MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 1350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017619	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386581048
2	NC_017619	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386581048
3	NC_017619	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	386581050
4	NC_017619	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	386581054
5	NC_017619	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	386581054
6	NC_017619	GAGAT	2	10	6830	6839	40 %	20 %	40 %	0 %	386581055
7	NC_017619	TGAAA	2	10	9967	9976	60 %	20 %	20 %	0 %	386581056
8	NC_017619	CTATT	2	10	11204	11213	20 %	60 %	0 %	20 %	386581059
9	NC_017619	CTTTG	2	10	13433	13442	0 %	60 %	20 %	20 %	386581061
10	NC_017619	AACAG	2	10	13877	13886	60 %	0 %	20 %	20 %	386581062
11	NC_017619	CTTGT	2	10	15033	15042	0 %	60 %	20 %	20 %	386581062
12	NC_017619	TTTAT	2	10	24440	24449	20 %	80 %	0 %	0 %	386581065
13	NC_017619	AATGC	2	10	25406	25415	40 %	20 %	20 %	20 %	386581066
14	NC_017619	CTACG	2	10	30760	30769	20 %	20 %	20 %	40 %	386581072
15	NC_017619	GAACG	2	10	33046	33055	40 %	0 %	40 %	20 %	386581073
16	NC_017619	AAACC	2	10	33182	33191	60 %	0 %	0 %	40 %	386581073
17	NC_017619	ATTCT	2	10	34529	34538	20 %	60 %	0 %	20 %	386581073
18	NC_017619	GCCAT	2	10	35004	35013	20 %	20 %	20 %	40 %	386581073
19	NC_017619	AAATG	2	10	36090	36099	60 %	20 %	20 %	0 %	386581074
20	NC_017619	AGCAG	2	10	38721	38730	40 %	0 %	40 %	20 %	386581077
21	NC_017619	CTATT	2	10	38946	38955	20 %	60 %	0 %	20 %	386581077
22	NC_017619	CTATT	2	10	41508	41517	20 %	60 %	0 %	20 %	386581079
23	NC_017619	GAAGC	2	10	42686	42695	40 %	0 %	40 %	20 %	386581080
24	NC_017619	AGCGG	2	10	45792	45801	20 %	0 %	60 %	20 %	386581083
25	NC_017619	TTAGT	2	10	47496	47505	20 %	60 %	20 %	0 %	386581085
26	NC_017619	GAAGT	2	10	48143	48152	40 %	20 %	40 %	0 %	386581086
27	NC_017619	TTATC	2	10	48274	48283	20 %	60 %	0 %	20 %	386581086
28	NC_017619	TAATC	2	10	48382	48391	40 %	40 %	0 %	20 %	386581086
29	NC_017619	TCAAT	2	10	48641	48650	40 %	40 %	0 %	20 %	386581087
30	NC_017619	TTATT	2	10	48894	48903	20 %	80 %	0 %	0 %	386581087
31	NC_017619	GAGAA	2	10	52400	52409	60 %	0 %	40 %	0 %	386581091
32	NC_017619	GCAGA	2	10	53881	53890	40 %	0 %	40 %	20 %	386581093
33	NC_017619	GGGCT	2	10	54352	54361	0 %	20 %	60 %	20 %	386581093
34	NC_017619	TGAAT	2	10	55975	55984	40 %	40 %	20 %	0 %	386581095
35	NC_017619	AGCAG	2	10	60118	60127	40 %	0 %	40 %	20 %	386581098
36	NC_017619	GCCCT	2	10	62940	62949	0 %	20 %	20 %	60 %	386581102
37	NC_017619	GTTTT	2	10	65443	65452	0 %	80 %	20 %	0 %	386581104
38	NC_017619	TTGCT	2	10	66039	66048	0 %	60 %	20 %	20 %	386581105
39	NC_017619	GTATC	2	10	69326	69335	20 %	40 %	20 %	20 %	386581108
40	NC_017619	TGGAT	2	10	71320	71329	20 %	40 %	40 %	0 %	386581112
41	NC_017619	TTATG	2	10	71530	71539	20 %	60 %	20 %	0 %	386581113
42	NC_017619	AAATT	2	10	72422	72431	60 %	40 %	0 %	0 %	386581115
43	NC_017619	TGGCG	2	10	73429	73438	0 %	20 %	60 %	20 %	386581117
44	NC_017619	AAAAC	2	10	73989	73998	80 %	0 %	0 %	20 %	386581118
45	NC_017619	TACAC	2	10	74403	74412	40 %	20 %	0 %	40 %	386581119
46	NC_017619	GAAAA	2	10	75282	75291	80 %	0 %	20 %	0 %	386581120
