MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 5373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017621	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386585203
2	NC_017621	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386585203
3	NC_017621	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386585203
4	NC_017621	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386585203
5	NC_017621	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386585204
6	NC_017621	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386585204
7	NC_017621	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386585204
8	NC_017621	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386585204
9	NC_017621	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	386585205
10	NC_017621	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	386585205
11	NC_017621	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	386585205
12	NC_017621	GTAT	2	8	3645	3652	25 %	50 %	25 %	0 %	386585206
13	NC_017621	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	386585207
14	NC_017621	AAAT	2	8	4691	4698	75 %	25 %	0 %	0 %	386585208
15	NC_017621	CTTG	2	8	5279	5286	0 %	50 %	25 %	25 %	386585208
16	NC_017621	ACTT	2	8	5295	5302	25 %	50 %	0 %	25 %	386585208
17	NC_017621	GTGC	2	8	5322	5329	0 %	25 %	50 %	25 %	386585208
18	NC_017621	TCTA	2	8	5876	5883	25 %	50 %	0 %	25 %	386585209
19	NC_017621	ATCA	2	8	6309	6316	50 %	25 %	0 %	25 %	386585210
20	NC_017621	GTTT	2	8	6539	6546	0 %	75 %	25 %	0 %	386585210
21	NC_017621	TCAA	2	8	6566	6573	50 %	25 %	0 %	25 %	386585210
22	NC_017621	CTTA	2	8	7039	7046	25 %	50 %	0 %	25 %	386585210
23	NC_017621	AGTT	2	8	7600	7607	25 %	50 %	25 %	0 %	386585210
24	NC_017621	GATG	2	8	7622	7629	25 %	25 %	50 %	0 %	386585210
25	NC_017621	GCAA	2	8	8254	8261	50 %	0 %	25 %	25 %	386585210
26	NC_017621	TCAG	2	8	9194	9201	25 %	25 %	25 %	25 %	386585210
27	NC_017621	CTTG	2	8	9473	9480	0 %	50 %	25 %	25 %	386585210
28	NC_017621	TGGC	2	8	9571	9578	0 %	25 %	50 %	25 %	386585210
29	NC_017621	AAGG	2	8	9752	9759	50 %	0 %	50 %	0 %	386585210
30	NC_017621	GAAG	2	8	9873	9880	50 %	0 %	50 %	0 %	386585211
31	NC_017621	TCTT	2	8	10203	10210	0 %	75 %	0 %	25 %	386585212
32	NC_017621	TGCC	2	8	10218	10225	0 %	25 %	25 %	50 %	386585212
33	NC_017621	TTTG	2	8	10602	10609	0 %	75 %	25 %	0 %	386585214
34	NC_017621	CTAT	2	8	10682	10689	25 %	50 %	0 %	25 %	386585214
35	NC_017621	AGTG	2	8	11545	11552	25 %	25 %	50 %	0 %	386585214
36	NC_017621	AGAT	2	8	11853	11860	50 %	25 %	25 %	0 %	386585215
37	NC_017621	GAAG	2	8	12168	12175	50 %	0 %	50 %	0 %	386585215
38	NC_017621	GATT	2	8	12236	12243	25 %	50 %	25 %	0 %	386585215
39	NC_017621	AGGC	2	8	12898	12905	25 %	0 %	50 %	25 %	386585215
40	NC_017621	TAAA	2	8	12932	12939	75 %	25 %	0 %	0 %	386585215
41	NC_017621	ATTA	2	8	16425	16432	50 %	50 %	0 %	0 %	386585217
42	NC_017621	TTTG	2	8	23584	23591	0 %	75 %	25 %	0 %	386585218
43	NC_017621	CAAA	2	8	24341	24348	75 %	0 %	0 %	25 %	386585218
44	NC_017621	GGTC	2	8	24439	24446	0 %	25 %	50 %	25 %	386585219
