MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 6359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017621	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386585203
2	NC_017621	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386585203
3	NC_017621	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386585203
4	NC_017621	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386585203
5	NC_017621	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386585204
6	NC_017621	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386585204
7	NC_017621	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386585204
8	NC_017621	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386585204
9	NC_017621	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	386585205
10	NC_017621	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	386585205
11	NC_017621	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	386585205
12	NC_017621	GTAT	2	8	3645	3652	25 %	50 %	25 %	0 %	386585206
13	NC_017621	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	386585207
14	NC_017621	AAAT	2	8	4691	4698	75 %	25 %	0 %	0 %	386585208
15	NC_017621	CTTG	2	8	5279	5286	0 %	50 %	25 %	25 %	386585208
16	NC_017621	ACTT	2	8	5295	5302	25 %	50 %	0 %	25 %	386585208
17	NC_017621	GTGC	2	8	5322	5329	0 %	25 %	50 %	25 %	386585208
18	NC_017621	TTGG	2	8	5658	5665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017621	TCTA	2	8	5876	5883	25 %	50 %	0 %	25 %	386585209
20	NC_017621	ATCA	2	8	6309	6316	50 %	25 %	0 %	25 %	386585210
21	NC_017621	GTTT	2	8	6539	6546	0 %	75 %	25 %	0 %	386585210
22	NC_017621	TCAA	2	8	6566	6573	50 %	25 %	0 %	25 %	386585210
23	NC_017621	CTTA	2	8	7039	7046	25 %	50 %	0 %	25 %	386585210
24	NC_017621	AGTT	2	8	7600	7607	25 %	50 %	25 %	0 %	386585210
25	NC_017621	GATG	2	8	7622	7629	25 %	25 %	50 %	0 %	386585210
26	NC_017621	GCAA	2	8	8254	8261	50 %	0 %	25 %	25 %	386585210
27	NC_017621	TCAG	2	8	9194	9201	25 %	25 %	25 %	25 %	386585210
28	NC_017621	CTTG	2	8	9473	9480	0 %	50 %	25 %	25 %	386585210
29	NC_017621	TGGC	2	8	9571	9578	0 %	25 %	50 %	25 %	386585210
30	NC_017621	AAGG	2	8	9752	9759	50 %	0 %	50 %	0 %	386585210
31	NC_017621	GAAG	2	8	9873	9880	50 %	0 %	50 %	0 %	386585211
32	NC_017621	TCTT	2	8	10203	10210	0 %	75 %	0 %	25 %	386585212
33	NC_017621	TGCC	2	8	10218	10225	0 %	25 %	25 %	50 %	386585212
34	NC_017621	TTTG	2	8	10602	10609	0 %	75 %	25 %	0 %	386585214
35	NC_017621	CTAT	2	8	10682	10689	25 %	50 %	0 %	25 %	386585214
36	NC_017621	AGTG	2	8	11545	11552	25 %	25 %	50 %	0 %	386585214
37	NC_017621	AGAT	2	8	11853	11860	50 %	25 %	25 %	0 %	386585215
38	NC_017621	GAAG	2	8	12168	12175	50 %	0 %	50 %	0 %	386585215
39	NC_017621	GATT	2	8	12236	12243	25 %	50 %	25 %	0 %	386585215
40	NC_017621	AGGC	2	8	12898	12905	25 %	0 %	50 %	25 %	386585215
41	NC_017621	TAAA	2	8	12932	12939	75 %	25 %	0 %	0 %	386585215
42	NC_017621	CTTG	2	8	14392	14399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017621	TGTT	2	8	14466	14473	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017621	GTTC	2	8	14492	14499	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017621	GTCG	2	8	14598	14605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017621	CAAC	2	8	14657	14664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017621	ATGG	2	8	14676	14683	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017621	CAAC	2	8	14719	14726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017621	TTGG	2	8	14784	14791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017621	AAGA	2	8	15024	15031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017621	TTAT	2	8	15842	15849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017621	ATTA	2	8	16425	16432	50 %	50 %	0 %	0 %	386585217
