	387604878
20	NC_017627	GCGA	2	8	11801	11808	25 %	0 %	50 %	25 %	387604880
21	NC_017627	CCTG	2	8	12930	12937	0 %	25 %	25 %	50 %	387604882
22	NC_017627	CTGA	2	8	12993	13000	25 %	25 %	25 %	25 %	387604882
23	NC_017627	CACT	2	8	13244	13251	25 %	25 %	0 %	50 %	387604882
24	NC_017627	GCTG	2	8	14775	14782	0 %	25 %	50 %	25 %	387604885
25	NC_017627	GGCT	2	8	14908	14915	0 %	25 %	50 %	25 %	387604885
26	NC_017627	GCCG	2	8	14965	14972	0 %	0 %	50 %	50 %	387604885
27	NC_017627	CCGC	2	8	15073	15080	0 %	0 %	25 %	75 %	387604885
28	NC_017627	TAAA	2	8	15313	15320	75 %	25 %	0 %	0 %	387604885
29	NC_017627	AGAA	2	8	16233	16240	75 %	0 %	25 %	0 %	387604886
30	NC_017627	GAAT	2	8	16241	16248	50 %	25 %	25 %	0 %	387604886
31	NC_017627	AGGA	2	8	16834	16841	50 %	0 %	50 %	0 %	387604887
32	NC_017627	CTGG	2	8	16934	16941	0 %	25 %	50 %	25 %	387604887
33	NC_017627	GTTG	2	8	17056	17063	0 %	50 %	50 %	0 %	387604887
34	NC_017627	GCAT	2	8	17125	17132	25 %	25 %	25 %	25 %	387604887
35	NC_017627	CAGT	2	8	18161	18168	25 %	25 %	25 %	25 %	387604888
36	NC_017627	GGCA	2	8	19776	19783	25 %	0 %	50 %	25 %	387604889
37	NC_017627	CTGA	2	8	19873	19880	25 %	25 %	25 %	25 %	387604889
38	NC_017627	CCAC	2	8	20384	20391	25 %	0 %	0 %	75 %	387604890
39	NC_017627	ATAC	2	8	20564	20571	50 %	25 %	0 %	25 %	387604890
40	NC_017627	GTAA	2	8	20751	20758	50 %	25 %	25 %	0 %	387604890
41	NC_017627	CCAC	2	8	20765	20772	25 %	0 %	0 %	75 %	387604890
42	NC_017627	TCTT	2	8	21007	21014	0 %	75 %	0 %	25 %	387604890
43	NC_017627	GCCT	2	8	22781	22788	0 %	25 %	25 %	50 %	387604892
44	NC_017627	CATA	2	8	23014	23021	50 %	25 %	0 %	25 %	387604893
45	NC_017627	TTCC	2	8	23199	23206	0 %	50 %	0 %	50 %	387604893
46	NC_017627	CAGC	2	8	23824	23831	25 %	0 %	25 %	50 %	387604893
47	NC_017627	TGAC	2	8	23925	23932	25 %	25 %	25 %	25 %	387604893
48	NC_017627	GAAT	2	8	24278	24285	50 %	25 %	25 %	0 %	387604893
49	NC_017627	CCCT	2	8	25417	25424	0 %	25 %	0 %	75 %	387604893
50	NC_017627	GCTG	2	8	27443	27450	0 %	25 %	50 %	25 %	387604895
51	NC_017627	TGGC	2	8	27576	27583	0 %	25 %	50 %	25 %	387604895
52	NC_017627	AAAC	2	8	28158	28165	75 %	0 %	0 %	25 %	387604896
53	NC_017627	GTAT	2	8	28864	28871	25 %	50 %	25 %	0 %	387604896
54	NC_017627	TATT	2	8	28995	29002	25 %	75 %	0 %	0 %	387604896
55	NC_017627	TATC	2	8	29641	29648	25 %	50 %	0 %	25 %	387604896
56	NC_017627	ACTG	2	8	30739	30746	25 %	25 %	25 %	25 %	387604896
57	NC_017627	AAAC	2	8	30823	30830	75 %	0 %	0 %	25 %	387604896
58	NC_017627	TCTG	2	8	31019	31026	0 %	50 %	25 %	25 %	387604896
59	NC_017627	CCTT	2	8	31107	31114	0 %	50 %	0 %	50 %	387604896