45	NC_017621	AACA	2	8	24848	24855	75 %	0 %	0 %	25 %	386585219
46	NC_017621	TCTA	2	8	24992	24999	25 %	50 %	0 %	25 %	386585220
47	NC_017621	AATC	2	8	25330	25337	50 %	25 %	0 %	25 %	386585220
48	NC_017621	ATTG	2	8	26759	26766	25 %	50 %	25 %	0 %	386585221
49	NC_017621	TTGA	2	8	26970	26977	25 %	50 %	25 %	0 %	386585221
50	NC_017621	TGAT	2	8	26983	26990	25 %	50 %	25 %	0 %	386585221
51	NC_017621	TTTG	2	8	27248	27255	0 %	75 %	25 %	0 %	386585221
52	NC_017621	TGCC	2	8	27720	27727	0 %	25 %	25 %	50 %	386585222
53	NC_017621	GCGG	2	8	28237	28244	0 %	0 %	75 %	25 %	386585222
54	NC_017621	GAAA	2	8	28392	28399	75 %	0 %	25 %	0 %	386585222
55	NC_017621	GTCT	2	8	28720	28727	0 %	50 %	25 %	25 %	386585223
56	NC_017621	CTAC	2	8	28798	28805	25 %	25 %	0 %	50 %	386585223
57	NC_017621	TGGG	2	8	29331	29338	0 %	25 %	75 %	0 %	386585224
58	NC_017621	TCAA	2	8	29370	29377	50 %	25 %	0 %	25 %	386585224
59	NC_017621	AAGA	2	8	29528	29535	75 %	0 %	25 %	0 %	386585224
60	NC_017621	CGTG	2	8	29797	29804	0 %	25 %	50 %	25 %	386585224
61	NC_017621	AACC	2	8	30099	30106	50 %	0 %	0 %	50 %	386585224
62	NC_017621	CTTG	2	8	30157	30164	0 %	50 %	25 %	25 %	386585224
63	NC_017621	AATT	2	8	30340	30347	50 %	50 %	0 %	0 %	386585225
64	NC_017621	AAGA	2	8	30783	30790	75 %	0 %	25 %	0 %	386585226
65	NC_017621	TGAA	2	8	30850	30857	50 %	25 %	25 %	0 %	386585226
66	NC_017621	TGGT	2	8	36014	36021	0 %	50 %	50 %	0 %	386585227
67	NC_017621	ACCT	2	8	36424	36431	25 %	25 %	0 %	50 %	386585227
68	NC_017621	AAGT	2	8	36598	36605	50 %	25 %	25 %	0 %	386585227
69	NC_017621	GGCA	2	8	38128	38135	25 %	0 %	50 %	25 %	386585228
70	NC_017621	ATCA	2	8	38383	38390	50 %	25 %	0 %	25 %	386585229
71	NC_017621	CGAT	2	8	38632	38639	25 %	25 %	25 %	25 %	386585229
72	NC_017621	CGTT	2	8	38930	38937	0 %	50 %	25 %	25 %	386585230
73	NC_017621	TTGA	2	8	39200	39207	25 %	50 %	25 %	0 %	386585230
74	NC_017621	GTCC	2	8	39300	39307	0 %	25 %	25 %	50 %	386585230
75	NC_017621	TTCG	2	8	39312	39319	0 %	50 %	25 %	25 %	386585230
76	NC_017621	CAAG	2	8	39493	39500	50 %	0 %	25 %	25 %	386585230
77	NC_017621	GCTA	2	8	39934	39941	25 %	25 %	25 %	25 %	386585230
78	NC_017621	GCGA	2	8	40001	40008	25 %	0 %	50 %	25 %	386585230
79	NC_017621	AACC	2	8	40228	40235	50 %	0 %	0 %	50 %	386585230
80	NC_017621	TCCG	2	8	40244	40251	0 %	25 %	25 %	50 %	386585230
81	NC_017621	GGCA	2	8	40348	40355	25 %	0 %	50 %	25 %	386585230
82	NC_017621	GTTC	2	8	40807	40814	0 %	50 %	25 %	25 %	386585231
83	NC_017621	CATG	2	8	41028	41035	25 %	25 %	25 %	25 %	386585231
84	NC_017621	CAAA	2	8	41887	41894	75 %	0 %	0 %	25 %	386585232
85	NC_017621	ATGA	2	8	42243	42250	50 %	25 %	25 %	0 %	386585233
86	NC_017621	AAAT	2	8	42805	42812	75 %	25 %	0 %	0 %	386585233
87	NC_017621	TTTG	2	8	42930	42937	0 %	75 %	25 %	0 %	386585233
88	NC_017621	AAAG	2	8	43471	43478	75 %	0 %	25 %	0 %	386585234
89	NC_017621	CAAA	2	8	44418	44425	75 %	0 %	0 %	25 %	386585235
90	NC_017621	GACC	2	8	44922	44929	25 %	0 %	25 %	50 %	386585235
91	NC_017621	CTGG	2	8	45060	45067	0 %	25 %	50 %	25 %	386585235
92	NC_017621	GCGG	2	8	45578	45585	0 %	0 %	75 %	25 %	386585236
