MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli DH1 chromosome

Total Repeats: 2468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017625	GCGGA	2	10	232	241	20 %	0 %	60 %	20 %	386593591
2	NC_017625	TTTAC	2	10	2904	2913	20 %	60 %	0 %	20 %	386593593
3	NC_017625	TGGCG	2	10	7583	7592	0 %	20 %	60 %	20 %	386593596
4	NC_017625	TGAAA	2	10	8775	8784	60 %	20 %	20 %	0 %	386593598
5	NC_017625	AAACT	2	10	10160	10169	60 %	20 %	0 %	20 %	386593599
6	NC_017625	GGTAC	2	10	10342	10351	20 %	20 %	40 %	20 %	386593600
7	NC_017625	AGTGA	2	10	10420	10429	40 %	20 %	40 %	0 %	386593600
8	NC_017625	GTTGG	2	10	11116	11125	0 %	40 %	60 %	0 %	386593601
9	NC_017625	TTATT	2	10	12280	12289	20 %	80 %	0 %	0 %	386593602
10	NC_017625	CGGAA	2	10	15247	15256	40 %	0 %	40 %	20 %	386593604
11	NC_017625	CGCAG	2	10	17245	17254	20 %	0 %	40 %	40 %	386593607
12	NC_017625	TGAAA	2	10	22678	22687	60 %	20 %	20 %	0 %	386593610
13	NC_017625	AAATG	2	10	26581	26590	60 %	20 %	20 %	0 %	386593612
14	NC_017625	ATTTT	2	10	27322	27331	20 %	80 %	0 %	0 %	386593613
15	NC_017625	CCGCA	2	10	28569	28578	20 %	0 %	20 %	60 %	386593616
16	NC_017625	TGGGC	2	10	32219	32228	0 %	20 %	60 %	20 %	386593619
17	NC_017625	GCGCT	2	10	32260	32269	0 %	20 %	40 %	40 %	386593619
18	NC_017625	GTGTT	2	10	32289	32298	0 %	60 %	40 %	0 %	386593619
19	NC_017625	TCCGA	2	10	32916	32925	20 %	20 %	20 %	40 %	386593620
20	NC_017625	TCTGG	2	10	34180	34189	0 %	40 %	40 %	20 %	386593622
21	NC_017625	CTGGC	2	10	34289	34298	0 %	20 %	40 %	40 %	386593622
22	NC_017625	GCACG	2	10	35083	35092	20 %	0 %	40 %	40 %	386593622
23	NC_017625	GCTGC	2	10	35666	35675	0 %	20 %	40 %	40 %	386593623
24	NC_017625	GCGGA	2	10	38652	38661	20 %	0 %	60 %	20 %	386593625
25	NC_017625	TGCCT	2	10	39371	39380	0 %	40 %	20 %	40 %	386593625
26	NC_017625	ATTCC	2	10	40664	40673	20 %	40 %	0 %	40 %	386593626
27	NC_017625	CTCGC	2	10	41661	41670	0 %	20 %	20 %	60 %	386593627
28	NC_017625	TCAGG	2	10	41689	41698	20 %	20 %	40 %	20 %	386593627
29	NC_017625	CGCGG	2	10	42047	42056	0 %	0 %	60 %	40 %	386593628
30	NC_017625	CGACC	2	10	44182	44191	20 %	0 %	20 %	60 %	386593631
31	NC_017625	CTTAC	2	10	48187	48196	20 %	40 %	0 %	40 %	386593635
32	NC_017625	TTAAT	2	10	48341	48350	40 %	60 %	0 %	0 %	386593635
33	NC_017625	GTTTG	2	10	50811	50820	0 %	60 %	40 %	0 %	386593636
34	NC_017625	CTTTA	2	10	51357	51366	20 %	60 %	0 %	20 %	386593636
35	NC_017625	CGGAC	2	10	53909	53918	20 %	0 %	40 %	40 %	386593638
36	NC_017625	GTGTG	2	10	62211	62220	0 %	40 %	60 %	0 %	386593644
37	NC_017625	CGGGA	2	10	62994	63003	20 %	0 %	60 %	20 %	386593645
38	NC_017625	TGTGG	2	10	63728	63737	0 %	40 %	60 %	0 %	386593645