53	NC_017621	GTGA	2	8	17445	17452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017621	AGCG	2	8	17616	17623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017621	AGCC	2	8	18498	18505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017621	GTAA	2	8	18964	18971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017621	TCAC	2	8	19021	19028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017621	GCGA	2	8	19120	19127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017621	ATTC	2	8	19986	19993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017621	CTAA	2	8	20342	20349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017621	CTGA	2	8	20616	20623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017621	TAGG	2	8	20998	21005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017621	AATC	2	8	22144	22151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017621	GCGT	2	8	23055	23062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017621	TTTG	2	8	23584	23591	0 %	75 %	25 %	0 %	386585218
66	NC_017621	CAAA	2	8	24341	24348	75 %	0 %	0 %	25 %	386585218
67	NC_017621	GGTC	2	8	24439	24446	0 %	25 %	50 %	25 %	386585219
68	NC_017621	AACA	2	8	24848	24855	75 %	0 %	0 %	25 %	386585219
69	NC_017621	TCTA	2	8	24992	24999	25 %	50 %	0 %	25 %	386585220
70	NC_017621	AATC	2	8	25330	25337	50 %	25 %	0 %	25 %	386585220
71	NC_017621	TTTG	2	8	26243	26250	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017621	ATTG	2	8	26759	26766	25 %	50 %	25 %	0 %	386585221
73	NC_017621	TTGA	2	8	26970	26977	25 %	50 %	25 %	0 %	386585221
74	NC_017621	TGAT	2	8	26983	26990	25 %	50 %	25 %	0 %	386585221
75	NC_017621	TTTG	2	8	27248	27255	0 %	75 %	25 %	0 %	386585221
76	NC_017621	ATTT	2	8	27310	27317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017621	TGCC	2	8	27720	27727	0 %	25 %	25 %	50 %	386585222
78	NC_017621	GCGG	2	8	28237	28244	0 %	0 %	75 %	25 %	386585222
79	NC_017621	GAAA	2	8	28392	28399	75 %	0 %	25 %	0 %	386585222
80	NC_017621	GTCT	2	8	28720	28727	0 %	50 %	25 %	25 %	386585223
81	NC_017621	CTAC	2	8	28798	28805	25 %	25 %	0 %	50 %	386585223
82	NC_017621	TGGG	2	8	29331	29338	0 %	25 %	75 %	0 %	386585224
83	NC_017621	TCAA	2	8	29370	29377	50 %	25 %	0 %	25 %	386585224
84	NC_017621	AAGA	2	8	29528	29535	75 %	0 %	25 %	0 %	386585224
85	NC_017621	CGTG	2	8	29797	29804	0 %	25 %	50 %	25 %	386585224
86	NC_017621	AACC	2	8	30099	30106	50 %	0 %	0 %	50 %	386585224
87	NC_017621	CTTG	2	8	30157	30164	0 %	50 %	25 %	25 %	386585224
88	NC_017621	AATT	2	8	30340	30347	50 %	50 %	0 %	0 %	386585225
89	NC_017621	AAGA	2	8	30783	30790	75 %	0 %	25 %	0 %	386585226
90	NC_017621	TGAA	2	8	30850	30857	50 %	25 %	25 %	0 %	386585226
