MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 2753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017623	CACGC	2	10	3066	3075	20 %	0 %	20 %	60 %	386589260
2	NC_017623	CGCGT	2	10	4647	4656	0 %	20 %	40 %	40 %	386589261
3	NC_017623	GCAAC	2	10	7591	7600	40 %	0 %	20 %	40 %	386589262
4	NC_017623	TGACG	2	10	8925	8934	20 %	20 %	40 %	20 %	386589264
5	NC_017623	GCGTG	2	10	10220	10229	0 %	20 %	60 %	20 %	386589265
6	NC_017623	TTCCG	2	10	12702	12711	0 %	40 %	20 %	40 %	386589267
7	NC_017623	CGATG	2	10	13500	13509	20 %	20 %	40 %	20 %	386589268
8	NC_017623	ACGCG	2	10	14916	14925	20 %	0 %	40 %	40 %	386589269
9	NC_017623	AAGTG	2	10	22100	22109	40 %	20 %	40 %	0 %	386589271
10	NC_017623	CTGGC	2	10	25425	25434	0 %	20 %	40 %	40 %	386589275
11	NC_017623	ATTGA	2	10	26968	26977	40 %	40 %	20 %	0 %	386589276
12	NC_017623	CGATG	2	10	27530	27539	20 %	20 %	40 %	20 %	386589277
13	NC_017623	CGCGA	2	10	27777	27786	20 %	0 %	40 %	40 %	386589277
14	NC_017623	CCGGC	2	10	29546	29555	0 %	0 %	40 %	60 %	386589278
15	NC_017623	GGGCA	2	10	30546	30555	20 %	0 %	60 %	20 %	386589279
16	NC_017623	ATGTT	2	10	31831	31840	20 %	60 %	20 %	0 %	386589280
17	NC_017623	GGGCA	2	10	32900	32909	20 %	0 %	60 %	20 %	386589282
18	NC_017623	CATCG	2	10	33028	33037	20 %	20 %	20 %	40 %	386589282
19	NC_017623	CGGCG	2	10	33962	33971	0 %	0 %	60 %	40 %	386589283
20	NC_017623	CGCTG	2	10	36264	36273	0 %	20 %	40 %	40 %	386589285
21	NC_017623	CCTGC	2	10	40768	40777	0 %	20 %	20 %	60 %	386589287
22	NC_017623	TTCTG	2	10	40896	40905	0 %	60 %	20 %	20 %	386589287
23	NC_017623	CGGCG	2	10	42718	42727	0 %	0 %	60 %	40 %	386589289
24	NC_017623	GGAGT	2	10	44578	44587	20 %	20 %	60 %	0 %	386589291
25	NC_017623	TGCCG	2	10	46891	46900	0 %	20 %	40 %	40 %	386589293
26	NC_017623	GCTGG	2	10	48843	48852	0 %	20 %	60 %	20 %	386589294
27	NC_017623	CGCGG	2	10	49726	49735	0 %	0 %	60 %	40 %	386589296
28	NC_017623	GCGCG	2	10	50164	50173	0 %	0 %	60 %	40 %	386589297
29	NC_017623	CGCTA	2	10	51628	51637	20 %	20 %	20 %	40 %	386589298
30	NC_017623	GGCAG	2	10	51665	51674	20 %	0 %	60 %	20 %	386589298
31	NC_017623	TTATT	2	10	53074	53083	20 %	80 %	0 %	0 %	386589299
32	NC_017623	TTTTC	2	10	53459	53468	0 %	80 %	0 %	20 %	386589300
33	NC_017623	TTTCG	2	10	53524	53533	0 %	60 %	20 %	20 %	386589300
34	NC_017623	GGCGT	2	10	53812	53821	0 %	20 %	60 %	20 %	386589300
35	NC_017623	GTTTG	2	10	53922	53931	0 %	60 %	40 %	0 %	386589300
36	NC_017623	CTGGC	2	10	54335	54344	0 %	20 %	40 %	40 %	386589300
37	NC_017623	GGGCG	2	10	54381	54390	0 %	0 %	80 %	20 %	386589300
38	NC_017623	TTCTG	2	10	54623	54632	0 %	60 %	20 %	20 %	386589300
39	NC_017623	ATTGA	2	10	55700	55709	40 %	40 %	20 %	0 %	386589302
40	NC_017623	GTTGA	2	10	56297	56306	20 %	40 %	40 %	0 %	386589302
41	NC_017623	GCGCG	2	10	58311	58320	0 %	0 %	60 %	40 %	386589303
42	NC_017623	CCAGC	2	10	60627	60636	20 %	0 %	20 %	60 %	386589305
43	NC_017623	GCCGC	2	10	64512	64521	0 %	0 %	40 %	60 %	386589307
44	NC_017623	GCTTT	2	10	65818	65827	0 %	60 %	20 %	20 %	386589309
45	NC_017623	CGTGC	2	10	65903	65912	0 %	20 %	40 %	40 %	386589309
46	NC_017623	GGGCT	2	10	66291	66300	0 %	20 %	60 %	20 %	386589311
47	NC_017623	CTGGT	2	10	70788	70797	0 %	40 %	40 %	20 %	386589317
48	NC_017623	TGGAT	2	10	74497	74506	20 %	40 %	40 %	0 %	386589319
