MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 1627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017618	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386578981
2	NC_017618	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386578981
3	NC_017618	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	386578983
4	NC_017618	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	386578987
5	NC_017618	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	386578987
6	NC_017618	GAGAT	2	10	6830	6839	40 %	20 %	40 %	0 %	386578988
7	NC_017618	TGAAA	2	10	9967	9976	60 %	20 %	20 %	0 %	386578989
8	NC_017618	CTATT	2	10	11204	11213	20 %	60 %	0 %	20 %	386578992
9	NC_017618	CTTTG	2	10	13433	13442	0 %	60 %	20 %	20 %	386578994
10	NC_017618	AACAG	2	10	13877	13886	60 %	0 %	20 %	20 %	386578995
11	NC_017618	CTTGT	2	10	15033	15042	0 %	60 %	20 %	20 %	386578995
12	NC_017618	TCGTG	2	10	18044	18053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017618	GTTAA	2	10	18923	18932	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017618	ATTAT	2	10	22860	22869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017618	ATATT	2	10	23408	23417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017618	TTTAT	2	10	24439	24448	20 %	80 %	0 %	0 %	386578998
17	NC_017618	AATGC	2	10	25405	25414	40 %	20 %	20 %	20 %	386578999
18	NC_017618	CTACG	2	10	30759	30768	20 %	20 %	20 %	40 %	386579005
19	NC_017618	GAACG	2	10	33045	33054	40 %	0 %	40 %	20 %	386579006
20	NC_017618	AAACC	2	10	33181	33190	60 %	0 %	0 %	40 %	386579006
21	NC_017618	ATTCT	2	10	34528	34537	20 %	60 %	0 %	20 %	386579006
22	NC_017618	GCCAT	2	10	35003	35012	20 %	20 %	20 %	40 %	386579006
23	NC_017618	AAATG	2	10	36089	36098	60 %	20 %	20 %	0 %	386579007
24	NC_017618	AGCAG	2	10	38720	38729	40 %	0 %	40 %	20 %	386579010
25	NC_017618	CTATT	2	10	38945	38954	20 %	60 %	0 %	20 %	386579010
26	NC_017618	CTATT	2	10	41507	41516	20 %	60 %	0 %	20 %	386579012
27	NC_017618	GAAGC	2	10	42685	42694	40 %	0 %	40 %	20 %	386579013
28	NC_017618	AGCGG	2	10	45791	45800	20 %	0 %	60 %	20 %	386579016
29	NC_017618	TTAGT	2	10	47407	47416	20 %	60 %	20 %	0 %	386579018
30	NC_017618	GAAGT	2	10	48054	48063	40 %	20 %	40 %	0 %	386579019
31	NC_017618	TTATC	2	10	48185	48194	20 %	60 %	0 %	20 %	386579019
32	NC_017618	TAATC	2	10	48293	48302	40 %	40 %	0 %	20 %	386579019
33	NC_017618	TCAAT	2	10	48552	48561	40 %	40 %	0 %	20 %	386579020
34	NC_017618	TTATT	2	10	48805	48814	20 %	80 %	0 %	0 %	386579020
35	NC_017618	GAGAA	2	10	52311	52320	60 %	0 %	40 %	0 %	386579024
36	NC_017618	GCAGA	2	10	53792	53801	40 %	0 %	40 %	20 %	386579026
37	NC_017618	GGGCT	2	10	54263	54272	0 %	20 %	60 %	20 %	386579026
38	NC_017618	TTTTG	2	10	55292	55301	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017618	TGAAT	2	10	55886	55895	40 %	40 %	20 %	0 %	386579028
40	NC_017618	TTAAG	2	10	58301	58310	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017618	AGCAG	2	10	60026	60035	40 %	0 %	40 %	20 %	386579031
42	NC_017618	GCCCT	2	10	62848	62857	0 %	20 %	20 %	60 %	386579035
43	NC_017618	GTTTT	2	10	65351	65360	0 %	80 %	20 %	0 %	386579037
44	NC_017618	TTGCT	2	10	65947	65956	0 %	60 %	20 %	20 %	386579038
45	NC_017618	GTATC	2	10	69234	69243	20 %	40 %	20 %	20 %	386579041
46	NC_017618	TGGAT	2	10	71228	71237	20 %	40 %	40 %	0 %	386579045
47	NC_017618	TTATG	2	10	71438	71447	20 %	60 %	20 %	0 %	386579046
48	NC_017618	AAATT	2	10	72330	72339	60 %	40 %	0 %	0 %	386579048