39	NC_017625	TGCTG	2	10	65545	65554	0 %	40 %	40 %	20 %	386593647
40	NC_017625	CTGCC	2	10	65685	65694	0 %	20 %	20 %	60 %	386593647
41	NC_017625	GAATC	2	10	67883	67892	40 %	20 %	20 %	20 %	386593649
42	NC_017625	CAGAT	2	10	69981	69990	40 %	20 %	20 %	20 %	386593653
43	NC_017625	TGGCG	2	10	71419	71428	0 %	20 %	60 %	20 %	386593654
44	NC_017625	ACGCT	2	10	73456	73465	20 %	20 %	20 %	40 %	386593658
45	NC_017625	GCCTG	2	10	76965	76974	0 %	20 %	40 %	40 %	386593661
46	NC_017625	CATCA	2	10	81898	81907	40 %	20 %	0 %	40 %	386593666
47	NC_017625	TACAA	2	10	82463	82472	60 %	20 %	0 %	20 %	386593666
48	NC_017625	TATAA	2	10	82888	82897	60 %	40 %	0 %	0 %	386593667
49	NC_017625	CATGG	2	10	83257	83266	20 %	20 %	40 %	20 %	386593667
50	NC_017625	CAGCG	2	10	83348	83357	20 %	0 %	40 %	40 %	386593667
51	NC_017625	AAAAT	2	10	83616	83625	80 %	20 %	0 %	0 %	386593668
52	NC_017625	ATAAA	2	10	85046	85055	80 %	20 %	0 %	0 %	386593669
53	NC_017625	CGTTG	2	10	85269	85278	0 %	40 %	40 %	20 %	386593669
54	NC_017625	ATCAC	2	10	85644	85653	40 %	20 %	0 %	40 %	386593670
55	NC_017625	CCATG	2	10	87442	87451	20 %	20 %	20 %	40 %	386593671
56	NC_017625	TGTGC	2	10	88389	88398	0 %	40 %	40 %	20 %	386593672
57	NC_017625	CTGAT	2	10	91387	91396	20 %	40 %	20 %	20 %	386593675
58	NC_017625	ACGGA	2	10	94877	94886	40 %	0 %	40 %	20 %	386593678
59	NC_017625	GCGCG	2	10	95170	95179	0 %	0 %	60 %	40 %	386593678
60	NC_017625	GCGTA	2	10	95378	95387	20 %	20 %	40 %	20 %	386593678
61	NC_017625	TCATC	2	10	96628	96637	20 %	40 %	0 %	40 %	386593679
62	NC_017625	GCACA	2	10	99498	99507	40 %	0 %	20 %	40 %	386593682
63	NC_017625	AACAA	2	10	99642	99651	80 %	0 %	0 %	20 %	386593683
64	NC_017625	GCGCG	2	10	101845	101854	0 %	0 %	60 %	40 %	386593685
65	NC_017625	GGGAT	2	10	102009	102018	20 %	20 %	60 %	0 %	386593685
66	NC_017625	GGGCA	2	10	102204	102213	20 %	0 %	60 %	20 %	386593686
67	NC_017625	CAAAG	2	10	104313	104322	60 %	0 %	20 %	20 %	386593688
68	NC_017625	TCTTT	2	10	104328	104337	0 %	80 %	0 %	20 %	386593688
69	NC_017625	CATGC	2	10	104364	104373	20 %	20 %	20 %	40 %	386593688
70	NC_017625	TGCAT	2	10	107701	107710	20 %	40 %	20 %	20 %	386593692
71	NC_017625	GCAGT	2	10	107763	107772	20 %	20 %	40 %	20 %	386593692
72	NC_017625	ATTGC	2	10	108193	108202	20 %	40 %	20 %	20 %	386593693
73	NC_017625	ACCGT	2	10	109813	109822	20 %	20 %	20 %	40 %	386593694
74	NC_017625	GGTCA	2	10	110181	110190	20 %	20 %	40 %	20 %	386593694
75	NC_017625	GTTTT	2	10	115506	115515	0 %	80 %	20 %	0 %	386593697
76	NC_017625	CGGTG	2	10	119453	119462	0 %	20 %	60 %	20 %	386593699
77	NC_017625	CGGGC	2	10	121374	121383	0 %	0 %	60 %	40 %	386593699
78	NC_017625	CGCAG	2	10	123588	123597	20 %	0 %	40 %	40 %	386593701
