MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 6132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017619	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386581048
2	NC_017619	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386581048
3	NC_017619	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	386581048
4	NC_017619	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386581048
5	NC_017619	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386581048
6	NC_017619	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386581049
7	NC_017619	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386581049
8	NC_017619	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	386581049
9	NC_017619	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386581049
10	NC_017619	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386581049
11	NC_017619	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	386581050
12	NC_017619	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	386581050
13	NC_017619	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	386581050
14	NC_017619	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	386581052
15	NC_017619	AAAT	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	386581053
16	NC_017619	CTTG	2	8	5247	5254	0 %	50 %	25 %	25 %	386581053
17	NC_017619	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017619	GATT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	386581054
19	NC_017619	ATGA	2	8	5870	5877	50 %	25 %	25 %	0 %	386581054
20	NC_017619	ATCA	2	8	6277	6284	50 %	25 %	0 %	25 %	386581055
21	NC_017619	AATC	2	8	6301	6308	50 %	25 %	0 %	25 %	386581055
22	NC_017619	GTTT	2	8	6507	6514	0 %	75 %	25 %	0 %	386581055
23	NC_017619	TCAA	2	8	6534	6541	50 %	25 %	0 %	25 %	386581055
24	NC_017619	CTTA	2	8	7007	7014	25 %	50 %	0 %	25 %	386581055
25	NC_017619	GATG	2	8	7590	7597	25 %	25 %	50 %	0 %	386581055
26	NC_017619	GCAA	2	8	8222	8229	50 %	0 %	25 %	25 %	386581055
27	NC_017619	TCAG	2	8	9162	9169	25 %	25 %	25 %	25 %	386581055
28	NC_017619	ATTG	2	8	9399	9406	25 %	50 %	25 %	0 %	386581055
29	NC_017619	CTTG	2	8	9441	9448	0 %	50 %	25 %	25 %	386581055
30	NC_017619	AAGG	2	8	9720	9727	50 %	0 %	50 %	0 %	386581055
31	NC_017619	GAAG	2	8	9841	9848	50 %	0 %	50 %	0 %	386581056
32	NC_017619	TCTT	2	8	10171	10178	0 %	75 %	0 %	25 %	386581057
33	NC_017619	TGCC	2	8	10186	10193	0 %	25 %	25 %	50 %	386581057
34	NC_017619	CTAT	2	8	10650	10657	25 %	50 %	0 %	25 %	386581059
35	NC_017619	AGTG	2	8	11513	11520	25 %	25 %	50 %	0 %	386581059
36	NC_017619	AGAT	2	8	11821	11828	50 %	25 %	25 %	0 %	386581060
37	NC_017619	GAAG	2	8	12136	12143	50 %	0 %	50 %	0 %	386581060
38	NC_017619	GATT	2	8	12204	12211	25 %	50 %	25 %	0 %	386581060
39	NC_017619	GGCG	2	8	12215	12222	0 %	0 %	75 %	25 %	386581060
40	NC_017619	AGGC	2	8	12866	12873	25 %	0 %	50 %	25 %	386581060
41	NC_017619	TAAA	2	8	12900	12907	75 %	25 %	0 %	0 %	386581060
42	NC_017619	CTTG	2	8	14363	14370	0 %	50 %	25 %	25 %	386581062
43	NC_017619	TGTT	2	8	14437	14444	0 %	75 %	25 %	0 %	386581062
44	NC_017619	GTTC	2	8	14463	14470	0 %	50 %	25 %	25 %	386581062
45	NC_017619	GTCG	2	8	14532	14539	0 %	25 %	50 %	25 %	386581062
46	NC_017619	CAAC	2	8	14591	14598	50 %	0 %	0 %	50 %	386581062