47	NC_017619	GTCTT	2	10	75570	75579	0 %	60 %	20 %	20 %	386581121
48	NC_017619	TTTGG	2	10	75701	75710	0 %	60 %	40 %	0 %	386581121
49	NC_017619	TAAGA	2	10	79034	79043	60 %	20 %	20 %	0 %	386581129
50	NC_017619	AGAAT	2	10	83822	83831	60 %	20 %	20 %	0 %	386581137
51	NC_017619	GAAAA	2	10	86148	86157	80 %	0 %	20 %	0 %	386581142
52	NC_017619	TGACT	2	10	86543	86552	20 %	40 %	20 %	20 %	386581142
53	NC_017619	TGTGA	2	10	94484	94493	20 %	40 %	40 %	0 %	386581144
54	NC_017619	TGCTT	2	10	96046	96055	0 %	60 %	20 %	20 %	386581146
55	NC_017619	TTGTT	2	10	97217	97226	0 %	80 %	20 %	0 %	386581148
56	NC_017619	AATAT	2	10	98659	98668	60 %	40 %	0 %	0 %	386581149
57	NC_017619	TTTCA	2	10	99475	99484	20 %	60 %	0 %	20 %	386581151
58	NC_017619	CTTCG	2	10	99718	99727	0 %	40 %	20 %	40 %	386581151
59	NC_017619	TTTTC	2	10	100639	100648	0 %	80 %	0 %	20 %	386581152
60	NC_017619	TTTGG	2	10	102935	102944	0 %	60 %	40 %	0 %	386581156
61	NC_017619	ATTGC	2	10	103400	103409	20 %	40 %	20 %	20 %	386581156
62	NC_017619	GCTTT	2	10	103631	103640	0 %	60 %	20 %	20 %	386581157
63	NC_017619	AGAAA	2	10	104089	104098	80 %	0 %	20 %	0 %	386581157
64	NC_017619	GACTT	2	10	105668	105677	20 %	40 %	20 %	20 %	386581158
65	NC_017619	CTGGG	2	10	109888	109897	0 %	20 %	60 %	20 %	386581163
66	NC_017619	CCGTT	2	10	115772	115781	0 %	40 %	20 %	40 %	386581165
67	NC_017619	GCTTG	2	10	121260	121269	0 %	40 %	40 %	20 %	386581168
68	NC_017619	TGGTT	2	10	121388	121397	0 %	60 %	40 %	0 %	386581168
69	NC_017619	GGTCA	2	10	121687	121696	20 %	20 %	40 %	20 %	386581168
70	NC_017619	AAGGA	2	10	122777	122786	60 %	0 %	40 %	0 %	386581171
71	NC_017619	GGCAA	2	10	123335	123344	40 %	0 %	40 %	20 %	386581173
72	NC_017619	TTGGT	2	10	125723	125732	0 %	60 %	40 %	0 %	386581175
73	NC_017619	GGATG	2	10	126025	126034	20 %	20 %	60 %	0 %	386581176
74	NC_017619	GAAAA	2	10	126185	126194	80 %	0 %	20 %	0 %	386581177
75	NC_017619	CCTTG	2	10	126238	126247	0 %	40 %	20 %	40 %	386581177
76	NC_017619	CTGGA	2	10	127126	127135	20 %	20 %	40 %	20 %	386581178
77	NC_017619	AGCAG	2	10	127482	127491	40 %	0 %	40 %	20 %	386581178
78	NC_017619	GCTCA	2	10	127590	127599	20 %	20 %	20 %	40 %	386581178
79	NC_017619	AATCA	2	10	128104	128113	60 %	20 %	0 %	20 %	386581179
80	NC_017619	AGGTG	2	10	128792	128801	20 %	20 %	60 %	0 %	386581179
81	NC_017619	ACTTT	2	10	132498	132507	20 %	60 %	0 %	20 %	386581184
82	NC_017619	TAGCG	2	10	135596	135605	20 %	20 %	40 %	20 %	386581188
83	NC_017619	ATCAA	2	10	136757	136766	60 %	20 %	0 %	20 %	386581190
84	NC_017619	CGTAT	2	10	138029	138038	20 %	40 %	20 %	20 %	386581191
85	NC_017619	ATCCA	2	10	138120	138129	40 %	20 %	0 %	40 %	386581191
86	NC_017619	CAAGA	2	10	138896	138905	60 %	0 %	20 %	20 %	386581191
87	NC_017619	AAGCT	2	10	139326	139335	40 %	20 %	20 %	20 %	386581191
88	NC_017619	AAGAA	2	10	141586	141595	80 %	0 %	20 %	0 %	386581193
89	NC_017619	GCAGT	2	10	141876	141885	20 %	20 %	40 %	20 %	386581193
90	NC_017619	ATCCA	2	10	141987	141996	40 %	20 %	0 %	40 %	386581193
91	NC_017619	TACGA	2	10	142488	142497	40 %	20 %	20 %	20 %	386581193
92	NC_017619	GTTTA	2	10	146485	146494	20 %	60 %	20 %	0 %	386581196
93	NC_017619	GCATG	2	10	148007	148016	20 %	20 %	40 %	20 %	386581198