91	NC_017621	TACT	2	8	32042	32049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017621	CGTG	2	8	32600	32607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017621	ACAG	2	8	32780	32787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017621	ACAG	2	8	32815	32822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017621	TTCC	2	8	33223	33230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017621	GCAG	2	8	33673	33680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017621	TACC	2	8	33890	33897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017621	GGAA	2	8	34864	34871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017621	AAGA	2	8	35093	35100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017621	AAAT	2	8	35141	35148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017621	TGGT	2	8	36014	36021	0 %	50 %	50 %	0 %	386585227
102	NC_017621	ACCT	2	8	36424	36431	25 %	25 %	0 %	50 %	386585227
103	NC_017621	AAGT	2	8	36598	36605	50 %	25 %	25 %	0 %	386585227
104	NC_017621	AGCC	2	8	37000	37007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017621	AGCC	2	8	37094	37101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017621	CTGG	2	8	37216	37223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017621	CGTC	2	8	37338	37345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017621	TGTT	2	8	37529	37536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017621	GGCA	2	8	38128	38135	25 %	0 %	50 %	25 %	386585228
110	NC_017621	ATCA	2	8	38383	38390	50 %	25 %	0 %	25 %	386585229
111	NC_017621	CGAT	2	8	38632	38639	25 %	25 %	25 %	25 %	386585229
112	NC_017621	CGTT	2	8	38930	38937	0 %	50 %	25 %	25 %	386585230
113	NC_017621	TTGA	2	8	39200	39207	25 %	50 %	25 %	0 %	386585230
114	NC_017621	GTCC	2	8	39300	39307	0 %	25 %	25 %	50 %	386585230
115	NC_017621	TTCG	2	8	39312	39319	0 %	50 %	25 %	25 %	386585230
116	NC_017621	CAAG	2	8	39493	39500	50 %	0 %	25 %	25 %	386585230
117	NC_017621	GCTA	2	8	39934	39941	25 %	25 %	25 %	25 %	386585230
118	NC_017621	GCGA	2	8	40001	40008	25 %	0 %	50 %	25 %	386585230
119	NC_017621	AACC	2	8	40228	40235	50 %	0 %	0 %	50 %	386585230
120	NC_017621	TCCG	2	8	40244	40251	0 %	25 %	25 %	50 %	386585230
121	NC_017621	GGCA	2	8	40348	40355	25 %	0 %	50 %	25 %	386585230
122	NC_017621	GTTC	2	8	40807	40814	0 %	50 %	25 %	25 %	386585231
123	NC_017621	CATG	2	8	41028	41035	25 %	25 %	25 %	25 %	386585231
124	NC_017621	CAAA	2	8	41887	41894	75 %	0 %	0 %	25 %	386585232
125	NC_017621	ATGA	2	8	42243	42250	50 %	25 %	25 %	0 %	386585233
126	NC_017621	AAAT	2	8	42805	42812	75 %	25 %	0 %	0 %	386585233
127	NC_017621	TTTG	2	8	42930	42937	0 %	75 %	25 %	0 %	386585233
128	NC_017621	AAAG	2	8	43471	43478	75 %	0 %	25 %	0 %	386585234
129	NC_017621	CAAA	2	8	44418	44425	75 %	0 %	0 %	25 %	386585235
130	NC_017621	GACC	2	8	44922	44929	25 %	0 %	25 %	50 %	386585235
131	NC_017621	CTGG	2	8	45060	45067	0 %	25 %	50 %	25 %	386585235
132	NC_017621	GCGG	2	8	45578	45585	0 %	0 %	75 %	25 %	386585236
133	NC_017621	TGCC	2	8	46507	46514	0 %	25 %	25 %	50 %	386585237
134	NC_017621	AAGA	2	8	47120	47127	75 %	0 %	25 %	0 %	386585238
135	NC_017621	AGTT	2	8	47136	47143	25 %	50 %	25 %	0 %	386585238
136	NC_017621	AATT	2	8	47344	47351	50 %	50 %	0 %	0 %	386585238
137	NC_017621	AGCA	2	8	47407	47414	50 %	0 %	25 %	25 %	386585238
138	NC_017621	AAAT	2	8	47571	47578	75 %	25 %	0 %	0 %	386585238
139	NC_017621	AAAC	2	8	48493	48500	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017621	TTGG	2	8	48567	48574	0 %	50 %	50 %	0 %	386585239
141	NC_017621	TCCT	2	8	49139	49146	0 %	50 %	0 %	50 %	386585239
142	NC_017621	TTGA	2	8	49582	49589	25 %	50 %	25 %	0 %	386585239
143	NC_017621	AATA	2	8	49844	49851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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