49	NC_017623	ATATT	2	10	74678	74687	40 %	60 %	0 %	0 %	386589319
50	NC_017623	TATTG	2	10	74691	74700	20 %	60 %	20 %	0 %	386589319
51	NC_017623	AAATA	2	10	75591	75600	80 %	20 %	0 %	0 %	386589320
52	NC_017623	GATTG	2	10	77192	77201	20 %	40 %	40 %	0 %	386589322
53	NC_017623	TGCGC	2	10	79937	79946	0 %	20 %	40 %	40 %	386589325
54	NC_017623	AGATA	2	10	80198	80207	60 %	20 %	20 %	0 %	386589325
55	NC_017623	GTGCG	2	10	81020	81029	0 %	20 %	60 %	20 %	386589326
56	NC_017623	GCTGC	2	10	83624	83633	0 %	20 %	40 %	40 %	386589329
57	NC_017623	CGGGC	2	10	86520	86529	0 %	0 %	60 %	40 %	386589330
58	NC_017623	AGTTA	2	10	91886	91895	40 %	40 %	20 %	0 %	386589334
59	NC_017623	GTTTG	2	10	92411	92420	0 %	60 %	40 %	0 %	386589335
60	NC_017623	GCGAA	2	10	95410	95419	40 %	0 %	40 %	20 %	386589338
61	NC_017623	TGCTG	2	10	96543	96552	0 %	40 %	40 %	20 %	386589340
62	NC_017623	GGCGC	2	10	96978	96987	0 %	0 %	60 %	40 %	386589341
63	NC_017623	ACTGC	2	10	97284	97293	20 %	20 %	20 %	40 %	386589341
64	NC_017623	CAGTA	2	10	98088	98097	40 %	20 %	20 %	20 %	386589342
65	NC_017623	GCCGC	2	10	98761	98770	0 %	0 %	40 %	60 %	386589343
66	NC_017623	TCTGT	2	10	100498	100507	0 %	60 %	20 %	20 %	386589344
67	NC_017623	ACGTG	2	10	101018	101027	20 %	20 %	40 %	20 %	386589345
68	NC_017623	GTGAT	2	10	101809	101818	20 %	40 %	40 %	0 %	386589345
69	NC_017623	AAGTG	2	10	102061	102070	40 %	20 %	40 %	0 %	386589345
70	NC_017623	TCGCG	2	10	104487	104496	0 %	20 %	40 %	40 %	386589347
71	NC_017623	AGTTT	2	10	105776	105785	20 %	60 %	20 %	0 %	386589347
72	NC_017623	TTCCG	2	10	106951	106960	0 %	40 %	20 %	40 %	386589348
73	NC_017623	GTTTA	2	10	118371	118380	20 %	60 %	20 %	0 %	386589355
74	NC_017623	GCCAA	2	10	119710	119719	40 %	0 %	20 %	40 %	386589357
75	NC_017623	CGCGG	2	10	122984	122993	0 %	0 %	60 %	40 %	386589358
76	NC_017623	GCGCC	2	10	129226	129235	0 %	0 %	40 %	60 %	386589363
77	NC_017623	ACTTC	2	10	131318	131327	20 %	40 %	0 %	40 %	386589364
78	NC_017623	ATTAA	2	10	133735	133744	60 %	40 %	0 %	0 %	386589366
79	NC_017623	GATAC	2	10	134064	134073	40 %	20 %	20 %	20 %	386589367
80	NC_017623	AATGT	2	10	135493	135502	40 %	40 %	20 %	0 %	386589368
81	NC_017623	TAACA	2	10	135518	135527	60 %	20 %	0 %	20 %	386589368
82	NC_017623	ATTAG	2	10	136049	136058	40 %	40 %	20 %	0 %	386589368
83	NC_017623	CGTAG	2	10	138971	138980	20 %	20 %	40 %	20 %	386589370
84	NC_017623	TTCCC	2	10	142028	142037	0 %	40 %	0 %	60 %	386589373
85	NC_017623	ATTTT	2	10	147659	147668	20 %	80 %	0 %	0 %	386589379
86	NC_017623	GCGAG	2	10	152468	152477	20 %	0 %	60 %	20 %	386589387
87	NC_017623	CGGCG	2	10	153200	153209	0 %	0 %	60 %	40 %	386589387
88	NC_017623	AGCCC	2	10	153844	153853	20 %	0 %	20 %	60 %	386589388
89	NC_017623	ACATG	2	10	154170	154179	40 %	20 %	20 %	20 %	386589389
90	NC_017623	GGCGC	2	10	158736	158745	0 %	0 %	60 %	40 %	386589390
91	NC_017623	GCGCG	2	10	163026	163035	0 %	0 %	60 %	40 %	386589395
92	NC_017623	TGCGA	2	10	164136	164145	20 %	20 %	40 %	20 %	386589397
93	NC_017623	CCGGC	2	10	167591	167600	0 %	0 %	40 %	60 %	386589400
94	NC_017623	ATGGC	2	10	169682	169691	20 %	20 %	40 %	20 %	386589401
95	NC_017623	GCACA	2	10	171117	171126	40 %	0 %	20 %	40 %	386589403
96	NC_017623	GTACT	2	10	176115	176124	20 %	40 %	20 %	20 %	386589407