94	NC_017619	AAAAT	2	10	148420	148429	80 %	20 %	0 %	0 %	386581198
95	NC_017619	GGGTC	2	10	153044	153053	0 %	20 %	60 %	20 %	386581204
96	NC_017619	TTTCA	2	10	154014	154023	20 %	60 %	0 %	20 %	386581205
97	NC_017619	TGGTC	2	10	157200	157209	0 %	40 %	40 %	20 %	386581208
98	NC_017619	GTCTT	2	10	158155	158164	0 %	60 %	20 %	20 %	386581209
99	NC_017619	TTGGA	2	10	160671	160680	20 %	40 %	40 %	0 %	386581211
100	NC_017619	TCATC	2	10	161544	161553	20 %	40 %	0 %	40 %	386581213
101	NC_017619	CTTGG	2	10	161713	161722	0 %	40 %	40 %	20 %	386581213
102	NC_017619	AATTG	2	10	162373	162382	40 %	40 %	20 %	0 %	386581214
103	NC_017619	TTTTC	2	10	162732	162741	0 %	80 %	0 %	20 %	386581215
104	NC_017619	CACCT	2	10	163295	163304	20 %	20 %	0 %	60 %	386581215
105	NC_017619	AGACT	2	10	168081	168090	40 %	20 %	20 %	20 %	386581218
106	NC_017619	ATACA	2	10	173809	173818	60 %	20 %	0 %	20 %	386581223
107	NC_017619	GGTTT	2	10	175967	175976	0 %	60 %	40 %	0 %	386581224
108	NC_017619	TTATC	2	10	176843	176852	20 %	60 %	0 %	20 %	386581225
109	NC_017619	TCTGG	2	10	180278	180287	0 %	40 %	40 %	20 %	386581228
110	NC_017619	TTCAA	2	10	180818	180827	40 %	40 %	0 %	20 %	386581228
111	NC_017619	TGATT	2	10	185308	185317	20 %	60 %	20 %	0 %	386581232
112	NC_017619	GAAGC	2	10	187425	187434	40 %	0 %	40 %	20 %	386581233
113	NC_017619	GGAAA	2	10	192794	192803	60 %	0 %	40 %	0 %	386581236
114	NC_017619	CTGGT	2	10	193290	193299	0 %	40 %	40 %	20 %	386581237
115	NC_017619	CCAGA	2	10	193343	193352	40 %	0 %	20 %	40 %	386581237
116	NC_017619	AGCAG	2	10	195391	195400	40 %	0 %	40 %	20 %	386581239
117	NC_017619	TTTTG	2	10	196923	196932	0 %	80 %	20 %	0 %	386581242
118	NC_017619	GAACA	2	10	196958	196967	60 %	0 %	20 %	20 %	386581242
119	NC_017619	TTTTA	2	10	198147	198156	20 %	80 %	0 %	0 %	386581243
120	NC_017619	TGAAA	2	10	199312	199321	60 %	20 %	20 %	0 %	386581244
121	NC_017619	AAGGA	2	10	199964	199973	60 %	0 %	40 %	0 %	386581244
122	NC_017619	AGTAA	2	10	200435	200444	60 %	20 %	20 %	0 %	386581244
123	NC_017619	CAAGT	2	10	202193	202202	40 %	20 %	20 %	20 %	386581245
124	NC_017619	ATGGA	2	10	202863	202872	40 %	20 %	40 %	0 %	386581245
125	NC_017619	TTTGG	2	10	205980	205989	0 %	60 %	40 %	0 %	386581247
126	NC_017619	TCTAC	2	10	206760	206769	20 %	40 %	0 %	40 %	386581248
127	NC_017619	AATGT	2	10	206907	206916	40 %	40 %	20 %	0 %	386581248
128	NC_017619	AGCAG	2	10	211047	211056	40 %	0 %	40 %	20 %	386581253
129	NC_017619	GACCA	2	10	213876	213885	40 %	0 %	20 %	40 %	386581254
130	NC_017619	GTTTT	2	10	214985	214994	0 %	80 %	20 %	0 %	386581255
131	NC_017619	CCATA	2	10	215087	215096	40 %	20 %	0 %	40 %	386581256
132	NC_017619	ATGAC	2	10	216475	216484	40 %	20 %	20 %	20 %	386581257
133	NC_017619	AGCTC	2	10	218211	218220	20 %	20 %	20 %	40 %	386581258
134	NC_017619	TCCAA	2	10	220748	220757	40 %	20 %	0 %	40 %	386581260
135	NC_017619	AAAGA	2	10	223653	223662	80 %	0 %	20 %	0 %	386581262
136	NC_017619	AGGGC	2	10	227178	227187	20 %	0 %	60 %	20 %	386581265
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262	NC_017619	TCCTG	2	10	417938	417947	0 %	40 %	20 %	40 %	386581435
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