MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 plasmid pB182_37

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017624	TCTG	2	8	694	701	0 %	50 %	25 %	25 %	386593546
2	NC_017624	TGGC	2	8	880	887	0 %	25 %	50 %	25 %	386593547
3	NC_017624	AATC	2	8	2018	2025	50 %	25 %	0 %	25 %	386593549
4	NC_017624	TAAT	2	8	2111	2118	50 %	50 %	0 %	0 %	386593549
5	NC_017624	GGAA	2	8	2151	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	386593550
6	NC_017624	ACTC	2	8	2500	2507	25 %	25 %	0 %	50 %	386593551
7	NC_017624	CAGG	2	8	2779	2786	25 %	0 %	50 %	25 %	386593551
8	NC_017624	GACA	2	8	3908	3915	50 %	0 %	25 %	25 %	386593551
9	NC_017624	ATTA	2	8	4482	4489	50 %	50 %	0 %	0 %	386593551
10	NC_017624	TAAC	2	8	4567	4574	50 %	25 %	0 %	25 %	386593552
11	NC_017624	CACT	2	8	4736	4743	25 %	25 %	0 %	50 %	386593552
12	NC_017624	CTAC	2	8	4754	4761	25 %	25 %	0 %	50 %	386593552
13	NC_017624	CTTG	2	8	5600	5607	0 %	50 %	25 %	25 %	386593554
14	NC_017624	CTGA	2	8	5750	5757	25 %	25 %	25 %	25 %	386593554
15	NC_017624	TTTC	2	8	6757	6764	0 %	75 %	0 %	25 %	386593554
16	NC_017624	AAAG	2	8	7967	7974	75 %	0 %	25 %	0 %	386593555
17	NC_017624	AACA	2	8	8537	8544	75 %	0 %	0 %	25 %	386593556
18	NC_017624	CCTG	2	8	8886	8893	0 %	25 %	25 %	50 %	386593556
19	NC_017624	TTCT	2	8	9281	9288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017624	TTCC	2	8	9778	9785	0 %	50 %	0 %	50 %	386593557
21	NC_017624	AACA	2	8	9889	9896	75 %	0 %	0 %	25 %	386593557
22	NC_017624	TTCG	2	8	9899	9906	0 %	50 %	25 %	25 %	386593557
23	NC_017624	GTTT	2	8	9998	10005	0 %	75 %	25 %	0 %	386593557
24	NC_017624	GAAG	2	8	10205	10212	50 %	0 %	50 %	0 %	386593557
25	NC_017624	ATTC	2	8	10901	10908	25 %	50 %	0 %	25 %	386593558
26	NC_017624	CCAC	2	8	12046	12053	25 %	0 %	0 %	75 %	386593560
27	NC_017624	ACTG	2	8	13110	13117	25 %	25 %	25 %	25 %	386593562
28	NC_017624	CCTG	2	8	13296	13303	0 %	25 %	25 %	50 %	386593562
29	NC_017624	GTAA	2	8	13484	13491	50 %	25 %	25 %	0 %	386593563
30	NC_017624	AGAT	2	8	13678	13685	50 %	25 %	25 %	0 %	386593563
31	NC_017624	CTCC	2	8	14303	14310	0 %	25 %	0 %	75 %	386593563
32	NC_017624	GAAA	2	8	14880	14887	75 %	0 %	25 %	0 %	386593563
33	NC_017624	TCAT	2	8	15358	15365	25 %	50 %	0 %	25 %	386593563
34	NC_017624	TCAT	2	8	15517	15524	25 %	50 %	0 %	25 %	386593563
35	NC_017624	CCAG	2	8	15975	15982	25 %	0 %	25 %	50 %	386593563
36	NC_017624	CATA	2	8	15995	16002	50 %	25 %	0 %	25 %	386593563
37	NC_017624	GGAT	2	8	17542	17549	25 %	25 %	50 %	0 %	386593566
38	NC_017624	TTTC	2	8	17929	17936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017624	AATA	2	8	18073	18080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017624	GCTG	2	8	18245	18252	0 %	25 %	50 %	25 %	386593567
41	NC_017624	TTCT	2	8	18773	18780	0 %	75 %	0 %	25 %	386593567
42	NC_017624	TCAT	2	8	18936	18943	25 %	50 %	0 %	25 %	386593567
43	NC_017624	TACG	2	8	20002	20009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017624	TTTA	2	8	20434	20441	25 %	75 %	0 %	0 %	386593570
45	NC_017624	CTTT	2	8	20751	20758	0 %	75 %	0 %	25 %	386593571
46	NC_017624	ATTA	2	8	20871	20878	50 %	50 %	0 %	0 %	386593572
47	NC_017624	AGAA	2	8	21101	21108	75 %	0 %	25 %	0 %	386593572
48	NC_017624	AATA	2	8	21344	21351	75 %	25 %	0 %	0 %	386593573
49	NC_017624	CTTT	2	8	21395	21402	0 %	75 %	0 %	25 %	386593573
50	NC_017624	CATC	2	8	21682	21689	25 %	25 %	0 %	50 %	386593574
51	NC_017624	TAAA	2	8	21825	21832	75 %	25 %	0 %	0 %	386593575
