MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli 042 plasmid pAA

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017627	GC	3	6	514	519	0 %	0 %	50 %	50 %	387604869
2	NC_017627	AT	3	6	2532	2537	50 %	50 %	0 %	0 %	387604871
3	NC_017627	AT	3	6	2914	2919	50 %	50 %	0 %	0 %	387604871
4	NC_017627	AT	3	6	4738	4743	50 %	50 %	0 %	0 %	387604874
5	NC_017627	AG	3	6	5151	5156	50 %	0 %	50 %	0 %	387604874
6	NC_017627	AG	3	6	5172	5177	50 %	0 %	50 %	0 %	387604874
7	NC_017627	AG	3	6	5254	5259	50 %	0 %	50 %	0 %	387604874
8	NC_017627	TA	3	6	5851	5856	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
9	NC_017627	AT	3	6	5982	5987	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
10	NC_017627	GA	3	6	6001	6006	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
11	NC_017627	TA	3	6	6013	6018	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
12	NC_017627	GA	3	6	6082	6087	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
13	NC_017627	GA	3	6	6249	6254	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
14	NC_017627	AG	3	6	6267	6272	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
15	NC_017627	TA	3	6	6712	6717	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
16	NC_017627	TA	3	6	7355	7360	50 %	50 %	0 %	0 %	387604876
17	NC_017627	AT	3	6	7817	7822	50 %	50 %	0 %	0 %	387604877
18	NC_017627	TC	3	6	7997	8002	0 %	50 %	0 %	50 %	387604877
19	NC_017627	AT	3	6	8441	8446	50 %	50 %	0 %	0 %	387604878
20	NC_017627	TA	3	6	8885	8890	50 %	50 %	0 %	0 %	387604878
21	NC_017627	AT	3	6	9177	9182	50 %	50 %	0 %	0 %	387604878
22	NC_017627	CT	3	6	11858	11863	0 %	50 %	0 %	50 %	387604880
23	NC_017627	GC	3	6	13173	13178	0 %	0 %	50 %	50 %	387604882
24	NC_017627	CT	4	8	13690	13697	0 %	50 %	0 %	50 %	387604883
25	NC_017627	GC	3	6	14877	14882	0 %	0 %	50 %	50 %	387604885
26	NC_017627	GC	3	6	14925	14930	0 %	0 %	50 %	50 %	387604885
27	NC_017627	GC	3	6	15027	15032	0 %	0 %	50 %	50 %	387604885
28	NC_017627	GA	3	6	16110	16115	50 %	0 %	50 %	0 %	387604886
29	NC_017627	TA	3	6	16223	16228	50 %	50 %	0 %	0 %	387604886
30	NC_017627	AT	3	6	17766	17771	50 %	50 %	0 %	0 %	387604888
31	NC_017627	GA	3	6	17873	17878	50 %	0 %	50 %	0 %	387604888
32	NC_017627	TG	3	6	19505	19510	0 %	50 %	50 %	0 %	387604889
33	NC_017627	GA	3	6	19625	19630	50 %	0 %	50 %	0 %	387604889
34	NC_017627	TG	3	6	20548	20553	0 %	50 %	50 %	0 %	387604890
35	NC_017627	AT	3	6	22592	22597	50 %	50 %	0 %	0 %	387604892
36	NC_017627	TC	3	6	23094	23099	0 %	50 %	0 %	50 %	387604893
37	NC_017627	CT	3	6	23520	23525	0 %	50 %	0 %	50 %	387604893
38	NC_017627	GT	3	6	24144	24149	0 %	50 %	50 %	0 %	387604893
39	NC_017627	AT	3	6	28069	28074	50 %	50 %	0 %	0 %	387604896
40	NC_017627	AT	3	6	28239	28244	50 %	50 %	0 %	0 %	387604896
41	NC_017627	CA	3	6	28440	28445	50 %	0 %	0 %	50 %	387604896
42	NC_017627	AG	3	6	29605	29610	50 %	0 %	50 %	0 %	387604896
43	NC_017627	AT	3	6	30085	30090	50 %	50 %	0 %	0 %	387604896
44	NC_017627	AT	3	6	31408	31413	50 %	50 %	0 %	0 %	387604896
45	NC_017627	AC	3	6	34232	34237	50 %	0 %	0 %	50 %	387604898
46	NC_017627	TC	3	6	34798	34803	0 %	50 %	0 %	50 %	387604899
47	NC_017627	TA	3	6	39060	39065	50 %	50 %	0 %	0 %	387604901
48	NC_017627	TA	3	6	39114	39119	50 %	50 %	0 %	0 %	387604901
49	NC_017627	AT	3	6	40093	40098	50 %	50 %	0 %	0 %	387604903
50	NC_017627	AT	3	6	41409	41414	50 %	50 %	0 %	0 %	387604906
51	NC_017627	AT	3	6	41461	41466	50 %	50 %	0 %	0 %	387604906
52	NC_017627	AT	3	6	41706	41711	50 %	50 %	0 %	0 %	387604906
53	NC_017627	CT	3	6	41718	41723	0 %	50 %	0 %	50 %	387604906
54	NC_017627	TA	3	6	41799	41804	50 %	50 %	0 %	0 %	387604906
