MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 59897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017623	CGC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589257
2	NC_017623	TAA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589257
3	NC_017623	GCC	2	6	781	786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589257
4	NC_017623	TGC	2	6	792	797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589257
5	NC_017623	TCA	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589258
6	NC_017623	TTG	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589258
7	NC_017623	GGT	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589258
8	NC_017623	GAT	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589258
9	NC_017623	AGC	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589258
10	NC_017623	GTT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589258
11	NC_017623	AAC	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589259
12	NC_017623	GGA	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589259
13	NC_017623	GTG	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589259
14	NC_017623	TGT	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589259
15	NC_017623	TGG	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589259
16	NC_017623	ATG	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
17	NC_017623	ATG	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
18	NC_017623	TGA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
19	NC_017623	GCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589259
20	NC_017623	GCG	2	6	2371	2376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
21	NC_017623	CGG	3	9	2393	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
22	NC_017623	TGC	3	9	2428	2436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589259
23	NC_017623	GCG	2	6	2464	2469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
24	NC_017623	GCC	2	6	2523	2528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589260
25	NC_017623	CAG	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589260
26	NC_017623	ATG	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589260
27	NC_017623	CAC	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
28	NC_017623	ACC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
29	NC_017623	AAT	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589260
30	NC_017623	GCC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589260
31	NC_017623	ATA	2	6	2888	2893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589260
32	NC_017623	AGC	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589260
33	NC_017623	TCC	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589260
34	NC_017623	GCT	2	6	3018	3023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589260
35	NC_017623	TAC	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
36	NC_017623	GAG	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589260
37	NC_017623	CGG	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
38	NC_017623	GGC	2	6	3170	3175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
39	NC_017623	ATC	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
40	NC_017623	GTT	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589260
41	NC_017623	GCG	2	6	3347	3352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
42	NC_017623	CAC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
43	NC_017623	GGC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
44	NC_017623	CTT	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589260
45	NC_017623	GTG	2	6	3545	3550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589260
46	NC_017623	CGG	2	6	3766	3771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
47	NC_017623	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
48	NC_017623	ATC	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
49	NC_017623	TTG	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589260
50	NC_017623	TGC	2	6	4057	4062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
51	NC_017623	TGC	2	6	4078	4083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
52	NC_017623	GCT	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
53	NC_017623	CAC	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589261
54	NC_017623	CGC	2	6	4274	4279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
55	NC_017623	CGG	2	6	4395	4400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589261
56	NC_017623	CTT	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
57	NC_017623	TGC	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
58	NC_017623	CCG	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
59	NC_017623	CTG	3	9	4530	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
60	NC_017623	TCA	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589261
61	NC_017623	AAG	2	6	4663	4668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589261
62	NC_017623	TTC	2	6	4696	4701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
63	NC_017623	TTC	2	6	4827	4832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
64	NC_017623	CTG	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
65	NC_017623	GCC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
66	NC_017623	CAG	2	6	5010	5015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589261
67	NC_017623	TCA	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589261
68	NC_017623	GGC	2	6	5285	5290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589261
69	NC_017623	CAA	2	6	5325	5330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589261
70	NC_017623	CGC	2	6	5352	5357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
71	NC_017623	GCT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
72	NC_017623	TAA	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589261
73	NC_017623	ATA	2	6	5458	5463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589261
74	NC_017623	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589262
75	NC_017623	TCT	2	6	5973	5978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589262
76	NC_017623	GGC	2	6	6131	6136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
77	NC_017623	GTG	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
78	NC_017623	CGC	2	6	6213	6218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589262
79	NC_017623	ATT	2	6	6248	6253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589262
80	NC_017623	TGT	2	6	6264	6269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
81	NC_017623	TAT	2	6	6367	6372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589262
82	NC_017623	GGT	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
83	NC_017623	CGT	2	6	6564	6569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
84	NC_017623	ACT	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589262
85	NC_017623	CTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589262
