MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 28653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017621	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585203
2	NC_017621	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585203
3	NC_017621	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585203
4	NC_017621	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585203
5	NC_017621	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585203
6	NC_017621	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585203
7	NC_017621	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585203
8	NC_017621	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585203
9	NC_017621	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585203
10	NC_017621	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585203
11	NC_017621	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585203
12	NC_017621	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585203
13	NC_017621	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585203
14	NC_017621	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585203
15	NC_017621	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585203
16	NC_017621	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017621	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017621	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017621	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585204
20	NC_017621	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585204
21	NC_017621	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585204
22	NC_017621	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585204
23	NC_017621	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585204
24	NC_017621	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585204
25	NC_017621	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585204
26	NC_017621	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585204
27	NC_017621	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585204
28	NC_017621	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585204
29	NC_017621	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585204
30	NC_017621	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585204
31	NC_017621	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585204
32	NC_017621	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585204
33	NC_017621	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585204
34	NC_017621	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585204
35	NC_017621	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017621	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585205
37	NC_017621	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585205
38	NC_017621	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585205
39	NC_017621	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585205
40	NC_017621	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585205
41	NC_017621	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585205
42	NC_017621	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585205
43	NC_017621	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585205
44	NC_017621	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585205
45	NC_017621	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585206
46	NC_017621	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585206
47	NC_017621	TGT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585206
48	NC_017621	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585206
49	NC_017621	CTG	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017621	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017621	CAA	2	6	3969	3974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585207
52	NC_017621	TTG	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585207
53	NC_017621	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585207
54	NC_017621	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585207
55	NC_017621	ATT	2	6	4323	4328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017621	ATT	2	6	4337	4342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017621	CAG	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585208
58	NC_017621	TCG	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585208
59	NC_017621	TGG	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585208
60	NC_017621	TCA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585208
61	NC_017621	TTG	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585208
62	NC_017621	CAA	2	6	4862	4867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585208
63	NC_017621	AGA	2	6	4961	4966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585208
64	NC_017621	GAA	2	6	5001	5006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585208
65	NC_017621	GTG	3	9	5151	5159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585208
66	NC_017621	GAA	3	9	5175	5183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585208
67	NC_017621	CGA	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585208
68	NC_017621	CTC	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585208
69	NC_017621	TAT	2	6	5372	5377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585208
70	NC_017621	ATG	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585208
71	NC_017621	GAA	2	6	5484	5489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585208
72	NC_017621	CAT	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585208
73	NC_017621	TTC	2	6	5564	5569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017621	GTT	2	6	5570	5575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017621	GAT	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017621	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585209
77	NC_017621	TGC	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585209
78	NC_017621	TTA	2	6	5940	5945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585209
79	NC_017621	TAG	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585209
80	NC_017621	GAC	2	6	5980	5985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585209
81	NC_017621	TGG	2	6	6033	6038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585209
82	NC_017621	GAA	2	6	6229	6234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585209
83	NC_017621	GAT	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585209
84	NC_017621	TAT	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585210
85	NC_017621	ATG	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
86	NC_017621	AGC	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585210
87	NC_017621	ATT	2	6	6483	6488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585210
88	NC_017621	GAT	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
89	NC_017621	GTT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585210
90	NC_017621	GCT	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585210
91	NC_017621	AGA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585210
92	NC_017621	TAG	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
93	NC_017621	TTG	2	6	7134	7139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585210
94	NC_017621	GAT	2	6	7173	7178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
95	NC_017621	TTG	2	6	7230	7235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585210
96	NC_017621	GAT	2	6	7239	7244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
97	NC_017621	CTT	2	6	7325	7330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585210
98	NC_017621	CCA	2	6	7412	7417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585210
99	NC_017621	GTT	2	6	7470	7475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585210
100	NC_017621	GCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585210
101	NC_017621	TAG	2	6	7567	7572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
102	NC_017621	TCA	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585210
103	NC_017621	TGT	2	6	7754	7759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585210
104	NC_017621	ATT	2	6	7828	7833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585210
105	NC_017621	TCT	2	6	7889	7894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585210
106	NC_017621	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585210
107	NC_017621	GAT	2	6	8004	8009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
108	NC_017621	TGA	3	9	8063	8071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
109	NC_017621	ACT	2	6	8092	8097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585210
110	NC_017621	CGA	2	6	8114	8119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585210
111	NC_017621	TGA	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
112	NC_017621	TGC	2	6	8228	8233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585210
113	NC_017621	ATG	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
114	NC_017621	TGT	2	6	8459	8464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585210
115	NC_017621	CTA	2	6	8815	8820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585210
116	NC_017621	CAA	2	6	8911	8916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585210
117	NC_017621	GTG	2	6	9166	9171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585210
118	NC_017621	TGC	2	6	9188	9193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585210
119	NC_017621	AGA	2	6	9289	9294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585210
120	NC_017621	AAG	2	6	9424	9429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585210
121	NC_017621	GTA	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
122	NC_017621	GAC	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585210
123	NC_017621	TGT	2	6	9665	9670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585210
124	NC_017621	AAT	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017621	TAA	2	6	9972	9977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585211
126	NC_017621	ACT	2	6	9978	9983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585211
127	NC_017621	GAA	2	6	10078	10083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585211
128	NC_017621	AAT	2	6	10103	10108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585212
129	NC_017621	CAA	2	6	10160	10165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585212
130	NC_017621	TTG	2	6	10233	10238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585212
131	NC_017621	CAG	3	9	10256	10264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585212
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