93	NC_017621	TGCC	2	8	46507	46514	0 %	25 %	25 %	50 %	386585237
94	NC_017621	AAGA	2	8	47120	47127	75 %	0 %	25 %	0 %	386585238
95	NC_017621	AGTT	2	8	47136	47143	25 %	50 %	25 %	0 %	386585238
96	NC_017621	AATT	2	8	47344	47351	50 %	50 %	0 %	0 %	386585238
97	NC_017621	AGCA	2	8	47407	47414	50 %	0 %	25 %	25 %	386585238
98	NC_017621	AAAT	2	8	47571	47578	75 %	25 %	0 %	0 %	386585238
99	NC_017621	TTGG	2	8	48567	48574	0 %	50 %	50 %	0 %	386585239
100	NC_017621	TCCT	2	8	49139	49146	0 %	50 %	0 %	50 %	386585239
101	NC_017621	TTGA	2	8	49582	49589	25 %	50 %	25 %	0 %	386585239
102	NC_017621	AAAC	2	8	50147	50154	75 %	0 %	0 %	25 %	386585240
103	NC_017621	CTAT	2	8	51020	51027	25 %	50 %	0 %	25 %	386585241
104	NC_017621	GCTT	2	8	51355	51362	0 %	50 %	25 %	25 %	386585242
105	NC_017621	CCTA	2	8	51441	51448	25 %	25 %	0 %	50 %	386585242
106	NC_017621	TCAA	2	8	51624	51631	50 %	25 %	0 %	25 %	386585242
107	NC_017621	GCTA	2	8	51709	51716	25 %	25 %	25 %	25 %	386585242
108	NC_017621	ATCA	2	8	52343	52350	50 %	25 %	0 %	25 %	386585244
109	NC_017621	TGAT	2	8	52572	52579	25 %	50 %	25 %	0 %	386585244
110	NC_017621	ATTG	2	8	52837	52844	25 %	50 %	25 %	0 %	386585244
111	NC_017621	ATTG	2	8	53146	53153	25 %	50 %	25 %	0 %	386585244
112	NC_017621	GAAA	2	8	53182	53189	75 %	0 %	25 %	0 %	386585244
113	NC_017621	TTTA	2	8	53296	53303	25 %	75 %	0 %	0 %	386585245
114	NC_017621	ATTC	2	8	53344	53351	25 %	50 %	0 %	25 %	386585245
115	NC_017621	CAGT	2	8	53631	53638	25 %	25 %	25 %	25 %	386585245
116	NC_017621	AGCG	2	8	53862	53869	25 %	0 %	50 %	25 %	386585245
117	NC_017621	CTTA	2	8	53894	53901	25 %	50 %	0 %	25 %	386585245
118	NC_017621	TTCC	2	8	54084	54091	0 %	50 %	0 %	50 %	386585246
119	NC_017621	GCTG	2	8	54155	54162	0 %	25 %	50 %	25 %	386585246
120	NC_017621	ATTT	2	8	54423	54430	25 %	75 %	0 %	0 %	386585246
121	NC_017621	TGAT	2	8	54835	54842	25 %	50 %	25 %	0 %	386585246
122	NC_017621	GTTG	2	8	54953	54960	0 %	50 %	50 %	0 %	386585246
123	NC_017621	GATT	2	8	55192	55199	25 %	50 %	25 %	0 %	386585246
124	NC_017621	ATTT	2	8	55443	55450	25 %	75 %	0 %	0 %	386585246
125	NC_017621	TGAT	2	8	56930	56937	25 %	50 %	25 %	0 %	386585248
126	NC_017621	ATTT	2	8	57975	57982	25 %	75 %	0 %	0 %	386585249
127	NC_017621	TGGA	2	8	57989	57996	25 %	25 %	50 %	0 %	386585249
128	NC_017621	CCTT	2	8	58059	58066	0 %	50 %	0 %	50 %	386585249
129	NC_017621	GTGC	2	8	58171	58178	0 %	25 %	50 %	25 %	386585249
130	NC_017621	TCCG	2	8	58785	58792	0 %	25 %	25 %	50 %	386585250
131	NC_017621	GATT	2	8	59051	59058	25 %	50 %	25 %	0 %	386585250
132	NC_017621	ATTT	2	8	59296	59303	25 %	75 %	0 %	0 %	386585250
133	NC_017621	CAAT	2	8	59582	59589	50 %	25 %	0 %	25 %	386585250
134	NC_017621	GATT	2	8	60485	60492	25 %	50 %	25 %	0 %	386585251
135	NC_017621	ACTT	2	8	61108	61115	25 %	50 %	0 %	25 %	386585251
136	NC_017621	GTAG	2	8	61612	61619	25 %	25 %	50 %	0 %	386585252
137	NC_017621	ACAA	2	8	62045	62052	75 %	0 %	0 %	25 %	386585252
138	NC_017621	CTGG	2	8	62143	62150	0 %	25 %	50 %	25 %	386585252
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