79	NC_017625	CGCGG	2	10	125024	125033	0 %	0 %	60 %	40 %	386593702
80	NC_017625	ACGCA	2	10	128021	128030	40 %	0 %	20 %	40 %	386593704
81	NC_017625	TGATG	2	10	128088	128097	20 %	40 %	40 %	0 %	386593704
82	NC_017625	TGGTG	2	10	129876	129885	0 %	40 %	60 %	0 %	386593707
83	NC_017625	AGATG	2	10	130035	130044	40 %	20 %	40 %	0 %	386593707
84	NC_017625	AGGTA	2	10	130521	130530	40 %	20 %	40 %	0 %	386593707
85	NC_017625	GCCAG	2	10	137623	137632	20 %	0 %	40 %	40 %	386593714
86	NC_017625	AGCCC	2	10	138677	138686	20 %	0 %	20 %	60 %	386593715
87	NC_017625	ATACA	2	10	139375	139384	60 %	20 %	0 %	20 %	386593716
88	NC_017625	TTGGG	2	10	140828	140837	0 %	40 %	60 %	0 %	386593718
89	NC_017625	AGCGG	2	10	141849	141858	20 %	0 %	60 %	20 %	386593719
90	NC_017625	CCCAA	2	10	143779	143788	40 %	0 %	0 %	60 %	386593721
91	NC_017625	TGCCC	2	10	144243	144252	0 %	20 %	20 %	60 %	386593722
92	NC_017625	CATGG	2	10	147786	147795	20 %	20 %	40 %	20 %	386593724
93	NC_017625	AAAGC	2	10	148414	148423	60 %	0 %	20 %	20 %	386593724
94	NC_017625	ATGCC	2	10	150759	150768	20 %	20 %	20 %	40 %	386593726
95	NC_017625	AGCGT	2	10	151196	151205	20 %	20 %	40 %	20 %	386593726
96	NC_017625	CTGGG	2	10	153907	153916	0 %	20 %	60 %	20 %	386593728
97	NC_017625	GGGGC	2	10	155572	155581	0 %	0 %	80 %	20 %	386593729
98	NC_017625	GCGCA	2	10	157010	157019	20 %	0 %	40 %	40 %	386593732
99	NC_017625	CTGGG	2	10	158835	158844	0 %	20 %	60 %	20 %	386593734
100	NC_017625	ATCGA	2	10	160284	160293	40 %	20 %	20 %	20 %	386593735
101	NC_017625	CCTCT	2	10	162256	162265	0 %	40 %	0 %	60 %	386593736
102	NC_017625	GTTAC	2	10	163512	163521	20 %	40 %	20 %	20 %	386593739
103	NC_017625	TTACG	2	10	165027	165036	20 %	40 %	20 %	20 %	386593741
104	NC_017625	GCTTC	2	10	166955	166964	0 %	40 %	20 %	40 %	386593743
105	NC_017625	TTCGC	2	10	169104	169113	0 %	40 %	20 %	40 %	386593744
106	NC_017625	CATTA	2	10	171157	171166	40 %	40 %	0 %	20 %	386593747
107	NC_017625	TGGTG	2	10	172349	172358	0 %	40 %	60 %	0 %	386593748
108	NC_017625	AGAAC	2	10	174238	174247	60 %	0 %	20 %	20 %	386593749
109	NC_017625	GCACG	2	10	174712	174721	20 %	0 %	40 %	40 %	386593749
110	NC_017625	TCGAC	2	10	175396	175405	20 %	20 %	20 %	40 %	386593750
111	NC_017625	TGAAC	2	10	176390	176399	40 %	20 %	20 %	20 %	386593751
112	NC_017625	AGTGA	2	10	176514	176523	40 %	20 %	40 %	0 %	386593751
113	NC_017625	TTGCC	2	10	179513	179522	0 %	40 %	20 %	40 %	386593753
114	NC_017625	CGTTT	2	10	181014	181023	0 %	60 %	20 %	20 %	386593755
115	NC_017625	ACGAA	2	10	182112	182121	60 %	0 %	20 %	20 %	386593756
116	NC_017625	AATGG	2	10	182575	182584	40 %	20 %	40 %	0 %	386593756
