MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis D9 chromosome

Total Repeats: 668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017620	TA	3	6	2884	2889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017620	TA	3	6	16918	16923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017620	AT	3	6	17894	17899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017620	CT	3	6	17925	17930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017620	AC	3	6	18415	18420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017620	AC	3	6	18584	18589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017620	TG	3	6	18940	18945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017620	AC	3	6	18950	18955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017620	AG	3	6	19511	19516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017620	CT	3	6	19625	19630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017620	TC	3	6	20003	20008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017620	TG	3	6	20394	20399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017620	GA	3	6	20545	20550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017620	GA	3	6	20841	20846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017620	CT	3	6	20957	20962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017620	GA	3	6	21164	21169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017620	GA	3	6	21979	21984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017620	TA	3	6	23284	23289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017620	AT	3	6	23375	23380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017620	GA	3	6	25297	25302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017620	AT	3	6	26676	26681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017620	TG	3	6	31003	31008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017620	AC	3	6	49210	49215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017620	TA	3	6	56865	56870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017620	TC	3	6	59354	59359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017620	AT	3	6	59522	59527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017620	GT	3	6	72798	72803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017620	GA	3	6	82975	82980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017620	CA	3	6	83357	83362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017620	CA	3	6	83439	83444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017620	AG	3	6	88787	88792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017620	TA	3	6	93488	93493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017620	AT	3	6	94464	94469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017620	CT	3	6	94495	94500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017620	AC	3	6	94985	94990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017620	AC	3	6	95154	95159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017620	TG	3	6	95511	95516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017620	AC	3	6	95521	95526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017620	AG	3	6	96082	96087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017620	CT	3	6	96196	96201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017620	TC	3	6	96574	96579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017620	TG	3	6	96965	96970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017620	GA	3	6	97116	97121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017620	GA	3	6	97412	97417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017620	CT	3	6	97528	97533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017620	GA	3	6	97735	97740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017620	GA	3	6	98550	98555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017620	GA	3	6	99566	99571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017620	CT	4	8	99635	99642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017620	TA	3	6	105215	105220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017620	TA	3	6	105983	105988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017620	TA	3	6	112024	112029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017620	GT	3	6	116369	116374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017620	TA	3	6	116546	116551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017620	TG	3	6	116572	116577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017620	CA	3	6	124340	124345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017620	AT	3	6	131842	131847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017620	GT	3	6	131849	131854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017620	AC	3	6	132031	132036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017620	AG	3	6	132664	132669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017620	TC	3	6	141349	141354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017620	AC	3	6	141394	141399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017620	TA	3	6	141443	141448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017620	CA	3	6	144939	144944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017620	TA	3	6	148106	148111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017620	AG	3	6	153752	153757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017620	GT	3	6	156191	156196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017620	GA	3	6	165097	165102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017620	TG	3	6	165313	165318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017620	AG	3	6	174351	174356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017620	TA	3	6	183970	183975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017620	TA	4	8	190486	190493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017620	TA	3	6	192367	192372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017620	AT	4	8	212107	212114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017620	GA	3	6	212147	212152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017620	TC	3	6	212157	212162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017620	TG	3	6	219722	219727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017620	AT	3	6	221230	221235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017620	CT	4	8	222991	222998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017620	AT	3	6	226194	226199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017620	AG	3	6	226217	226222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017620	GA	3	6	226436	226441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017620	GA	3	6	227522	227527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017620	TA	4	8	232855	232862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017620	TA	3	6	234586	234591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017620	GA	3	6	251082	251087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017620	CT	3	6	251746	251751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017620	CT	4	8	252548	252555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017620	AT	3	6	257011	257016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_017620	TA	3	6	259261	259266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017620	TC	3	6	262469	262474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017620	AT	3	6	267265	267270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017620	TA	3	6	267283	267288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017620	TA	3	6	267300	267305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017620	AT	3	6	274310	274315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017620	AG	3	6	274333	274338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017620	GA	3	6	274556	274561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017620	AT	6	12	280227	280238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017620	TA	3	6	285183	285188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017620	TA	3	6	290224	290229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017620	TA	3	6	299259	299264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017620	AG	3	6	299626	299631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017620	GT	3	6	299657	299662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017620	AG	4	8	303859	303866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017620	GA	3	6	307946	307951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017620	TA	3	6	310215	310220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017620	GT	3	6	314237	314242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017620	AC	3	6	314246	314251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017620	AG	3	6	327743	327748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017620	AG	3	6	332462	332467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017620	TA	3	6	346981	346986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017620	TA	3	6	347089	347094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017620	AT	3	6	347361	347366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017620	AT	3	6	348785	348790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017620	TA	3	6	349120	349125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017620	GA	3	6	349251	349256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017620	AT	3	6	350418	350423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017620	CT	3	6	350449	350454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017620	AC	3	6	350939	350944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017620	AC	3	6	351108	351113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017620	TG	3	6	351465	351470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017620	AC	3	6	351475	351480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017620	AG	3	6	352036	352041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017620	CT	3	6	352150	352155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017620	TC	3	6	352528	352533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017620	TG	3	6	352919	352924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017620	GA	3	6	353070	353075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017620	GA	3	6	353366	353371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017620	CT	3	6	353482	353487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017620	GA	3	6	353689	353694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017620	GA	3	6	354504	354509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017620	AC	3	6	357064	357069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017620	AC	3	6	357086	357091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017620	GA	3	6	360072	360077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017620	AT	3	6	364874	364879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017620	AT	3	6	374529	374534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017620	AC	3	6	375138	375143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017620	AT	3	6	377832	377837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017620	AG	3	6	383376	383381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017620	AG	3	6	383671	383676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017620	AG	3	6	383966	383971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017620	TA	3	6	398078	398083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017620	AG	4	8	399073	399080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017620	TA	3	6	403114	403119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017620	TA	3	6	403140	403145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017620	TA	3	6	403147	403152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017620	AT	3	6	405879	405884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017620	GA	3	6	422755	422760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017620	AT	3	6	431963	431968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017620	AG	3	6	431986	431991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017620	GA	3	6	432205	432210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017620	AG	3	6	432515	432520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017620	TA	3	6	437887	437892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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