47	NC_017619	ATGG	2	8	14610	14617	25 %	25 %	50 %	0 %	386581062
48	NC_017619	CAAC	2	8	14653	14660	50 %	0 %	0 %	50 %	386581062
49	NC_017619	TTGG	2	8	14718	14725	0 %	50 %	50 %	0 %	386581062
50	NC_017619	AAGA	2	8	14958	14965	75 %	0 %	25 %	0 %	386581062
51	NC_017619	ACAA	2	8	15341	15348	75 %	0 %	0 %	25 %	386581062
52	NC_017619	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017619	ATTA	2	8	16359	16366	50 %	50 %	0 %	0 %	386581063
54	NC_017619	GTGA	2	8	17379	17386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017619	AGCG	2	8	17550	17557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017619	AGCC	2	8	18432	18439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017619	GTAA	2	8	19011	19018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017619	TCAC	2	8	19068	19075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017619	GCGA	2	8	19167	19174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017619	ATTC	2	8	20033	20040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017619	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017619	TAGG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017619	AATC	2	8	22191	22198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017619	GCGT	2	8	23102	23109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017619	TTTG	2	8	23631	23638	0 %	75 %	25 %	0 %	386581064
66	NC_017619	CAAA	2	8	24388	24395	75 %	0 %	0 %	25 %	386581064
67	NC_017619	GGTC	2	8	24486	24493	0 %	25 %	50 %	25 %	386581065
68	NC_017619	AACA	2	8	24895	24902	75 %	0 %	0 %	25 %	386581065
69	NC_017619	TCTA	2	8	25039	25046	25 %	50 %	0 %	25 %	386581066
70	NC_017619	ATCA	2	8	25378	25385	50 %	25 %	0 %	25 %	386581066
71	NC_017619	TTTG	2	8	26290	26297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017619	ATTG	2	8	26806	26813	25 %	50 %	25 %	0 %	386581067
73	NC_017619	TTGA	2	8	27017	27024	25 %	50 %	25 %	0 %	386581067
74	NC_017619	TGAT	2	8	27030	27037	25 %	50 %	25 %	0 %	386581067
75	NC_017619	TTTG	2	8	27295	27302	0 %	75 %	25 %	0 %	386581067
76	NC_017619	ATTT	2	8	27357	27364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017619	TGCC	2	8	27767	27774	0 %	25 %	25 %	50 %	386581068
78	NC_017619	GCGG	2	8	28284	28291	0 %	0 %	75 %	25 %	386581068
79	NC_017619	GAAA	2	8	28439	28446	75 %	0 %	25 %	0 %	386581068
80	NC_017619	TGGG	2	8	29378	29385	0 %	25 %	75 %	0 %	386581070
81	NC_017619	TCAA	2	8	29417	29424	50 %	25 %	0 %	25 %	386581070
82	NC_017619	CGTG	2	8	29844	29851	0 %	25 %	50 %	25 %	386581070
83	NC_017619	TCAA	2	8	30097	30104	50 %	25 %	0 %	25 %	386581070
84	NC_017619	AACC	2	8	30146	30153	50 %	0 %	0 %	50 %	386581070
85	NC_017619	CTTG	2	8	30204	30211	0 %	50 %	25 %	25 %	386581070
86	NC_017619	AATT	2	8	30387	30394	50 %	50 %	0 %	0 %	386581071
87	NC_017619	TTTA	2	8	30569	30576	25 %	75 %	0 %	0 %	386581071
88	NC_017619	AAGA	2	8	30830	30837	75 %	0 %	25 %	0 %	386581072
89	NC_017619	TGAA	2	8	30897	30904	50 %	25 %	25 %	0 %	386581072
90	NC_017619	TTCA	2	8	32024	32031	25 %	50 %	0 %	25 %	386581073
91	NC_017619	TACT	2	8	32089	32096	25 %	50 %	0 %	25 %	386581073
92	NC_017619	GTCC	2	8	33098	33105	0 %	25 %	25 %	50 %	386581073
93	NC_017619	TTCC	2	8	33235	33242	0 %	50 %	0 %	50 %	386581073
94	NC_017619	GCAG	2	8	33685	33692	25 %	0 %	50 %	25 %	386581073
95	NC_017619	TACC	2	8	33902	33909	25 %	25 %	0 %	50 %	386581073
