MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli DH1 chromosome

Total Repeats: 58692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017625	CCG	2	6	28	33	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593591
2	NC_017625	GCA	2	6	50	55	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593591
3	NC_017625	TAA	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386593591
4	NC_017625	TGC	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593591
5	NC_017625	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593591
6	NC_017625	GTT	2	6	533	538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593591
7	NC_017625	GGC	2	6	546	551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593591
8	NC_017625	CTG	2	6	573	578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593591
9	NC_017625	AAC	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593591
10	NC_017625	CTA	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593591
11	NC_017625	CTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593591
12	NC_017625	CGA	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593591
13	NC_017625	TAA	2	6	755	760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386593591
14	NC_017625	CTG	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593591
15	NC_017625	TGA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593591
16	NC_017625	CGA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593591
17	NC_017625	AGA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593591
18	NC_017625	TAC	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593591
19	NC_017625	TGG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593591
20	NC_017625	ACG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593591
21	NC_017625	AGA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593591
22	NC_017625	TTA	2	6	1468	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386593592
23	NC_017625	ACA	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593592
24	NC_017625	GGT	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593592
25	NC_017625	CTG	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593592
26	NC_017625	TGG	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593592
27	NC_017625	CGA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593592
28	NC_017625	GCG	2	6	1777	1782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593592
29	NC_017625	GAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593592
30	NC_017625	CGG	2	6	2064	2069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593592
31	NC_017625	GCA	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593592
32	NC_017625	ACA	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593592
33	NC_017625	TGG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593592
34	NC_017625	CGC	2	6	2173	2178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593592
35	NC_017625	GAA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593592
36	NC_017625	CAA	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593592
37	NC_017625	GAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593592
38	NC_017625	ATG	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593592
39	NC_017625	TGT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593592
40	NC_017625	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593593
41	NC_017625	AGG	2	6	2734	2739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386593593
42	NC_017625	CGG	2	6	2918	2923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593593
43	NC_017625	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593593
44	NC_017625	AGC	2	6	3016	3021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593593
45	NC_017625	GCG	2	6	3027	3032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593593
46	NC_017625	GAT	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593593
47	NC_017625	TGA	3	9	3464	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593593
48	NC_017625	GCT	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593593
49	NC_017625	CTC	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386593594
50	NC_017625	CAC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593594
51	NC_017625	GGT	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593594
52	NC_017625	CGA	2	6	3786	3791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593594
53	NC_017625	CGG	3	9	3908	3916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
54	NC_017625	CGG	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
55	NC_017625	GTA	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593594
56	NC_017625	AGA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593594
57	NC_017625	GGC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
58	NC_017625	TCT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593594
59	NC_017625	CAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593594
60	NC_017625	CGG	2	6	4473	4478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
61	NC_017625	GCG	2	6	4501	4506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
62	NC_017625	AAG	2	6	4538	4543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593594
63	NC_017625	TCC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386593594
64	NC_017625	TCT	2	6	4666	4671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593594
65	NC_017625	CGG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
66	NC_017625	CAG	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593594
67	NC_017625	CTG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
68	NC_017625	TGC	2	6	4773	4778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
69	NC_017625	GCG	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
70	NC_017625	CCG	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593594
71	NC_017625	TGG	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593594
72	NC_017625	GGC	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
73	NC_017625	CAT	4	12	5118	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593594
74	NC_017625	GCT	2	6	5166	5171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
75	NC_017625	CTT	2	6	5178	5183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593594
76	NC_017625	GCC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593594
77	NC_017625	GAA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593594
78	NC_017625	GAC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593594
79	NC_017625	CGT	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
80	NC_017625	TGA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593594
81	NC_017625	TCG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
82	NC_017625	GAA	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593594
83	NC_017625	CGT	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
84	NC_017625	GTC	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
85	NC_017625	TGC	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
86	NC_017625	TGC	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593594
87	NC_017625	GTT	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593594
88	NC_017625	CAC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593594
89	NC_017625	GCG	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593594
90	NC_017625	TGA	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593595
91	NC_017625	GAG	2	6	6375	6380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386593595
92	NC_017625	GGC	2	6	6384	6389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593595
93	NC_017625	TGC	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593595
94	NC_017625	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593595
95	NC_017625	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386593595
96	NC_017625	CAC	2	6	6628	6633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593595
97	NC_017625	CTG	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593595
98	NC_017625	CTG	2	6	6852	6857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593596
99	NC_017625	CCG	2	6	6877	6882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593596
100	NC_017625	ACG	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593596
101	NC_017625	ACT	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593596
102	NC_017625	GAC	2	6	7080	7085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593596
103	NC_017625	CAC	2	6	7145	7150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593596
104	NC_017625	CTA	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593596
105	NC_017625	CCA	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593596
106	NC_017625	TGA	3	9	7270	7278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593596
107	NC_017625	TGA	2	6	7280	7285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593596
108	NC_017625	GAA	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593596
109	NC_017625	AAG	2	6	7543	7548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386593596
110	NC_017625	ATT	2	6	7667	7672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386593597
111	NC_017625	ATG	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593597
112	NC_017625	TGC	2	6	7746	7751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593597
113	NC_017625	TCT	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386593597
114	NC_017625	AGT	3	9	7961	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593597
115	NC_017625	CGC	2	6	8678	8683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593598
116	NC_017625	GAG	2	6	8707	8712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386593598
117	NC_017625	CAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593598
118	NC_017625	TGG	2	6	8912	8917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386593598
119	NC_017625	GCA	2	6	8938	8943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593598
120	NC_017625	GAT	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593598
121	NC_017625	CAA	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386593598
122	NC_017625	TGC	2	6	9059	9064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386593598
123	NC_017625	GGC	2	6	9237	9242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593598
124	NC_017625	GCA	2	6	9490	9495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386593599
125	NC_017625	ATT	2	6	9588	9593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386593599
126	NC_017625	GCG	2	6	9637	9642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593599
127	NC_017625	TGA	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386593599
128	NC_017625	CAT	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386593599
129	NC_017625	GCC	2	6	9818	9823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386593599
130	NC_017625	TTG	2	6	9969	9974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386593599
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251	NC_017625	GGC	2	6	19689	19694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386593609
252	NC_017625	ACC	2	6	19697	19702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386593609
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