97	NC_017623	TTGCA	2	10	177252	177261	20 %	40 %	20 %	20 %	386589408
98	NC_017623	GAAAA	2	10	177455	177464	80 %	0 %	20 %	0 %	386589409
99	NC_017623	GCGTC	2	10	177806	177815	0 %	20 %	40 %	40 %	386589409
100	NC_017623	GCCCG	2	10	178992	179001	0 %	0 %	40 %	60 %	386589411
101	NC_017623	AGCGC	2	10	179072	179081	20 %	0 %	40 %	40 %	386589411
102	NC_017623	AGGCA	2	10	181200	181209	40 %	0 %	40 %	20 %	386589413
103	NC_017623	GTTAT	2	10	186736	186745	20 %	60 %	20 %	0 %	386589418
104	NC_017623	GAAAA	2	10	187065	187074	80 %	0 %	20 %	0 %	386589418
105	NC_017623	AACAG	2	10	187424	187433	60 %	0 %	20 %	20 %	386589419
106	NC_017623	CGCGC	3	15	189758	189772	0 %	0 %	40 %	60 %	386589421
107	NC_017623	CCACT	2	10	196423	196432	20 %	20 %	0 %	60 %	386589426
108	NC_017623	ATTTC	2	10	196964	196973	20 %	60 %	0 %	20 %	386589427
109	NC_017623	ATTCT	2	10	198899	198908	20 %	60 %	0 %	20 %	386589429
110	NC_017623	TTATT	2	10	199491	199500	20 %	80 %	0 %	0 %	386589430
111	NC_017623	GGCAG	2	10	199903	199912	20 %	0 %	60 %	20 %	386589431
112	NC_017623	CATTT	2	10	201444	201453	20 %	60 %	0 %	20 %	386589432
113	NC_017623	TTCAT	2	10	205299	205308	20 %	60 %	0 %	20 %	386589437
114	NC_017623	GATCA	2	10	209938	209947	40 %	20 %	20 %	20 %	386589443
115	NC_017623	CGGCG	2	10	210352	210361	0 %	0 %	60 %	40 %	386589443
116	NC_017623	GCAAT	2	10	210801	210810	40 %	20 %	20 %	20 %	386589443
117	NC_017623	TTGCT	2	10	212412	212421	0 %	60 %	20 %	20 %	386589445
118	NC_017623	GGCAA	2	10	215950	215959	40 %	0 %	40 %	20 %	386589447
119	NC_017623	GCGCA	2	10	220892	220901	20 %	0 %	40 %	40 %	386589450
120	NC_017623	CCGCG	2	10	226296	226305	0 %	0 %	40 %	60 %	386589454
121	NC_017623	CAATG	2	10	226940	226949	40 %	20 %	20 %	20 %	386589454
122	NC_017623	ACCAC	2	10	228048	228057	40 %	0 %	0 %	60 %	386589455
123	NC_017623	CGTTT	2	10	229016	229025	0 %	60 %	20 %	20 %	386589456
124	NC_017623	GCCGC	2	10	229197	229206	0 %	0 %	40 %	60 %	386589456
125	NC_017623	GCCGG	2	10	231658	231667	0 %	0 %	60 %	40 %	386589457
126	NC_017623	TCGCG	2	10	234702	234711	0 %	20 %	40 %	40 %	386589460
127	NC_017623	TTCGT	2	10	236446	236455	0 %	60 %	20 %	20 %	386589461
128	NC_017623	GCGAG	2	10	237249	237258	20 %	0 %	60 %	20 %	386589461
129	NC_017623	CGGCG	2	10	237298	237307	0 %	0 %	60 %	40 %	386589461
130	NC_017623	GATGG	2	10	237379	237388	20 %	20 %	60 %	0 %	386589461
131	NC_017623	GCCCA	2	10	237824	237833	20 %	0 %	20 %	60 %	386589461
132	NC_017623	AGTTC	2	10	239439	239448	20 %	40 %	20 %	20 %	386589462
133	NC_017623	GGCGT	2	10	239855	239864	0 %	20 %	60 %	20 %	386589462
134	NC_017623	CAGTA	2	10	241268	241277	40 %	20 %	20 %	20 %	386589463
135	NC_017623	CGCAG	2	10	242823	242832	20 %	0 %	40 %	40 %	386589464
136	NC_017623	CGTAC	2	10	246123	246132	20 %	20 %	20 %	40 %	386589467
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140	NC_017623	CAGGT	2	10	265730	265739	20 %	20 %	40 %	20 %	386589481
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142	NC_017623	TCCGT	2	10	268986	268995	0 %	40 %	20 %	40 %	386589484
143	NC_017623	GAAGC	2	10	270716	270725	40 %	0 %	40 %	20 %	386589484
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153	NC_017623	ACATC	2	10	301680	301689	40 %	20 %	0 %	40 %	386589508
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