49	NC_017618	TGGCG	2	10	73337	73346	0 %	20 %	60 %	20 %	386579050
50	NC_017618	AAAAC	2	10	73897	73906	80 %	0 %	0 %	20 %	386579051
51	NC_017618	TACAC	2	10	74311	74320	40 %	20 %	0 %	40 %	386579052
52	NC_017618	GAAAA	2	10	75190	75199	80 %	0 %	20 %	0 %	386579053
53	NC_017618	GTCTT	2	10	75478	75487	0 %	60 %	20 %	20 %	386579054
54	NC_017618	TTTGG	2	10	75609	75618	0 %	60 %	40 %	0 %	386579054
55	NC_017618	AAGGA	2	10	78184	78193	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017618	TAAGA	2	10	78942	78951	60 %	20 %	20 %	0 %	386579062
57	NC_017618	AGAAT	2	10	83730	83739	60 %	20 %	20 %	0 %	386579069
58	NC_017618	TAGTC	2	10	84515	84524	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017618	GAAAA	2	10	86056	86065	80 %	0 %	20 %	0 %	386579074
60	NC_017618	TGACT	2	10	86451	86460	20 %	40 %	20 %	20 %	386579074
61	NC_017618	TTTTA	2	10	87285	87294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017618	ACAAA	2	10	87711	87720	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017618	TCGTG	2	10	88843	88852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017618	GTTAA	2	10	89722	89731	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017618	TTAAT	2	10	93609	93618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017618	TGTGA	2	10	94570	94579	20 %	40 %	40 %	0 %	386579076
67	NC_017618	CTTTC	2	10	95468	95477	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017618	TGCTT	2	10	96132	96141	0 %	60 %	20 %	20 %	386579078
69	NC_017618	CGCTC	2	10	97196	97205	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_017618	TTGTT	2	10	97303	97312	0 %	80 %	20 %	0 %	386579080
71	NC_017618	AATAT	2	10	98745	98754	60 %	40 %	0 %	0 %	386579081
72	NC_017618	TTTCA	2	10	99561	99570	20 %	60 %	0 %	20 %	386579083
73	NC_017618	CTTCG	2	10	99804	99813	0 %	40 %	20 %	40 %	386579083
74	NC_017618	AAAAT	2	10	99938	99947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017618	TTTTG	2	10	100117	100126	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017618	TTTTC	2	10	100725	100734	0 %	80 %	0 %	20 %	386579084
77	NC_017618	TTTGG	2	10	103021	103030	0 %	60 %	40 %	0 %	386579088
78	NC_017618	ATTGC	2	10	103486	103495	20 %	40 %	20 %	20 %	386579088
79	NC_017618	GCTTT	2	10	103717	103726	0 %	60 %	20 %	20 %	386579089
80	NC_017618	AGAAA	2	10	104175	104184	80 %	0 %	20 %	0 %	386579089
81	NC_017618	GACTT	2	10	105754	105763	20 %	40 %	20 %	20 %	386579090
82	NC_017618	CTGGG	2	10	109974	109983	0 %	20 %	60 %	20 %	386579095
83	NC_017618	AAGAA	2	10	114626	114635	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017618	CCGTT	2	10	115669	115678	0 %	40 %	20 %	40 %	386579097
85	NC_017618	GTCTG	2	10	119141	119150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017618	GGCCT	2	10	119209	119218	0 %	20 %	40 %	40 %	386579100
87	NC_017618	GTCAA	2	10	119306	119315	40 %	20 %	20 %	20 %	386579100
88	NC_017618	GCTTG	2	10	121157	121166	0 %	40 %	40 %	20 %	386579102
89	NC_017618	TGGTT	2	10	121285	121294	0 %	60 %	40 %	0 %	386579102
90	NC_017618	GGTCA	2	10	121584	121593	20 %	20 %	40 %	20 %	386579102
91	NC_017618	AAGGA	2	10	122674	122683	60 %	0 %	40 %	0 %	386579105
92	NC_017618	GGCAA	2	10	123232	123241	40 %	0 %	40 %	20 %	386579107
93	NC_017618	TTGGT	2	10	125620	125629	0 %	60 %	40 %	0 %	386579109
94	NC_017618	GGATG	2	10	125922	125931	20 %	20 %	60 %	0 %	386579110
95	NC_017618	GAAAA	2	10	126082	126091	80 %	0 %	20 %	0 %	386579111