55	NC_017627	AT	3	6	43469	43474	50 %	50 %	0 %	0 %	387604908
56	NC_017627	AT	3	6	45974	45979	50 %	50 %	0 %	0 %	387604909
57	NC_017627	TA	3	6	46411	46416	50 %	50 %	0 %	0 %	387604910
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60	NC_017627	CA	3	6	50685	50690	50 %	0 %	0 %	50 %	387604915
61	NC_017627	GA	3	6	53349	53354	50 %	0 %	50 %	0 %	387604917
62	NC_017627	TG	3	6	54180	54185	0 %	50 %	50 %	0 %	387604917
63	NC_017627	CT	3	6	54301	54306	0 %	50 %	0 %	50 %	387604917
64	NC_017627	TG	3	6	54801	54806	0 %	50 %	50 %	0 %	387604917
65	NC_017627	CT	3	6	55392	55397	0 %	50 %	0 %	50 %	387604917
66	NC_017627	GT	3	6	56709	56714	0 %	50 %	50 %	0 %	387604917
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68	NC_017627	GT	3	6	58611	58616	0 %	50 %	50 %	0 %	387604918
69	NC_017627	AT	3	6	59231	59236	50 %	50 %	0 %	0 %	387604918
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71	NC_017627	GA	3	6	60105	60110	50 %	0 %	50 %	0 %	387604919
72	NC_017627	GA	3	6	61552	61557	50 %	0 %	50 %	0 %	387604921
73	NC_017627	TA	3	6	61580	61585	50 %	50 %	0 %	0 %	387604921
74	NC_017627	TG	3	6	63134	63139	0 %	50 %	50 %	0 %	387604922
75	NC_017627	GA	3	6	63432	63437	50 %	0 %	50 %	0 %	387604922
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82	NC_017627	TC	3	6	71297	71302	0 %	50 %	0 %	50 %	387604932
83	NC_017627	AC	3	6	71509	71514	50 %	0 %	0 %	50 %	387604933
84	NC_017627	AT	3	6	71563	71568	50 %	50 %	0 %	0 %	387604933
85	NC_017627	AT	3	6	71724	71729	50 %	50 %	0 %	0 %	387604933
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101	NC_017627	TA	3	6	82578	82583	50 %	50 %	0 %	0 %	387604948
102	NC_017627	CT	3	6	82585	82590	0 %	50 %	0 %	50 %	387604948
103	NC_017627	CA	3	6	82772	82777	50 %	0 %	0 %	50 %	387604948
104	NC_017627	CA	3	6	85019	85024	50 %	0 %	0 %	50 %	387604951
105	NC_017627	AT	3	6	85267	85272	50 %	50 %	0 %	0 %	387604951
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109	NC_017627	CG	3	6	89884	89889	0 %	0 %	50 %	50 %	387604958
110	NC_017627	CT	3	6	90560	90565	0 %	50 %	0 %	50 %	387604959
111	NC_017627	GC	3	6	91153	91158	0 %	0 %	50 %	50 %	387604960
112	NC_017627	CG	3	6	92361	92366	0 %	0 %	50 %	50 %	387604962
113	NC_017627	CA	3	6	92640	92645	50 %	0 %	0 %	50 %	387604962
114	NC_017627	GC	3	6	92831	92836	0 %	0 %	50 %	50 %	387604962
115	NC_017627	TC	3	6	94039	94044	0 %	50 %	0 %	50 %	387604963
116	NC_017627	CG	3	6	94214	94219	0 %	0 %	50 %	50 %	387604963
117	NC_017627	GT	3	6	95052	95057	0 %	50 %	50 %	0 %	387604967
118	NC_017627	CG	3	6	95554	95559	0 %	0 %	50 %	50 %	387604968
119	NC_017627	GA	3	6	96624	96629	50 %	0 %	50 %	0 %	387604970
120	NC_017627	CA	3	6	97251	97256	50 %	0 %	0 %	50 %	387604971
121	NC_017627	GT	4	8	97919	97926	0 %	50 %	50 %	0 %	387604972
122	NC_017627	TC	3	6	98097	98102	0 %	50 %	0 %	50 %	387604972
123	NC_017627	GC	3	6	98180	98185	0 %	0 %	50 %	50 %	387604972
124	NC_017627	CA	3	6	98513	98518	50 %	0 %	0 %	50 %	387604973
125	NC_017627	GT	3	6	98775	98780	0 %	50 %	50 %	0 %	387604974
126	NC_017627	AC	3	6	99920	99925	50 %	0 %	0 %	50 %	387604975
127	NC_017627	CA	4	8	100654	100661	50 %	0 %	0 %	50 %	387604975
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131	NC_017627	TA	3	6	106429	106434	50 %	50 %	0 %	0 %	387604982
132	NC_017627	CT	4	8	108646	108653	0 %	50 %	0 %	50 %	387604984
133	NC_017627	TG	3	6	109799	109804	0 %	50 %	50 %	0 %	387604985
134	NC_017627	TG	3	6	111038	111043	0 %	50 %	50 %	0 %	387604986
135	NC_017627	AG	4	8	112880	112887	50 %	0 %	50 %	0 %	387604988

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.