MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 68642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017623	AGA	2	6	107	112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017623	TTA	2	6	148	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017623	TAA	2	6	188	193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017623	AAC	2	6	295	300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017623	CCA	2	6	339	344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017623	CGC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589257
7	NC_017623	TAA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589257
8	NC_017623	GCC	2	6	781	786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589257
9	NC_017623	TGC	2	6	792	797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589257
10	NC_017623	TCA	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589258
11	NC_017623	TTG	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589258
12	NC_017623	GGT	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589258
13	NC_017623	GAT	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589258
14	NC_017623	AGC	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589258
15	NC_017623	GTT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589258
16	NC_017623	ATT	2	6	1413	1418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017623	ATT	2	6	1458	1463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017623	TTG	2	6	1480	1485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017623	AAC	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589259
20	NC_017623	GGA	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589259
21	NC_017623	GTG	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589259
22	NC_017623	TGT	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589259
23	NC_017623	TGG	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589259
24	NC_017623	ATG	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
25	NC_017623	ATG	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
26	NC_017623	TGA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
27	NC_017623	GCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589259
28	NC_017623	GCG	2	6	2371	2376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
29	NC_017623	CGG	3	9	2393	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
30	NC_017623	TGC	3	9	2428	2436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589259
31	NC_017623	GCG	2	6	2464	2469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
32	NC_017623	GCC	2	6	2523	2528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589260
33	NC_017623	CAG	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589260
34	NC_017623	ATG	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589260
35	NC_017623	CAC	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
36	NC_017623	ACC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
37	NC_017623	AAT	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589260
38	NC_017623	GCC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589260
39	NC_017623	ATA	2	6	2888	2893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589260
40	NC_017623	AGC	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589260
41	NC_017623	TCC	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589260
42	NC_017623	GCT	2	6	3018	3023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589260
43	NC_017623	TAC	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
44	NC_017623	GAG	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589260
45	NC_017623	CGG	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
46	NC_017623	GGC	2	6	3170	3175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
47	NC_017623	ATC	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
48	NC_017623	GTT	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589260
49	NC_017623	GCG	2	6	3347	3352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
50	NC_017623	CAC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
51	NC_017623	GGC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
52	NC_017623	CTT	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589260
53	NC_017623	GTG	2	6	3545	3550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589260
54	NC_017623	CGG	2	6	3766	3771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
55	NC_017623	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
56	NC_017623	ATC	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
57	NC_017623	TTG	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589260
58	NC_017623	TGC	2	6	4057	4062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
59	NC_017623	TGC	2	6	4078	4083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
60	NC_017623	GCT	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
61	NC_017623	CAC	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589261
62	NC_017623	CGC	2	6	4274	4279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
63	NC_017623	CGG	2	6	4395	4400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589261
64	NC_017623	CTT	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
65	NC_017623	TGC	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
66	NC_017623	CCG	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
67	NC_017623	CTG	3	9	4530	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
68	NC_017623	TCA	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589261
69	NC_017623	AAG	2	6	4663	4668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589261
70	NC_017623	TTC	2	6	4696	4701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
71	NC_017623	TTC	2	6	4827	4832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
72	NC_017623	CTG	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
73	NC_017623	GCC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
74	NC_017623	CAG	2	6	5010	5015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589261
75	NC_017623	TCA	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589261
76	NC_017623	GGC	2	6	5285	5290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589261
77	NC_017623	CAA	2	6	5325	5330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589261
78	NC_017623	CGC	2	6	5352	5357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
79	NC_017623	GCT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
80	NC_017623	TAA	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589261
81	NC_017623	ATA	2	6	5458	5463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589261
82	NC_017623	CAC	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017623	GGC	2	6	5693	5698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017623	AGG	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017623	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589262
86	NC_017623	TCT	2	6	5973	5978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589262
87	NC_017623	GGC	2	6	6131	6136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
88	NC_017623	GTG	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
89	NC_017623	CGC	2	6	6213	6218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589262
90	NC_017623	ATT	2	6	6248	6253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589262
91	NC_017623	TGT	2	6	6264	6269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
92	NC_017623	TAT	2	6	6367	6372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589262
93	NC_017623	GGT	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
94	NC_017623	CGT	2	6	6564	6569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
95	NC_017623	ACT	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589262
96	NC_017623	CTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589262
97	NC_017623	GCT	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
98	NC_017623	GCT	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
99	NC_017623	GTT	2	6	6860	6865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
100	NC_017623	GGC	3	9	6895	6903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
101	NC_017623	TTG	2	6	7061	7066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
102	NC_017623	CGG	2	6	7069	7074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
103	NC_017623	ACC	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589262
104	NC_017623	CGT	2	6	7151	7156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
105	NC_017623	GAT	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589262
106	NC_017623	CCG	2	6	7211	7216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589262
107	NC_017623	CAA	2	6	7297	7302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589262
108	NC_017623	GTG	2	6	7412	7417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
109	NC_017623	GAT	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589262
110	NC_017623	CGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
111	NC_017623	TGT	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
112	NC_017623	ATG	2	6	7802	7807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017623	GAA	2	6	7874	7879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589263
114	NC_017623	TCG	2	6	7905	7910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589263
115	NC_017623	CTT	2	6	8017	8022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589263
116	NC_017623	GGT	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589263
117	NC_017623	GGC	2	6	8066	8071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589263
118	NC_017623	ACA	2	6	8093	8098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589263
119	NC_017623	GCA	2	6	8144	8149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589263
120	NC_017623	TGG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
121	NC_017623	CCA	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589264
122	NC_017623	TGA	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
123	NC_017623	GTT	2	6	8478	8483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589264
124	NC_017623	ACC	2	6	8500	8505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589264
125	NC_017623	ATT	2	6	8545	8550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589264
126	NC_017623	ACC	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589264
127	NC_017623	TGG	2	6	8711	8716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
128	NC_017623	TGG	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
129	NC_017623	TCA	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589264
130	NC_017623	ATG	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
131	NC_017623	ATG	2	6	9104	9109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
132	NC_017623	TGC	2	6	9119	9124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589264
133	NC_017623	TGA	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
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135	NC_017623	AGC	2	6	9410	9415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589264
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137	NC_017623	TGA	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
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142	NC_017623	CTG	2	6	9885	9890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589265
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145	NC_017623	CTG	2	6	10044	10049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589265
146	NC_017623	TCG	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589265
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153	NC_017623	TGC	2	6	10375	10380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589265
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252	NC_017623	CCA	2	6	16048	16053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
253	NC_017623	AAC	2	6	16063	16068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_017623	GCC	2	6	16078	16083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_017623	CGC	2	6	16174	16179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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257	NC_017623	AGC	2	6	16422	16427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_017623	TGC	2	6	16429	16434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_017623	ACT	2	6	16496	16501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_017623	TTG	2	6	16593	16598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017623	CGA	2	6	16621	16626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_017623	GCA	2	6	16695	16700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_017623	GAA	2	6	16754	16759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017623	GGA	2	6	16790	16795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017623	TAA	2	6	16808	16813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017623	AAC	2	6	19223	19228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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380	NC_017623	ACC	2	6	26612	26617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589275
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383	NC_017623	ATG	2	6	26830	26835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589275
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385	NC_017623	CAA	2	6	27076	27081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589276
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