96	NC_017618	CCTTG	2	10	126135	126144	0 %	40 %	20 %	40 %	386579111
97	NC_017618	CTGGA	2	10	127023	127032	20 %	20 %	40 %	20 %	386579112
98	NC_017618	AGCAG	2	10	127379	127388	40 %	0 %	40 %	20 %	386579112
99	NC_017618	GCTCA	2	10	127487	127496	20 %	20 %	20 %	40 %	386579112
100	NC_017618	AATCA	2	10	128001	128010	60 %	20 %	0 %	20 %	386579113
101	NC_017618	AGGTG	2	10	128689	128698	20 %	20 %	60 %	0 %	386579113
102	NC_017618	CATGA	2	10	129062	129071	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017618	GAAAG	2	10	130501	130510	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017618	ACTTT	2	10	132395	132404	20 %	60 %	0 %	20 %	386579118
105	NC_017618	CTATA	2	10	133419	133428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017618	TAGCG	2	10	135493	135502	20 %	20 %	40 %	20 %	386579122
107	NC_017618	ATCAA	2	10	136654	136663	60 %	20 %	0 %	20 %	386579124
108	NC_017618	GAAGC	2	10	137143	137152	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017618	CGTAT	2	10	137926	137935	20 %	40 %	20 %	20 %	386579125
110	NC_017618	ATCCA	2	10	138017	138026	40 %	20 %	0 %	40 %	386579125
111	NC_017618	CAAGA	2	10	138793	138802	60 %	0 %	20 %	20 %	386579125
112	NC_017618	AAGCT	2	10	139223	139232	40 %	20 %	20 %	20 %	386579125
113	NC_017618	AAGAA	2	10	141483	141492	80 %	0 %	20 %	0 %	386579127
114	NC_017618	GCAGT	2	10	141773	141782	20 %	20 %	40 %	20 %	386579127
115	NC_017618	ATCCA	2	10	141884	141893	40 %	20 %	0 %	40 %	386579127
116	NC_017618	TACGA	2	10	142385	142394	40 %	20 %	20 %	20 %	386579127
117	NC_017618	TTAAG	2	10	142717	142726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017618	GTAAA	2	10	144199	144208	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017618	GAAAA	2	10	146177	146186	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017618	CTATT	2	10	146203	146212	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017618	GTTTA	2	10	146382	146391	20 %	60 %	20 %	0 %	386579130
122	NC_017618	GCATG	2	10	147904	147913	20 %	20 %	40 %	20 %	386579132
123	NC_017618	AAAAT	2	10	148317	148326	80 %	20 %	0 %	0 %	386579132
124	NC_017618	ATAAA	2	10	148756	148765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017618	GGGTC	2	10	152939	152948	0 %	20 %	60 %	20 %	386579137
126	NC_017618	TTTCA	2	10	153909	153918	20 %	60 %	0 %	20 %	386579138
127	NC_017618	AAAAG	2	10	154502	154511	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017618	TGGTC	2	10	157095	157104	0 %	40 %	40 %	20 %	386579141
129	NC_017618	GTCTT	2	10	158050	158059	0 %	60 %	20 %	20 %	386579142
130	NC_017618	TTGGA	2	10	160566	160575	20 %	40 %	40 %	0 %	386579144
131	NC_017618	TCATC	2	10	161439	161448	20 %	40 %	0 %	40 %	386579146
132	NC_017618	CTTGG	2	10	161608	161617	0 %	40 %	40 %	20 %	386579146
133	NC_017618	AATTG	2	10	162268	162277	40 %	40 %	20 %	0 %	386579147
134	NC_017618	TTTTC	2	10	162627	162636	0 %	80 %	0 %	20 %	386579148
135	NC_017618	CACCT	2	10	163190	163199	20 %	20 %	0 %	60 %	386579148
136	NC_017618	AGACT	2	10	167976	167985	40 %	20 %	20 %	20 %	386579151
137	NC_017618	CATTG	2	10	172029	172038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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260	NC_017618	TTCCT	2	10	314136	314145	0 %	60 %	0 %	40 %	386579281
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267	NC_017618	GTTTT	2	10	325307	325316	0 %	80 %	20 %	0 %	386579290
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