117	NC_017625	CAAAG	2	10	185316	185325	60 %	0 %	20 %	20 %	386593758
118	NC_017625	AAAGA	2	10	186497	186506	80 %	0 %	20 %	0 %	386593760
119	NC_017625	ATTTT	2	10	187062	187071	20 %	80 %	0 %	0 %	386593760
120	NC_017625	CCTGG	2	10	188652	188661	0 %	20 %	40 %	40 %	386593763
121	NC_017625	CGGAG	2	10	191093	191102	20 %	0 %	60 %	20 %	386593763
122	NC_017625	GCAAC	2	10	191237	191246	40 %	0 %	20 %	40 %	386593764
123	NC_017625	TGGTT	2	10	191912	191921	0 %	60 %	40 %	0 %	386593764
124	NC_017625	CAGCG	2	10	193175	193184	20 %	0 %	40 %	40 %	386593764
125	NC_017625	GTTCG	2	10	193267	193276	0 %	40 %	40 %	20 %	386593764
126	NC_017625	CTGGG	2	10	193971	193980	0 %	20 %	60 %	20 %	386593765
127	NC_017625	ATGCG	2	10	198866	198875	20 %	20 %	40 %	20 %	386593767
128	NC_017625	TGGCG	2	10	199230	199239	0 %	20 %	60 %	20 %	386593767
129	NC_017625	AAGTG	2	10	205085	205094	40 %	20 %	40 %	0 %	386593771
130	NC_017625	CGGCA	2	10	207197	207206	20 %	0 %	40 %	40 %	386593772
131	NC_017625	GCAAA	2	10	211265	211274	60 %	0 %	20 %	20 %	386593775
132	NC_017625	TGCGT	2	10	216475	216484	0 %	40 %	40 %	20 %	386593779
133	NC_017625	AAACC	2	10	216642	216651	60 %	0 %	0 %	40 %	386593779
134	NC_017625	ATAAC	2	10	217583	217592	60 %	20 %	0 %	20 %	386593779
135	NC_017625	GTTGA	2	10	221780	221789	20 %	40 %	40 %	0 %	386593782
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248	NC_017625	CGCAT	2	10	410491	410500	20 %	20 %	20 %	40 %	386593952
249	NC_017625	CCAAG	2	10	417882	417891	40 %	0 %	20 %	40 %	386593957
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251	NC_017625	CGACA	2	10	422793	422802	40 %	0 %	20 %	40 %	386593965
252	NC_017625	CATCC	2	10	423093	423102	20 %	20 %	0 %	60 %	386593965
253	NC_017625	GCCAT	2	10	426132	426141	20 %	20 %	20 %	40 %	386593967
254	NC_017625	GAGAA	2	10	428374	428383	60 %	0 %	40 %	0 %	386593969
255	NC_017625	GAGAT	2	10	428607	428616	40 %	20 %	40 %	0 %	386593969
256	NC_017625	ATCGC	2	10	429389	429398	20 %	20 %	20 %	40 %	386593969
257	NC_017625	CAACA	2	10	430063	430072	60 %	0 %	0 %	40 %	386593970
258	NC_017625	CTGAA	2	10	436953	436962	40 %	20 %	20 %	20 %	386593985
259	NC_017625	GCCGA	2	10	441114	441123	20 %	0 %	40 %	40 %	386593993
260	NC_017625	GTTGG	2	10	441788	441797	0 %	40 %	60 %	0 %	386593995
261	NC_017625	CGATC	2	10	443481	443490	20 %	20 %	20 %	40 %	386593997
262	NC_017625	GCGAT	2	10	446957	446966	20 %	20 %	40 %	20 %	386594003
263	NC_017625	TTAGC	2	10	447279	447288	20 %	40 %	20 %	20 %	386594004
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390	NC_017625	CAGTG	2	10	696775	696784	20 %	20 %	40 %	20 %	386594230
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