60	NC_017627	AACA	2	8	31262	31269	75 %	0 %	0 %	25 %	387604896
61	NC_017627	GCAG	2	8	31328	31335	25 %	0 %	50 %	25 %	387604896
62	NC_017627	TTAC	2	8	34028	34035	25 %	50 %	0 %	25 %	387604898
63	NC_017627	GTAT	2	8	34215	34222	25 %	50 %	25 %	0 %	387604898
64	NC_017627	GTGG	2	8	34395	34402	0 %	25 %	75 %	0 %	387604898
65	NC_017627	TGTT	2	8	35165	35172	0 %	75 %	25 %	0 %	387604900
66	NC_017627	TCAG	2	8	35480	35487	25 %	25 %	25 %	25 %	387604900
67	NC_017627	ACAT	2	8	39434	39441	50 %	25 %	0 %	25 %	387604902
68	NC_017627	TAAA	2	8	39557	39564	75 %	25 %	0 %	0 %	387604902
69	NC_017627	TGTT	2	8	39668	39675	0 %	75 %	25 %	0 %	387604903
70	NC_017627	AAAT	2	8	39936	39943	75 %	25 %	0 %	0 %	387604903
71	NC_017627	GCCA	2	8	40463	40470	25 %	0 %	25 %	50 %	387604904
72	NC_017627	CAGC	2	8	40596	40603	25 %	0 %	25 %	50 %	387604904
73	NC_017627	CTTC	2	8	41759	41766	0 %	50 %	0 %	50 %	387604906
74	NC_017627	AGAC	2	8	42833	42840	50 %	0 %	25 %	25 %	387604907
75	NC_017627	CATA	2	8	42873	42880	50 %	25 %	0 %	25 %	387604907
76	NC_017627	CTTC	2	8	45773	45780	0 %	50 %	0 %	50 %	387604909
77	NC_017627	GCCA	2	8	45937	45944	25 %	0 %	25 %	50 %	387604909
78	NC_017627	AATC	2	8	46588	46595	50 %	25 %	0 %	25 %	387604911
79	NC_017627	TGCA	2	8	47349	47356	25 %	25 %	25 %	25 %	387604912
80	NC_017627	TGGA	2	8	47487	47494	25 %	25 %	50 %	0 %	387604912
81	NC_017627	CCGG	2	8	48032	48039	0 %	0 %	50 %	50 %	387604912
82	NC_017627	GGCG	2	8	48377	48384	0 %	0 %	75 %	25 %	387604912
83	NC_017627	CCAG	2	8	48741	48748	25 %	0 %	25 %	50 %	387604913
84	NC_017627	CCGG	2	8	48856	48863	0 %	0 %	50 %	50 %	387604914
85	NC_017627	AGGC	2	8	49234	49241	25 %	0 %	50 %	25 %	387604914
86	NC_017627	GGCA	2	8	50664	50671	25 %	0 %	50 %	25 %	387604915
87	NC_017627	CAGC	2	8	51327	51334	25 %	0 %	25 %	50 %	387604916
88	NC_017627	AGGC	2	8	51335	51342	25 %	0 %	50 %	25 %	387604916
89	NC_017627	CCAC	2	8	51484	51491	25 %	0 %	0 %	75 %	387604916
90	NC_017627	CAGC	2	8	52426	52433	25 %	0 %	25 %	50 %	387604917
91	NC_017627	CCTG	2	8	52668	52675	0 %	25 %	25 %	50 %	387604917
92	NC_017627	TCCG	2	8	53051	53058	0 %	25 %	25 %	50 %	387604917
93	NC_017627	ACCG	2	8	54089	54096	25 %	0 %	25 %	50 %	387604917
94	NC_017627	CAGG	2	8	54904	54911	25 %	0 %	50 %	25 %	387604917
95	NC_017627	GCCC	2	8	54924	54931	0 %	0 %	25 %	75 %	387604917
96	NC_017627	TCGC	2	8	55031	55038	0 %	25 %	25 %	50 %	387604917
97	NC_017627	CCGG	2	8	55060	55067	0 %	0 %	50 %	50 %	387604917
98	NC_017627	CGGT	2	8	55226	55233	0 %	25 %	50 %	25 %	387604917
99	NC_017627	CCAG	2	8	55264	55271	25 %	0 %	25 %	50 %	387604917