86	NC_017623	GCT	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
87	NC_017623	GCT	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
88	NC_017623	GTT	2	6	6860	6865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
89	NC_017623	GGC	3	9	6895	6903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
90	NC_017623	TTG	2	6	7061	7066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
91	NC_017623	CGG	2	6	7069	7074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
92	NC_017623	ACC	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589262
93	NC_017623	CGT	2	6	7151	7156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
94	NC_017623	GAT	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589262
95	NC_017623	CCG	2	6	7211	7216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589262
96	NC_017623	CAA	2	6	7297	7302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589262
97	NC_017623	GTG	2	6	7412	7417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
98	NC_017623	GAT	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589262
99	NC_017623	CGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
100	NC_017623	TGT	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
101	NC_017623	GAA	2	6	7874	7879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589263
102	NC_017623	TCG	2	6	7905	7910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589263
103	NC_017623	CTT	2	6	8017	8022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589263
104	NC_017623	GGT	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589263
105	NC_017623	GGC	2	6	8066	8071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589263
106	NC_017623	ACA	2	6	8093	8098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589263
107	NC_017623	GCA	2	6	8144	8149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589263
108	NC_017623	TGG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
109	NC_017623	CCA	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589264
110	NC_017623	TGA	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
111	NC_017623	GTT	2	6	8478	8483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589264
112	NC_017623	ACC	2	6	8500	8505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589264
113	NC_017623	ATT	2	6	8545	8550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589264
114	NC_017623	ACC	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589264
115	NC_017623	TGG	2	6	8711	8716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
116	NC_017623	TGG	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
117	NC_017623	TCA	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589264
118	NC_017623	ATG	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
119	NC_017623	ATG	2	6	9104	9109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
120	NC_017623	TGC	2	6	9119	9124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589264
121	NC_017623	TGA	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
122	NC_017623	GTG	2	6	9244	9249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
123	NC_017623	AGC	2	6	9410	9415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589264
124	NC_017623	GGT	2	6	9490	9495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589264
125	NC_017623	TGA	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589264
126	NC_017623	CGA	2	6	9555	9560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589264
127	NC_017623	CAT	2	6	9639	9644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589264
128	NC_017623	CAT	2	6	9690	9695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589264
129	NC_017623	CTT	2	6	9858	9863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589265
130	NC_017623	CTG	2	6	9885	9890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589265
131	NC_017623	TAA	2	6	9938	9943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589265
132	NC_017623	TTC	2	6	9955	9960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589265
133	NC_017623	CTG	2	6	10044	10049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589265
134	NC_017623	TCG	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589265
135	NC_017623	GCC	2	6	10113	10118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589265
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137	NC_017623	TGA	2	6	10204	10209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589265
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140	NC_017623	CGC	2	6	10361	10366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589265
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147	NC_017623	GGC	2	6	10599	10604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589265
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154	NC_017623	ACA	2	6	10759	10764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589265
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159	NC_017623	TGG	2	6	10975	10980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589266
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162	NC_017623	GTC	2	6	11163	11168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589266
163	NC_017623	GCG	2	6	11283	11288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589266
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240	NC_017623	CTG	2	6	22123	22128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589271
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246	NC_017623	GAA	2	6	22876	22881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589272
247	NC_017623	GGC	2	6	22999	23004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589272
248	NC_017623	AGA	2	6	23025	23030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589272
249	NC_017623	TGA	2	6	23043	23048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589272
250	NC_017623	TAA	2	6	23050	23055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589272
251	NC_017623	CAG	2	6	23083	23088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589273
252	NC_017623	AAC	2	6	23105	23110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589273
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254	NC_017623	CTT	2	6	23329	23334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589273
255	NC_017623	GCG	2	6	23360	23365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589273
256	NC_017623	GGA	2	6	23432	23437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589273
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374	NC_017623	GAA	2	6	32351	32356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589281
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499	NC_017623	GTT	2	6	40280	40285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589287
500	NC_017623	AAC	2	6	40335	40340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589287

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