96	NC_017619	CCAA	2	8	34767	34774	50 %	0 %	0 %	50 %	386581073
97	NC_017619	AAGA	2	8	35105	35112	75 %	0 %	25 %	0 %	386581073
98	NC_017619	AAAT	2	8	35153	35160	75 %	25 %	0 %	0 %	386581073
99	NC_017619	TGGT	2	8	36026	36033	0 %	50 %	50 %	0 %	386581074
100	NC_017619	CAAC	2	8	36139	36146	50 %	0 %	0 %	50 %	386581074
101	NC_017619	ACCT	2	8	36436	36443	25 %	25 %	0 %	50 %	386581074
102	NC_017619	AGCC	2	8	37011	37018	25 %	0 %	25 %	50 %	386581075
103	NC_017619	GATT	2	8	37074	37081	25 %	50 %	25 %	0 %	386581075
104	NC_017619	CTGG	2	8	37133	37140	0 %	25 %	50 %	25 %	386581075
105	NC_017619	GGCT	2	8	38138	38145	0 %	25 %	50 %	25 %	386581076
106	NC_017619	GTCC	2	8	38630	38637	0 %	25 %	25 %	50 %	386581077
107	NC_017619	CAAG	2	8	38823	38830	50 %	0 %	25 %	25 %	386581077
108	NC_017619	GCAG	2	8	39096	39103	25 %	0 %	50 %	25 %	386581077
109	NC_017619	AACC	2	8	39558	39565	50 %	0 %	0 %	50 %	386581077
110	NC_017619	CGTC	2	8	39572	39579	0 %	25 %	25 %	50 %	386581077
111	NC_017619	CAAA	2	8	40244	40251	75 %	0 %	0 %	25 %	386581078
112	NC_017619	GACC	2	8	40748	40755	25 %	0 %	25 %	50 %	386581078
113	NC_017619	AAAG	2	8	41310	41317	75 %	0 %	25 %	0 %	386581079
114	NC_017619	GCGG	2	8	41404	41411	0 %	0 %	75 %	25 %	386581079
115	NC_017619	TGCC	2	8	42333	42340	0 %	25 %	25 %	50 %	386581080
116	NC_017619	TGAA	2	8	42459	42466	50 %	25 %	25 %	0 %	386581080
117	NC_017619	ATAC	2	8	43221	43228	50 %	25 %	0 %	25 %	386581081
118	NC_017619	AAAG	2	8	43240	43247	75 %	0 %	25 %	0 %	386581081
119	NC_017619	TGAC	2	8	43546	43553	25 %	25 %	25 %	25 %	386581081
120	NC_017619	AATA	2	8	43615	43622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017619	TAAA	2	8	43648	43655	75 %	25 %	0 %	0 %	386581082
122	NC_017619	TTAT	2	8	44338	44345	25 %	75 %	0 %	0 %	386581082
123	NC_017619	GAAG	2	8	44594	44601	50 %	0 %	50 %	0 %	386581082
124	NC_017619	GAAG	2	8	44762	44769	50 %	0 %	50 %	0 %	386581082
125	NC_017619	TTGG	2	8	44937	44944	0 %	50 %	50 %	0 %	386581083
126	NC_017619	CGAC	2	8	45152	45159	25 %	0 %	25 %	50 %	386581083
127	NC_017619	TTGA	2	8	45952	45959	25 %	50 %	25 %	0 %	386581083
128	NC_017619	TCAG	2	8	46079	46086	25 %	25 %	25 %	25 %	386581083
129	NC_017619	AATA	2	8	46215	46222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017619	CTCC	2	8	46241	46248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_017619	TTCG	2	8	46342	46349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017619	AAGC	2	8	46552	46559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017619	AAAC	2	8	46754	46761	75 %	0 %	0 %	25 %	386581084
134	NC_017619	ATCA	2	8	46824	46831	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017619	CTAT	2	8	47627	47634	25 %	50 %	0 %	25 %	386581085
136	NC_017619	TCAA	2	8	47648	47655	50 %	25 %	0 %	25 %	386581085
137	NC_017619	GCTT	2	8	47962	47969	0 %	50 %	25 %	25 %	386581086
138	NC_017619	CCTA	2	8	48048	48055	25 %	25 %	0 %	50 %	386581086
139	NC_017619	GCTA	2	8	48316	48323	25 %	25 %	25 %	25 %	386581086
140	NC_017619	AAGA	2	8	48919	48926	75 %	0 %	25 %	0 %	386581087
141	NC_017619	ATCA	2	8	48950	48957	50 %	25 %	0 %	25 %	386581088
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143	NC_017619	ATTG	2	8	49444	49451	25 %	50 %	25 %	0 %	386581088
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