52	NC_017624	CGAA	2	8	23152	23159	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017624	ATCA	2	8	23206	23213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017624	ACTT	2	8	23558	23565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017624	TGGC	2	8	24093	24100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017624	TGAT	2	8	24156	24163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017624	AAAC	2	8	24455	24462	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017624	CAAG	2	8	24648	24655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017624	CCAG	2	8	25433	25440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017624	CTTT	2	8	25458	25465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017624	AATT	2	8	25476	25483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017624	GGAA	2	8	25570	25577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017624	AATA	2	8	25852	25859	75 %	25 %	0 %	0 %	386593578
64	NC_017624	ATGA	2	8	25997	26004	50 %	25 %	25 %	0 %	386593578
65	NC_017624	CTGA	2	8	26093	26100	25 %	25 %	25 %	25 %	386593578
66	NC_017624	TCCA	2	8	26337	26344	25 %	25 %	0 %	50 %	386593578
67	NC_017624	AGTC	2	8	26361	26368	25 %	25 %	25 %	25 %	386593578
68	NC_017624	CTTA	2	8	27674	27681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017624	GAAT	2	8	28106	28113	50 %	25 %	25 %	0 %	386593581
70	NC_017624	TGAG	2	8	28312	28319	25 %	25 %	50 %	0 %	386593581
71	NC_017624	AAAG	2	8	28436	28443	75 %	0 %	25 %	0 %	386593581
72	NC_017624	AGTA	2	8	28602	28609	50 %	25 %	25 %	0 %	386593581
73	NC_017624	ATCA	2	8	28840	28847	50 %	25 %	0 %	25 %	386593582
74	NC_017624	TACT	2	8	28882	28889	25 %	50 %	0 %	25 %	386593582
75	NC_017624	GTTG	2	8	28924	28931	0 %	50 %	50 %	0 %	386593582
76	NC_017624	CCAG	2	8	28946	28953	25 %	0 %	25 %	50 %	386593582
77	NC_017624	GATG	2	8	29201	29208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017624	GCAG	2	8	29839	29846	25 %	0 %	50 %	25 %	386593583
79	NC_017624	TAGC	2	8	30018	30025	25 %	25 %	25 %	25 %	386593583
80	NC_017624	CGGA	2	8	30179	30186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017624	TGGC	2	8	30514	30521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017624	GCCA	2	8	30528	30535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017624	GCCA	2	8	30937	30944	25 %	0 %	25 %	50 %	386593585
84	NC_017624	TCTT	2	8	31269	31276	0 %	75 %	0 %	25 %	386593586
85	NC_017624	AGTG	2	8	31521	31528	25 %	25 %	50 %	0 %	386593586
86	NC_017624	ACAA	2	8	31562	31569	75 %	0 %	0 %	25 %	386593586
87	NC_017624	CATG	2	8	31570	31577	25 %	25 %	25 %	25 %	386593586
88	NC_017624	AAAC	2	8	31811	31818	75 %	0 %	0 %	25 %	386593587
89	NC_017624	TCAA	2	8	32106	32113	50 %	25 %	0 %	25 %	386593587
90	NC_017624	TGAT	2	8	32162	32169	25 %	50 %	25 %	0 %	386593587
91	NC_017624	TCTT	2	8	32725	32732	0 %	75 %	0 %	25 %	386593587
92	NC_017624	GATG	2	8	32778	32785	25 %	25 %	50 %	0 %	386593587
93	NC_017624	ACAA	2	8	33002	33009	75 %	0 %	0 %	25 %	386593587
94	NC_017624	AGTC	2	8	33105	33112	25 %	25 %	25 %	25 %	386593587
95	NC_017624	AAAG	2	8	33202	33209	75 %	0 %	25 %	0 %	386593587
96	NC_017624	CAAA	2	8	33548	33555	75 %	0 %	0 %	25 %	386593587
97	NC_017624	CCAG	2	8	34416	34423	25 %	0 %	25 %	50 %	386593588
98	NC_017624	ACTG	2	8	34489	34496	25 %	25 %	25 %	25 %	386593588
99	NC_017624	TACT	2	8	34844	34851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017624	TGAT	2	8	34880	34887	25 %	50 %	25 %	0 %	386593589
101	NC_017624	TAGA	2	8	34955	34962	50 %	25 %	25 %	0 %	386593589
102	NC_017624	AAGC	2	8	35164	35171	50 %	0 %	25 %	25 %	386593589
103	NC_017624	TCAC	2	8	35267	35274	25 %	25 %	0 %	50 %	386593589
104	NC_017624	GCAT	2	8	35362	35369	25 %	25 %	25 %	25 %	386593589
105	NC_017624	AGAT	2	8	36165	36172	50 %	25 %	25 %	0 %	386593589
106	NC_017624	ATTA	2	8	36444	36451	50 %	50 %	0 %	0 %	386593589
107	NC_017624	ATGA	2	8	36502	36509	50 %	25 %	25 %	0 %	386593589
108	NC_017624	GATA	2	8	36631	36638	50 %	25 %	25 %	0 %	386593589
109	NC_017624	AATA	2	8	36825	36832	75 %	25 %	0 %	0 %	386593589
110	NC_017624	TTTG	2	8	36964	36971	0 %	75 %	25 %	0 %	386593589

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.