MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017622	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017622	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017622	AAAT	2	8	16629	16636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017622	GTGA	2	8	17378	17385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017622	AGCG	2	8	17549	17556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017622	AGCC	2	8	18431	18438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017622	GTAA	2	8	19010	19017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017622	TCAC	2	8	19067	19074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017622	GCGA	2	8	19166	19173	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017622	ATTC	2	8	20032	20039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017622	CTAA	2	8	20387	20394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017622	TAGG	2	8	21043	21050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017622	AATC	2	8	22189	22196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017622	GCGT	2	8	23100	23107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017622	TTTG	2	8	26601	26608	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017622	ATTT	2	8	27668	27675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017622	AGCC	2	8	37322	37329	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017622	GATT	2	8	37385	37392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017622	CTGG	2	8	37444	37451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017622	AATA	2	8	43926	43933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017622	AATA	2	8	46526	46533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017622	CTCC	2	8	46552	46559	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_017622	TTCG	2	8	46653	46660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017622	AAGC	2	8	46775	46782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017622	ATCA	2	8	47047	47054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017622	GACC	2	8	52547	52554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017622	ATAG	2	8	52615	52622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017622	GAAT	2	8	52855	52862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017622	ACTC	2	8	56928	56935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017622	AGGG	2	8	58238	58245	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017622	TAAG	2	8	58614	58621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017622	AAGG	2	8	58704	58711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017622	TCTT	2	8	58779	58786	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017622	GGAA	2	8	58845	58852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017622	GTTA	2	8	59736	59743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017622	AATA	2	8	61046	61053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017622	GAGC	2	8	66727	66734	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017622	AAGT	2	8	71691	71698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017622	GACT	2	8	75233	75240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017622	TTGA	2	8	75257	75264	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017622	AAAC	2	8	78108	78115	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017622	CAAC	2	8	79277	79284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017622	ATCT	2	8	79327	79334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017622	TAGA	2	8	79434	79441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017622	TACA	2	8	82209	82216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017622	GTGA	2	8	88485	88492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017622	AGCG	2	8	88656	88663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017622	AGCC	2	8	89538	89545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017622	GTAA	2	8	90117	90124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017622	TCAC	2	8	90174	90181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017622	GCGA	2	8	90273	90280	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017622	ATTC	2	8	91139	91146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017622	CTAA	2	8	91495	91502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017622	TAGG	2	8	92151	92158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017622	TAGT	2	8	95412	95419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017622	TATT	2	8	99144	99151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017622	TAAA	2	8	99189	99196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017622	GCTG	2	8	101246	101253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017622	TTTA	2	8	101464	101471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017622	TACT	2	8	101575	101582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017622	TTAA	2	8	101647	101654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017622	TCTT	2	8	105179	105186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017622	TCTT	2	8	110904	110911	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017622	ATGG	2	8	114619	114626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017622	ATCC	2	8	114756	114763	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017622	GAAA	2	8	118487	118494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017622	CAGT	2	8	119311	119318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017622	GGTA	2	8	119411	119418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017622	CGAC	2	8	119706	119713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017622	AACT	2	8	125913	125920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017622	TTTG	2	8	129700	129707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017622	TCTA	2	8	130073	130080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017622	CAAT	2	8	137477	137484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017622	TCTA	2	8	139937	139944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017622	ACCT	2	8	139946	139953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017622	AAAC	2	8	140308	140315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017622	AAAT	2	8	140639	140646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017622	TTTG	2	8	140669	140676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017622	ATAG	2	8	140705	140712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017622	AAAG	2	8	140850	140857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017622	TTTG	2	8	146327	146334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017622	CTTT	2	8	150986	150993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017622	GTCT	2	8	151031	151038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017622	AAAG	2	8	151562	151569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017622	ATAA	2	8	162741	162748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017622	GGTA	2	8	166652	166659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017622	TAGA	2	8	169305	169312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017622	TAGA	2	8	169914	169921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017622	TGTA	2	8	171333	171340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017622	GAAA	2	8	171406	171413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017622	GTAG	2	8	171414	171421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017622	TTCA	2	8	179374	179381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017622	AAAT	2	8	192062	192069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017622	AAAT	2	8	192124	192131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017622	TAAA	2	8	194004	194011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017622	TAAA	2	8	194746	194753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017622	GTTG	2	8	196639	196646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017622	AAAT	3	12	197943	197954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017622	TAAA	2	8	197977	197984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017622	ATTT	2	8	201302	201309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017622	ATAG	2	8	201333	201340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017622	ATTT	2	8	201349	201356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017622	ATTT	2	8	201370	201377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017622	TCTT	2	8	207739	207746	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017622	CTTG	2	8	210865	210872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017622	TTGT	2	8	214620	214627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017622	GAGT	2	8	217256	217263	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017622	ATTG	2	8	217441	217448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017622	TTTA	2	8	217487	217494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017622	GAAT	2	8	218727	218734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017622	TGGT	2	8	220729	220736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017622	CAAT	2	8	221571	221578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017622	ATAG	2	8	223621	223628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017622	ACTT	2	8	228234	228241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017622	TTTA	2	8	231059	231066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017622	AACG	2	8	232043	232050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017622	TTAT	2	8	232154	232161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017622	GTCT	2	8	232173	232180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017622	GACC	2	8	232552	232559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017622	TGGA	2	8	232738	232745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017622	AGTC	2	8	233028	233035	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017622	AAGA	2	8	233093	233100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017622	GTCT	2	8	233114	233121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017622	TTGC	2	8	233476	233483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017622	AGCA	2	8	233752	233759	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017622	ACTG	2	8	236964	236971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017622	GTTT	2	8	241787	241794	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017622	AAGA	2	8	241809	241816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017622	AAAT	2	8	253245	253252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017622	ATAA	2	8	253274	253281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017622	GGAA	2	8	258014	258021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017622	TAGT	2	8	258094	258101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017622	AGCA	2	8	259014	259021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017622	ATGA	2	8	259341	259348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017622	ATTT	2	8	259809	259816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017622	GAAA	2	8	259985	259992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017622	GAAG	2	8	260153	260160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017622	GAAG	2	8	260386	260393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017622	ACAA	2	8	260517	260524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017622	GGCT	2	8	260702	260709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017622	GCTG	2	8	261838	261845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017622	GGAA	2	8	262716	262723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017622	AGAA	2	8	268360	268367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017622	TAGG	2	8	271393	271400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017622	TTGT	2	8	271498	271505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017622	TCTA	2	8	271583	271590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017622	ATTT	2	8	273145	273152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017622	GTTT	2	8	273178	273185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017622	AAAG	2	8	288532	288539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017622	CAAC	2	8	288555	288562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017622	CTTT	2	8	296702	296709	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017622	GTCA	2	8	300122	300129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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