MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli DH1 chromosome

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017625	ACATAA	2	12	23620	23631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017625	GATAAA	2	12	107111	107122	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017625	GGCAAA	2	12	177688	177699	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017625	TGAAAT	2	12	219104	219115	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017625	CGGTAT	2	12	219984	219995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017625	GCATCT	2	12	229214	229225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017625	TATTTC	2	12	230104	230115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017625	GTTTTT	2	12	283875	283886	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017625	GAATGA	2	12	302722	302733	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017625	TAAATT	2	12	337410	337421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017625	TAAAAA	2	12	521797	521808	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017625	GTATCT	2	12	561762	561773	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017625	TTATAT	2	12	596460	596471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017625	ATAAAA	2	12	604923	604934	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017625	AATGCA	2	12	606820	606831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017625	CGGTTA	2	12	617690	617701	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017625	AGGGAG	2	12	644156	644167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017625	ATCATT	2	12	667212	667223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017625	AAAAAG	2	12	668047	668058	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017625	TACAAC	2	12	672723	672734	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017625	TTAATT	2	12	697717	697728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017625	ACGAAA	2	12	755653	755664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017625	CTGCGT	2	12	762300	762311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017625	CTCAGT	2	12	801914	801925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017625	ACGCAG	2	12	812452	812463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017625	CCTCAC	2	12	834654	834665	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017625	TCGCGA	2	12	842597	842608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017625	AAAATT	2	12	888677	888688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017625	AACAAA	2	12	936457	936468	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017625	TGATCT	2	12	955697	955708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017625	TCTTGT	2	12	961393	961404	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017625	AAAACC	2	12	965724	965735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017625	TAAGAT	2	12	1026910	1026921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017625	ATCAGA	2	12	1069375	1069386	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017625	AGGCTG	2	12	1074376	1074387	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017625	GTTAAT	2	12	1095719	1095730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017625	GTAAAA	2	12	1100657	1100668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017625	AAAACC	2	12	1118380	1118391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017625	AAACTG	2	12	1179606	1179617	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017625	TGTCCA	2	12	1194193	1194204	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017625	TGCACT	2	12	1345652	1345663	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017625	CATAAC	2	12	1364116	1364127	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017625	CATCAG	2	12	1381956	1381967	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017625	CTGTTT	2	12	1424591	1424602	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017625	TTTTCT	2	12	1446146	1446157	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017625	GTGACA	2	12	1456426	1456437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017625	CATTTA	2	12	1470060	1470071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017625	TAGTGG	2	12	1527335	1527346	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017625	AACTGC	2	12	1543972	1543983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017625	GACGCT	2	12	1545476	1545487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017625	GGCATG	2	12	1545968	1545979	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017625	GCCTGC	2	12	1546538	1546549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017625	GGAAGA	2	12	1613011	1613022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017625	GAAAAT	2	12	1648855	1648866	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017625	TCGGTA	2	12	1678452	1678463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017625	TGCCGC	2	12	1680239	1680250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017625	GGTATC	2	12	1703723	1703734	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017625	AGGGGG	2	12	1724715	1724726	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017625	CGAAGT	2	12	1843365	1843376	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017625	TAAATA	2	12	1844188	1844199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017625	ATAAGA	2	12	1877583	1877594	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017625	TGAATT	2	12	1891401	1891412	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017625	CATTAA	2	12	1898526	1898537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017625	GACAGT	2	12	1939741	1939752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017625	CCCTGA	2	12	1968590	1968601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017625	ACGTTG	2	12	1970924	1970935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017625	ATGTTT	2	12	1984596	1984607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017625	TATAAA	2	12	1984643	1984654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017625	AAAGAA	2	12	1988540	1988551	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017625	GTAATA	2	12	2006556	2006567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017625	CTGTTC	2	12	2075004	2075015	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017625	CTTTTT	2	12	2113862	2113873	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017625	AGTCTT	2	12	2122784	2122795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017625	AAAACA	2	12	2123044	2123055	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017625	TTATTT	2	12	2123676	2123687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017625	TAAGTA	2	12	2137332	2137343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017625	GTTTTT	2	12	2233443	2233454	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017625	GAAAAA	2	12	2245821	2245832	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017625	ATATTT	2	12	2247542	2247553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017625	CTATAT	2	12	2281432	2281443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017625	CAGGCA	2	12	2281527	2281538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017625	GGTACG	2	12	2282222	2282233	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017625	AGCGGT	2	12	2284133	2284144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017625	CATAAC	2	12	2299010	2299021	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017625	TAACGG	2	12	2307841	2307852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017625	TATGAA	2	12	2311115	2311126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017625	GTTTTT	2	12	2322706	2322717	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017625	AAAGGC	2	12	2452308	2452319	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017625	GCATCT	2	12	2455130	2455141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017625	ATTGCC	2	12	2455374	2455385	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017625	TTAAAT	2	12	2459963	2459974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017625	AGTTAT	2	12	2522399	2522410	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017625	GATCAG	2	12	2568668	2568679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017625	ACCCCC	2	12	2570926	2570937	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_017625	TCAGCA	2	12	2595287	2595298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017625	CGCAGC	2	12	2599087	2599098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017625	AGCCTG	2	12	2638189	2638200	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017625	TCGAGT	2	12	2638321	2638332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017625	AAGCGT	2	12	2638341	2638352	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017625	GCCTGT	2	12	2656608	2656619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017625	ATCGCT	2	12	2658560	2658571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017625	ACAAAA	2	12	2658961	2658972	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017625	GAAGCT	2	12	2677804	2677815	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017625	AAATAA	2	12	2760594	2760605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017625	AGTGAA	2	12	2788363	2788374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017625	CATTAT	2	12	2849650	2849661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017625	TCCTTA	2	12	2851064	2851075	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017625	TGGACA	2	12	2873332	2873343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017625	ATCTTT	2	12	2893965	2893976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017625	TTCCAG	2	12	2916932	2916943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017625	CGGTTA	2	12	2958223	2958234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017625	TTTCTG	2	12	3048118	3048129	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017625	ACGCAG	2	12	3077757	3077768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017625	CAAGAA	2	12	3165096	3165107	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017625	TATTTT	2	12	3177219	3177230	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017625	GCCAGC	2	12	3222617	3222628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017625	CGATAA	2	12	3258892	3258903	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017625	ATTTGC	2	12	3268454	3268465	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017625	TCACCA	2	12	3273636	3273647	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017625	ACGCAG	2	12	3284099	3284110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017625	TGACAG	2	12	3300964	3300975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017625	CGCCTG	2	12	3379623	3379634	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017625	TGAAAA	2	12	3398466	3398477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.