100	NC_017627	GCGA	2	8	55765	55772	25 %	0 %	50 %	25 %	387604917
101	NC_017627	GACG	2	8	55887	55894	25 %	0 %	50 %	25 %	387604917
102	NC_017627	CGGA	2	8	56004	56011	25 %	0 %	50 %	25 %	387604917
103	NC_017627	ACCG	2	8	56147	56154	25 %	0 %	25 %	50 %	387604917
104	NC_017627	GTCC	2	8	56794	56801	0 %	25 %	25 %	50 %	387604917
105	NC_017627	ATCA	2	8	56870	56877	50 %	25 %	0 %	25 %	387604917
106	NC_017627	TCCG	2	8	56993	57000	0 %	25 %	25 %	50 %	387604917
107	NC_017627	CAGC	2	8	58387	58394	25 %	0 %	25 %	50 %	387604918
108	NC_017627	CAGA	2	8	58963	58970	50 %	0 %	25 %	25 %	387604918
109	NC_017627	CTGG	2	8	59301	59308	0 %	25 %	50 %	25 %	387604918
110	NC_017627	GTCA	2	8	59673	59680	25 %	25 %	25 %	25 %	387604919
111	NC_017627	GATT	2	8	60538	60545	25 %	50 %	25 %	0 %	387604920
112	NC_017627	TATT	2	8	61904	61911	25 %	75 %	0 %	0 %	387604922
113	NC_017627	ACTG	2	8	62946	62953	25 %	25 %	25 %	25 %	387604922
114	NC_017627	CATC	2	8	63105	63112	25 %	25 %	0 %	50 %	387604922
115	NC_017627	CTGC	2	8	63266	63273	0 %	25 %	25 %	50 %	387604922
116	NC_017627	GGAC	2	8	63558	63565	25 %	0 %	50 %	25 %	387604922
117	NC_017627	CTGG	2	8	63817	63824	0 %	25 %	50 %	25 %	387604922
118	NC_017627	GACT	2	8	63827	63834	25 %	25 %	25 %	25 %	387604922
119	NC_017627	GACC	2	8	64335	64342	25 %	0 %	25 %	50 %	387604922
120	NC_017627	TTCA	2	8	64618	64625	25 %	50 %	0 %	25 %	387604922
121	NC_017627	TCAC	2	8	65026	65033	25 %	25 %	0 %	50 %	387604923
122	NC_017627	CGCC	2	8	65858	65865	0 %	0 %	25 %	75 %	387604923
123	NC_017627	CCCT	2	8	66005	66012	0 %	25 %	0 %	75 %	387604924
124	NC_017627	ATTC	2	8	66075	66082	25 %	50 %	0 %	25 %	387604924
125	NC_017627	ACAT	2	8	66146	66153	50 %	25 %	0 %	25 %	387604924
126	NC_017627	TTCA	2	8	66404	66411	25 %	50 %	0 %	25 %	387604925
127	NC_017627	ATCC	2	8	66450	66457	25 %	25 %	0 %	50 %	387604925
128	NC_017627	ATCC	2	8	66675	66682	25 %	25 %	0 %	50 %	387604926
129	NC_017627	CCTG	2	8	66983	66990	0 %	25 %	25 %	50 %	387604926
130	NC_017627	ATTT	2	8	68578	68585	25 %	75 %	0 %	0 %	387604929
131	NC_017627	CCTG	2	8	68957	68964	0 %	25 %	25 %	50 %	387604931
132	NC_017627	CAGA	2	8	69229	69236	50 %	0 %	25 %	25 %	387604931
133	NC_017627	CAGC	2	8	69480	69487	25 %	0 %	25 %	50 %	387604931
134	NC_017627	CCAC	2	8	69873	69880	25 %	0 %	0 %	75 %	387604931
135	NC_017627	TGAA	2	8	70466	70473	50 %	25 %	25 %	0 %	387604931
136	NC_017627	GCCT	2	8	70879	70886	0 %	25 %	25 %	50 %	387604932
137	NC_017627	AAAT	2	8	71660	71667	75 %	25 %	0 %	0 %	387604933
138	NC_017627	GTCC	2	8	72253	72260	0 %	25 %	25 %	50 %	387604934
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.