MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 27423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017619	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581048
2	NC_017619	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581048
3	NC_017619	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581048
4	NC_017619	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386581048
5	NC_017619	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581048
6	NC_017619	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581048
7	NC_017619	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581048
8	NC_017619	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581048
9	NC_017619	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581048
10	NC_017619	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581048
11	NC_017619	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581048
12	NC_017619	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581048
13	NC_017619	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581048
14	NC_017619	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581048
15	NC_017619	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386581048
16	NC_017619	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581048
17	NC_017619	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017619	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017619	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017619	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581049
21	NC_017619	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581049
22	NC_017619	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581049
23	NC_017619	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581049
24	NC_017619	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581049
25	NC_017619	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581049
26	NC_017619	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581049
27	NC_017619	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581049
28	NC_017619	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581049
29	NC_017619	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581049
30	NC_017619	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581049
31	NC_017619	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581049
32	NC_017619	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581049
33	NC_017619	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581049
34	NC_017619	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581049
35	NC_017619	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581049
36	NC_017619	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017619	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581050
38	NC_017619	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581050
39	NC_017619	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581050
40	NC_017619	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581050
41	NC_017619	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581050
42	NC_017619	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581050
43	NC_017619	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581050
44	NC_017619	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581050
45	NC_017619	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581050
46	NC_017619	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581050
47	NC_017619	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581051
48	NC_017619	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581051
49	NC_017619	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581051
50	NC_017619	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017619	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017619	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581052
53	NC_017619	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581052
54	NC_017619	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581052
55	NC_017619	TGT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581052
56	NC_017619	ATT	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581052
57	NC_017619	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581052
58	NC_017619	CAG	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581053
59	NC_017619	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581053
60	NC_017619	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581053
61	NC_017619	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581053
62	NC_017619	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581053
63	NC_017619	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581053
64	NC_017619	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581053
65	NC_017619	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581053
66	NC_017619	GTG	3	9	5119	5127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581053
67	NC_017619	GAA	3	9	5143	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581053
68	NC_017619	CGA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581053
69	NC_017619	CAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581053
70	NC_017619	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581053
71	NC_017619	CTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386581053
72	NC_017619	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581053
73	NC_017619	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581053
74	NC_017619	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581053
75	NC_017619	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581053
76	NC_017619	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017619	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017619	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017619	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581054
80	NC_017619	TTA	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581054
81	NC_017619	TAG	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581054
82	NC_017619	GAC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581054
83	NC_017619	TGG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581054
84	NC_017619	GAA	2	6	6197	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581054
85	NC_017619	GAT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581054
86	NC_017619	TTA	3	9	6319	6327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581055
87	NC_017619	ATG	2	6	6416	6421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
88	NC_017619	ATT	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581055
89	NC_017619	GAT	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
90	NC_017619	AGA	2	6	6936	6941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581055
91	NC_017619	TAG	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
92	NC_017619	TTG	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581055
93	NC_017619	GAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
94	NC_017619	TTG	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581055
95	NC_017619	GAT	2	6	7207	7212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
96	NC_017619	CTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581055
97	NC_017619	CCA	2	6	7380	7385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386581055
98	NC_017619	GTT	2	6	7438	7443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581055
99	NC_017619	GCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581055
100	NC_017619	TAG	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
101	NC_017619	TCA	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581055
102	NC_017619	TGT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581055
103	NC_017619	ATT	2	6	7796	7801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581055
104	NC_017619	TCT	2	6	7857	7862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581055
105	NC_017619	TAA	2	6	7902	7907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581055
106	NC_017619	GGA	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581055
107	NC_017619	GAT	2	6	7972	7977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
108	NC_017619	TGA	3	9	8031	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
109	NC_017619	ACT	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581055
110	NC_017619	TGA	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
111	NC_017619	TAG	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
112	NC_017619	ATG	2	6	8216	8221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
113	NC_017619	TGT	2	6	8427	8432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581055
114	NC_017619	CTA	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581055
115	NC_017619	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581055
116	NC_017619	GTG	2	6	9134	9139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581055
117	NC_017619	TGC	2	6	9156	9161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581055
118	NC_017619	AGA	2	6	9257	9262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581055
119	NC_017619	AAG	2	6	9392	9397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581055
120	NC_017619	GTA	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581055
121	NC_017619	GAC	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581055
122	NC_017619	TGT	2	6	9633	9638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581055
123	NC_017619	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017619	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581056
125	NC_017619	ACT	2	6	9946	9951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581056
126	NC_017619	GAA	2	6	10046	10051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581056
127	NC_017619	AAT	2	6	10071	10076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581057
128	NC_017619	CAA	2	6	10128	10133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581057
129	NC_017619	TTG	2	6	10201	10206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581057
130	NC_017619	CAG	3	9	10224	10232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581057
131	NC_017619	GAA	2	6	10266	10271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581057
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